MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Novosphingobium sp. PP1Y plasmid Lpl

Total Repeats: 3820

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_015579	GCGG	2	8	26378	26385	0 %	0 %	75 %	25 %	334133249
502	NC_015579	CGC	2	6	26390	26395	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	334133249
503	NC_015579	GTGG	2	8	26461	26468	0 %	25 %	75 %	0 %	334133250
504	NC_015579	GC	4	8	26521	26528	0 %	0 %	50 %	50 %	334133250
505	NC_015579	GCT	2	6	26675	26680	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334133250
506	NC_015579	GGCA	2	8	26712	26719	25 %	0 %	50 %	25 %	334133250
507	NC_015579	CAA	2	6	26756	26761	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	334133250
508	NC_015579	GCT	2	6	26845	26850	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334133250
509	NC_015579	GCAGG	2	10	26890	26899	20 %	0 %	60 %	20 %	334133250
510	NC_015579	GCCGGC	2	12	26945	26956	0 %	0 %	50 %	50 %	334133250
511	NC_015579	CG	4	8	26965	26972	0 %	0 %	50 %	50 %	334133250
512	NC_015579	GTGGCA	2	12	27027	27038	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	334133250
513	NC_015579	GCA	2	6	27250	27255	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334133250
514	NC_015579	CGA	2	6	27268	27273	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334133250
515	NC_015579	AAT	2	6	27405	27410	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	334133250
516	NC_015579	T	6	6	27410	27415	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
517	NC_015579	TC	3	6	27432	27437	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
518	NC_015579	TGC	2	6	27473	27478	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
519	NC_015579	GC	3	6	27477	27482	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
520	NC_015579	CGC	2	6	27530	27535	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	334133251
521	NC_015579	AGC	2	6	27599	27604	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334133251
522	NC_015579	GC	3	6	27668	27673	0 %	0 %	50 %	50 %	334133251
523	NC_015579	TCA	2	6	27817	27822	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	334133251
524	NC_015579	GCG	2	6	27836	27841	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	334133251
525	NC_015579	GAG	2	6	27951	27956	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	334133251
526	NC_015579	AGG	2	6	28010	28015	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	334133251
527	NC_015579	CGG	3	9	28034	28042	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	334133251
528	NC_015579	TCC	2	6	28077	28082	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	334133251
529	NC_015579	GCG	2	6	28261	28266	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	334133251
530	NC_015579	CAG	3	9	28350	28358	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334133251
531	NC_015579	GCG	2	6	28390	28395	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	334133251
532	NC_015579	TGG	2	6	28402	28407	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	334133251
533	NC_015579	CGA	2	6	28469	28474	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334133251
534	NC_015579	ACG	2	6	28479	28484	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334133251
535	NC_015579	GGC	2	6	28495	28500	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	334133251
536	NC_015579	CCA	2	6	28526	28531	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	334133251
537	NC_015579	ACA	2	6	28573	28578	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	334133251
538	NC_015579	CAC	2	6	28607	28612	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	334133251
539	NC_015579	GAC	2	6	28625	28630	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334133251
540	NC_015579	CGG	2	6	28675	28680	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	334133251
541	NC_015579	CAA	2	6	28742	28747	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	334133251
542	NC_015579	ACG	2	6	28813	28818	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334133251
543	NC_015579	CCG	2	6	28837	28842	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	334133251
544	NC_015579	GCG	2	6	28867	28872	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	334133251
545	NC_015579	CGGG	2	8	28939	28946	0 %	0 %	75 %	25 %	334133251
546	NC_015579	GCG	2	6	29073	29078	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	334133251
547	NC_015579	CTG	2	6	29109	29114	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334133251
548	NC_015579	CAGTAC	2	12	29208	29219	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	334133251
549	NC_015579	TGC	2	6	29278	29283	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334133251
550	NC_015579	CGG	2	6	29291	29296	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	334133251
551	NC_015579	ACCGCG	2	12	29407	29418	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	334133251
552	NC_015579	CAA	2	6	29540	29545	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	334133251
553	NC_015579	CG	3	6	29612	29617	0 %	0 %	50 %	50 %	334133251
554	NC_015579	GAA	2	6	29748	29753	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	334133251
555	NC_015579	CCG	2	6	29775	29780	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	334133251
556	NC_015579	CGG	2	6	29852	29857	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	334133251
557	NC_015579	CGA	2	6	29864	29869	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334133251
558	NC_015579	TCG	2	6	29917	29922	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334133251
559	NC_015579	CCG	2	6	30039	30044	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	334133251
560	NC_015579	CTC	2	6	30062	30067	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	334133251
561	NC_015579	TCA	2	6	30079	30084	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	334133251
562	NC_015579	TGA	2	6	30108	30113	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	334133251
563	NC_015579	GCG	2	6	30203	30208	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	334133252
564	NC_015579	CCTG	2	8	30211	30218	0 %	25 %	25 %	50 %	334133252
565	NC_015579	AGA	2	6	30253	30258	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	334133252
566	NC_015579	GCC	2	6	30298	30303	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	334133252
567	NC_015579	ATCG	2	8	30334	30341	25 %	25 %	25 %	25 %	334133252
568	NC_015579	ACGA	2	8	30398	30405	50 %	0 %	25 %	25 %	334133252
569	NC_015579	CAT	2	6	30454	30459	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	334133252
570	NC_015579	CGA	2	6	30463	30468	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334133252
571	NC_015579	AGGC	2	8	30510	30517	25 %	0 %	50 %	25 %	334133252
572	NC_015579	GCC	2	6	30540	30545	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	334133252
573	NC_015579	GTT	2	6	30577	30582	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	334133252
574	NC_015579	GC	3	6	30616	30621	0 %	0 %	50 %	50 %	334133252
575	NC_015579	GCA	2	6	30639	30644	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334133252
576	NC_015579	CGG	2	6	30688	30693	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	334133252
577	NC_015579	GGAC	2	8	30694	30701	25 %	0 %	50 %	25 %	334133252
578	NC_015579	GAT	2	6	30785	30790	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	334133252
579	NC_015579	GCAA	2	8	30806	30813	50 %	0 %	25 %	25 %	334133252
580	NC_015579	AGC	2	6	30893	30898	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334133252
581	NC_015579	AGC	2	6	30900	30905	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334133252
582	NC_015579	GCCGC	2	10	30929	30938	0 %	0 %	40 %	60 %	334133252
583	NC_015579	CGCGG	2	10	30963	30972	0 %	0 %	60 %	40 %	334133252
584	NC_015579	CGC	2	6	31011	31016	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	334133252
585	NC_015579	TGC	2	6	31035	31040	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334133252
586	NC_015579	TGG	2	6	31100	31105	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	334133252
587	NC_015579	GGT	2	6	31115	31120	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	334133252
588	NC_015579	GCG	2	6	31132	31137	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	334133252
589	NC_015579	TCTG	2	8	31260	31267	0 %	50 %	25 %	25 %	334133252
590	NC_015579	CAAG	2	8	31450	31457	50 %	0 %	25 %	25 %	334133252
591	NC_015579	GTG	2	6	31478	31483	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	334133252
592	NC_015579	CG	3	6	31494	31499	0 %	0 %	50 %	50 %	334133252
593	NC_015579	GCG	2	6	31509	31514	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	334133252
594	NC_015579	GAT	2	6	31523	31528	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	334133252
595	NC_015579	TCA	2	6	31785	31790	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	334133252
596	NC_015579	TGC	2	6	31826	31831	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334133252
597	NC_015579	TGC	2	6	31951	31956	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334133252
598	NC_015579	GC	3	6	31955	31960	0 %	0 %	50 %	50 %	334133252
599	NC_015579	CTG	2	6	32000	32005	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334133252
600	NC_015579	ATC	3	9	32037	32045	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	334133252
601	NC_015579	CGAT	2	8	32166	32173	25 %	25 %	25 %	25 %	334133252
602	NC_015579	GAT	2	6	32201	32206	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	334133252
603	NC_015579	ATT	2	6	32262	32267	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
604	NC_015579	CAAT	2	8	32312	32319	50 %	25 %	0 %	25 %	334133253
605	NC_015579	GGCTTC	2	12	32342	32353	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334133253
606	NC_015579	TTGGC	2	10	32392	32401	0 %	40 %	40 %	20 %	334133253
607	NC_015579	GCT	2	6	32413	32418	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334133253
608	NC_015579	TCGA	2	8	32429	32436	25 %	25 %	25 %	25 %	334133253
609	NC_015579	CGAT	2	8	32594	32601	25 %	25 %	25 %	25 %	334133253
610	NC_015579	CAC	2	6	32616	32621	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	334133253
611	NC_015579	AGGC	2	8	32640	32647	25 %	0 %	50 %	25 %	334133253
612	NC_015579	AG	3	6	32736	32741	50 %	0 %	50 %	0 %	334133253
613	NC_015579	GGC	2	6	32750	32755	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	334133253
614	NC_015579	CGTCG	2	10	32807	32816	0 %	20 %	40 %	40 %	334133253
615	NC_015579	CCG	2	6	32846	32851	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	334133253
616	NC_015579	TGC	2	6	32897	32902	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334133253
617	NC_015579	GCA	2	6	32986	32991	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334133253
618	NC_015579	CGG	2	6	33010	33015	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	334133253
619	NC_015579	ATG	2	6	33120	33125	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	334133253
620	NC_015579	GGTC	2	8	33159	33166	0 %	25 %	50 %	25 %	334133253
621	NC_015579	CGA	2	6	33199	33204	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334133253
622	NC_015579	GC	3	6	33233	33238	0 %	0 %	50 %	50 %	334133253
623	NC_015579	TCG	2	6	33249	33254	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334133253
624	NC_015579	TTG	2	6	33268	33273	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	334133253
625	NC_015579	GCG	2	6	33305	33310	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	334133253
626	NC_015579	GAG	2	6	33356	33361	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	334133253
627	NC_015579	GCG	2	6	33410	33415	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	334133253
628	NC_015579	GTT	2	6	33418	33423	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	334133253
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751	NC_015579	GATCGC	2	12	39950	39961	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
752	NC_015579	CCA	2	6	39964	39969	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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755	NC_015579	GCT	2	6	40136	40141	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334133261
756	NC_015579	GCC	2	6	40177	40182	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	334133261
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865	NC_015579	CGG	2	6	45317	45322	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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868	NC_015579	AGCTG	2	10	45411	45420	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
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882	NC_015579	TGG	2	6	45892	45897	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	334133266
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