MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Nitrosomonas sp. AL212 plasmid pNAL21201

Total Repeats: 148

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015223	TC	3	6	439	444	0 %	50 %	0 %	50 %	325983715
2	NC_015223	TA	3	6	892	897	50 %	50 %	0 %	0 %	325983715
3	NC_015223	TC	3	6	1437	1442	0 %	50 %	0 %	50 %	325983716
4	NC_015223	TG	3	6	1643	1648	0 %	50 %	50 %	0 %	325983716
5	NC_015223	AC	3	6	2558	2563	50 %	0 %	0 %	50 %	325983716
6	NC_015223	TC	3	6	3572	3577	0 %	50 %	0 %	50 %	325983716
7	NC_015223	TG	3	6	4926	4931	0 %	50 %	50 %	0 %	325983716
8	NC_015223	TG	3	6	6120	6125	0 %	50 %	50 %	0 %	325983717
9	NC_015223	TA	3	6	6760	6765	50 %	50 %	0 %	0 %	325983718
10	NC_015223	TG	3	6	6911	6916	0 %	50 %	50 %	0 %	325983718
11	NC_015223	TA	3	6	7539	7544	50 %	50 %	0 %	0 %	325983718
12	NC_015223	TA	3	6	7876	7881	50 %	50 %	0 %	0 %	325983719
13	NC_015223	TC	3	6	8013	8018	0 %	50 %	0 %	50 %	325983719
14	NC_015223	TA	4	8	9528	9535	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_015223	TA	3	6	9615	9620	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_015223	TA	3	6	9820	9825	50 %	50 %	0 %	0 %	325983721
17	NC_015223	GA	3	6	11540	11545	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
18	NC_015223	TA	3	6	12086	12091	50 %	50 %	0 %	0 %	325983724
19	NC_015223	GA	3	6	12383	12388	50 %	0 %	50 %	0 %	325983724
20	NC_015223	AT	3	6	12410	12415	50 %	50 %	0 %	0 %	325983724
21	NC_015223	GT	3	6	12813	12818	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
22	NC_015223	GC	3	6	13063	13068	0 %	0 %	50 %	50 %	325983725
23	NC_015223	TC	4	8	13996	14003	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
24	NC_015223	TC	4	8	15042	15049	0 %	50 %	0 %	50 %	325983726
25	NC_015223	TG	3	6	15536	15541	0 %	50 %	50 %	0 %	325983726
26	NC_015223	GC	3	6	15766	15771	0 %	0 %	50 %	50 %	325983726
27	NC_015223	AC	3	6	16161	16166	50 %	0 %	0 %	50 %	325983726
28	NC_015223	GA	3	6	16496	16501	50 %	0 %	50 %	0 %	325983726
29	NC_015223	GA	3	6	17354	17359	50 %	0 %	50 %	0 %	325983726
30	NC_015223	GC	3	6	17659	17664	0 %	0 %	50 %	50 %	325983726
31	NC_015223	TC	3	6	18080	18085	0 %	50 %	0 %	50 %	325983727
32	NC_015223	GC	3	6	18566	18571	0 %	0 %	50 %	50 %	325983727
33	NC_015223	GC	3	6	19666	19671	0 %	0 %	50 %	50 %	325983728
34	NC_015223	CG	3	6	20527	20532	0 %	0 %	50 %	50 %	325983728
35	NC_015223	TA	4	8	21501	21508	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_015223	TA	3	6	21590	21595	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_015223	TC	3	6	21953	21958	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
38	NC_015223	CG	3	6	22587	22592	0 %	0 %	50 %	50 %	325983730
39	NC_015223	CT	3	6	23138	23143	0 %	50 %	0 %	50 %	325983731
40	NC_015223	GT	3	6	25172	25177	0 %	50 %	50 %	0 %	325983734
41	NC_015223	AT	3	6	25389	25394	50 %	50 %	0 %	0 %	325983734
42	NC_015223	AT	3	6	25398	25403	50 %	50 %	0 %	0 %	325983734
43	NC_015223	CG	3	6	26838	26843	0 %	0 %	50 %	50 %	325983734
44	NC_015223	GA	3	6	27362	27367	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
45	NC_015223	TA	3	6	27468	27473	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_015223	GC	3	6	27773	27778	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
47	NC_015223	AC	3	6	28101	28106	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
48	NC_015223	TA	3	6	28649	28654	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_015223	TC	3	6	28779	28784	0 %	50 %	0 %	50 %	325983735
50	NC_015223	TC	3	6	29065	29070	0 %	50 %	0 %	50 %	325983735
51	NC_015223	CA	3	6	29377	29382	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
52	NC_015223	GC	3	6	30414	30419	0 %	0 %	50 %	50 %	325983737
53	NC_015223	CG	3	6	31367	31372	0 %	0 %	50 %	50 %	325983739
54	NC_015223	AT	3	6	32204	32209	50 %	50 %	0 %	0 %	325983740
55	NC_015223	AC	3	6	32498	32503	50 %	0 %	0 %	50 %	325983740
56	NC_015223	CT	3	6	32778	32783	0 %	50 %	0 %	50 %	325983740
57	NC_015223	CG	3	6	32984	32989	0 %	0 %	50 %	50 %	325983740
58	NC_015223	TC	3	6	33780	33785	0 %	50 %	0 %	50 %	325983741
59	NC_015223	CT	3	6	34166	34171	0 %	50 %	0 %	50 %	325983742
60	NC_015223	AG	3	6	34893	34898	50 %	0 %	50 %	0 %	325983742
61	NC_015223	AG	3	6	34925	34930	50 %	0 %	50 %	0 %	325983742
62	NC_015223	TG	3	6	38283	38288	0 %	50 %	50 %	0 %	325983745
63	NC_015223	GC	3	6	38315	38320	0 %	0 %	50 %	50 %	325983745
64	NC_015223	GA	3	6	38960	38965	50 %	0 %	50 %	0 %	325983746
65	NC_015223	GC	3	6	39091	39096	0 %	0 %	50 %	50 %	325983747
66	NC_015223	CA	3	6	39446	39451	50 %	0 %	0 %	50 %	325983747
67	NC_015223	AT	3	6	40042	40047	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_015223	TC	3	6	43486	43491	0 %	50 %	0 %	50 %	325983752
69	NC_015223	TG	3	6	44279	44284	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
70	NC_015223	AT	3	6	45300	45305	50 %	50 %	0 %	0 %	325983754
71	NC_015223	GA	3	6	46552	46557	50 %	0 %	50 %	0 %	325983755
72	NC_015223	TC	3	6	46682	46687	0 %	50 %	0 %	50 %	325983756
73	NC_015223	TC	3	6	46947	46952	0 %	50 %	0 %	50 %	325983756
74	NC_015223	AT	3	6	46976	46981	50 %	50 %	0 %	0 %	325983756
75	NC_015223	TC	3	6	47039	47044	0 %	50 %	0 %	50 %	325983757
76	NC_015223	AT	3	6	48067	48072	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_015223	CG	3	6	48450	48455	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
78	NC_015223	AT	3	6	48992	48997	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_015223	TA	3	6	49246	49251	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_015223	TA	3	6	49290	49295	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_015223	CA	3	6	49492	49497	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
82	NC_015223	AT	3	6	50447	50452	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_015223	AT	3	6	50529	50534	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_015223	TA	3	6	51076	51081	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_015223	TG	3	6	51204	51209	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
86	NC_015223	TG	3	6	51365	51370	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
87	NC_015223	TG	3	6	51449	51454	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
88	NC_015223	TG	3	6	51481	51486	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
89	NC_015223	GA	3	6	51997	52002	50 %	0 %	50 %	0 %	325983758
90	NC_015223	TG	3	6	52752	52757	0 %	50 %	50 %	0 %	325983758
91	NC_015223	GT	3	6	53146	53151	0 %	50 %	50 %	0 %	325983759
92	NC_015223	GA	3	6	53178	53183	50 %	0 %	50 %	0 %	325983759
93	NC_015223	CT	3	6	53735	53740	0 %	50 %	0 %	50 %	325983760
94	NC_015223	CT	3	6	54282	54287	0 %	50 %	0 %	50 %	325983761
95	NC_015223	AT	3	6	54492	54497	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_015223	AC	3	6	55222	55227	50 %	0 %	0 %	50 %	325983763
97	NC_015223	CA	3	6	55943	55948	50 %	0 %	0 %	50 %	325983763
98	NC_015223	TG	3	6	56761	56766	0 %	50 %	50 %	0 %	325983764
99	NC_015223	GC	3	6	57360	57365	0 %	0 %	50 %	50 %	325983764
100	NC_015223	CT	3	6	57581	57586	0 %	50 %	0 %	50 %	325983764
101	NC_015223	TC	3	6	58031	58036	0 %	50 %	0 %	50 %	325983764
102	NC_015223	GC	3	6	58306	58311	0 %	0 %	50 %	50 %	325983764
103	NC_015223	GC	3	6	59014	59019	0 %	0 %	50 %	50 %	325983765
104	NC_015223	TC	3	6	59981	59986	0 %	50 %	0 %	50 %	325983767
105	NC_015223	GC	3	6	61097	61102	0 %	0 %	50 %	50 %	325983767
106	NC_015223	GT	3	6	63703	63708	0 %	50 %	50 %	0 %	325983771
107	NC_015223	GC	3	6	64189	64194	0 %	0 %	50 %	50 %	325983771
108	NC_015223	GT	3	6	64250	64255	0 %	50 %	50 %	0 %	325983771
109	NC_015223	CG	3	6	64361	64366	0 %	0 %	50 %	50 %	325983771
110	NC_015223	CA	3	6	65181	65186	50 %	0 %	0 %	50 %	325983772
111	NC_015223	AT	3	6	66195	66200	50 %	50 %	0 %	0 %	325983774
112	NC_015223	TA	3	6	67320	67325	50 %	50 %	0 %	0 %	325983774
113	NC_015223	TC	3	6	67721	67726	0 %	50 %	0 %	50 %	325983774
114	NC_015223	TA	3	6	69631	69636	50 %	50 %	0 %	0 %	325983775
115	NC_015223	CT	3	6	69896	69901	0 %	50 %	0 %	50 %	325983775
116	NC_015223	TA	3	6	71226	71231	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_015223	AG	3	6	72117	72122	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
118	NC_015223	TC	3	6	74686	74691	0 %	50 %	0 %	50 %	325983779
119	NC_015223	AT	3	6	76669	76674	50 %	50 %	0 %	0 %	325983781
120	NC_015223	CG	3	6	78092	78097	0 %	0 %	50 %	50 %	325983782
121	NC_015223	GC	3	6	78497	78502	0 %	0 %	50 %	50 %	325983782
122	NC_015223	CA	3	6	79312	79317	50 %	0 %	0 %	50 %	325983783
123	NC_015223	TC	3	6	79470	79475	0 %	50 %	0 %	50 %	325983783
124	NC_015223	CT	4	8	79522	79529	0 %	50 %	0 %	50 %	325983783
125	NC_015223	GT	3	6	80061	80066	0 %	50 %	50 %	0 %	325983783
126	NC_015223	GT	3	6	80130	80135	0 %	50 %	50 %	0 %	325983783
127	NC_015223	GT	3	6	80266	80271	0 %	50 %	50 %	0 %	325983783
128	NC_015223	TC	3	6	80481	80486	0 %	50 %	0 %	50 %	325983783
129	NC_015223	AT	3	6	81985	81990	50 %	50 %	0 %	0 %	325983784
130	NC_015223	CT	3	6	82045	82050	0 %	50 %	0 %	50 %	325983784
131	NC_015223	AC	3	6	82345	82350	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
132	NC_015223	GA	3	6	82456	82461	50 %	0 %	50 %	0 %	325983785
133	NC_015223	TA	3	6	82976	82981	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_015223	GC	3	6	83360	83365	0 %	0 %	50 %	50 %	325983787
135	NC_015223	AT	3	6	83525	83530	50 %	50 %	0 %	0 %	325983788
136	NC_015223	AT	3	6	83567	83572	50 %	50 %	0 %	0 %	325983788
137	NC_015223	GA	3	6	84115	84120	50 %	0 %	50 %	0 %	325983789
138	NC_015223	TA	3	6	84548	84553	50 %	50 %	0 %	0 %	325983789
139	NC_015223	GC	3	6	84596	84601	0 %	0 %	50 %	50 %	325983789
140	NC_015223	CT	3	6	84775	84780	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
141	NC_015223	GA	3	6	85042	85047	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
142	NC_015223	AG	3	6	85054	85059	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
143	NC_015223	CG	3	6	85260	85265	0 %	0 %	50 %	50 %	325983790
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146	NC_015223	GC	3	6	90968	90973	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
147	NC_015223	TA	3	6	91129	91134	50 %	50 %	0 %	0 %	325983798
148	NC_015223	CT	3	6	91851	91856	0 %	50 %	0 %	50 %	325983799

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.