MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Nitrosomonas sp. AL212 chromosome

Total Repeats: 62088

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
2001	NC_015222	TCA	2	6	101687	101692	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325980964
2002	NC_015222	ATT	2	6	101693	101698	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	325980964
2003	NC_015222	TCT	2	6	101955	101960	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325980964
2004	NC_015222	T	7	7	101985	101991	0 %	100 %	0 %	0 %	325980964
2005	NC_015222	CGT	2	6	102044	102049	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325980964
2006	NC_015222	TCA	3	9	102089	102097	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325980964
2007	NC_015222	TAA	2	6	102103	102108	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	325980964
2008	NC_015222	ATTTTA	2	12	102117	102128	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	325980964
2009	NC_015222	TAAT	2	8	102168	102175	50 %	50 %	0 %	0 %	325980964
2010	NC_015222	GTTC	2	8	102201	102208	0 %	50 %	25 %	25 %	325980964
2011	NC_015222	ATT	2	6	102248	102253	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	325980964
2012	NC_015222	TAT	2	6	102282	102287	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	325980964
2013	NC_015222	TCT	2	6	102308	102313	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325980964
2014	NC_015222	ATT	2	6	102416	102421	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	325980964
2015	NC_015222	TAA	2	6	102498	102503	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	325980964
2016	NC_015222	GTTA	2	8	102514	102521	25 %	50 %	25 %	0 %	325980964
2017	NC_015222	T	8	8	102522	102529	0 %	100 %	0 %	0 %	325980964
2018	NC_015222	AAT	2	6	102543	102548	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	325980964
2019	NC_015222	AACT	2	8	102679	102686	50 %	25 %	0 %	25 %	325980964
2020	NC_015222	TTC	2	6	102694	102699	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325980964
2021	NC_015222	ACTT	2	8	102724	102731	25 %	50 %	0 %	25 %	325980964
2022	NC_015222	ATAA	2	8	102733	102740	75 %	25 %	0 %	0 %	325980964
2023	NC_015222	TTG	2	6	102755	102760	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	325980964
2024	NC_015222	GTT	2	6	102863	102868	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	325980964
2025	NC_015222	ATG	2	6	102894	102899	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325980964
2026	NC_015222	T	6	6	102947	102952	0 %	100 %	0 %	0 %	325980964
2027	NC_015222	GAG	2	6	102968	102973	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	325980964
2028	NC_015222	T	6	6	103049	103054	0 %	100 %	0 %	0 %	325980964
2029	NC_015222	GCTC	2	8	103055	103062	0 %	25 %	25 %	50 %	325980964
2030	NC_015222	TC	3	6	103069	103074	0 %	50 %	0 %	50 %	325980964
2031	NC_015222	GGT	2	6	103091	103096	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	325980964
2032	NC_015222	AGC	2	6	103156	103161	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325980964
2033	NC_015222	ATAA	2	8	103213	103220	75 %	25 %	0 %	0 %	325980964
2034	NC_015222	TGA	2	6	103297	103302	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325980964
2035	NC_015222	TTG	2	6	103351	103356	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	325980964
2036	NC_015222	TCA	2	6	103391	103396	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325980964
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2038	NC_015222	TGTTA	2	10	103522	103531	20 %	60 %	20 %	0 %	325980964
2039	NC_015222	AGC	2	6	103546	103551	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325980964
2040	NC_015222	AGA	2	6	103604	103609	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325980964
2041	NC_015222	CTT	2	6	103622	103627	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325980964
2042	NC_015222	AAT	2	6	103710	103715	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	325980964
2043	NC_015222	CAT	2	6	103779	103784	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325980964
2044	NC_015222	ATT	2	6	103802	103807	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	325980964
2045	NC_015222	A	6	6	103837	103842	100 %	0 %	0 %	0 %	325980964
2046	NC_015222	TGA	2	6	103867	103872	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325980964
2047	NC_015222	T	7	7	103929	103935	0 %	100 %	0 %	0 %	325980964
2048	NC_015222	AT	3	6	103976	103981	50 %	50 %	0 %	0 %	325980964
2049	NC_015222	CTA	2	6	103983	103988	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325980964
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2051	NC_015222	ACTT	2	8	104101	104108	25 %	50 %	0 %	25 %	325980964
2052	NC_015222	TGC	2	6	104179	104184	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325980964
2053	NC_015222	AT	3	6	104216	104221	50 %	50 %	0 %	0 %	325980964
2054	NC_015222	ATC	2	6	104236	104241	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325980964
2055	NC_015222	T	6	6	104260	104265	0 %	100 %	0 %	0 %	325980964
2056	NC_015222	CAA	2	6	104275	104280	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	325980964
2057	NC_015222	GTT	2	6	104478	104483	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	325980964
2058	NC_015222	TTG	2	6	104506	104511	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	325980964
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2060	NC_015222	TCT	2	6	104561	104566	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325980964
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2062	NC_015222	T	6	6	104657	104662	0 %	100 %	0 %	0 %	325980964
2063	NC_015222	TTA	2	6	104760	104765	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	325980964
2064	NC_015222	GA	3	6	104836	104841	50 %	0 %	50 %	0 %	325980964
2065	NC_015222	TTCTA	2	10	104866	104875	20 %	60 %	0 %	20 %	325980964
2066	NC_015222	CAA	2	6	104901	104906	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	325980964
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2069	NC_015222	TCA	2	6	104969	104974	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325980964
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2073	NC_015222	TAA	2	6	105145	105150	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2074	NC_015222	CTG	2	6	105154	105159	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2075	NC_015222	TTG	2	6	105177	105182	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2076	NC_015222	TAG	2	6	105219	105224	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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2081	NC_015222	TTA	2	6	105321	105326	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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2087	NC_015222	ATTT	2	8	105601	105608	25 %	75 %	0 %	0 %	325980965
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2092	NC_015222	AC	3	6	105946	105951	50 %	0 %	0 %	50 %	325980965
2093	NC_015222	ATTG	2	8	105983	105990	25 %	50 %	25 %	0 %	325980965
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2096	NC_015222	GATT	2	8	106289	106296	25 %	50 %	25 %	0 %	325980965
2097	NC_015222	CATC	2	8	106356	106363	25 %	25 %	0 %	50 %	325980965
2098	NC_015222	GCC	2	6	106368	106373	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325980965
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2102	NC_015222	TTG	2	6	106594	106599	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	325980965
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2107	NC_015222	TGC	2	6	106957	106962	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325980965
2108	NC_015222	TGC	2	6	106988	106993	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325980965
2109	NC_015222	GAT	2	6	107000	107005	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325980965
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2111	NC_015222	ATC	2	6	107058	107063	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325980965
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2120	NC_015222	T	6	6	107352	107357	0 %	100 %	0 %	0 %	325980965
2121	NC_015222	CAA	2	6	107358	107363	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	325980965
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2126	NC_015222	TA	4	8	107498	107505	50 %	50 %	0 %	0 %	325980965
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2132	NC_015222	T	6	6	107931	107936	0 %	100 %	0 %	0 %	325980965
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2142	NC_015222	TCA	2	6	108358	108363	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325980965
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2242	NC_015222	CTAAAA	2	12	113628	113639	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	325980971
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2248	NC_015222	TAA	2	6	113790	113795	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	325980971
2249	NC_015222	GAAT	2	8	113835	113842	50 %	25 %	25 %	0 %	325980971
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2365	NC_015222	GGAT	2	8	120148	120155	25 %	25 %	50 %	0 %	325980977
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2372	NC_015222	ATCA	2	8	120469	120476	50 %	25 %	0 %	25 %	325980977
2373	NC_015222	GGT	2	6	120529	120534	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	325980977
2374	NC_015222	ATA	2	6	120589	120594	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	325980977
2375	NC_015222	AGT	2	6	120607	120612	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325980977
2376	NC_015222	TTGC	2	8	120655	120662	0 %	50 %	25 %	25 %	325980977
2377	NC_015222	TGT	2	6	120675	120680	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	325980977
2378	NC_015222	GGT	2	6	120789	120794	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	325980977
2379	NC_015222	TGC	2	6	120941	120946	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325980977
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2381	NC_015222	TAT	2	6	121055	121060	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2382	NC_015222	ATTT	2	8	121105	121112	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
2383	NC_015222	TCA	2	6	121126	121131	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2384	NC_015222	TCT	2	6	121182	121187	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2385	NC_015222	AAT	2	6	121199	121204	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2386	NC_015222	TTG	2	6	121349	121354	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	325980978
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2390	NC_015222	ATC	2	6	121544	121549	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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2411	NC_015222	TAC	2	6	122735	122740	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325980980
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2413	NC_015222	AATA	2	8	122839	122846	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
2414	NC_015222	TCAA	2	8	122885	122892	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
2415	NC_015222	ATT	2	6	122909	122914	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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2418	NC_015222	AT	3	6	123057	123062	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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2427	NC_015222	T	6	6	123587	123592	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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2472	NC_015222	GTG	2	6	125445	125450	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2473	NC_015222	T	7	7	125451	125457	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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2475	NC_015222	CTTG	2	8	125503	125510	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
2476	NC_015222	CAAT	2	8	125520	125527	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
2477	NC_015222	CTG	2	6	125564	125569	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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2479	NC_015222	GATG	2	8	125751	125758	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
2480	NC_015222	TTGC	2	8	125787	125794	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
2481	NC_015222	T	8	8	125803	125810	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2482	NC_015222	GCT	2	6	125870	125875	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325980983
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2486	NC_015222	GA	4	8	126080	126087	50 %	0 %	50 %	0 %	325980983
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2489	NC_015222	CCGC	2	8	126158	126165	0 %	0 %	25 %	75 %	325980983
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2491	NC_015222	AAGA	2	8	126195	126202	75 %	0 %	25 %	0 %	325980983
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2493	NC_015222	AGAA	2	8	126217	126224	75 %	0 %	25 %	0 %	325980983
2494	NC_015222	CAG	2	6	126591	126596	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325980983
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2496	NC_015222	T	7	7	126627	126633	0 %	100 %	0 %	0 %	325980983
2497	NC_015222	GT	3	6	126666	126671	0 %	50 %	50 %	0 %	325980983
2498	NC_015222	TGC	2	6	126672	126677	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325980983
2499	NC_015222	AAT	2	6	126686	126691	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	325980983
2500	NC_015222	TCA	2	6	126818	126823	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325980984

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