MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Nitrosomonas sp. AL212 chromosome

Total Repeats: 62088

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_015222	GCC	2	6	75192	75197	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325980943
1502	NC_015222	CAC	2	6	75229	75234	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	325980943
1503	NC_015222	AATG	2	8	75306	75313	50 %	25 %	25 %	0 %	325980943
1504	NC_015222	GGA	2	6	75367	75372	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	325980943
1505	NC_015222	AGT	2	6	75375	75380	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325980943
1506	NC_015222	CAATCA	2	12	75435	75446	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	325980943
1507	NC_015222	A	6	6	75452	75457	100 %	0 %	0 %	0 %	325980943
1508	NC_015222	TTC	3	9	75487	75495	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325980943
1509	NC_015222	TTC	2	6	75653	75658	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325980943
1510	NC_015222	GCC	2	6	75675	75680	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325980943
1511	NC_015222	GAT	2	6	75682	75687	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325980943
1512	NC_015222	TGCC	2	8	75743	75750	0 %	25 %	25 %	50 %	325980943
1513	NC_015222	GTT	2	6	75772	75777	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	325980943
1514	NC_015222	TCA	2	6	75821	75826	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325980943
1515	NC_015222	CTG	2	6	75889	75894	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325980943
1516	NC_015222	TGC	2	6	76043	76048	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325980943
1517	NC_015222	GTA	2	6	76114	76119	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325980943
1518	NC_015222	ATG	2	6	76175	76180	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325980943
1519	NC_015222	TCC	2	6	76202	76207	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	325980943
1520	NC_015222	T	7	7	76290	76296	0 %	100 %	0 %	0 %	325980943
1521	NC_015222	T	6	6	76320	76325	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1522	NC_015222	TCAA	2	8	76434	76441	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
1523	NC_015222	TAC	2	6	76467	76472	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1524	NC_015222	A	6	6	76656	76661	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1525	NC_015222	TTA	2	6	76676	76681	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1526	NC_015222	GAA	2	6	76686	76691	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325980944
1527	NC_015222	ATG	2	6	76750	76755	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325980944
1528	NC_015222	GGT	2	6	76757	76762	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	325980944
1529	NC_015222	GCTT	2	8	76857	76864	0 %	50 %	25 %	25 %	325980944
1530	NC_015222	TGA	2	6	76868	76873	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325980944
1531	NC_015222	TGGAT	2	10	76902	76911	20 %	40 %	40 %	0 %	325980944
1532	NC_015222	GCA	2	6	76977	76982	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325980944
1533	NC_015222	TGG	2	6	77030	77035	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	325980944
1534	NC_015222	CTG	2	6	77041	77046	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325980944
1535	NC_015222	TGC	2	6	77081	77086	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325980944
1536	NC_015222	CGG	2	6	77112	77117	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325980944
1537	NC_015222	AATG	2	8	77335	77342	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1538	NC_015222	CGG	2	6	77375	77380	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1539	NC_015222	T	7	7	77477	77483	0 %	100 %	0 %	0 %	325980945
1540	NC_015222	GTTT	2	8	77491	77498	0 %	75 %	25 %	0 %	325980945
1541	NC_015222	AGT	2	6	77504	77509	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325980945
1542	NC_015222	ATG	2	6	77635	77640	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325980945
1543	NC_015222	TCA	2	6	77644	77649	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325980945
1544	NC_015222	TTCA	2	8	77670	77677	25 %	50 %	0 %	25 %	325980945
1545	NC_015222	TTCC	2	8	77681	77688	0 %	50 %	0 %	50 %	325980945
1546	NC_015222	GTGCG	2	10	77781	77790	0 %	20 %	60 %	20 %	325980945
1547	NC_015222	GAT	2	6	77808	77813	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325980945
1548	NC_015222	T	6	6	77813	77818	0 %	100 %	0 %	0 %	325980945
1549	NC_015222	CGA	2	6	77858	77863	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325980945
1550	NC_015222	GC	3	6	77868	77873	0 %	0 %	50 %	50 %	325980945
1551	NC_015222	GTG	2	6	77878	77883	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	325980945
1552	NC_015222	CG	3	6	77894	77899	0 %	0 %	50 %	50 %	325980945
1553	NC_015222	TGC	2	6	77935	77940	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325980945
1554	NC_015222	TGA	2	6	78005	78010	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1555	NC_015222	GCA	2	6	78078	78083	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1556	NC_015222	T	6	6	78105	78110	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1557	NC_015222	CTAT	2	8	78111	78118	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
1558	NC_015222	TTAT	2	8	78120	78127	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1559	NC_015222	AAT	2	6	78131	78136	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1560	NC_015222	CTTG	2	8	78206	78213	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
1561	NC_015222	GT	3	6	78271	78276	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1562	NC_015222	GAG	2	6	78300	78305	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1563	NC_015222	ACA	2	6	78306	78311	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	325980946
1564	NC_015222	TTG	2	6	78440	78445	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	325980946
1565	NC_015222	CAGC	2	8	78455	78462	25 %	0 %	25 %	50 %	325980946
1566	NC_015222	AAT	2	6	78488	78493	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	325980946
1567	NC_015222	TGG	2	6	78537	78542	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	325980946
1568	NC_015222	TGC	2	6	78568	78573	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325980946
1569	NC_015222	C	7	7	78593	78599	0 %	0 %	0 %	100 %	325980946
1570	NC_015222	GTTG	2	8	78634	78641	0 %	50 %	50 %	0 %	325980946
1571	NC_015222	AAATTG	2	12	78690	78701	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	325980946
1572	NC_015222	AGG	2	6	78714	78719	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	325980946
1573	NC_015222	CCT	2	6	78728	78733	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	325980946
1574	NC_015222	TGA	2	6	78759	78764	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1575	NC_015222	GTT	2	6	78790	78795	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	325980947
1576	NC_015222	GCG	2	6	78861	78866	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325980947
1577	NC_015222	GATT	2	8	78876	78883	25 %	50 %	25 %	0 %	325980947
1578	NC_015222	CGG	3	9	78933	78941	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325980947
1579	NC_015222	TTC	2	6	79014	79019	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325980947
1580	NC_015222	TGC	2	6	79050	79055	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325980947
1581	NC_015222	GT	3	6	79065	79070	0 %	50 %	50 %	0 %	325980947
1582	NC_015222	GC	3	6	79094	79099	0 %	0 %	50 %	50 %	325980947
1583	NC_015222	CGG	2	6	79116	79121	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325980947
1584	NC_015222	ACT	2	6	79292	79297	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325980947
1585	NC_015222	GGT	2	6	79324	79329	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	325980947
1586	NC_015222	CG	4	8	79331	79338	0 %	0 %	50 %	50 %	325980947
1587	NC_015222	AT	3	6	79391	79396	50 %	50 %	0 %	0 %	325980947
1588	NC_015222	GAA	2	6	79412	79417	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325980947
1589	NC_015222	TTA	2	6	79448	79453	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	325980947
1590	NC_015222	GGA	2	6	79495	79500	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	325980947
1591	NC_015222	GCC	2	6	79529	79534	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325980947
1592	NC_015222	CG	3	6	79551	79556	0 %	0 %	50 %	50 %	325980947
1593	NC_015222	CAAA	2	8	79594	79601	75 %	0 %	0 %	25 %	325980947
1594	NC_015222	A	6	6	79720	79725	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1595	NC_015222	TCTT	2	8	79742	79749	0 %	75 %	0 %	25 %	325980948
1596	NC_015222	GCA	2	6	79791	79796	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325980948
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1598	NC_015222	ATG	2	6	79942	79947	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325980948
1599	NC_015222	GCCG	2	8	79950	79957	0 %	0 %	50 %	50 %	325980948
1600	NC_015222	GTT	3	9	80075	80083	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	325980949
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1602	NC_015222	TGC	2	6	80123	80128	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325980949
1603	NC_015222	GAAT	2	8	80140	80147	50 %	25 %	25 %	0 %	325980949
1604	NC_015222	AAAG	2	8	80162	80169	75 %	0 %	25 %	0 %	325980949
1605	NC_015222	GTG	3	9	80289	80297	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	325980949
1606	NC_015222	GCA	2	6	80315	80320	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325980949
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1608	NC_015222	TAT	2	6	80484	80489	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	325980949
1609	NC_015222	CGC	2	6	80598	80603	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325980949
1610	NC_015222	TGA	2	6	80636	80641	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325980949
1611	NC_015222	AGA	2	6	80700	80705	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325980949
1612	NC_015222	GCA	2	6	80767	80772	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325980949
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1614	NC_015222	AGA	2	6	80841	80846	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325980949
1615	NC_015222	AAT	2	6	80856	80861	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	325980949
1616	NC_015222	TTGA	2	8	80883	80890	25 %	50 %	25 %	0 %	325980949
1617	NC_015222	CAA	2	6	81029	81034	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	325980949
1618	NC_015222	CCA	2	6	81259	81264	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	325980949
1619	NC_015222	GC	4	8	81279	81286	0 %	0 %	50 %	50 %	325980949
1620	NC_015222	GGT	2	6	81306	81311	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	325980949
1621	NC_015222	CG	3	6	81373	81378	0 %	0 %	50 %	50 %	325980949
1622	NC_015222	GGA	2	6	81426	81431	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	325980949
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1625	NC_015222	TGA	2	6	81590	81595	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325980949
1626	NC_015222	CAG	2	6	81601	81606	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325980949
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1628	NC_015222	TCC	2	6	81683	81688	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	325980949
1629	NC_015222	AAT	2	6	81702	81707	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	325980949
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