MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Nitrosomonas sp. AL212 chromosome

Total Repeats: 62088

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
6001	NC_015222	GAC	2	6	309719	309724	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325981141
6002	NC_015222	ATT	2	6	309837	309842	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	325981141
6003	NC_015222	GC	3	6	309853	309858	0 %	0 %	50 %	50 %	325981141
6004	NC_015222	CG	3	6	309896	309901	0 %	0 %	50 %	50 %	325981141
6005	NC_015222	GCA	2	6	309943	309948	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325981141
6006	NC_015222	ATC	2	6	310004	310009	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325981141
6007	NC_015222	ACC	2	6	310017	310022	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	325981141
6008	NC_015222	CG	3	6	310040	310045	0 %	0 %	50 %	50 %	325981141
6009	NC_015222	TCC	2	6	310056	310061	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	325981141
6010	NC_015222	GAT	2	6	310129	310134	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325981141
6011	NC_015222	T	6	6	310134	310139	0 %	100 %	0 %	0 %	325981141
6012	NC_015222	GC	3	6	310142	310147	0 %	0 %	50 %	50 %	325981141
6013	NC_015222	CAAA	2	8	310159	310166	75 %	0 %	0 %	25 %	325981141
6014	NC_015222	GTG	3	9	310184	310192	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	325981141
6015	NC_015222	CGA	2	6	310201	310206	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325981141
6016	NC_015222	GGC	2	6	310264	310269	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325981141
6017	NC_015222	GAA	2	6	310276	310281	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325981141
6018	NC_015222	GAG	2	6	310286	310291	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	325981141
6019	NC_015222	CAT	2	6	310396	310401	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325981141
6020	NC_015222	TCG	2	6	310407	310412	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325981141
6021	NC_015222	CGC	2	6	310500	310505	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325981141
6022	NC_015222	GATG	2	8	310576	310583	25 %	25 %	50 %	0 %	325981141
6023	NC_015222	GAA	2	6	310643	310648	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325981141
6024	NC_015222	GAG	2	6	310655	310660	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	325981141
6025	NC_015222	TCA	2	6	310743	310748	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325981141
6026	NC_015222	CGA	2	6	310753	310758	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325981141
6027	NC_015222	A	6	6	310767	310772	100 %	0 %	0 %	0 %	325981141
6028	NC_015222	CGCGG	2	10	310800	310809	0 %	0 %	60 %	40 %	325981141
6029	NC_015222	TGG	2	6	310827	310832	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	325981141
6030	NC_015222	GGAA	2	8	310887	310894	50 %	0 %	50 %	0 %	325981141
6031	NC_015222	GCG	2	6	310948	310953	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325981141
6032	NC_015222	AGC	2	6	310959	310964	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325981141
6033	NC_015222	GGT	2	6	310996	311001	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	325981141
6034	NC_015222	GAA	2	6	311024	311029	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325981141
6035	NC_015222	CGC	2	6	311035	311040	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325981141
6036	NC_015222	CCG	2	6	311390	311395	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325981141
6037	NC_015222	CTG	2	6	311423	311428	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325981141
6038	NC_015222	AAG	2	6	311468	311473	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325981141
6039	NC_015222	GAA	2	6	311483	311488	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325981141
6040	NC_015222	CGA	2	6	311500	311505	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325981141
6041	NC_015222	TCAA	2	8	311529	311536	50 %	25 %	0 %	25 %	325981141
6042	NC_015222	ATG	2	6	311559	311564	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325981141
6043	NC_015222	CGGT	2	8	311663	311670	0 %	25 %	50 %	25 %	325981141
6044	NC_015222	GTG	3	9	311771	311779	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	325981141
6045	NC_015222	GC	3	6	311932	311937	0 %	0 %	50 %	50 %	325981141
6046	NC_015222	TGC	2	6	311964	311969	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325981141
6047	NC_015222	GCA	2	6	312007	312012	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325981141
6048	NC_015222	ACA	2	6	312027	312032	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	325981141
6049	NC_015222	GGT	2	6	312035	312040	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	325981141
6050	NC_015222	ATT	2	6	312054	312059	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	325981141
6051	NC_015222	TGA	2	6	312069	312074	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325981141
6052	NC_015222	GC	3	6	312091	312096	0 %	0 %	50 %	50 %	325981141
6053	NC_015222	GTT	2	6	312145	312150	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	325981141
6054	NC_015222	A	6	6	312161	312166	100 %	0 %	0 %	0 %	325981141
6055	NC_015222	GGC	2	6	312205	312210	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325981141
6056	NC_015222	TGC	2	6	312231	312236	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325981141
6057	NC_015222	TCCGC	2	10	312297	312306	0 %	20 %	20 %	60 %	325981141
6058	NC_015222	TAT	2	6	312354	312359	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	325981141
6059	NC_015222	GAT	2	6	312374	312379	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325981141
6060	NC_015222	CTTAA	2	10	312429	312438	40 %	40 %	0 %	20 %	325981141
6061	NC_015222	GGA	2	6	312460	312465	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6062	NC_015222	CAAA	2	8	312537	312544	75 %	0 %	0 %	25 %	325981142
6063	NC_015222	CGC	2	6	312598	312603	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325981142
6064	NC_015222	GTA	2	6	312637	312642	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325981142
6065	NC_015222	ACCC	2	8	312720	312727	25 %	0 %	0 %	75 %	325981142
6066	NC_015222	GA	3	6	312750	312755	50 %	0 %	50 %	0 %	325981142
6067	NC_015222	TCG	2	6	312786	312791	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325981142
6068	NC_015222	TTC	2	6	312797	312802	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325981142
6069	NC_015222	A	6	6	312823	312828	100 %	0 %	0 %	0 %	325981142
6070	NC_015222	TCA	2	6	312871	312876	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325981142
6071	NC_015222	TCA	2	6	312932	312937	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6072	NC_015222	ATG	2	6	313009	313014	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6073	NC_015222	TAA	2	6	313029	313034	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6074	NC_015222	CAG	2	6	313037	313042	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6075	NC_015222	T	6	6	313142	313147	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6076	NC_015222	TTC	2	6	313201	313206	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6077	NC_015222	CAA	2	6	313266	313271	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6078	NC_015222	ATTT	2	8	313314	313321	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
6079	NC_015222	ATTCTG	2	12	313462	313473	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	325981143
6080	NC_015222	GAT	2	6	313491	313496	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325981143
6081	NC_015222	AAT	2	6	313570	313575	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	325981143
6082	NC_015222	ATT	2	6	313603	313608	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	325981143
6083	NC_015222	ATT	2	6	313648	313653	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	325981143
6084	NC_015222	TGC	2	6	313731	313736	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325981143
6085	NC_015222	GAA	2	6	313771	313776	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325981143
6086	NC_015222	A	6	6	313775	313780	100 %	0 %	0 %	0 %	325981143
6087	NC_015222	TTG	2	6	313799	313804	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	325981143
6088	NC_015222	ACC	2	6	313822	313827	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	325981143
6089	NC_015222	TAG	2	6	313892	313897	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325981143
6090	NC_015222	CGG	2	6	313932	313937	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325981143
6091	NC_015222	CTG	2	6	313948	313953	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325981143
6092	NC_015222	GAA	2	6	314191	314196	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325981143
6093	NC_015222	ACG	2	6	314273	314278	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325981143
6094	NC_015222	GAA	2	6	314433	314438	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325981143
6095	NC_015222	TGA	2	6	314475	314480	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325981143
6096	NC_015222	ACG	2	6	314552	314557	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325981143
6097	NC_015222	GC	3	6	314581	314586	0 %	0 %	50 %	50 %	325981143
6098	NC_015222	CTG	2	6	314677	314682	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325981143
6099	NC_015222	GCAAG	2	10	314766	314775	40 %	0 %	40 %	20 %	325981143
6100	NC_015222	AAG	2	6	314801	314806	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325981143
6101	NC_015222	T	6	6	314818	314823	0 %	100 %	0 %	0 %	325981143
6102	NC_015222	CAT	2	6	314824	314829	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325981143
6103	NC_015222	GC	3	6	314839	314844	0 %	0 %	50 %	50 %	325981143
6104	NC_015222	TGA	2	6	314877	314882	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325981143
6105	NC_015222	TTG	2	6	314941	314946	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	325981143
6106	NC_015222	TCCC	2	8	314963	314970	0 %	25 %	0 %	75 %	325981143
6107	NC_015222	ATA	2	6	315026	315031	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	325981143
6108	NC_015222	CAT	2	6	315063	315068	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325981143
6109	NC_015222	GCG	2	6	315098	315103	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325981143
6110	NC_015222	GGA	2	6	315270	315275	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	325981143
6111	NC_015222	AGAA	2	8	315347	315354	75 %	0 %	25 %	0 %	325981143
6112	NC_015222	TGGCG	2	10	315368	315377	0 %	20 %	60 %	20 %	325981143
6113	NC_015222	ACGC	2	8	315403	315410	25 %	0 %	25 %	50 %	325981143
6114	NC_015222	GTG	2	6	315532	315537	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	325981143
6115	NC_015222	ATTT	2	8	315542	315549	25 %	75 %	0 %	0 %	325981143
6116	NC_015222	GGT	2	6	315576	315581	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	325981143
6117	NC_015222	GC	3	6	315589	315594	0 %	0 %	50 %	50 %	325981143
6118	NC_015222	TGA	2	6	315596	315601	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325981143
6119	NC_015222	ATA	2	6	315659	315664	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	325981143
6120	NC_015222	TGCAA	2	10	315743	315752	40 %	20 %	20 %	20 %	325981143
6121	NC_015222	GCG	2	6	315813	315818	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325981143
6122	NC_015222	CAT	2	6	315831	315836	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325981143
6123	NC_015222	GAA	2	6	315868	315873	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325981143
6124	NC_015222	CCATT	2	10	315914	315923	20 %	40 %	0 %	40 %	325981143
6125	NC_015222	ACG	2	6	315940	315945	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325981143
6126	NC_015222	CG	3	6	316018	316023	0 %	0 %	50 %	50 %	325981143
6127	NC_015222	GT	4	8	316028	316035	0 %	50 %	50 %	0 %	325981143
6128	NC_015222	CTG	2	6	316042	316047	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325981143
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6146	NC_015222	ATT	2	6	317142	317147	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6147	NC_015222	GT	3	6	317198	317203	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
6148	NC_015222	TATCT	2	10	317304	317313	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
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6155	NC_015222	AG	3	6	317569	317574	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
6156	NC_015222	AT	3	6	317591	317596	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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6158	NC_015222	CTG	2	6	317622	317627	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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6179	NC_015222	CGTAA	2	10	318495	318504	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
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6234	NC_015222	T	6	6	320750	320755	0 %	100 %	0 %	0 %	325981148
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6241	NC_015222	TCCTT	2	10	321163	321172	0 %	60 %	0 %	40 %	325981148
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6244	NC_015222	ATA	2	6	321229	321234	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	325981148
6245	NC_015222	ATTT	2	8	321303	321310	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
6246	NC_015222	T	7	7	321308	321314	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6247	NC_015222	ATA	2	6	321316	321321	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6248	NC_015222	A	6	6	321390	321395	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6249	NC_015222	GAA	2	6	321398	321403	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6250	NC_015222	ATT	2	6	321434	321439	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	325981149
6251	NC_015222	T	7	7	321500	321506	0 %	100 %	0 %	0 %	325981149
6252	NC_015222	ACG	2	6	321593	321598	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325981149
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6254	NC_015222	ATC	2	6	321662	321667	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325981149
6255	NC_015222	GCA	2	6	321708	321713	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325981149
6256	NC_015222	AAT	2	6	321716	321721	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	325981149
6257	NC_015222	CGT	2	6	321909	321914	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325981149
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6259	NC_015222	ATT	2	6	322023	322028	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	325981149
6260	NC_015222	GTTTTC	2	12	322035	322046	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	325981149
6261	NC_015222	CTT	2	6	322145	322150	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325981149
6262	NC_015222	GT	3	6	322253	322258	0 %	50 %	50 %	0 %	325981149
6263	NC_015222	T	7	7	322315	322321	0 %	100 %	0 %	0 %	325981149
6264	NC_015222	TATTT	2	10	322331	322340	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
6265	NC_015222	AT	3	6	322406	322411	50 %	50 %	0 %	0 %	325981150
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6270	NC_015222	TTGCC	2	10	322678	322687	0 %	40 %	20 %	40 %	325981150
6271	NC_015222	TTG	2	6	322706	322711	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	325981150
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6280	NC_015222	GCA	2	6	323154	323159	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325981150
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6283	NC_015222	GAA	2	6	323225	323230	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325981150
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6286	NC_015222	TCAAGC	2	12	323407	323418	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	325981150
6287	NC_015222	TTTC	2	8	323492	323499	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
6288	NC_015222	TAT	2	6	323589	323594	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	325981151
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6293	NC_015222	T	6	6	323964	323969	0 %	100 %	0 %	0 %	325981151
6294	NC_015222	TTGCT	2	10	324018	324027	0 %	60 %	20 %	20 %	325981151
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6296	NC_015222	ATGT	2	8	324068	324075	25 %	50 %	25 %	0 %	325981151
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6312	NC_015222	ATT	2	6	324759	324764	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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6314	NC_015222	CTG	2	6	324797	324802	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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6316	NC_015222	T	6	6	324850	324855	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6317	NC_015222	TA	4	8	324898	324905	50 %	50 %	0 %	0 %	325981152
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6320	NC_015222	GCT	2	6	324976	324981	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325981152
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6343	NC_015222	TCT	2	6	326298	326303	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325981153
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6349	NC_015222	TAA	2	6	326621	326626	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6350	NC_015222	A	6	6	326636	326641	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6351	NC_015222	A	6	6	326646	326651	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6352	NC_015222	TGA	2	6	326659	326664	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6353	NC_015222	T	6	6	326720	326725	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6354	NC_015222	AATG	2	8	326744	326751	50 %	25 %	25 %	0 %	325981154
6355	NC_015222	TAA	2	6	326783	326788	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	325981154
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6360	NC_015222	CGG	3	9	327072	327080	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325981154
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6364	NC_015222	T	6	6	327182	327187	0 %	100 %	0 %	0 %	325981154
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6366	NC_015222	TTG	2	6	327279	327284	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	325981154
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6372	NC_015222	A	6	6	327720	327725	100 %	0 %	0 %	0 %	325981154
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6496	NC_015222	TTG	2	6	333940	333945	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	325981160
6497	NC_015222	TGC	2	6	334004	334009	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325981160
6498	NC_015222	ATT	2	6	334036	334041	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	325981160
6499	NC_015222	CTG	2	6	334165	334170	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325981160
6500	NC_015222	ATT	2	6	334237	334242	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	325981160

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