MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Nitrosomonas sp. AL212 chromosome

Total Repeats: 62088

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5501	NC_015222	AGATG	2	10	283463	283472	40 %	20 %	40 %	0 %	325981118
5502	NC_015222	GAT	2	6	283485	283490	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325981118
5503	NC_015222	GCTT	2	8	283595	283602	0 %	50 %	25 %	25 %	325981118
5504	NC_015222	T	6	6	283608	283613	0 %	100 %	0 %	0 %	325981118
5505	NC_015222	GC	3	6	283635	283640	0 %	0 %	50 %	50 %	325981118
5506	NC_015222	GAT	2	6	283704	283709	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325981118
5507	NC_015222	CA	3	6	283761	283766	50 %	0 %	0 %	50 %	325981118
5508	NC_015222	GTG	2	6	283851	283856	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	325981118
5509	NC_015222	A	6	6	283921	283926	100 %	0 %	0 %	0 %	325981118
5510	NC_015222	AACA	2	8	283930	283937	75 %	0 %	0 %	25 %	325981118
5511	NC_015222	CGG	2	6	284029	284034	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325981118
5512	NC_015222	CGG	2	6	284047	284052	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325981118
5513	NC_015222	ATGA	2	8	284073	284080	50 %	25 %	25 %	0 %	325981118
5514	NC_015222	ACCAA	2	10	284182	284191	60 %	0 %	0 %	40 %	325981118
5515	NC_015222	GCA	2	6	284208	284213	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325981118
5516	NC_015222	CGG	2	6	284293	284298	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325981118
5517	NC_015222	CAAA	2	8	284306	284313	75 %	0 %	0 %	25 %	325981118
5518	NC_015222	ATTG	2	8	284321	284328	25 %	50 %	25 %	0 %	325981118
5519	NC_015222	TGC	2	6	284360	284365	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325981118
5520	NC_015222	GGA	2	6	284432	284437	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	325981118
5521	NC_015222	TAG	2	6	284470	284475	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325981118
5522	NC_015222	GGT	2	6	284522	284527	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	325981118
5523	NC_015222	GAA	2	6	284538	284543	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325981118
5524	NC_015222	TTC	2	6	284545	284550	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325981118
5525	NC_015222	ACC	2	6	284586	284591	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	325981118
5526	NC_015222	TCA	2	6	284850	284855	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325981119
5527	NC_015222	CCA	2	6	284990	284995	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	325981119
5528	NC_015222	TTTA	2	8	285008	285015	25 %	75 %	0 %	0 %	325981119
5529	NC_015222	GAA	2	6	285037	285042	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325981119
5530	NC_015222	CAG	2	6	285262	285267	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325981119
5531	NC_015222	GCA	2	6	285273	285278	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325981119
5532	NC_015222	TGG	2	6	285340	285345	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	325981119
5533	NC_015222	GGC	2	6	285348	285353	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325981119
5534	NC_015222	TGC	2	6	285371	285376	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325981119
5535	NC_015222	CGG	2	6	285409	285414	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325981119
5536	NC_015222	TGC	2	6	285450	285455	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325981119
5537	NC_015222	GCA	2	6	285744	285749	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325981119
5538	NC_015222	CGC	2	6	285761	285766	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325981119
5539	NC_015222	GAA	2	6	285835	285840	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325981119
5540	NC_015222	TGA	2	6	285869	285874	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325981119
5541	NC_015222	GAT	2	6	285889	285894	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325981119
5542	NC_015222	GCC	2	6	285906	285911	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325981119
5543	NC_015222	T	7	7	286002	286008	0 %	100 %	0 %	0 %	325981119
5544	NC_015222	T	6	6	286111	286116	0 %	100 %	0 %	0 %	325981119
5545	NC_015222	AGCG	2	8	286123	286130	25 %	0 %	50 %	25 %	325981119
5546	NC_015222	GC	3	6	286175	286180	0 %	0 %	50 %	50 %	325981119
5547	NC_015222	GA	3	6	286240	286245	50 %	0 %	50 %	0 %	325981119
5548	NC_015222	CTG	2	6	286246	286251	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325981119
5549	NC_015222	TGGA	2	8	286295	286302	25 %	25 %	50 %	0 %	325981119
5550	NC_015222	AGC	2	6	286306	286311	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325981119
5551	NC_015222	ATA	2	6	286433	286438	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	325981119
5552	NC_015222	GAAGCA	2	12	286468	286479	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	325981119
5553	NC_015222	ACA	2	6	286492	286497	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	325981119
5554	NC_015222	GAA	2	6	286537	286542	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325981119
5555	NC_015222	CCG	2	6	286598	286603	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325981119
5556	NC_015222	GCG	2	6	286626	286631	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325981119
5557	NC_015222	CG	3	6	286630	286635	0 %	0 %	50 %	50 %	325981119
5558	NC_015222	GGA	2	6	286674	286679	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	325981119
5559	NC_015222	GCGG	2	8	286854	286861	0 %	0 %	75 %	25 %	325981119
5560	NC_015222	GCT	2	6	286906	286911	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325981119
5561	NC_015222	ATC	2	6	286965	286970	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325981119
5562	NC_015222	GAA	2	6	287053	287058	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325981119
5563	NC_015222	ATT	2	6	287068	287073	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	325981119
5564	NC_015222	GCA	2	6	287084	287089	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325981119
5565	NC_015222	TGC	2	6	287141	287146	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325981119
5566	NC_015222	GCT	2	6	287148	287153	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325981119
5567	NC_015222	TGC	2	6	287265	287270	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325981119
5568	NC_015222	ATC	2	6	287299	287304	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325981119
5569	NC_015222	AGC	2	6	287305	287310	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325981119
5570	NC_015222	TAGCG	2	10	287370	287379	20 %	20 %	40 %	20 %	325981119
5571	NC_015222	TCA	2	6	287383	287388	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325981119
5572	NC_015222	TGA	2	6	287474	287479	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325981119
5573	NC_015222	CGT	2	6	287572	287577	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325981119
5574	NC_015222	CAA	2	6	287641	287646	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	325981119
5575	NC_015222	TGA	2	6	287733	287738	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325981119
5576	NC_015222	CAT	2	6	287773	287778	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325981119
5577	NC_015222	GAA	2	6	287785	287790	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325981119
5578	NC_015222	GCA	2	6	287799	287804	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325981119
5579	NC_015222	TCA	2	6	287810	287815	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325981119
5580	NC_015222	CCG	2	6	287817	287822	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325981119
5581	NC_015222	GCA	2	6	287826	287831	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325981119
5582	NC_015222	TAC	2	6	287881	287886	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325981119
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5584	NC_015222	C	6	6	287988	287993	0 %	0 %	0 %	100 %	325981119
5585	NC_015222	GAG	2	6	288034	288039	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	325981119
5586	NC_015222	ACA	2	6	288051	288056	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	325981119
5587	NC_015222	AGGA	2	8	288170	288177	50 %	0 %	50 %	0 %	325981119
5588	NC_015222	GATT	2	8	288188	288195	25 %	50 %	25 %	0 %	325981119
5589	NC_015222	AGG	2	6	288203	288208	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	325981119
5590	NC_015222	GAC	2	6	288214	288219	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325981119
5591	NC_015222	CGT	2	6	288230	288235	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325981119
5592	NC_015222	AAAC	2	8	288439	288446	75 %	0 %	0 %	25 %	325981119
5593	NC_015222	CAT	2	6	288475	288480	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325981119
5594	NC_015222	GGA	2	6	288495	288500	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	325981119
5595	NC_015222	A	8	8	288504	288511	100 %	0 %	0 %	0 %	325981119
5596	NC_015222	A	6	6	288544	288549	100 %	0 %	0 %	0 %	325981119
5597	NC_015222	GTG	2	6	288691	288696	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	325981119
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5599	NC_015222	CGGCGA	2	12	288756	288767	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	325981119
5600	NC_015222	A	8	8	288863	288870	100 %	0 %	0 %	0 %	325981119
5601	NC_015222	CAT	2	6	288888	288893	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325981119
5602	NC_015222	GTG	2	6	288961	288966	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	325981119
5603	NC_015222	ATC	2	6	289114	289119	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325981119
5604	NC_015222	TTC	2	6	289122	289127	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325981119
5605	NC_015222	AT	3	6	289175	289180	50 %	50 %	0 %	0 %	325981119
5606	NC_015222	AGA	2	6	289200	289205	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325981119
5607	NC_015222	T	6	6	289414	289419	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5608	NC_015222	ATT	2	6	289424	289429	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5609	NC_015222	T	6	6	289469	289474	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5610	NC_015222	TCT	2	6	289520	289525	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325981120
5611	NC_015222	GGC	2	6	289564	289569	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325981120
5612	NC_015222	GCT	2	6	289586	289591	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325981120
5613	NC_015222	CGAA	2	8	289939	289946	50 %	0 %	25 %	25 %	325981121
5614	NC_015222	TAT	2	6	290005	290010	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	325981121
5615	NC_015222	CAG	2	6	290095	290100	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325981121
5616	NC_015222	ATG	2	6	290107	290112	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325981121
5617	NC_015222	GGCA	2	8	290184	290191	25 %	0 %	50 %	25 %	325981121
5618	NC_015222	TGG	2	6	290196	290201	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	325981121
5619	NC_015222	ATA	2	6	290300	290305	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	325981121
5620	NC_015222	ATTCT	2	10	290384	290393	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
5621	NC_015222	GTG	2	6	290405	290410	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5622	NC_015222	A	6	6	290526	290531	100 %	0 %	0 %	0 %	325981122
5623	NC_015222	TGC	2	6	290549	290554	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325981122
5624	NC_015222	CGG	3	9	290570	290578	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325981122
5625	NC_015222	CTG	2	6	290587	290592	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325981122
5626	NC_015222	TGGC	2	8	290611	290618	0 %	25 %	50 %	25 %	325981122
5627	NC_015222	GGT	2	6	290676	290681	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	325981122
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5629	NC_015222	CTG	2	6	290794	290799	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325981122
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5631	NC_015222	GCT	2	6	290895	290900	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325981122
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5634	NC_015222	A	8	8	291011	291018	100 %	0 %	0 %	0 %	325981122
5635	NC_015222	TGC	2	6	291120	291125	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5636	NC_015222	GTCG	2	8	291237	291244	0 %	25 %	50 %	25 %	325981123
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5652	NC_015222	TGTT	2	8	292026	292033	0 %	75 %	25 %	0 %	325981123
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5659	NC_015222	TTCAT	2	10	292369	292378	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
5660	NC_015222	AAT	2	6	292432	292437	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5661	NC_015222	ACA	2	6	292446	292451	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5662	NC_015222	TATT	2	8	292464	292471	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
5663	NC_015222	TCA	2	6	292485	292490	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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5665	NC_015222	GGA	2	6	292603	292608	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5666	NC_015222	ACC	2	6	292633	292638	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	325981125
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5688	NC_015222	TTG	2	6	293651	293656	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5689	NC_015222	ATTGA	2	10	293662	293671	40 %	40 %	20 %	0 %	325981126
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5736	NC_015222	T	7	7	295801	295807	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5744	NC_015222	GAT	2	6	296067	296072	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325981128
5745	NC_015222	T	6	6	296088	296093	0 %	100 %	0 %	0 %	325981128
5746	NC_015222	T	6	6	296143	296148	0 %	100 %	0 %	0 %	325981128
5747	NC_015222	T	6	6	296170	296175	0 %	100 %	0 %	0 %	325981128
5748	NC_015222	CTTT	2	8	296230	296237	0 %	75 %	0 %	25 %	325981128
5749	NC_015222	AAAT	2	8	296279	296286	75 %	25 %	0 %	0 %	325981128
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5752	NC_015222	AGT	2	6	296363	296368	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325981128
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5755	NC_015222	GTA	2	6	296413	296418	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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5759	NC_015222	AGGT	2	8	296576	296583	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
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5761	NC_015222	TTCGT	2	10	296631	296640	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
5762	NC_015222	GAT	2	6	296641	296646	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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5765	NC_015222	AAAC	2	8	296751	296758	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
5766	NC_015222	T	6	6	296804	296809	0 %	100 %	0 %	0 %	325981129
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5789	NC_015222	AT	3	6	298244	298249	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5790	NC_015222	CAG	2	6	298342	298347	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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5793	NC_015222	ATA	2	6	298436	298441	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5850	NC_015222	ACCC	2	8	302064	302071	25 %	0 %	0 %	75 %	325981132
5851	NC_015222	ACC	2	6	302073	302078	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	325981132
5852	NC_015222	CATC	2	8	302103	302110	25 %	25 %	0 %	50 %	325981132
5853	NC_015222	CCA	2	6	302141	302146	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	325981132
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5856	NC_015222	AATT	2	8	302228	302235	50 %	50 %	0 %	0 %	325981133
5857	NC_015222	CAGC	2	8	302577	302584	25 %	0 %	25 %	50 %	325981133
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5863	NC_015222	A	6	6	302824	302829	100 %	0 %	0 %	0 %	325981133
5864	NC_015222	CACC	2	8	302860	302867	25 %	0 %	0 %	75 %	325981133
5865	NC_015222	AAT	2	6	302913	302918	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	325981133
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5867	NC_015222	CAG	2	6	303043	303048	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325981133
5868	NC_015222	GCT	2	6	303074	303079	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325981134
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5880	NC_015222	GAA	2	6	303668	303673	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5881	NC_015222	GAA	2	6	303715	303720	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325981135
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5990	NC_015222	A	6	6	308998	309003	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5991	NC_015222	GGTGG	2	10	309073	309082	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
5992	NC_015222	GAC	2	6	309149	309154	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5993	NC_015222	AAAT	2	8	309170	309177	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
5994	NC_015222	AGATC	2	10	309214	309223	40 %	20 %	20 %	20 %	325981141
5995	NC_015222	ACG	2	6	309306	309311	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325981141
5996	NC_015222	TGG	2	6	309345	309350	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	325981141
5997	NC_015222	AGC	2	6	309397	309402	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325981141
5998	NC_015222	GCG	2	6	309433	309438	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325981141
5999	NC_015222	CGC	2	6	309629	309634	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325981141
6000	NC_015222	TGT	3	9	309642	309650	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	325981141

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