MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Nitrosomonas sp. AL212 plasmid pNAL21202

Total Repeats: 90

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015221	AT	3	6	419	424	50 %	50 %	0 %	0 %	325980817
2	NC_015221	AT	3	6	461	466	50 %	50 %	0 %	0 %	325980817
3	NC_015221	TG	3	6	1004	1009	0 %	50 %	50 %	0 %	325980818
4	NC_015221	CA	3	6	1256	1261	50 %	0 %	0 %	50 %	325980818
5	NC_015221	CT	3	6	1669	1674	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
6	NC_015221	GC	3	6	1987	1992	0 %	0 %	50 %	50 %	325980819
7	NC_015221	GC	3	6	3097	3102	0 %	0 %	50 %	50 %	325980822
8	NC_015221	CG	3	6	3447	3452	0 %	0 %	50 %	50 %	325980822
9	NC_015221	GC	3	6	3861	3866	0 %	0 %	50 %	50 %	325980823
10	NC_015221	GC	3	6	4397	4402	0 %	0 %	50 %	50 %	325980823
11	NC_015221	AC	3	6	4944	4949	50 %	0 %	0 %	50 %	325980823
12	NC_015221	CT	3	6	7923	7928	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
13	NC_015221	AT	3	6	8498	8503	50 %	50 %	0 %	0 %	325980828
14	NC_015221	AT	3	6	8857	8862	50 %	50 %	0 %	0 %	325980829
15	NC_015221	GC	3	6	9530	9535	0 %	0 %	50 %	50 %	325980829
16	NC_015221	CG	3	6	9616	9621	0 %	0 %	50 %	50 %	325980829
17	NC_015221	TC	3	6	10412	10417	0 %	50 %	0 %	50 %	325980830
18	NC_015221	CG	3	6	12672	12677	0 %	0 %	50 %	50 %	325980833
19	NC_015221	TG	3	6	14939	14944	0 %	50 %	50 %	0 %	325980834
20	NC_015221	GC	3	6	14971	14976	0 %	0 %	50 %	50 %	325980834
21	NC_015221	GA	3	6	16414	16419	50 %	0 %	50 %	0 %	325980836
22	NC_015221	CG	3	6	17025	17030	0 %	0 %	50 %	50 %	325980836
23	NC_015221	GT	3	6	17041	17046	0 %	50 %	50 %	0 %	325980836
24	NC_015221	AT	3	6	17914	17919	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_015221	AT	3	6	21754	21759	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_015221	AC	3	6	22273	22278	50 %	0 %	0 %	50 %	325980843
27	NC_015221	AT	3	6	22385	22390	50 %	50 %	0 %	0 %	325980843
28	NC_015221	TA	3	6	23429	23434	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_015221	AT	3	6	23992	23997	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_015221	TA	3	6	24085	24090	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_015221	CT	3	6	24549	24554	0 %	50 %	0 %	50 %	325980846
32	NC_015221	CG	3	6	25014	25019	0 %	0 %	50 %	50 %	325980846
33	NC_015221	GA	3	6	25088	25093	50 %	0 %	50 %	0 %	325980846
34	NC_015221	CG	3	6	25357	25362	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
35	NC_015221	GT	3	6	26331	26336	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
36	NC_015221	TG	3	6	26633	26638	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
37	NC_015221	TG	3	6	26748	26753	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
38	NC_015221	AT	3	6	26956	26961	50 %	50 %	0 %	0 %	325980848
39	NC_015221	AG	3	6	27388	27393	50 %	0 %	50 %	0 %	325980848
40	NC_015221	TA	3	6	27889	27894	50 %	50 %	0 %	0 %	325980848
41	NC_015221	TG	3	6	27947	27952	0 %	50 %	50 %	0 %	325980848
42	NC_015221	GT	3	6	28341	28346	0 %	50 %	50 %	0 %	325980849
43	NC_015221	CT	3	6	29477	29482	0 %	50 %	0 %	50 %	325980851
44	NC_015221	TA	3	6	29632	29637	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_015221	AT	3	6	29687	29692	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_015221	TC	3	6	29727	29732	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
47	NC_015221	AC	3	6	30417	30422	50 %	0 %	0 %	50 %	325980853
48	NC_015221	AC	3	6	31937	31942	50 %	0 %	0 %	50 %	325980854
49	NC_015221	TG	3	6	31965	31970	0 %	50 %	50 %	0 %	325980854
50	NC_015221	CT	3	6	32794	32799	0 %	50 %	0 %	50 %	325980854
51	NC_015221	GC	3	6	32890	32895	0 %	0 %	50 %	50 %	325980854
52	NC_015221	GC	3	6	33167	33172	0 %	0 %	50 %	50 %	325980854
53	NC_015221	CG	3	6	33520	33525	0 %	0 %	50 %	50 %	325980854
54	NC_015221	GT	3	6	34033	34038	0 %	50 %	50 %	0 %	325980855
55	NC_015221	GC	3	6	34227	34232	0 %	0 %	50 %	50 %	325980855
56	NC_015221	GC	3	6	34992	34997	0 %	0 %	50 %	50 %	325980857
57	NC_015221	AT	4	8	35388	35395	50 %	50 %	0 %	0 %	325980857
58	NC_015221	TC	3	6	35496	35501	0 %	50 %	0 %	50 %	325980857
59	NC_015221	CA	4	8	36333	36340	50 %	0 %	0 %	50 %	325980857
60	NC_015221	CA	3	6	36671	36676	50 %	0 %	0 %	50 %	325980857
61	NC_015221	TG	3	6	41877	41882	0 %	50 %	50 %	0 %	325980862
62	NC_015221	TA	3	6	45124	45129	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_015221	TA	3	6	45171	45176	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_015221	TG	3	6	45724	45729	0 %	50 %	50 %	0 %	325980866
65	NC_015221	GC	4	8	46482	46489	0 %	0 %	50 %	50 %	325980866
66	NC_015221	TG	3	6	50156	50161	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
67	NC_015221	AC	3	6	50172	50177	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
68	NC_015221	TA	3	6	50524	50529	50 %	50 %	0 %	0 %	325980870
69	NC_015221	CG	3	6	51031	51036	0 %	0 %	50 %	50 %	325980870
70	NC_015221	CG	3	6	51066	51071	0 %	0 %	50 %	50 %	325980870
71	NC_015221	AC	3	6	51090	51095	50 %	0 %	0 %	50 %	325980870
72	NC_015221	TC	3	6	51787	51792	0 %	50 %	0 %	50 %	325980870
73	NC_015221	AG	3	6	53065	53070	50 %	0 %	50 %	0 %	325980871
74	NC_015221	TC	3	6	53276	53281	0 %	50 %	0 %	50 %	325980871
75	NC_015221	CG	3	6	55204	55209	0 %	0 %	50 %	50 %	325980872
76	NC_015221	GC	3	6	55454	55459	0 %	0 %	50 %	50 %	325980872
77	NC_015221	CA	3	6	55652	55657	50 %	0 %	0 %	50 %	325980872
78	NC_015221	AC	3	6	56188	56193	50 %	0 %	0 %	50 %	325980872
79	NC_015221	GC	3	6	56238	56243	0 %	0 %	50 %	50 %	325980872
80	NC_015221	AT	3	6	56767	56772	50 %	50 %	0 %	0 %	325980873
81	NC_015221	CG	3	6	57302	57307	0 %	0 %	50 %	50 %	325980873
82	NC_015221	CA	3	6	57511	57516	50 %	0 %	0 %	50 %	325980873
83	NC_015221	GC	3	6	58797	58802	0 %	0 %	50 %	50 %	325980874
84	NC_015221	CG	3	6	59000	59005	0 %	0 %	50 %	50 %	325980874
85	NC_015221	AG	3	6	60266	60271	50 %	0 %	50 %	0 %	325980876
86	NC_015221	CA	4	8	60550	60557	50 %	0 %	0 %	50 %	325980876
87	NC_015221	CG	3	6	61694	61699	0 %	0 %	50 %	50 %	325980878
88	NC_015221	GT	3	6	62576	62581	0 %	50 %	50 %	0 %	325980878
89	NC_015221	GA	3	6	63139	63144	50 %	0 %	50 %	0 %	325980879
90	NC_015221	TA	3	6	63659	63664	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.