MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Nitrosomonas sp. AL212 plasmid pNAL21202

Total Repeats: 49

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015221	GGCTA	2	10	2035	2044	20 %	20 %	40 %	20 %	325980819
2	NC_015221	GCGCG	2	10	2408	2417	0 %	0 %	60 %	40 %	325980820
3	NC_015221	CGGCG	2	10	2552	2561	0 %	0 %	60 %	40 %	325980820
4	NC_015221	ATCAG	2	10	6205	6214	40 %	20 %	20 %	20 %	325980825
5	NC_015221	ACTTT	2	10	7548	7557	20 %	60 %	0 %	20 %	325980826
6	NC_015221	CCCTG	2	10	9508	9517	0 %	20 %	20 %	60 %	325980829
7	NC_015221	TTCTT	2	10	10169	10178	0 %	80 %	0 %	20 %	325980830
8	NC_015221	CCCTG	2	10	11216	11225	0 %	20 %	20 %	60 %	325980831
9	NC_015221	CCAAT	2	10	11523	11532	40 %	20 %	0 %	40 %	325980831
10	NC_015221	TCCAG	2	10	13568	13577	20 %	20 %	20 %	40 %	325980833
11	NC_015221	GTGTG	2	10	16035	16044	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
12	NC_015221	ATTCT	2	10	17244	17253	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
13	NC_015221	TCAGT	2	10	18178	18187	20 %	40 %	20 %	20 %	325980837
14	NC_015221	CAGCT	2	10	18221	18230	20 %	20 %	20 %	40 %	325980837
15	NC_015221	AATTA	2	10	18278	18287	60 %	40 %	0 %	0 %	325980837
16	NC_015221	TTGAT	2	10	18793	18802	20 %	60 %	20 %	0 %	325980839
17	NC_015221	AAAGA	2	10	19514	19523	80 %	0 %	20 %	0 %	325980839
18	NC_015221	ATTTG	2	10	19733	19742	20 %	60 %	20 %	0 %	325980839
19	NC_015221	ATAAA	2	10	20149	20158	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_015221	GAAAT	2	10	20668	20677	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
21	NC_015221	TTAAT	2	10	21270	21279	40 %	60 %	0 %	0 %	325980842
22	NC_015221	AAAAG	2	10	22453	22462	80 %	0 %	20 %	0 %	325980844
23	NC_015221	CTTAG	2	10	25124	25133	20 %	40 %	20 %	20 %	325980846
24	NC_015221	AAAGC	2	10	25780	25789	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
25	NC_015221	GTAAA	2	10	26068	26077	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
26	NC_015221	TCGAT	2	10	28128	28137	20 %	40 %	20 %	20 %	325980849
27	NC_015221	GCAGG	2	10	28850	28859	20 %	0 %	60 %	20 %	325980850
28	NC_015221	GTTTA	2	10	29593	29602	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
29	NC_015221	TCACA	2	10	29793	29802	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
30	NC_015221	CAATT	2	10	32014	32023	40 %	40 %	0 %	20 %	325980854
31	NC_015221	ATTTT	2	10	32143	32152	20 %	80 %	0 %	0 %	325980854
32	NC_015221	CGATC	2	10	32970	32979	20 %	20 %	20 %	40 %	325980854
33	NC_015221	ATCTG	2	10	33281	33290	20 %	40 %	20 %	20 %	325980854
34	NC_015221	TTCTG	2	10	33791	33800	0 %	60 %	20 %	20 %	325980855
35	NC_015221	ATCAA	2	10	35459	35468	60 %	20 %	0 %	20 %	325980857
36	NC_015221	TGGTT	2	10	38993	39002	0 %	60 %	40 %	0 %	325980859
37	NC_015221	CGCCA	2	10	40811	40820	20 %	0 %	20 %	60 %	325980860
38	NC_015221	GGAAT	2	10	43407	43416	40 %	20 %	40 %	0 %	325980864
39	NC_015221	TACCT	2	10	44080	44089	20 %	40 %	0 %	40 %	325980864
40	NC_015221	ACAGC	2	10	45189	45198	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
41	NC_015221	GTCTT	2	10	45656	45665	0 %	60 %	20 %	20 %	325980866
42	NC_015221	CACCG	2	10	46921	46930	20 %	0 %	20 %	60 %	325980866
43	NC_015221	ACTTC	2	10	47538	47547	20 %	40 %	0 %	40 %	325980867
44	NC_015221	TAATT	2	10	47935	47944	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_015221	TGATT	2	10	49608	49617	20 %	60 %	20 %	0 %	325980869
46	NC_015221	ACACC	2	10	57590	57599	40 %	0 %	0 %	60 %	325980873
47	NC_015221	AATCA	2	10	57804	57813	60 %	20 %	0 %	20 %	325980873
48	NC_015221	TGCAA	2	10	58840	58849	40 %	20 %	20 %	20 %	325980874
49	NC_015221	GAAAT	2	10	59919	59928	60 %	20 %	20 %	0 %	325980875

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.