MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Nitratifractor salsuginis DSM 16511 chromosome

Total Repeats: 30314

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014935	ATC	2	6	129	134	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	319955761
2	NC_014935	CGC	2	6	251	256	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	319955761
3	NC_014935	GCA	2	6	268	273	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	319955761
4	NC_014935	AGG	2	6	344	349	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	319955761
5	NC_014935	TCG	2	6	448	453	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	319955761
6	NC_014935	CAA	2	6	638	643	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	319955761
7	NC_014935	CGA	2	6	719	724	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	319955761
8	NC_014935	AGA	2	6	748	753	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	319955761
9	NC_014935	CAT	2	6	929	934	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	319955761
10	NC_014935	AAG	2	6	939	944	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	319955761
11	NC_014935	ATC	2	6	978	983	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	319955761
12	NC_014935	CGA	2	6	1145	1150	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	319955761
13	NC_014935	CGT	2	6	1223	1228	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	319955761
14	NC_014935	ACG	2	6	1235	1240	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	319955761
15	NC_014935	CCG	2	6	1321	1326	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	319955761
16	NC_014935	TGA	2	6	1367	1372	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	319955761
17	NC_014935	TCC	2	6	1384	1389	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	319955761
18	NC_014935	CGA	2	6	1391	1396	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	319955761
19	NC_014935	CTA	2	6	1560	1565	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
20	NC_014935	TCA	2	6	1636	1641	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	319955762
21	NC_014935	GAA	2	6	1661	1666	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	319955762
22	NC_014935	ATC	2	6	1827	1832	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	319955762
23	NC_014935	TGA	2	6	1882	1887	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	319955762
24	NC_014935	CAG	2	6	1893	1898	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	319955762
25	NC_014935	CCT	2	6	1942	1947	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	319955762
26	NC_014935	CAA	2	6	2036	2041	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	319955762
27	NC_014935	TGG	2	6	2098	2103	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	319955762
28	NC_014935	CCA	2	6	2131	2136	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	319955762
29	NC_014935	CAA	2	6	2141	2146	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	319955762
30	NC_014935	TCC	2	6	2170	2175	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	319955762
31	NC_014935	ACG	2	6	2233	2238	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	319955762
32	NC_014935	ATC	2	6	2250	2255	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	319955762
33	NC_014935	ACG	2	6	2260	2265	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	319955762
34	NC_014935	TCA	2	6	2287	2292	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	319955762
35	NC_014935	ACC	2	6	2391	2396	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	319955762
36	NC_014935	CGA	2	6	2456	2461	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	319955762
37	NC_014935	TCT	2	6	2540	2545	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	319955762
38	NC_014935	ATC	2	6	2640	2645	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	319955762
39	NC_014935	TAT	2	6	2651	2656	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	319955762
40	NC_014935	CAA	2	6	2686	2691	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	319955763
41	NC_014935	CTC	2	6	2770	2775	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	319955763
42	NC_014935	CAA	2	6	2949	2954	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	319955763
43	NC_014935	CAC	2	6	2958	2963	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	319955763
44	NC_014935	GGT	2	6	3030	3035	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	319955763
45	NC_014935	TCG	2	6	3044	3049	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	319955763
46	NC_014935	CCG	2	6	3069	3074	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	319955763
47	NC_014935	ACC	2	6	3118	3123	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	319955763
48	NC_014935	GCA	2	6	3185	3190	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	319955763
49	NC_014935	TGA	2	6	3194	3199	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	319955763
50	NC_014935	CCT	2	6	3213	3218	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	319955763
51	NC_014935	GCG	2	6	3232	3237	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	319955763
52	NC_014935	GCG	2	6	3282	3287	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	319955763
53	NC_014935	GAA	2	6	3348	3353	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	319955763
54	NC_014935	AGC	2	6	3473	3478	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	319955763
55	NC_014935	GCA	2	6	3528	3533	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	319955763
56	NC_014935	CGA	2	6	3549	3554	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	319955763
57	NC_014935	TCG	2	6	3734	3739	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	319955763
58	NC_014935	AGA	2	6	3803	3808	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	319955763
59	NC_014935	CGA	2	6	3903	3908	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	319955763
60	NC_014935	ACC	2	6	3982	3987	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	319955763
61	NC_014935	GGA	2	6	4053	4058	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	319955763
62	NC_014935	AGC	2	6	4127	4132	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	319955763
63	NC_014935	TTG	2	6	4280	4285	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	319955763
64	NC_014935	AGC	2	6	4298	4303	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	319955763
65	NC_014935	GCT	2	6	4358	4363	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	319955764
66	NC_014935	CGA	2	6	4376	4381	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	319955764
67	NC_014935	GCG	2	6	4535	4540	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	319955764
68	NC_014935	TTC	2	6	4542	4547	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	319955764
69	NC_014935	CGC	2	6	4673	4678	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	319955764
70	NC_014935	GCG	2	6	4686	4691	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	319955764
71	NC_014935	ACC	2	6	4732	4737	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	319955764
72	NC_014935	CGC	2	6	4756	4761	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	319955764
73	NC_014935	CCG	2	6	4862	4867	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	319955764
74	NC_014935	ATC	2	6	4920	4925	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	319955764
75	NC_014935	GCA	2	6	4943	4948	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	319955764
76	NC_014935	CCT	2	6	4982	4987	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	319955764
77	NC_014935	TCG	2	6	5011	5016	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	319955764
78	NC_014935	GGA	2	6	5105	5110	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	319955764
79	NC_014935	AGG	2	6	5152	5157	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	319955764
80	NC_014935	AGG	2	6	5227	5232	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	319955764
81	NC_014935	TCG	2	6	5308	5313	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	319955764
82	NC_014935	CCT	2	6	5371	5376	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	319955764
83	NC_014935	AGC	2	6	5515	5520	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	319955764
84	NC_014935	GCA	2	6	5726	5731	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	319955764
85	NC_014935	AGG	2	6	5767	5772	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	319955764
86	NC_014935	AAG	2	6	5941	5946	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
87	NC_014935	TAA	2	6	5959	5964	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_014935	ATA	2	6	5984	5989	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_014935	CAG	2	6	6078	6083	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	319955765
90	NC_014935	TTG	2	6	6195	6200	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	319955765
91	NC_014935	TCG	2	6	6228	6233	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	319955765
92	NC_014935	ACT	2	6	6279	6284	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	319955765
93	NC_014935	GAC	2	6	6295	6300	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	319955765
94	NC_014935	AAG	2	6	6302	6307	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	319955765
95	NC_014935	AAG	3	9	6311	6319	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	319955765
96	NC_014935	TGA	2	6	6358	6363	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	319955765
97	NC_014935	GTC	2	6	6485	6490	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	319955765
98	NC_014935	CGC	2	6	6530	6535	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	319955765
99	NC_014935	GAA	2	6	6550	6555	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	319955765
100	NC_014935	TCT	2	6	6594	6599	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	319955765
101	NC_014935	CAT	2	6	6916	6921	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
102	NC_014935	GGC	2	6	7171	7176	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	319955766
103	NC_014935	TCT	2	6	7179	7184	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	319955766
104	NC_014935	GGC	3	9	7477	7485	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	319955766
105	NC_014935	CCG	2	6	7488	7493	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	319955766
106	NC_014935	TCG	2	6	7610	7615	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	319955766
107	NC_014935	GCC	2	6	7640	7645	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	319955766
108	NC_014935	CGG	2	6	7650	7655	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	319955766
109	NC_014935	GAT	2	6	7699	7704	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	319955766
110	NC_014935	GGC	2	6	7798	7803	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	319955766
111	NC_014935	CTC	2	6	7917	7922	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	319955767
112	NC_014935	AGT	2	6	8004	8009	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	319955767
113	NC_014935	GGC	2	6	8124	8129	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	319955767
114	NC_014935	GCC	2	6	8185	8190	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	319955767
115	NC_014935	TCC	2	6	8290	8295	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	319955767
116	NC_014935	GAT	2	6	8409	8414	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	319955767
117	NC_014935	GCC	2	6	8448	8453	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	319955767
118	NC_014935	CGG	2	6	8459	8464	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	319955767
119	NC_014935	GGA	2	6	8481	8486	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	319955767
120	NC_014935	TCC	2	6	8599	8604	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	319955767
121	NC_014935	TGT	2	6	8804	8809	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	319955767
122	NC_014935	GCG	2	6	8872	8877	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	319955767
123	NC_014935	GCC	2	6	8986	8991	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	319955767
124	NC_014935	GTT	2	6	9063	9068	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	319955767
125	NC_014935	CCT	2	6	9096	9101	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
126	NC_014935	TCT	2	6	9155	9160	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
127	NC_014935	AGC	2	6	9283	9288	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
128	NC_014935	GCT	2	6	9342	9347	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
129	NC_014935	TGA	2	6	9562	9567	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	319955768
130	NC_014935	GGT	2	6	9632	9637	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	319955768
131	NC_014935	CGC	2	6	9655	9660	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	319955768
132	NC_014935	CGA	2	6	9817	9822	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	319955768
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255	NC_014935	GCC	2	6	18356	18361	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	319955776
256	NC_014935	CAT	2	6	18376	18381	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	319955776
257	NC_014935	TCG	2	6	18405	18410	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	319955777
258	NC_014935	GGC	2	6	18435	18440	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	319955777
259	NC_014935	CTG	2	6	18555	18560	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	319955777
260	NC_014935	CTT	2	6	18567	18572	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	319955777
261	NC_014935	GGC	2	6	18603	18608	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	319955777
262	NC_014935	GTA	2	6	18612	18617	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	319955777
263	NC_014935	GGC	3	9	18657	18665	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	319955777
264	NC_014935	ATC	2	6	18691	18696	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	319955777
265	NC_014935	GCA	2	6	18701	18706	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	319955777
266	NC_014935	GGT	2	6	18708	18713	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	319955777
267	NC_014935	CAG	2	6	18738	18743	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	319955777
268	NC_014935	AGA	2	6	18773	18778	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	319955777
269	NC_014935	AGG	2	6	18944	18949	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	319955777
270	NC_014935	GCG	2	6	19067	19072	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	319955777
271	NC_014935	TGA	2	6	19157	19162	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	319955777
272	NC_014935	AGG	2	6	19219	19224	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	319955777
273	NC_014935	GAG	2	6	19353	19358	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	319955777
274	NC_014935	ATC	2	6	19387	19392	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	319955777
275	NC_014935	CAG	2	6	19458	19463	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	319955777
276	NC_014935	AGA	2	6	19481	19486	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	319955777
277	NC_014935	GGT	2	6	19597	19602	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	319955778
278	NC_014935	AGG	2	6	19684	19689	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	319955778
279	NC_014935	CGC	2	6	19696	19701	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	319955778
280	NC_014935	TGA	2	6	19777	19782	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	319955778
281	NC_014935	TTC	2	6	19955	19960	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	319955778
282	NC_014935	TCT	2	6	19978	19983	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	319955778
283	NC_014935	CGG	2	6	19984	19989	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	319955778
284	NC_014935	TCA	2	6	20084	20089	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
285	NC_014935	ATT	2	6	20132	20137	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
286	NC_014935	CCT	2	6	20239	20244	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	319955779
287	NC_014935	TGA	2	6	20356	20361	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	319955779
288	NC_014935	CTT	2	6	20494	20499	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	319955779
289	NC_014935	AGG	2	6	20553	20558	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	319955779
290	NC_014935	CAG	2	6	20591	20596	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	319955779
291	NC_014935	GCG	2	6	20597	20602	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	319955779
292	NC_014935	CCT	2	6	20735	20740	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	319955780
293	NC_014935	GAG	3	9	20799	20807	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	319955780
294	NC_014935	GGA	2	6	20867	20872	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	319955780
295	NC_014935	GTC	2	6	21006	21011	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	319955780
296	NC_014935	GAG	3	9	21048	21056	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	319955780
297	NC_014935	GGA	2	6	21105	21110	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	319955780
298	NC_014935	TTG	2	6	21123	21128	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	319955780
299	NC_014935	GGC	2	6	21160	21165	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	319955780
300	NC_014935	TGA	2	6	21256	21261	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	319955780
301	NC_014935	TGG	2	6	21277	21282	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	319955780
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303	NC_014935	ATT	3	9	21523	21531	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
304	NC_014935	AGG	2	6	21728	21733	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	319955781
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313	NC_014935	AGG	2	6	22440	22445	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	319955782
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319	NC_014935	GAT	2	6	22573	22578	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	319955782
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324	NC_014935	GAG	2	6	22751	22756	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	319955782
325	NC_014935	TCC	2	6	22872	22877	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	319955782
326	NC_014935	TCT	2	6	23007	23012	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
327	NC_014935	AGA	2	6	23188	23193	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	319955783
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329	NC_014935	GAC	2	6	23315	23320	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	319955783
330	NC_014935	CAT	2	6	23360	23365	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	319955783
331	NC_014935	GGA	2	6	23405	23410	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	319955783
332	NC_014935	CGG	2	6	23503	23508	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	319955783
333	NC_014935	GCT	2	6	23510	23515	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	319955783
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369	NC_014935	TCC	2	6	25889	25894	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	319955785
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371	NC_014935	AAG	2	6	26088	26093	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	319955785
372	NC_014935	GCT	2	6	26147	26152	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	319955785
373	NC_014935	CGA	2	6	26161	26166	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	319955785
374	NC_014935	ACG	2	6	26404	26409	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	319955785
375	NC_014935	CGT	2	6	26430	26435	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	319955785
376	NC_014935	TGC	2	6	26527	26532	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	319955785
377	NC_014935	AGG	2	6	26569	26574	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	319955785
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