MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Nitrosococcus watsonii C-113 chromosome

Total Repeats: 2283

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014315	AATTA	2	10	3053	3062	60 %	40 %	0 %	0 %	300112747
2	NC_014315	TTTTG	2	10	6736	6745	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
3	NC_014315	GGCCC	2	10	7384	7393	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
4	NC_014315	TCATT	2	10	7914	7923	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
5	NC_014315	TAGAG	2	10	8668	8677	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
6	NC_014315	AAACG	2	10	10211	10220	60 %	0 %	20 %	20 %	300112750
7	NC_014315	GGGTA	2	10	10565	10574	20 %	20 %	60 %	0 %	300112750
8	NC_014315	TTATC	2	10	12408	12417	20 %	60 %	0 %	20 %	300112751
9	NC_014315	GTACG	2	10	13988	13997	20 %	20 %	40 %	20 %	300112753
10	NC_014315	CGGGA	2	10	14773	14782	20 %	0 %	60 %	20 %	300112754
11	NC_014315	GGGTT	2	10	21508	21517	0 %	40 %	60 %	0 %	300112760
12	NC_014315	AGGGT	2	10	23626	23635	20 %	20 %	60 %	0 %	300112762
13	NC_014315	AGAGG	2	10	24158	24167	40 %	0 %	60 %	0 %	300112762
14	NC_014315	TCTGT	2	10	25023	25032	0 %	60 %	20 %	20 %	300112763
15	NC_014315	TAGGA	2	10	26497	26506	40 %	20 %	40 %	0 %	300112763
16	NC_014315	TCCAT	2	10	29890	29899	20 %	40 %	0 %	40 %	300112766
17	NC_014315	TTTTC	2	10	30864	30873	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
18	NC_014315	ACGGG	2	10	34173	34182	20 %	0 %	60 %	20 %	300112771
19	NC_014315	GGCAT	2	10	35359	35368	20 %	20 %	40 %	20 %	300112772
20	NC_014315	AACCA	2	10	35388	35397	60 %	0 %	0 %	40 %	300112772
21	NC_014315	GTTTT	2	10	35924	35933	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
22	NC_014315	GCAGC	2	10	36391	36400	20 %	0 %	40 %	40 %	300112773
23	NC_014315	TTTAG	2	10	36912	36921	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
24	NC_014315	AGGCT	2	10	38266	38275	20 %	20 %	40 %	20 %	300112776
25	NC_014315	ACGAT	2	10	43719	43728	40 %	20 %	20 %	20 %	300112781
26	NC_014315	ATCGT	2	10	43932	43941	20 %	40 %	20 %	20 %	300112781
27	NC_014315	CGAAT	2	10	52760	52769	40 %	20 %	20 %	20 %	300112787
28	NC_014315	CCGCT	2	10	53233	53242	0 %	20 %	20 %	60 %	300112788
29	NC_014315	CTCAG	2	10	55024	55033	20 %	20 %	20 %	40 %	300112788
30	NC_014315	TATCT	2	10	56541	56550	20 %	60 %	0 %	20 %	300112789
31	NC_014315	TTGCT	2	10	57200	57209	0 %	60 %	20 %	20 %	300112789
32	NC_014315	GGGTT	2	10	57434	57443	0 %	40 %	60 %	0 %	300112789
33	NC_014315	TTCCA	2	10	58636	58645	20 %	40 %	0 %	40 %	300112790
34	NC_014315	AGGCA	2	10	58777	58786	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
35	NC_014315	CAAGT	2	10	59082	59091	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
36	NC_014315	GCCAC	2	10	61345	61354	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
37	NC_014315	TGGTG	2	10	63359	63368	0 %	40 %	60 %	0 %	300112792
38	NC_014315	GTTTG	2	10	63487	63496	0 %	60 %	40 %	0 %	300112792
39	NC_014315	GAGTA	2	10	66253	66262	40 %	20 %	40 %	0 %	300112793
40	NC_014315	CCCTG	2	10	66301	66310	0 %	20 %	20 %	60 %	300112793
41	NC_014315	CATCA	2	10	68675	68684	40 %	20 %	0 %	40 %	300112793
42	NC_014315	CGGCT	2	10	69390	69399	0 %	20 %	40 %	40 %	300112793
43	NC_014315	TTGAT	2	10	69729	69738	20 %	60 %	20 %	0 %	300112793
44	NC_014315	GATAT	2	10	71957	71966	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
45	NC_014315	TCGCG	2	10	75752	75761	0 %	20 %	40 %	40 %	300112801
46	NC_014315	CAAGC	2	10	76739	76748	40 %	0 %	20 %	40 %	300112804
47	NC_014315	AGAGC	2	10	77891	77900	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
48	NC_014315	GCTTA	2	10	78223	78232	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
49	NC_014315	GCGCC	2	10	81682	81691	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
50	NC_014315	GCGTT	2	10	82167	82176	0 %	40 %	40 %	20 %	300112810
51	NC_014315	ACGCT	2	10	83623	83632	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
52	NC_014315	GGAAA	2	10	84118	84127	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
53	NC_014315	TACGG	2	10	85473	85482	20 %	20 %	40 %	20 %	300112811
54	NC_014315	CATAG	2	10	88987	88996	40 %	20 %	20 %	20 %	300112815
55	NC_014315	CCATG	2	10	90491	90500	20 %	20 %	20 %	40 %	300112816
56	NC_014315	AAGCG	2	10	90935	90944	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
57	NC_014315	TGCAA	2	10	91605	91614	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
58	NC_014315	CGCTC	2	10	92270	92279	0 %	20 %	20 %	60 %	300112818
59	NC_014315	TTCCC	2	10	93452	93461	0 %	40 %	0 %	60 %	300112819
60	NC_014315	CGTCT	2	10	93632	93641	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
61	NC_014315	TCCCA	2	10	96863	96872	20 %	20 %	0 %	60 %	300112821
62	NC_014315	ATCGG	2	10	100368	100377	20 %	20 %	40 %	20 %	300112823
63	NC_014315	AGCCG	2	10	101392	101401	20 %	0 %	40 %	40 %	300112824
64	NC_014315	GCGTT	2	10	102262	102271	0 %	40 %	40 %	20 %	300112824
65	NC_014315	GATGC	2	10	108452	108461	20 %	20 %	40 %	20 %	300112829
66	NC_014315	TGGCA	2	10	111505	111514	20 %	20 %	40 %	20 %	300112832
67	NC_014315	ATTAT	2	10	112746	112755	40 %	60 %	0 %	0 %	300112833
68	NC_014315	GCATG	2	10	115353	115362	20 %	20 %	40 %	20 %	300112835
69	NC_014315	GTACC	2	10	116669	116678	20 %	20 %	20 %	40 %	300112837
70	NC_014315	GGAAG	2	10	117712	117721	40 %	0 %	60 %	0 %	300112838
71	NC_014315	TTCCA	2	10	118249	118258	20 %	40 %	0 %	40 %	300112839
72	NC_014315	TGAAA	2	10	120793	120802	60 %	20 %	20 %	0 %	300112839
73	NC_014315	CTGTC	2	10	121253	121262	0 %	40 %	20 %	40 %	300112839
74	NC_014315	GATGG	2	10	121389	121398	20 %	20 %	60 %	0 %	300112839
75	NC_014315	AATCA	2	10	121717	121726	60 %	20 %	0 %	20 %	300112839
76	NC_014315	GTTTG	2	10	123524	123533	0 %	60 %	40 %	0 %	300112840
77	NC_014315	TGCTG	2	10	123767	123776	0 %	40 %	40 %	20 %	300112840
78	NC_014315	TCCAT	2	10	123890	123899	20 %	40 %	0 %	40 %	300112840
79	NC_014315	ATTTT	2	10	126768	126777	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_014315	CTTGG	2	10	130117	130126	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
81	NC_014315	ACTTA	2	10	132909	132918	40 %	40 %	0 %	20 %	300112848
82	NC_014315	GCAGG	2	10	133522	133531	20 %	0 %	60 %	20 %	300112848
83	NC_014315	GAGAT	2	10	133864	133873	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
84	NC_014315	ATGGG	2	10	133977	133986	20 %	20 %	60 %	0 %	300112849
85	NC_014315	CCTCT	2	10	137323	137332	0 %	40 %	0 %	60 %	300112853
86	NC_014315	GCGAG	2	10	138377	138386	20 %	0 %	60 %	20 %	300112855
87	NC_014315	TTGGG	2	10	139492	139501	0 %	40 %	60 %	0 %	300112857
88	NC_014315	CAGGC	2	10	139708	139717	20 %	0 %	40 %	40 %	300112857
89	NC_014315	CGATG	2	10	142884	142893	20 %	20 %	40 %	20 %	300112860
90	NC_014315	CGTCA	2	10	143603	143612	20 %	20 %	20 %	40 %	300112861
91	NC_014315	TGTTT	2	10	143917	143926	0 %	80 %	20 %	0 %	300112861
92	NC_014315	TGGGC	2	10	144365	144374	0 %	20 %	60 %	20 %	300112862
93	NC_014315	AATGC	2	10	146447	146456	40 %	20 %	20 %	20 %	300112864
94	NC_014315	ATCAG	2	10	148205	148214	40 %	20 %	20 %	20 %	300112865
95	NC_014315	GACCG	2	10	148588	148597	20 %	0 %	40 %	40 %	300112865
96	NC_014315	TATTG	2	10	151761	151770	20 %	60 %	20 %	0 %	300112866
97	NC_014315	ATTAT	2	10	151808	151817	40 %	60 %	0 %	0 %	300112866
98	NC_014315	GCATC	2	10	153073	153082	20 %	20 %	20 %	40 %	300112868
99	NC_014315	GATGA	2	10	155275	155284	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
100	NC_014315	TGGGT	2	10	155975	155984	0 %	40 %	60 %	0 %	300112870
101	NC_014315	CCTAG	2	10	160784	160793	20 %	20 %	20 %	40 %	300112873
102	NC_014315	GGAAG	2	10	160891	160900	40 %	0 %	60 %	0 %	300112873
103	NC_014315	GCATC	2	10	164305	164314	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
104	NC_014315	CGCTG	2	10	164576	164585	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
105	NC_014315	TGGTC	2	10	168934	168943	0 %	40 %	40 %	20 %	300112877
106	NC_014315	TGCTT	2	10	169714	169723	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
107	NC_014315	ATTTA	2	10	169827	169836	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_014315	CTTAT	2	10	171250	171259	20 %	60 %	0 %	20 %	300112879
109	NC_014315	CCAGG	2	10	176956	176965	20 %	0 %	40 %	40 %	300112889
110	NC_014315	AATTC	2	10	177256	177265	40 %	40 %	0 %	20 %	300112889
111	NC_014315	ATGAA	2	10	177782	177791	60 %	20 %	20 %	0 %	300112890
112	NC_014315	TATGC	2	10	177886	177895	20 %	40 %	20 %	20 %	300112890
113	NC_014315	ATGAA	2	10	181400	181409	60 %	20 %	20 %	0 %	300112891
114	NC_014315	TTGCC	2	10	182306	182315	0 %	40 %	20 %	40 %	300112892
115	NC_014315	ATTTT	2	10	182698	182707	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_014315	GAAAC	2	10	183248	183257	60 %	0 %	20 %	20 %	300112893
117	NC_014315	TCTAA	2	10	183709	183718	40 %	40 %	0 %	20 %	300112893
118	NC_014315	TTGCT	2	10	184171	184180	0 %	60 %	20 %	20 %	300112894
119	NC_014315	TGGCT	2	10	184504	184513	0 %	40 %	40 %	20 %	300112894
120	NC_014315	GGGAA	2	10	184858	184867	40 %	0 %	60 %	0 %	300112894
121	NC_014315	GCCGC	2	10	185125	185134	0 %	0 %	40 %	60 %	300112895
122	NC_014315	TATGC	2	10	186328	186337	20 %	40 %	20 %	20 %	300112896
123	NC_014315	CGCTG	2	10	187567	187576	0 %	20 %	40 %	40 %	300112897
124	NC_014315	GGTAA	2	10	189575	189584	40 %	20 %	40 %	0 %	300112899
125	NC_014315	TGGAC	2	10	189657	189666	20 %	20 %	40 %	20 %	300112899
126	NC_014315	TCAAG	2	10	195743	195752	40 %	20 %	20 %	20 %	300112908
127	NC_014315	CTTGC	2	10	200507	200516	0 %	40 %	20 %	40 %	300112913
128	NC_014315	ATGGC	2	10	200682	200691	20 %	20 %	40 %	20 %	300112913
129	NC_014315	TTTGC	2	10	201635	201644	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
130	NC_014315	CCATG	2	10	202531	202540	20 %	20 %	20 %	40 %	300112914
131	NC_014315	AGCCC	2	10	203552	203561	20 %	0 %	20 %	60 %	300112914
132	NC_014315	CTATC	2	10	204282	204291	20 %	40 %	0 %	40 %	300112915
133	NC_014315	TGTGG	2	10	206254	206263	0 %	40 %	60 %	0 %	300112917
134	NC_014315	GGCCC	2	10	206611	206620	0 %	0 %	40 %	60 %	300112918
135	NC_014315	GATCC	2	10	208654	208663	20 %	20 %	20 %	40 %	300112918
136	NC_014315	TTTAT	2	10	210119	210128	20 %	80 %	0 %	0 %	300112919
137	NC_014315	TTCCC	2	10	211493	211502	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
138	NC_014315	AAAAT	2	10	211906	211915	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_014315	ATTCC	2	10	217741	217750	20 %	40 %	0 %	40 %	300112928
140	NC_014315	TGGTC	2	10	218174	218183	0 %	40 %	40 %	20 %	300112929
141	NC_014315	GATCT	2	10	218760	218769	20 %	40 %	20 %	20 %	300112930
142	NC_014315	GATCA	2	10	219036	219045	40 %	20 %	20 %	20 %	300112930
143	NC_014315	ATTAT	2	10	221109	221118	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_014315	AGGTG	2	10	222312	222321	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
145	NC_014315	TTTTA	2	10	222543	222552	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_014315	GTTTT	2	10	223305	223314	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
147	NC_014315	CGCAC	2	10	224579	224588	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
148	NC_014315	CTGGC	2	10	226777	226786	0 %	20 %	40 %	40 %	300112937
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151	NC_014315	GTAAG	2	10	228402	228411	40 %	20 %	40 %	0 %	300112937
152	NC_014315	GTGGC	2	10	229070	229079	0 %	20 %	60 %	20 %	300112938
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160	NC_014315	GGGCG	2	10	240824	240833	0 %	0 %	80 %	20 %	300112948
161	NC_014315	AGCGG	2	10	241096	241105	20 %	0 %	60 %	20 %	300112948
162	NC_014315	ATTGA	2	10	247994	248003	40 %	40 %	20 %	0 %	300112953
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165	NC_014315	ATATT	2	10	251142	251151	40 %	60 %	0 %	0 %	300112957
166	NC_014315	TAATT	2	10	255158	255167	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
167	NC_014315	AGGTG	2	10	255566	255575	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
168	NC_014315	ATTAT	2	10	255699	255708	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
169	NC_014315	AAAGA	2	10	257238	257247	80 %	0 %	20 %	0 %	300112961
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176	NC_014315	CTTTG	2	10	277180	277189	0 %	60 %	20 %	20 %	300112982
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179	NC_014315	GCCAT	2	10	278798	278807	20 %	20 %	20 %	40 %	300112984
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181	NC_014315	CTATC	2	10	280100	280109	20 %	40 %	0 %	40 %	300112985
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191	NC_014315	CGGGT	2	10	299340	299349	0 %	20 %	60 %	20 %	300113002
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199	NC_014315	GGATT	2	10	317842	317851	20 %	40 %	40 %	0 %	300113024
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201	NC_014315	GGGCA	2	10	326368	326377	20 %	0 %	60 %	20 %	300113031
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217	NC_014315	ATCTT	2	10	342847	342856	20 %	60 %	0 %	20 %	300113044
218	NC_014315	AGGAG	2	10	344725	344734	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
219	NC_014315	CATGG	2	10	345763	345772	20 %	20 %	40 %	20 %	300113046
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233	NC_014315	CATGG	2	10	369034	369043	20 %	20 %	40 %	20 %	300113068
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239	NC_014315	TTCCA	2	10	373725	373734	20 %	40 %	0 %	40 %	300113073
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241	NC_014315	CGGTT	2	10	381468	381477	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
242	NC_014315	AAAGG	2	10	383802	383811	60 %	0 %	40 %	0 %	300113081
243	NC_014315	CTGAA	2	10	383952	383961	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
244	NC_014315	TTACC	2	10	384119	384128	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
245	NC_014315	TTGGT	2	10	384967	384976	0 %	60 %	40 %	0 %	300113082
246	NC_014315	TGGCG	2	10	385346	385355	0 %	20 %	60 %	20 %	300113083
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248	NC_014315	TGCCA	2	10	388359	388368	20 %	20 %	20 %	40 %	300113085
249	NC_014315	ATAGG	2	10	388887	388896	40 %	20 %	40 %	0 %	300113085
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251	NC_014315	TATTT	3	15	390985	390999	20 %	80 %	0 %	0 %	300113086
252	NC_014315	GGGAC	2	10	392854	392863	20 %	0 %	60 %	20 %	300113088
253	NC_014315	AAATC	2	10	392898	392907	60 %	20 %	0 %	20 %	300113088
254	NC_014315	ATGGC	2	10	394255	394264	20 %	20 %	40 %	20 %	300113089
255	NC_014315	AGTTT	2	10	397372	397381	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
256	NC_014315	TATAA	2	10	398499	398508	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
257	NC_014315	TTCCT	2	10	399378	399387	0 %	60 %	0 %	40 %	300113096
258	NC_014315	GGCCC	2	10	400023	400032	0 %	0 %	40 %	60 %	300113096
259	NC_014315	TAAAT	2	10	400958	400967	60 %	40 %	0 %	0 %	300113097
260	NC_014315	CCCAT	2	10	402629	402638	20 %	20 %	0 %	60 %	300113099
261	NC_014315	TTTGA	2	10	403996	404005	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
262	NC_014315	AGAAA	2	10	405450	405459	80 %	0 %	20 %	0 %	300113102
263	NC_014315	AAGCA	2	10	406759	406768	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
264	NC_014315	GGTTT	2	10	411194	411203	0 %	60 %	40 %	0 %	300113108
265	NC_014315	AATTT	2	10	414330	414339	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
266	NC_014315	TTTGG	2	10	415259	415268	0 %	60 %	40 %	0 %	300113111
267	NC_014315	GTTTG	2	10	416020	416029	0 %	60 %	40 %	0 %	300113111
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269	NC_014315	ACCAA	2	10	420235	420244	60 %	0 %	0 %	40 %	300113118
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398	NC_014315	GGGGA	2	10	609667	609676	20 %	0 %	80 %	0 %	300113295
399	NC_014315	CCGAT	2	10	609892	609901	20 %	20 %	20 %	40 %	300113295
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401	NC_014315	GCGAA	2	10	613059	613068	40 %	0 %	40 %	20 %	300113298
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427	NC_014315	GGAGT	2	10	650274	650283	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
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498	NC_014315	TATTT	2	10	766331	766340	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
499	NC_014315	GTTTA	2	10	770104	770113	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
500	NC_014315	TTGGG	2	10	771445	771454	0 %	40 %	60 %	0 %	300113451

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