MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Nitrosococcus watsonii C-113 chromosome

Total Repeats: 8600

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014315	GCAA	2	8	228	235	50 %	0 %	25 %	25 %	300112746
2	NC_014315	ATTG	2	8	283	290	25 %	50 %	25 %	0 %	300112746
3	NC_014315	CAAT	2	8	525	532	50 %	25 %	0 %	25 %	300112746
4	NC_014315	ATGC	2	8	631	638	25 %	25 %	25 %	25 %	300112746
5	NC_014315	CTAT	2	8	1558	1565	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
6	NC_014315	AAAT	2	8	1818	1825	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_014315	CCCT	2	8	2284	2291	0 %	25 %	0 %	75 %	300112747
8	NC_014315	CTGA	2	8	2526	2533	25 %	25 %	25 %	25 %	300112747
9	NC_014315	AGTA	2	8	3117	3124	50 %	25 %	25 %	0 %	300112747
10	NC_014315	CTTG	2	8	3179	3186	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
11	NC_014315	TTCT	2	8	3756	3763	0 %	75 %	0 %	25 %	300112748
12	NC_014315	CATC	2	8	4739	4746	25 %	25 %	0 %	50 %	300112749
13	NC_014315	TTCG	2	8	4878	4885	0 %	50 %	25 %	25 %	300112749
14	NC_014315	CGGG	2	8	5481	5488	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
15	NC_014315	CGGG	2	8	5653	5660	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
16	NC_014315	CGGG	2	8	6524	6531	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
17	NC_014315	GCTC	2	8	6557	6564	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
18	NC_014315	GGGA	2	8	6845	6852	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
19	NC_014315	CCCG	2	8	7278	7285	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
20	NC_014315	TGCT	2	8	7477	7484	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
21	NC_014315	CCAC	2	8	7490	7497	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
22	NC_014315	GGAT	2	8	7967	7974	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
23	NC_014315	AGCC	2	8	8214	8221	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
24	NC_014315	CTGG	2	8	8817	8824	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
25	NC_014315	TGCT	2	8	8838	8845	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
26	NC_014315	TCGA	2	8	8907	8914	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
27	NC_014315	TAGT	2	8	8962	8969	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
28	NC_014315	TTCC	2	8	9480	9487	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
29	NC_014315	ATTT	2	8	9627	9634	25 %	75 %	0 %	0 %	300112750
30	NC_014315	AATT	2	8	9667	9674	50 %	50 %	0 %	0 %	300112750
31	NC_014315	GCAG	2	8	9725	9732	25 %	0 %	50 %	25 %	300112750
32	NC_014315	AACG	2	8	9961	9968	50 %	0 %	25 %	25 %	300112750
33	NC_014315	TGGA	2	8	10288	10295	25 %	25 %	50 %	0 %	300112750
34	NC_014315	GTAT	2	8	10693	10700	25 %	50 %	25 %	0 %	300112751
35	NC_014315	GGTA	2	8	10973	10980	25 %	25 %	50 %	0 %	300112751
36	NC_014315	CTGG	2	8	11463	11470	0 %	25 %	50 %	25 %	300112751
37	NC_014315	TGGA	2	8	12121	12128	25 %	25 %	50 %	0 %	300112751
38	NC_014315	ACGC	2	8	12137	12144	25 %	0 %	25 %	50 %	300112751
39	NC_014315	GCTA	2	8	13124	13131	25 %	25 %	25 %	25 %	300112752
40	NC_014315	CTGC	2	8	13157	13164	0 %	25 %	25 %	50 %	300112752
41	NC_014315	TTAA	2	8	13770	13777	50 %	50 %	0 %	0 %	300112752
42	NC_014315	AGAA	2	8	13853	13860	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
43	NC_014315	TGTT	2	8	13893	13900	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
44	NC_014315	AATT	2	8	14638	14645	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_014315	TTGT	2	8	14817	14824	0 %	75 %	25 %	0 %	300112754
46	NC_014315	ATGC	2	8	15098	15105	25 %	25 %	25 %	25 %	300112755
47	NC_014315	AAAT	2	8	15500	15507	75 %	25 %	0 %	0 %	300112755
48	NC_014315	TTGT	2	8	15574	15581	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
49	NC_014315	TGAA	2	8	15634	15641	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
50	NC_014315	TATT	2	8	15643	15650	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_014315	AGTA	2	8	15896	15903	50 %	25 %	25 %	0 %	300112756
52	NC_014315	ATTA	2	8	16666	16673	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_014315	GTTT	2	8	16681	16688	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
54	NC_014315	ATTT	2	8	16762	16769	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_014315	GGGC	2	8	17283	17290	0 %	0 %	75 %	25 %	300112757
56	NC_014315	GCCC	2	8	17389	17396	0 %	0 %	25 %	75 %	300112757
57	NC_014315	AAAG	2	8	17688	17695	75 %	0 %	25 %	0 %	300112757
58	NC_014315	ACCT	2	8	18064	18071	25 %	25 %	0 %	50 %	300112758
59	NC_014315	CGCA	2	8	18079	18086	25 %	0 %	25 %	50 %	300112758
60	NC_014315	TACC	2	8	18222	18229	25 %	25 %	0 %	50 %	300112758
61	NC_014315	AAAT	2	8	18736	18743	75 %	25 %	0 %	0 %	300112759
62	NC_014315	CCGG	2	8	18839	18846	0 %	0 %	50 %	50 %	300112759
63	NC_014315	CAGC	2	8	19333	19340	25 %	0 %	25 %	50 %	300112759
64	NC_014315	TATC	2	8	19934	19941	25 %	50 %	0 %	25 %	300112759
65	NC_014315	CGCA	2	8	20079	20086	25 %	0 %	25 %	50 %	300112759
66	NC_014315	ATCG	2	8	20181	20188	25 %	25 %	25 %	25 %	300112759
67	NC_014315	GATG	2	8	20228	20235	25 %	25 %	50 %	0 %	300112759
68	NC_014315	CATG	2	8	20306	20313	25 %	25 %	25 %	25 %	300112759
69	NC_014315	GCCC	2	8	20549	20556	0 %	0 %	25 %	75 %	300112760
70	NC_014315	CCGC	2	8	20767	20774	0 %	0 %	25 %	75 %	300112760
71	NC_014315	CTGC	2	8	21075	21082	0 %	25 %	25 %	50 %	300112760
72	NC_014315	ATTT	2	8	21811	21818	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_014315	TCCT	2	8	23558	23565	0 %	50 %	0 %	50 %	300112762
74	NC_014315	AGGC	2	8	23917	23924	25 %	0 %	50 %	25 %	300112762
75	NC_014315	AGGG	2	8	24606	24613	25 %	0 %	75 %	0 %	300112763
76	NC_014315	GTCC	2	8	24749	24756	0 %	25 %	25 %	50 %	300112763
77	NC_014315	TCCT	2	8	25507	25514	0 %	50 %	0 %	50 %	300112763
78	NC_014315	TAGA	2	8	25798	25805	50 %	25 %	25 %	0 %	300112763
79	NC_014315	TAGG	2	8	26159	26166	25 %	25 %	50 %	0 %	300112763
80	NC_014315	TCAA	2	8	26685	26692	50 %	25 %	0 %	25 %	300112764
81	NC_014315	AGCA	2	8	26834	26841	50 %	0 %	25 %	25 %	300112764
82	NC_014315	CTGG	2	8	26959	26966	0 %	25 %	50 %	25 %	300112764
83	NC_014315	AAGC	2	8	27029	27036	50 %	0 %	25 %	25 %	300112764
84	NC_014315	GCTC	2	8	29032	29039	0 %	25 %	25 %	50 %	300112766
85	NC_014315	CATC	2	8	30418	30425	25 %	25 %	0 %	50 %	300112766
86	NC_014315	ACCA	2	8	31127	31134	50 %	0 %	0 %	50 %	300112767
87	NC_014315	TTGC	2	8	31166	31173	0 %	50 %	25 %	25 %	300112767
88	NC_014315	AATC	2	8	31246	31253	50 %	25 %	0 %	25 %	300112767
89	NC_014315	AGCA	2	8	31796	31803	50 %	0 %	25 %	25 %	300112767
90	NC_014315	CTTG	2	8	32114	32121	0 %	50 %	25 %	25 %	300112768
91	NC_014315	ACCA	3	12	32207	32218	50 %	0 %	0 %	50 %	300112769
92	NC_014315	TCTT	2	8	32271	32278	0 %	75 %	0 %	25 %	300112769
93	NC_014315	TCAC	2	8	32398	32405	25 %	25 %	0 %	50 %	300112769
94	NC_014315	TAAT	2	8	32687	32694	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_014315	TGCT	2	8	32784	32791	0 %	50 %	25 %	25 %	300112770
96	NC_014315	TTAC	2	8	32872	32879	25 %	50 %	0 %	25 %	300112770
97	NC_014315	CTAC	2	8	33164	33171	25 %	25 %	0 %	50 %	300112770
98	NC_014315	TGCT	2	8	33303	33310	0 %	50 %	25 %	25 %	300112770
99	NC_014315	CTTG	2	8	33404	33411	0 %	50 %	25 %	25 %	300112770
100	NC_014315	GGAG	2	8	33565	33572	25 %	0 %	75 %	0 %	300112770
101	NC_014315	GGCA	2	8	33883	33890	25 %	0 %	50 %	25 %	300112771
102	NC_014315	CGTC	2	8	33902	33909	0 %	25 %	25 %	50 %	300112771
103	NC_014315	AATT	2	8	35186	35193	50 %	50 %	0 %	0 %	300112772
104	NC_014315	TAAA	2	8	36831	36838	75 %	25 %	0 %	0 %	300112774
105	NC_014315	TGCT	2	8	37408	37415	0 %	50 %	25 %	25 %	300112775
106	NC_014315	TGTT	2	8	37796	37803	0 %	75 %	25 %	0 %	300112776
107	NC_014315	ATTT	2	8	38902	38909	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_014315	AATT	2	8	39582	39589	50 %	50 %	0 %	0 %	300112779
109	NC_014315	CCCT	2	8	40034	40041	0 %	25 %	0 %	75 %	300112779
110	NC_014315	GGCG	2	8	40464	40471	0 %	0 %	75 %	25 %	300112779
111	NC_014315	TGGA	2	8	40662	40669	25 %	25 %	50 %	0 %	300112779
112	NC_014315	ATTA	2	8	40975	40982	50 %	50 %	0 %	0 %	300112779
113	NC_014315	GTCA	2	8	41383	41390	25 %	25 %	25 %	25 %	300112780
114	NC_014315	GATC	2	8	41474	41481	25 %	25 %	25 %	25 %	300112780
115	NC_014315	GTAT	2	8	41668	41675	25 %	50 %	25 %	0 %	300112780
116	NC_014315	CGGG	2	8	42360	42367	0 %	0 %	75 %	25 %	300112780
117	NC_014315	CTAT	2	8	42405	42412	25 %	50 %	0 %	25 %	300112780
118	NC_014315	AGGC	2	8	42618	42625	25 %	0 %	50 %	25 %	300112780
119	NC_014315	AAAT	2	8	43257	43264	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_014315	TTCT	3	12	43374	43385	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
121	NC_014315	CGAG	2	8	43872	43879	25 %	0 %	50 %	25 %	300112781
122	NC_014315	ATGG	2	8	44159	44166	25 %	25 %	50 %	0 %	300112781
123	NC_014315	AGGG	2	8	44277	44284	25 %	0 %	75 %	0 %	300112782
124	NC_014315	GTCC	2	8	45474	45481	0 %	25 %	25 %	50 %	300112782
125	NC_014315	CAAG	2	8	46452	46459	50 %	0 %	25 %	25 %	300112782
126	NC_014315	ATGG	2	8	46555	46562	25 %	25 %	50 %	0 %	300112782
127	NC_014315	AGGC	2	8	47591	47598	25 %	0 %	50 %	25 %	300112782
128	NC_014315	CTGA	2	8	47716	47723	25 %	25 %	25 %	25 %	300112782
129	NC_014315	GATG	2	8	47835	47842	25 %	25 %	50 %	0 %	300112782
130	NC_014315	CAAG	2	8	48117	48124	50 %	0 %	25 %	25 %	300112782
131	NC_014315	CAGT	2	8	48125	48132	25 %	25 %	25 %	25 %	300112782
132	NC_014315	ATGG	2	8	48826	48833	25 %	25 %	50 %	0 %	300112784
133	NC_014315	AGCC	2	8	49066	49073	25 %	0 %	25 %	50 %	300112784
134	NC_014315	ACAA	2	8	50102	50109	75 %	0 %	0 %	25 %	300112784
135	NC_014315	TGTT	2	8	50733	50740	0 %	75 %	25 %	0 %	300112784
136	NC_014315	AACC	2	8	51504	51511	50 %	0 %	0 %	50 %	300112785
137	NC_014315	ATTC	2	8	51751	51758	25 %	50 %	0 %	25 %	300112785
138	NC_014315	GGAA	2	8	52771	52778	50 %	0 %	50 %	0 %	300112787
139	NC_014315	GTGG	2	8	53578	53585	0 %	25 %	75 %	0 %	300112788
140	NC_014315	AAGG	2	8	54323	54330	50 %	0 %	50 %	0 %	300112788
141	NC_014315	AGCC	2	8	54340	54347	25 %	0 %	25 %	50 %	300112788
142	NC_014315	TTGA	2	8	54560	54567	25 %	50 %	25 %	0 %	300112788
143	NC_014315	GCCA	2	8	55480	55487	25 %	0 %	25 %	50 %	300112788
144	NC_014315	CAGG	2	8	55526	55533	25 %	0 %	50 %	25 %	300112788
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155	NC_014315	GCAG	2	8	62005	62012	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
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250	NC_014315	ATTG	2	8	100873	100880	25 %	50 %	25 %	0 %	300112823
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252	NC_014315	ACTG	2	8	102439	102446	25 %	25 %	25 %	25 %	300112824
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