MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Nitrosococcus watsonii C-113 chromosome

Total Repeats: 65205

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_014315	TA	3	6	78700	78705	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1502	NC_014315	ATG	2	6	78797	78802	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300112806
1503	NC_014315	AAG	2	6	78919	78924	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	300112806
1504	NC_014315	CAG	2	6	78942	78947	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300112806
1505	NC_014315	GAA	2	6	79055	79060	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	300112806
1506	NC_014315	AGA	2	6	79066	79071	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	300112806
1507	NC_014315	TGG	2	6	79151	79156	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1508	NC_014315	AGCC	2	8	79257	79264	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
1509	NC_014315	GCC	3	9	79262	79270	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1510	NC_014315	ACCG	2	8	79363	79370	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
1511	NC_014315	CGC	2	6	79371	79376	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1512	NC_014315	TGAC	2	8	79378	79385	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1513	NC_014315	GC	3	6	79468	79473	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1514	NC_014315	CCA	2	6	79566	79571	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1515	NC_014315	GGA	2	6	79591	79596	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1516	NC_014315	AAG	2	6	79667	79672	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1517	NC_014315	TTG	2	6	79700	79705	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	300112807
1518	NC_014315	TTG	2	6	79785	79790	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	300112807
1519	NC_014315	AGGA	2	8	79799	79806	50 %	0 %	50 %	0 %	300112807
1520	NC_014315	TG	3	6	79815	79820	0 %	50 %	50 %	0 %	300112807
1521	NC_014315	CTA	2	6	79870	79875	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300112807
1522	NC_014315	GCG	2	6	79878	79883	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300112807
1523	NC_014315	TGG	2	6	79927	79932	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	300112807
1524	NC_014315	AGA	2	6	79950	79955	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	300112807
1525	NC_014315	GGT	2	6	79990	79995	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	300112807
1526	NC_014315	AGG	2	6	80023	80028	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	300112807
1527	NC_014315	TTC	2	6	80061	80066	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	300112807
1528	NC_014315	AAAT	2	8	80081	80088	75 %	25 %	0 %	0 %	300112807
1529	NC_014315	GAG	2	6	80118	80123	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1530	NC_014315	GCC	2	6	80130	80135	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1531	NC_014315	CGA	2	6	80195	80200	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1532	NC_014315	ATC	2	6	80263	80268	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1533	NC_014315	AG	3	6	80308	80313	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1534	NC_014315	GAA	2	6	80348	80353	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1535	NC_014315	TTA	2	6	80381	80386	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1536	NC_014315	CATA	2	8	80401	80408	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
1537	NC_014315	T	6	6	80414	80419	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1538	NC_014315	GTT	2	6	80687	80692	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1539	NC_014315	AGGT	2	8	80703	80710	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
1540	NC_014315	CAC	2	6	80735	80740	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	300112809
1541	NC_014315	GAG	2	6	80765	80770	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	300112809
1542	NC_014315	TTC	2	6	80780	80785	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	300112809
1543	NC_014315	GGCT	2	8	80798	80805	0 %	25 %	50 %	25 %	300112809
1544	NC_014315	CTTT	2	8	80871	80878	0 %	75 %	0 %	25 %	300112809
1545	NC_014315	CAT	2	6	80951	80956	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300112809
1546	NC_014315	CAGGAA	2	12	80971	80982	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	300112809
1547	NC_014315	GAT	2	6	80990	80995	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300112809
1548	NC_014315	CTG	2	6	81011	81016	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300112809
1549	NC_014315	T	6	6	81086	81091	0 %	100 %	0 %	0 %	300112809
1550	NC_014315	A	6	6	81181	81186	100 %	0 %	0 %	0 %	300112809
1551	NC_014315	GGAA	2	8	81225	81232	50 %	0 %	50 %	0 %	300112809
1552	NC_014315	CAAA	2	8	81336	81343	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
1553	NC_014315	TACC	2	8	81362	81369	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
1554	NC_014315	AGT	2	6	81397	81402	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1555	NC_014315	GCC	2	6	81520	81525	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1556	NC_014315	ATT	2	6	81526	81531	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1557	NC_014315	TGC	2	6	81544	81549	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1558	NC_014315	AAC	2	6	81650	81655	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1559	NC_014315	GCGCC	2	10	81682	81691	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
1560	NC_014315	TTA	2	6	81740	81745	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1561	NC_014315	TCTT	2	8	81761	81768	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
1562	NC_014315	ATT	2	6	81777	81782	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1563	NC_014315	ATT	2	6	81801	81806	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1564	NC_014315	T	6	6	81838	81843	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1565	NC_014315	ATA	2	6	81900	81905	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1566	NC_014315	ATGA	2	8	81906	81913	50 %	25 %	25 %	0 %	300112810
1567	NC_014315	TGT	2	6	81941	81946	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	300112810
1568	NC_014315	GAA	2	6	81960	81965	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	300112810
1569	NC_014315	GA	3	6	82013	82018	50 %	0 %	50 %	0 %	300112810
1570	NC_014315	CCA	2	6	82029	82034	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	300112810
1571	NC_014315	A	6	6	82134	82139	100 %	0 %	0 %	0 %	300112810
1572	NC_014315	GCGTT	2	10	82167	82176	0 %	40 %	40 %	20 %	300112810
1573	NC_014315	CTG	2	6	82189	82194	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300112810
1574	NC_014315	CAT	2	6	82245	82250	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300112810
1575	NC_014315	TA	3	6	82254	82259	50 %	50 %	0 %	0 %	300112810
1576	NC_014315	GAT	2	6	82272	82277	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300112810
1577	NC_014315	TA	3	6	82284	82289	50 %	50 %	0 %	0 %	300112810
1578	NC_014315	TGT	2	6	82325	82330	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	300112810
1579	NC_014315	GGT	2	6	82391	82396	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	300112810
1580	NC_014315	AGG	2	6	82685	82690	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1581	NC_014315	CCT	2	6	82743	82748	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1582	NC_014315	ATG	2	6	82772	82777	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1583	NC_014315	GAAA	2	8	82893	82900	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
1584	NC_014315	GC	3	6	82939	82944	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1585	NC_014315	GAG	2	6	82984	82989	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1586	NC_014315	AAG	2	6	83033	83038	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1587	NC_014315	ATT	2	6	83050	83055	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1588	NC_014315	TAC	2	6	83140	83145	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1589	NC_014315	TTA	2	6	83196	83201	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1590	NC_014315	CGGT	2	8	83228	83235	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
1591	NC_014315	T	6	6	83244	83249	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1592	NC_014315	TGTC	2	8	83313	83320	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
1593	NC_014315	AGCC	2	8	83348	83355	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
1594	NC_014315	GGC	2	6	83473	83478	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1595	NC_014315	TTGC	2	8	83574	83581	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
1596	NC_014315	ACC	2	6	83598	83603	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1597	NC_014315	ACGCT	2	10	83623	83632	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
1598	NC_014315	TGG	2	6	83693	83698	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1599	NC_014315	TTA	2	6	83726	83731	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1600	NC_014315	GGGA	2	8	83748	83755	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
1601	NC_014315	CTA	2	6	83848	83853	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1602	NC_014315	ACTG	2	8	83876	83883	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1603	NC_014315	CG	3	6	83908	83913	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1604	NC_014315	CGCT	3	12	83989	84000	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
1605	NC_014315	ACG	2	6	84047	84052	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1606	NC_014315	ATT	2	6	84099	84104	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1607	NC_014315	GGAAA	2	10	84118	84127	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
1608	NC_014315	TGA	2	6	84133	84138	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1609	NC_014315	ATA	2	6	84168	84173	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1610	NC_014315	ATAA	2	8	84222	84229	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1611	NC_014315	ATGA	2	8	84265	84272	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1612	NC_014315	GGTG	2	8	84332	84339	0 %	25 %	75 %	0 %	300112811
1613	NC_014315	GAT	2	6	84600	84605	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300112811
1614	NC_014315	T	8	8	84620	84627	0 %	100 %	0 %	0 %	300112811
1615	NC_014315	GGC	2	6	84632	84637	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300112811
1616	NC_014315	AATA	2	8	84660	84667	75 %	25 %	0 %	0 %	300112811
1617	NC_014315	ATA	2	6	84778	84783	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	300112811
1618	NC_014315	GGT	2	6	84804	84809	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	300112811
1619	NC_014315	CAG	2	6	84819	84824	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300112811
1620	NC_014315	TGA	2	6	84898	84903	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300112811
1621	NC_014315	AGG	2	6	84905	84910	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	300112811
1622	NC_014315	TCA	2	6	84928	84933	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300112811
1623	NC_014315	GCA	2	6	84992	84997	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300112811
1624	NC_014315	A	6	6	85116	85121	100 %	0 %	0 %	0 %	300112811
1625	NC_014315	GTC	2	6	85195	85200	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300112811
1626	NC_014315	ATG	2	6	85339	85344	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300112811
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1628	NC_014315	CCA	2	6	85388	85393	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	300112811
1629	NC_014315	TACGG	2	10	85473	85482	20 %	20 %	40 %	20 %	300112811
1630	NC_014315	ATC	2	6	85699	85704	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300112811
1631	NC_014315	ACC	2	6	85729	85734	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	300112811
1632	NC_014315	GCGT	2	8	85855	85862	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
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1634	NC_014315	A	6	6	85906	85911	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1893	NC_014315	CGC	2	6	99002	99007	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300112822
1894	NC_014315	T	7	7	99058	99064	0 %	100 %	0 %	0 %	300112822
1895	NC_014315	TAT	2	6	99137	99142	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	300112822
1896	NC_014315	ATT	2	6	99144	99149	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	300112822
1897	NC_014315	TGG	2	6	99186	99191	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	300112822
1898	NC_014315	TGC	2	6	99198	99203	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300112822
1899	NC_014315	GGT	2	6	99302	99307	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	300112822
1900	NC_014315	TGG	2	6	99325	99330	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	300112822
1901	NC_014315	ATG	2	6	99449	99454	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300112822
1902	NC_014315	AGA	2	6	99535	99540	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	300112822
1903	NC_014315	TGT	2	6	99607	99612	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	300112823
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1918	NC_014315	GGCT	2	8	100339	100346	0 %	25 %	50 %	25 %	300112823
1919	NC_014315	ATCGG	2	10	100368	100377	20 %	20 %	40 %	20 %	300112823
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1921	NC_014315	AGGA	2	8	100587	100594	50 %	0 %	50 %	0 %	300112823
1922	NC_014315	GTG	2	6	100634	100639	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	300112823
1923	NC_014315	GGAC	2	8	100694	100701	25 %	0 %	50 %	25 %	300112823
1924	NC_014315	GTA	2	6	100785	100790	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300112823
1925	NC_014315	ATTG	2	8	100873	100880	25 %	50 %	25 %	0 %	300112823
1926	NC_014315	GCC	2	6	100907	100912	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300112823
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1929	NC_014315	TCA	2	6	101087	101092	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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1931	NC_014315	AGGT	2	8	101176	101183	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
1932	NC_014315	AAC	2	6	101224	101229	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1933	NC_014315	TTC	2	6	101238	101243	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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1935	NC_014315	A	6	6	101355	101360	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1936	NC_014315	AGCCG	2	10	101392	101401	20 %	0 %	40 %	40 %	300112824
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1954	NC_014315	CGG	2	6	102474	102479	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300112824
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1964	NC_014315	A	6	6	102922	102927	100 %	0 %	0 %	0 %	300112824
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1974	NC_014315	GCC	2	6	103261	103266	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1975	NC_014315	TAT	2	6	103268	103273	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1976	NC_014315	TAT	2	6	103291	103296	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1977	NC_014315	GCTT	2	8	103305	103312	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
1978	NC_014315	ATAA	2	8	103351	103358	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1979	NC_014315	G	6	6	103385	103390	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
1980	NC_014315	ATT	2	6	103401	103406	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1981	NC_014315	CT	3	6	103508	103513	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1982	NC_014315	GGAG	2	8	103547	103554	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
1983	NC_014315	TTTAGT	2	12	103592	103603	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
1984	NC_014315	GGC	2	6	103635	103640	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1985	NC_014315	CAA	2	6	103665	103670	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1986	NC_014315	CCTC	3	12	103711	103722	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
1987	NC_014315	GT	3	6	103778	103783	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1988	NC_014315	CAA	2	6	103789	103794	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1989	NC_014315	TAA	2	6	103824	103829	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	300112825
1990	NC_014315	CCAC	2	8	103846	103853	25 %	0 %	0 %	75 %	300112825
1991	NC_014315	GTTC	2	8	103933	103940	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
1992	NC_014315	CGGA	2	8	103955	103962	25 %	0 %	50 %	25 %	300112826
1993	NC_014315	TAG	2	6	103969	103974	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300112826
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1996	NC_014315	AAT	2	6	104166	104171	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	300112826
1997	NC_014315	GCG	2	6	104353	104358	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300112826
1998	NC_014315	GGGA	2	8	104396	104403	25 %	0 %	75 %	0 %	300112826
1999	NC_014315	CGG	2	6	104450	104455	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300112826
2000	NC_014315	CGA	2	6	104489	104494	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300112826

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