MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Nitrosococcus watsonii C-113 chromosome

Total Repeats: 65205

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
6001	NC_014315	CTCG	2	8	308305	308312	0 %	25 %	25 %	50 %	300113012
6002	NC_014315	TC	3	6	308431	308436	0 %	50 %	0 %	50 %	300113012
6003	NC_014315	TAA	2	6	308452	308457	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	300113012
6004	NC_014315	CGC	3	9	308559	308567	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300113012
6005	NC_014315	T	6	6	308598	308603	0 %	100 %	0 %	0 %	300113012
6006	NC_014315	AAT	2	6	308628	308633	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	300113012
6007	NC_014315	ATA	2	6	308694	308699	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	300113012
6008	NC_014315	TTG	2	6	308700	308705	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	300113012
6009	NC_014315	CTT	2	6	308734	308739	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	300113012
6010	NC_014315	CGG	2	6	308769	308774	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300113012
6011	NC_014315	ATG	2	6	308798	308803	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300113012
6012	NC_014315	CGT	2	6	308861	308866	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300113012
6013	NC_014315	GCC	2	6	309105	309110	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300113013
6014	NC_014315	TGGC	2	8	309217	309224	0 %	25 %	50 %	25 %	300113013
6015	NC_014315	TGGT	2	8	309285	309292	0 %	50 %	50 %	0 %	300113013
6016	NC_014315	TAT	2	6	309378	309383	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	300113013
6017	NC_014315	GATG	2	8	309444	309451	25 %	25 %	50 %	0 %	300113013
6018	NC_014315	GTA	2	6	309455	309460	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300113013
6019	NC_014315	TCC	2	6	309500	309505	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	300113013
6020	NC_014315	TGT	2	6	309510	309515	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	300113013
6021	NC_014315	T	6	6	309568	309573	0 %	100 %	0 %	0 %	300113013
6022	NC_014315	GTA	2	6	309583	309588	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300113013
6023	NC_014315	TCA	2	6	309671	309676	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300113013
6024	NC_014315	GAT	2	6	309760	309765	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300113013
6025	NC_014315	AGC	2	6	309772	309777	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300113013
6026	NC_014315	ATA	2	6	309826	309831	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	300113014
6027	NC_014315	TAGA	2	8	309851	309858	50 %	25 %	25 %	0 %	300113014
6028	NC_014315	GTT	2	6	309910	309915	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	300113014
6029	NC_014315	AAT	2	6	310007	310012	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	300113014
6030	NC_014315	AGA	2	6	310023	310028	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	300113014
6031	NC_014315	TCA	2	6	310035	310040	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300113014
6032	NC_014315	A	6	6	310102	310107	100 %	0 %	0 %	0 %	300113014
6033	NC_014315	TCC	2	6	310221	310226	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	300113014
6034	NC_014315	GGT	2	6	310238	310243	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	300113014
6035	NC_014315	TTC	2	6	310280	310285	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	300113014
6036	NC_014315	TAA	2	6	310289	310294	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	300113014
6037	NC_014315	TAA	2	6	310357	310362	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	300113015
6038	NC_014315	ATA	2	6	310402	310407	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	300113015
6039	NC_014315	GCA	2	6	310426	310431	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300113015
6040	NC_014315	CGC	2	6	310519	310524	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300113015
6041	NC_014315	ATA	2	6	310525	310530	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	300113015
6042	NC_014315	CAT	2	6	310544	310549	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300113015
6043	NC_014315	TGT	2	6	310723	310728	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	300113015
6044	NC_014315	GCC	2	6	310800	310805	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300113015
6045	NC_014315	ATT	2	6	310890	310895	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6046	NC_014315	T	6	6	310894	310899	0 %	100 %	0 %	0 %	300113016
6047	NC_014315	CTA	2	6	310963	310968	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300113016
6048	NC_014315	AGG	2	6	310971	310976	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	300113016
6049	NC_014315	ATT	2	6	310998	311003	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	300113016
6050	NC_014315	GCG	2	6	311016	311021	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300113016
6051	NC_014315	GCG	2	6	311108	311113	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300113016
6052	NC_014315	GAC	2	6	311159	311164	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300113016
6053	NC_014315	GCG	2	6	311205	311210	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300113016
6054	NC_014315	TTC	2	6	311243	311248	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	300113016
6055	NC_014315	GGC	2	6	311296	311301	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300113016
6056	NC_014315	TGGG	2	8	311306	311313	0 %	25 %	75 %	0 %	300113016
6057	NC_014315	CAA	2	6	311351	311356	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	300113016
6058	NC_014315	TGC	2	6	311395	311400	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300113016
6059	NC_014315	CTT	2	6	311431	311436	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	300113016
6060	NC_014315	TC	3	6	311563	311568	0 %	50 %	0 %	50 %	300113016
6061	NC_014315	TGGC	2	8	311625	311632	0 %	25 %	50 %	25 %	300113016
6062	NC_014315	A	7	7	311648	311654	100 %	0 %	0 %	0 %	300113016
6063	NC_014315	GCC	2	6	311693	311698	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300113016
6064	NC_014315	AT	3	6	311754	311759	50 %	50 %	0 %	0 %	300113016
6065	NC_014315	GGC	2	6	311765	311770	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300113016
6066	NC_014315	GCT	2	6	311802	311807	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300113016
6067	NC_014315	AGC	2	6	311850	311855	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300113016
6068	NC_014315	ATC	2	6	311867	311872	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300113016
6069	NC_014315	GTTAAC	2	12	311924	311935	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
6070	NC_014315	GTAG	2	8	311943	311950	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
6071	NC_014315	AGG	2	6	312021	312026	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	300113017
6072	NC_014315	GAA	2	6	312034	312039	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	300113017
6073	NC_014315	TCT	2	6	312064	312069	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	300113017
6074	NC_014315	TCG	2	6	312085	312090	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300113017
6075	NC_014315	TTC	2	6	312114	312119	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	300113017
6076	NC_014315	CAT	2	6	312134	312139	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300113017
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6078	NC_014315	TCG	2	6	312430	312435	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300113017
6079	NC_014315	CCCG	2	8	312447	312454	0 %	0 %	25 %	75 %	300113017
6080	NC_014315	TCC	2	6	312474	312479	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	300113017
6081	NC_014315	GGGT	2	8	312617	312624	0 %	25 %	75 %	0 %	300113017
6082	NC_014315	GCA	2	6	312673	312678	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300113017
6083	NC_014315	CAT	2	6	312731	312736	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300113017
6084	NC_014315	CAGC	2	8	312754	312761	25 %	0 %	25 %	50 %	300113017
6085	NC_014315	GAG	2	6	312771	312776	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	300113017
6086	NC_014315	TAG	2	6	312783	312788	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300113017
6087	NC_014315	CT	3	6	312859	312864	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
6088	NC_014315	TGAT	2	8	312866	312873	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
6089	NC_014315	TTAGA	2	10	312901	312910	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
6090	NC_014315	CTT	2	6	312946	312951	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6091	NC_014315	AGA	2	6	312960	312965	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6092	NC_014315	TTC	2	6	312980	312985	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6093	NC_014315	ATC	2	6	313004	313009	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6094	NC_014315	TGG	2	6	313066	313071	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6095	NC_014315	AGT	2	6	313094	313099	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6096	NC_014315	AGA	2	6	313143	313148	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6097	NC_014315	TTA	2	6	313152	313157	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6098	NC_014315	GCG	2	6	313214	313219	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6099	NC_014315	GCC	2	6	313239	313244	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6100	NC_014315	GATA	2	8	313359	313366	50 %	25 %	25 %	0 %	300113018
6101	NC_014315	ACC	2	6	313390	313395	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	300113018
6102	NC_014315	G	6	6	313444	313449	0 %	0 %	100 %	0 %	300113018
6103	NC_014315	G	6	6	313465	313470	0 %	0 %	100 %	0 %	300113018
6104	NC_014315	TGT	2	6	313547	313552	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	300113018
6105	NC_014315	TC	3	6	313578	313583	0 %	50 %	0 %	50 %	300113018
6106	NC_014315	CGG	2	6	313732	313737	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300113018
6107	NC_014315	ATG	2	6	313771	313776	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300113018
6108	NC_014315	ATG	2	6	313784	313789	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300113018
6109	NC_014315	ATG	2	6	313853	313858	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300113018
6110	NC_014315	ATG	2	6	313889	313894	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300113018
6111	NC_014315	AGG	2	6	313898	313903	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	300113018
6112	NC_014315	G	6	6	313938	313943	0 %	0 %	100 %	0 %	300113018
6113	NC_014315	GTG	2	6	313948	313953	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	300113018
6114	NC_014315	GGC	2	6	314135	314140	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300113018
6115	NC_014315	T	7	7	314230	314236	0 %	100 %	0 %	0 %	300113019
6116	NC_014315	TGC	2	6	314258	314263	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300113019
6117	NC_014315	TAC	2	6	314269	314274	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300113019
6118	NC_014315	CAT	2	6	314327	314332	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300113019
6119	NC_014315	TTG	2	6	314350	314355	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	300113019
6120	NC_014315	TTG	2	6	314389	314394	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	300113019
6121	NC_014315	GAA	2	6	314406	314411	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	300113019
6122	NC_014315	TGCTT	2	10	314468	314477	0 %	60 %	20 %	20 %	300113019
6123	NC_014315	GCGGG	2	10	314481	314490	0 %	0 %	80 %	20 %	300113019
6124	NC_014315	CTG	2	6	314506	314511	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300113019
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6245	NC_014315	CCCA	2	8	321144	321151	25 %	0 %	0 %	75 %	300113027
6246	NC_014315	G	6	6	321187	321192	0 %	0 %	100 %	0 %	300113027
6247	NC_014315	TTAA	2	8	321195	321202	50 %	50 %	0 %	0 %	300113027
6248	NC_014315	GGT	2	6	321219	321224	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	300113027
6249	NC_014315	TCT	2	6	321411	321416	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	300113028
6250	NC_014315	GCG	2	6	321427	321432	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300113028
6251	NC_014315	CAG	2	6	321451	321456	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300113028
6252	NC_014315	GCA	2	6	321518	321523	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300113028
6253	NC_014315	TCA	2	6	321563	321568	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300113028
6254	NC_014315	GT	3	6	321594	321599	0 %	50 %	50 %	0 %	300113028
6255	NC_014315	GCAC	2	8	321611	321618	25 %	0 %	25 %	50 %	300113028
6256	NC_014315	GAT	2	6	321622	321627	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300113028
6257	NC_014315	ATC	2	6	321634	321639	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300113028
6258	NC_014315	GAC	2	6	321679	321684	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300113028
6259	NC_014315	GGC	2	6	321717	321722	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300113028
6260	NC_014315	GAT	2	6	321751	321756	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300113028
6261	NC_014315	AGGC	2	8	321760	321767	25 %	0 %	50 %	25 %	300113028
6262	NC_014315	GGC	2	6	321771	321776	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300113028
6263	NC_014315	CGG	3	9	321812	321820	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300113028
6264	NC_014315	ATT	2	6	321826	321831	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	300113028
6265	NC_014315	TCA	2	6	321854	321859	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300113028
6266	NC_014315	GCC	2	6	321868	321873	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300113028
6267	NC_014315	CTA	2	6	322077	322082	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300113028
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6269	NC_014315	TGA	2	6	322211	322216	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6270	NC_014315	CTG	2	6	322240	322245	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300113029
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6273	NC_014315	GCT	2	6	322383	322388	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300113029
6274	NC_014315	CCA	2	6	322464	322469	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	300113029
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6277	NC_014315	GCC	2	6	322532	322537	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300113029
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6300	NC_014315	TGA	2	6	323325	323330	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300113029
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6302	NC_014315	AAT	2	6	323470	323475	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6303	NC_014315	AGGT	2	8	323504	323511	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
6304	NC_014315	A	6	6	323582	323587	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6305	NC_014315	GAA	2	6	323610	323615	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6306	NC_014315	T	6	6	323664	323669	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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6328	NC_014315	ATA	2	6	325263	325268	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6329	NC_014315	TTC	2	6	325338	325343	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6330	NC_014315	T	7	7	325386	325392	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6331	NC_014315	ATG	2	6	325460	325465	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6332	NC_014315	CCG	2	6	325518	325523	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300113031
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6351	NC_014315	GGGCA	2	10	326368	326377	20 %	0 %	60 %	20 %	300113031
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6354	NC_014315	ACT	2	6	326492	326497	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300113031
6355	NC_014315	TCG	2	6	326606	326611	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300113031
6356	NC_014315	GGCCAT	2	12	326635	326646	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	300113031
6357	NC_014315	CGCTGG	2	12	326660	326671	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	300113031
6358	NC_014315	AG	3	6	326677	326682	50 %	0 %	50 %	0 %	300113031
6359	NC_014315	TTC	2	6	326695	326700	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	300113031
6360	NC_014315	GGC	2	6	326740	326745	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300113031
6361	NC_014315	CT	3	6	326768	326773	0 %	50 %	0 %	50 %	300113031
6362	NC_014315	GAGG	2	8	326839	326846	25 %	0 %	75 %	0 %	300113031
6363	NC_014315	TTGC	2	8	326893	326900	0 %	50 %	25 %	25 %	300113031
6364	NC_014315	GCA	2	6	326916	326921	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300113031
6365	NC_014315	TGG	2	6	326984	326989	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	300113031
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6472	NC_014315	AGCC	2	8	332013	332020	25 %	0 %	25 %	50 %	300113035
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6490	NC_014315	GCT	2	6	332756	332761	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300113036
6491	NC_014315	TCC	2	6	332762	332767	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	300113036
6492	NC_014315	GCAG	2	8	332780	332787	25 %	0 %	50 %	25 %	300113036
6493	NC_014315	CTTG	2	8	332830	332837	0 %	50 %	25 %	25 %	300113036
6494	NC_014315	GCT	2	6	332867	332872	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300113037
6495	NC_014315	AGG	2	6	332889	332894	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	300113037
6496	NC_014315	CAG	2	6	332958	332963	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300113037
6497	NC_014315	TGC	2	6	333117	333122	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300113037
6498	NC_014315	CAGCG	2	10	333179	333188	20 %	0 %	40 %	40 %	300113037
6499	NC_014315	TGG	2	6	333225	333230	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	300113037
6500	NC_014315	ATT	2	6	333255	333260	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	300113037

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