MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Nitrosococcus watsonii C-113 chromosome

Total Repeats: 65205

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5501	NC_014315	GCG	2	6	282980	282985	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300112988
5502	NC_014315	T	7	7	282995	283001	0 %	100 %	0 %	0 %	300112988
5503	NC_014315	TGG	3	9	283015	283023	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	300112988
5504	NC_014315	GGT	2	6	283034	283039	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	300112988
5505	NC_014315	CT	3	6	283058	283063	0 %	50 %	0 %	50 %	300112988
5506	NC_014315	CGA	2	6	283108	283113	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300112988
5507	NC_014315	G	6	6	283185	283190	0 %	0 %	100 %	0 %	300112989
5508	NC_014315	CTG	2	6	283201	283206	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300112989
5509	NC_014315	A	6	6	283223	283228	100 %	0 %	0 %	0 %	300112989
5510	NC_014315	GAC	2	6	283251	283256	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300112989
5511	NC_014315	TAA	2	6	283257	283262	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	300112989
5512	NC_014315	GCT	2	6	283279	283284	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300112989
5513	NC_014315	TTG	2	6	283365	283370	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	300112989
5514	NC_014315	GCG	2	6	283386	283391	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300112989
5515	NC_014315	GCC	3	9	283456	283464	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300112989
5516	NC_014315	GGA	2	6	283560	283565	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	300112989
5517	NC_014315	AGG	2	6	283618	283623	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	300112990
5518	NC_014315	CGC	2	6	283668	283673	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300112990
5519	NC_014315	TTA	2	6	283810	283815	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	300112990
5520	NC_014315	T	6	6	283859	283864	0 %	100 %	0 %	0 %	300112990
5521	NC_014315	A	7	7	283966	283972	100 %	0 %	0 %	0 %	300112990
5522	NC_014315	CTC	2	6	284037	284042	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	300112990
5523	NC_014315	CTG	2	6	284167	284172	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300112990
5524	NC_014315	GGA	2	6	284207	284212	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	300112990
5525	NC_014315	TGG	2	6	284551	284556	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	300112991
5526	NC_014315	T	6	6	284730	284735	0 %	100 %	0 %	0 %	300112991
5527	NC_014315	GGA	2	6	284939	284944	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	300112991
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5529	NC_014315	TAT	2	6	284993	284998	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	300112991
5530	NC_014315	GCA	2	6	285032	285037	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300112991
5531	NC_014315	GGC	2	6	285038	285043	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300112991
5532	NC_014315	GAA	2	6	285189	285194	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	300112991
5533	NC_014315	AGA	2	6	285197	285202	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	300112991
5534	NC_014315	CGT	2	6	285206	285211	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300112991
5535	NC_014315	G	7	7	285335	285341	0 %	0 %	100 %	0 %	300112991
5536	NC_014315	GAA	2	6	285360	285365	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	300112991
5537	NC_014315	TAG	2	6	285490	285495	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300112991
5538	NC_014315	ATT	2	6	285509	285514	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	300112991
5539	NC_014315	TGT	2	6	285552	285557	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5540	NC_014315	AG	3	6	285611	285616	50 %	0 %	50 %	0 %	300112992
5541	NC_014315	GCG	2	6	285688	285693	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300112992
5542	NC_014315	AGG	2	6	285703	285708	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	300112992
5543	NC_014315	CTG	2	6	285721	285726	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300112992
5544	NC_014315	GGA	2	6	285752	285757	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	300112992
5545	NC_014315	GCA	2	6	285763	285768	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300112992
5546	NC_014315	GC	3	6	285797	285802	0 %	0 %	50 %	50 %	300112992
5547	NC_014315	GAGCT	2	10	285805	285814	20 %	20 %	40 %	20 %	300112992
5548	NC_014315	TTA	2	6	285891	285896	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	300112992
5549	NC_014315	AATT	2	8	285979	285986	50 %	50 %	0 %	0 %	300112992
5550	NC_014315	GCT	2	6	286101	286106	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300112992
5551	NC_014315	GTT	2	6	286125	286130	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	300112992
5552	NC_014315	CAG	2	6	286207	286212	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300112992
5553	NC_014315	AGC	2	6	286290	286295	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5554	NC_014315	GAGTA	2	10	286326	286335	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
5555	NC_014315	ACC	2	6	286369	286374	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	300112993
5556	NC_014315	ACC	2	6	286441	286446	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	300112993
5557	NC_014315	TGG	2	6	286484	286489	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	300112993
5558	NC_014315	GGCA	2	8	286505	286512	25 %	0 %	50 %	25 %	300112993
5559	NC_014315	TGA	2	6	286569	286574	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300112993
5560	NC_014315	GTG	2	6	286579	286584	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	300112993
5561	NC_014315	A	7	7	286660	286666	100 %	0 %	0 %	0 %	300112993
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5589	NC_014315	AGCA	2	8	287675	287682	50 %	0 %	25 %	25 %	300112993
5590	NC_014315	TAA	2	6	287688	287693	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	300112993
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5598	NC_014315	AGGCA	2	10	288189	288198	40 %	0 %	40 %	20 %	300112993
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5603	NC_014315	GGGCCT	2	12	288306	288317	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
5604	NC_014315	ACG	2	6	288346	288351	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5605	NC_014315	GTG	2	6	288374	288379	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5606	NC_014315	AAG	2	6	288488	288493	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	300112994
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5609	NC_014315	TTCT	2	8	288591	288598	0 %	75 %	0 %	25 %	300112994
5610	NC_014315	G	6	6	288671	288676	0 %	0 %	100 %	0 %	300112994
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5618	NC_014315	T	7	7	288968	288974	0 %	100 %	0 %	0 %	300112994
5619	NC_014315	GTG	2	6	289044	289049	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	300112994
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5622	NC_014315	TCG	2	6	289254	289259	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300112994
5623	NC_014315	CGG	2	6	289384	289389	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300112994
5624	NC_014315	TCT	2	6	289402	289407	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	300112994
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5630	NC_014315	GGC	2	6	289614	289619	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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5651	NC_014315	AGG	2	6	290675	290680	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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5745	NC_014315	GAT	2	6	296037	296042	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300112999
5746	NC_014315	GCA	2	6	296176	296181	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300112999
5747	NC_014315	GCA	2	6	296326	296331	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300112999
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5754	NC_014315	CTAT	2	8	296699	296706	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
5755	NC_014315	A	6	6	296779	296784	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5858	NC_014315	GAG	2	6	301864	301869	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5859	NC_014315	AATT	2	8	301956	301963	50 %	50 %	0 %	0 %	300113004
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5865	NC_014315	GATG	2	8	302224	302231	25 %	25 %	50 %	0 %	300113004
5866	NC_014315	CTG	2	6	302242	302247	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300113004
5867	NC_014315	TCA	3	9	302277	302285	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300113004
5868	NC_014315	TGAG	2	8	302310	302317	25 %	25 %	50 %	0 %	300113004
5869	NC_014315	GGAAA	2	10	302333	302342	60 %	0 %	40 %	0 %	300113004
5870	NC_014315	GGCG	2	8	302350	302357	0 %	0 %	75 %	25 %	300113004
5871	NC_014315	TAA	2	6	302465	302470	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	300113004
5872	NC_014315	ATC	2	6	302505	302510	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300113004
5873	NC_014315	TCCA	2	8	302657	302664	25 %	25 %	0 %	50 %	300113004
5874	NC_014315	TCC	2	6	302708	302713	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	300113004
5875	NC_014315	CCA	2	6	302725	302730	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	300113004
5876	NC_014315	TTC	3	9	302753	302761	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	300113004
5877	NC_014315	AGT	2	6	302771	302776	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300113004
5878	NC_014315	TGC	2	6	302924	302929	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300113004
5879	NC_014315	GCT	2	6	302934	302939	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300113004
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5882	NC_014315	GCAA	2	8	303003	303010	50 %	0 %	25 %	25 %	300113004
5883	NC_014315	GAT	2	6	303029	303034	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300113004
5884	NC_014315	TCA	2	6	303042	303047	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300113004
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5887	NC_014315	CCG	2	6	303190	303195	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300113004
5888	NC_014315	GTC	2	6	303203	303208	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300113004
5889	NC_014315	TAA	2	6	303212	303217	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	300113004
5890	NC_014315	AT	3	6	303219	303224	50 %	50 %	0 %	0 %	300113004
5891	NC_014315	GGC	2	6	303232	303237	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300113004
5892	NC_014315	AGTG	2	8	303272	303279	25 %	25 %	50 %	0 %	300113004
5893	NC_014315	TCA	2	6	303348	303353	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300113004
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5895	NC_014315	GGTG	2	8	303469	303476	0 %	25 %	75 %	0 %	300113004
5896	NC_014315	AGC	2	6	303485	303490	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300113004
5897	NC_014315	ATT	2	6	303506	303511	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	300113004
5898	NC_014315	TAA	2	6	303735	303740	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5899	NC_014315	TAT	2	6	303756	303761	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	300113005
5900	NC_014315	CTTC	2	8	303811	303818	0 %	50 %	0 %	50 %	300113005
5901	NC_014315	GGC	2	6	303863	303868	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300113005
5902	NC_014315	CAT	2	6	303872	303877	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300113005
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5905	NC_014315	TAA	2	6	304000	304005	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	300113005
5906	NC_014315	TGG	2	6	304043	304048	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	300113006
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5908	NC_014315	ATC	2	6	304270	304275	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300113006
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5927	NC_014315	CTG	2	6	305135	305140	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300113007
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5932	NC_014315	CCTGAT	2	12	305235	305246	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	300113007
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5934	NC_014315	TCA	2	6	305294	305299	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5935	NC_014315	G	6	6	305346	305351	0 %	0 %	100 %	0 %	300113008
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5943	NC_014315	GCT	2	6	305770	305775	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300113008
5944	NC_014315	GGAGT	2	10	305908	305917	20 %	20 %	60 %	0 %	300113008
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5950	NC_014315	TGC	2	6	306203	306208	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300113009
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5952	NC_014315	TGC	2	6	306311	306316	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300113009
5953	NC_014315	CAG	2	6	306329	306334	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300113009
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5955	NC_014315	TGC	2	6	306392	306397	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300113010
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5957	NC_014315	T	7	7	306451	306457	0 %	100 %	0 %	0 %	300113010
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5963	NC_014315	TA	3	6	306652	306657	50 %	50 %	0 %	0 %	300113010
5964	NC_014315	GCT	2	6	306714	306719	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5965	NC_014315	TTTG	2	8	306726	306733	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
5966	NC_014315	CTG	2	6	306943	306948	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300113011
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5969	NC_014315	CATG	2	8	307043	307050	25 %	25 %	25 %	25 %	300113011
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5971	NC_014315	A	6	6	307111	307116	100 %	0 %	0 %	0 %	300113011
5972	NC_014315	CTG	2	6	307119	307124	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300113011
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5975	NC_014315	TAAG	2	8	307151	307158	50 %	25 %	25 %	0 %	300113011
5976	NC_014315	CTT	2	6	307199	307204	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	300113011
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5979	NC_014315	TGA	2	6	307387	307392	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300113011
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5985	NC_014315	TTC	2	6	307698	307703	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	300113011
5986	NC_014315	ATAG	2	8	307715	307722	50 %	25 %	25 %	0 %	300113011
5987	NC_014315	CTT	2	6	307724	307729	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	300113011
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