MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111 chromosome 2

Total Repeats: 782

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014211	CCGGG	2	10	1338	1347	0 %	0 %	60 %	40 %	297563786
2	NC_014211	CGCGG	2	10	1844	1853	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
3	NC_014211	CCGGA	2	10	2134	2143	20 %	0 %	40 %	40 %	297563787
4	NC_014211	GCCGC	2	10	4381	4390	0 %	0 %	40 %	60 %	297563789
5	NC_014211	CCGCA	2	10	5163	5172	20 %	0 %	20 %	60 %	297563789
6	NC_014211	GAGGC	2	10	5679	5688	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
7	NC_014211	ACGAC	2	10	5743	5752	40 %	0 %	20 %	40 %	297563790
8	NC_014211	GCACG	2	10	5820	5829	20 %	0 %	40 %	40 %	297563790
9	NC_014211	GGGCG	2	10	5831	5840	0 %	0 %	80 %	20 %	297563790
10	NC_014211	TGGCG	2	10	6166	6175	0 %	20 %	60 %	20 %	297563790
11	NC_014211	CGGCG	2	10	6186	6195	0 %	0 %	60 %	40 %	297563790
12	NC_014211	TGGTG	2	10	6754	6763	0 %	40 %	60 %	0 %	297563790
13	NC_014211	GCGCG	2	10	6784	6793	0 %	0 %	60 %	40 %	297563790
14	NC_014211	CCGGC	2	10	8068	8077	0 %	0 %	40 %	60 %	297563792
15	NC_014211	CTCCG	2	10	8552	8561	0 %	20 %	20 %	60 %	297563792
16	NC_014211	GGCCG	2	10	10690	10699	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
17	NC_014211	CCCGG	2	10	11102	11111	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
18	NC_014211	GCGCC	2	10	11242	11251	0 %	0 %	40 %	60 %	297563795
19	NC_014211	CGGGG	2	10	12696	12705	0 %	0 %	80 %	20 %	297563796
20	NC_014211	GGCCC	2	10	13620	13629	0 %	0 %	40 %	60 %	297563797
21	NC_014211	ACGGG	2	10	14024	14033	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
22	NC_014211	GGCCG	2	10	14503	14512	0 %	0 %	60 %	40 %	297563798
23	NC_014211	CCTCG	2	10	14727	14736	0 %	20 %	20 %	60 %	297563798
24	NC_014211	GCCGG	2	10	15244	15253	0 %	0 %	60 %	40 %	297563798
25	NC_014211	CCGGA	2	10	15338	15347	20 %	0 %	40 %	40 %	297563798
26	NC_014211	CACGC	2	10	15437	15446	20 %	0 %	20 %	60 %	297563798
27	NC_014211	CGGGA	2	10	17970	17979	20 %	0 %	60 %	20 %	297563801
28	NC_014211	GAGGG	2	10	19037	19046	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
29	NC_014211	CCCGG	2	10	19981	19990	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
30	NC_014211	CCGGT	2	10	20161	20170	0 %	20 %	40 %	40 %	297563805
31	NC_014211	GTCCG	2	10	20993	21002	0 %	20 %	40 %	40 %	297563807
32	NC_014211	CCTGG	2	10	23965	23974	0 %	20 %	40 %	40 %	297563810
33	NC_014211	GGCCA	2	10	30259	30268	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
34	NC_014211	CGGCC	2	10	30763	30772	0 %	0 %	40 %	60 %	297563817
35	NC_014211	CGCGT	2	10	31538	31547	0 %	20 %	40 %	40 %	297563817
36	NC_014211	CCGGA	2	10	32050	32059	20 %	0 %	40 %	40 %	297563818
37	NC_014211	GCCGC	2	10	32935	32944	0 %	0 %	40 %	60 %	297563819
38	NC_014211	CCAGC	2	10	33001	33010	20 %	0 %	20 %	60 %	297563819
39	NC_014211	CGGGT	2	10	33260	33269	0 %	20 %	60 %	20 %	297563819
40	NC_014211	CGGTC	2	10	34496	34505	0 %	20 %	40 %	40 %	297563820
41	NC_014211	GCCCG	2	10	36002	36011	0 %	0 %	40 %	60 %	297563822
42	NC_014211	GCCCT	2	10	36069	36078	0 %	20 %	20 %	60 %	297563822
43	NC_014211	CCTCG	2	10	36575	36584	0 %	20 %	20 %	60 %	297563822
44	NC_014211	GGTGT	2	10	37303	37312	0 %	40 %	60 %	0 %	297563823
45	NC_014211	GCCGG	2	10	37990	37999	0 %	0 %	60 %	40 %	297563823
46	NC_014211	TCGGC	2	10	38189	38198	0 %	20 %	40 %	40 %	297563823
47	NC_014211	GCCCG	2	10	38332	38341	0 %	0 %	40 %	60 %	297563824
48	NC_014211	CGCTG	2	10	40924	40933	0 %	20 %	40 %	40 %	297563826
49	NC_014211	GCCCG	2	10	41445	41454	0 %	0 %	40 %	60 %	297563826
50	NC_014211	GCCCG	2	10	43309	43318	0 %	0 %	40 %	60 %	297563827
51	NC_014211	ACCAC	2	10	43358	43367	40 %	0 %	0 %	60 %	297563827
52	NC_014211	GGCCT	2	10	44530	44539	0 %	20 %	40 %	40 %	297563827
53	NC_014211	GGACG	2	10	45483	45492	20 %	0 %	60 %	20 %	297563827
54	NC_014211	CCTGG	2	10	47460	47469	0 %	20 %	40 %	40 %	297563829
55	NC_014211	CGAAG	2	10	47662	47671	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
56	NC_014211	CCGCG	2	10	49241	49250	0 %	0 %	40 %	60 %	297563831
57	NC_014211	TCCGC	2	10	49637	49646	0 %	20 %	20 %	60 %	297563832
58	NC_014211	GGCCC	2	10	49667	49676	0 %	0 %	40 %	60 %	297563832
59	NC_014211	CCGCC	2	10	50545	50554	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
60	NC_014211	ACCCG	2	10	51659	51668	20 %	0 %	20 %	60 %	297563834
61	NC_014211	GCGAG	2	10	56274	56283	20 %	0 %	60 %	20 %	297563838
62	NC_014211	CACCG	2	10	57343	57352	20 %	0 %	20 %	60 %	297563839
63	NC_014211	CCGCC	2	10	58573	58582	0 %	0 %	20 %	80 %	297563839
64	NC_014211	GCGCC	2	10	59523	59532	0 %	0 %	40 %	60 %	297563841
65	NC_014211	GCGCC	2	10	60337	60346	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
66	NC_014211	CGCGG	2	10	60367	60376	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
67	NC_014211	GGTCG	2	10	61893	61902	0 %	20 %	60 %	20 %	297563843
68	NC_014211	ACCAC	2	10	62411	62420	40 %	0 %	0 %	60 %	297563843
69	NC_014211	TCCCT	2	10	63695	63704	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
70	NC_014211	CCGCG	2	10	64263	64272	0 %	0 %	40 %	60 %	297563844
71	NC_014211	CTCGC	2	10	65646	65655	0 %	20 %	20 %	60 %	297563846
72	NC_014211	TCGAT	2	10	68050	68059	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
73	NC_014211	CCCAC	2	10	68538	68547	20 %	0 %	0 %	80 %	297563848
74	NC_014211	GACCA	2	10	70356	70365	40 %	0 %	20 %	40 %	297563849
75	NC_014211	GCGGG	2	10	70502	70511	0 %	0 %	80 %	20 %	297563849
76	NC_014211	CGGCG	2	10	70892	70901	0 %	0 %	60 %	40 %	297563849
77	NC_014211	GCCCG	2	10	72552	72561	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
78	NC_014211	CTGGC	2	10	74649	74658	0 %	20 %	40 %	40 %	297563853
79	NC_014211	GAAGG	2	10	76939	76948	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
80	NC_014211	GCCCC	2	10	77093	77102	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
81	NC_014211	CCGAC	2	10	78484	78493	20 %	0 %	20 %	60 %	297563856
82	NC_014211	CCGTG	2	10	80335	80344	0 %	20 %	40 %	40 %	297563858
83	NC_014211	CCTGC	2	10	80892	80901	0 %	20 %	20 %	60 %	297563859
84	NC_014211	CCGTC	2	10	81017	81026	0 %	20 %	20 %	60 %	297563859
85	NC_014211	CGGGG	2	10	81846	81855	0 %	0 %	80 %	20 %	297563859
86	NC_014211	CCCGT	2	10	82106	82115	0 %	20 %	20 %	60 %	297563860
87	NC_014211	CGGGA	2	10	83329	83338	20 %	0 %	60 %	20 %	297563861
88	NC_014211	GGACC	2	10	83799	83808	20 %	0 %	40 %	40 %	297563861
89	NC_014211	CCGAC	2	10	85080	85089	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
90	NC_014211	GCCCC	2	10	86385	86394	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
91	NC_014211	CGACC	2	10	86473	86482	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
92	NC_014211	GTCGA	2	10	87079	87088	20 %	20 %	40 %	20 %	297563864
93	NC_014211	CGCGG	2	10	87262	87271	0 %	0 %	60 %	40 %	297563864
94	NC_014211	GCGCC	2	10	90366	90375	0 %	0 %	40 %	60 %	297563866
95	NC_014211	CGGGG	2	10	90483	90492	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
96	NC_014211	AGCGG	2	10	90527	90536	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
97	NC_014211	CACCC	2	10	90626	90635	20 %	0 %	0 %	80 %	Non-Coding
98	NC_014211	CGTGA	2	10	92281	92290	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
99	NC_014211	GGCGA	2	10	93037	93046	20 %	0 %	60 %	20 %	297563868
100	NC_014211	GCCCA	2	10	94735	94744	20 %	0 %	20 %	60 %	297563868
101	NC_014211	GCCCA	2	10	95125	95134	20 %	0 %	20 %	60 %	297563868
102	NC_014211	GCGCC	2	10	95145	95154	0 %	0 %	40 %	60 %	297563868
103	NC_014211	GCGCC	2	10	95328	95337	0 %	0 %	40 %	60 %	297563868
104	NC_014211	CCCCG	2	10	95499	95508	0 %	0 %	20 %	80 %	297563868
105	NC_014211	GGTCG	2	10	96037	96046	0 %	20 %	60 %	20 %	297563869
106	NC_014211	CGGCC	2	10	97672	97681	0 %	0 %	40 %	60 %	297563869
107	NC_014211	CAGGA	2	10	97793	97802	40 %	0 %	40 %	20 %	297563869
108	NC_014211	GAGCG	2	10	99770	99779	20 %	0 %	60 %	20 %	297563871
109	NC_014211	GCCCT	2	10	100875	100884	0 %	20 %	20 %	60 %	297563871
110	NC_014211	GCGGG	2	10	103809	103818	0 %	0 %	80 %	20 %	297563877
111	NC_014211	CGGTG	2	10	104143	104152	0 %	20 %	60 %	20 %	297563877
112	NC_014211	CGGTG	2	10	104568	104577	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
113	NC_014211	CGGAG	2	10	105076	105085	20 %	0 %	60 %	20 %	297563879
114	NC_014211	GGCCT	2	10	105443	105452	0 %	20 %	40 %	40 %	297563879
115	NC_014211	CGAGG	2	10	106298	106307	20 %	0 %	60 %	20 %	297563881
116	NC_014211	CGGGG	2	10	108497	108506	0 %	0 %	80 %	20 %	297563882
117	NC_014211	GACCG	2	10	109191	109200	20 %	0 %	40 %	40 %	297563883
118	NC_014211	GCCGC	2	10	109748	109757	0 %	0 %	40 %	60 %	297563883
119	NC_014211	GGGGC	2	10	110851	110860	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
120	NC_014211	GCCGT	2	10	114134	114143	0 %	20 %	40 %	40 %	297563887
121	NC_014211	TCGCG	2	10	115039	115048	0 %	20 %	40 %	40 %	297563889
122	NC_014211	GTCCC	2	10	116008	116017	0 %	20 %	20 %	60 %	297563890
123	NC_014211	GACAC	2	10	116539	116548	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
124	NC_014211	GCTGC	2	10	117651	117660	0 %	20 %	40 %	40 %	297563892
125	NC_014211	GCGCC	2	10	118156	118165	0 %	0 %	40 %	60 %	297563892
126	NC_014211	CCTCG	2	10	119784	119793	0 %	20 %	20 %	60 %	297563894
127	NC_014211	CGCCC	2	10	120196	120205	0 %	0 %	20 %	80 %	297563895
128	NC_014211	GGCCG	2	10	120265	120274	0 %	0 %	60 %	40 %	297563895
129	NC_014211	ACCGC	2	10	121131	121140	20 %	0 %	20 %	60 %	297563896
130	NC_014211	GCGCC	2	10	121187	121196	0 %	0 %	40 %	60 %	297563896
131	NC_014211	GCCGC	2	10	121771	121780	0 %	0 %	40 %	60 %	297563896
132	NC_014211	CCGCG	2	10	121805	121814	0 %	0 %	40 %	60 %	297563896
133	NC_014211	CCCCG	2	10	122003	122012	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
134	NC_014211	CGGCT	2	10	123572	123581	0 %	20 %	40 %	40 %	297563897
135	NC_014211	GGACC	2	10	124458	124467	20 %	0 %	40 %	40 %	297563897
136	NC_014211	GCGCT	2	10	125333	125342	0 %	20 %	40 %	40 %	297563898
137	NC_014211	GGGCA	2	10	127347	127356	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
138	NC_014211	CGGGA	2	10	127406	127415	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
139	NC_014211	GGAGT	2	10	128555	128564	20 %	20 %	60 %	0 %	297563902
140	NC_014211	GGCGG	2	10	129060	129069	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
141	NC_014211	GCGCC	2	10	130242	130251	0 %	0 %	40 %	60 %	297563904
142	NC_014211	CGGAG	2	10	130443	130452	20 %	0 %	60 %	20 %	297563904
143	NC_014211	AGCGC	2	10	132038	132047	20 %	0 %	40 %	40 %	297563906
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146	NC_014211	GGGGC	2	10	135558	135567	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
147	NC_014211	AGCCG	2	10	137300	137309	20 %	0 %	40 %	40 %	297563909
148	NC_014211	AGCCG	2	10	140075	140084	20 %	0 %	40 %	40 %	297563913
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155	NC_014211	GCCCG	2	10	145907	145916	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
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170	NC_014211	CGCCC	2	10	160180	160189	0 %	0 %	20 %	80 %	297563932
171	NC_014211	GCCCC	2	10	160387	160396	0 %	0 %	20 %	80 %	297563932
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173	NC_014211	CCGTC	2	10	163853	163862	0 %	20 %	20 %	60 %	297563936
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245	NC_014211	TCCGC	2	10	247600	247609	0 %	20 %	20 %	60 %	297564014
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248	NC_014211	CGCCC	2	10	250093	250102	0 %	0 %	20 %	80 %	297564016
249	NC_014211	TTCTG	2	10	251990	251999	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
250	NC_014211	GGCCA	2	10	252087	252096	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
251	NC_014211	TCCGC	2	10	252514	252523	0 %	20 %	20 %	60 %	297564019
252	NC_014211	GCGGA	2	10	253339	253348	20 %	0 %	60 %	20 %	297564020
253	NC_014211	ACGGC	2	10	255180	255189	20 %	0 %	40 %	40 %	297564021
254	NC_014211	GCGCA	2	10	255463	255472	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
255	NC_014211	CCTGC	2	10	255573	255582	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
256	NC_014211	TGCGG	2	10	255594	255603	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
257	NC_014211	CCGCA	2	10	255618	255627	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
258	NC_014211	CCGGT	2	10	255734	255743	0 %	20 %	40 %	40 %	297564022
259	NC_014211	CCGCG	2	10	255946	255955	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
260	NC_014211	GGCCA	2	10	257353	257362	20 %	0 %	40 %	40 %	297564024
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262	NC_014211	CGTCC	2	10	261305	261314	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
263	NC_014211	TCCCG	2	10	261394	261403	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
264	NC_014211	GGTGT	2	10	261642	261651	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
265	NC_014211	TCCCG	2	10	262412	262421	0 %	20 %	20 %	60 %	297564030
266	NC_014211	GCTGG	2	10	262518	262527	0 %	20 %	60 %	20 %	297564030
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269	NC_014211	CGGTC	2	10	267469	267478	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
270	NC_014211	CGTCC	2	10	269507	269516	0 %	20 %	20 %	60 %	297564031
271	NC_014211	CGGCC	2	10	271110	271119	0 %	0 %	40 %	60 %	297564031
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287	NC_014211	GGACT	2	10	292013	292022	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
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384	NC_014211	CGTCA	2	10	392268	392277	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
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402	NC_014211	CCGGG	2	10	412251	412260	0 %	0 %	60 %	40 %	297564163
403	NC_014211	GAGCA	2	10	412580	412589	40 %	0 %	40 %	20 %	297564163
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405	NC_014211	CCCGG	2	10	415417	415426	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
406	NC_014211	GCTCC	2	10	415505	415514	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
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