MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111 chromosome 1

Total Repeats: 5997

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014210	ACCCG	2	10	124	133	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
2	NC_014210	CCGCA	2	10	257	266	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
3	NC_014210	TGGTC	2	10	336	345	0 %	40 %	40 %	20 %	297558986
4	NC_014210	CGACC	2	10	559	568	20 %	0 %	20 %	60 %	297558986
5	NC_014210	ACCAC	2	10	2145	2154	40 %	0 %	0 %	60 %	297558986
6	NC_014210	GTCCG	2	10	2324	2333	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
7	NC_014210	GAGCA	2	10	4622	4631	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
8	NC_014210	TCGCC	2	10	4726	4735	0 %	20 %	20 %	60 %	297558988
9	NC_014210	CGCGG	2	10	6951	6960	0 %	0 %	60 %	40 %	297558990
10	NC_014210	TCCGC	2	10	8640	8649	0 %	20 %	20 %	60 %	297558991
11	NC_014210	GCCGC	2	10	9371	9380	0 %	0 %	40 %	60 %	297558991
12	NC_014210	GCAGC	2	10	9987	9996	20 %	0 %	40 %	40 %	297558992
13	NC_014210	TCGGC	2	10	10262	10271	0 %	20 %	40 %	40 %	297558992
14	NC_014210	ACCGG	2	10	10646	10655	20 %	0 %	40 %	40 %	297558992
15	NC_014210	CCGGC	2	10	12066	12075	0 %	0 %	40 %	60 %	297558992
16	NC_014210	GGGCC	2	10	13391	13400	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
17	NC_014210	CGGCC	2	10	13691	13700	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
18	NC_014210	CTCCC	2	10	17133	17142	0 %	20 %	0 %	80 %	297558997
19	NC_014210	GGGCG	2	10	17426	17435	0 %	0 %	80 %	20 %	297558997
20	NC_014210	CCGCT	2	10	18381	18390	0 %	20 %	20 %	60 %	297558998
21	NC_014210	GTCCT	2	10	19397	19406	0 %	40 %	20 %	40 %	297559000
22	NC_014210	GGTCG	2	10	21807	21816	0 %	20 %	60 %	20 %	297559001
23	NC_014210	GGGGA	2	10	22156	22165	20 %	0 %	80 %	0 %	297559001
24	NC_014210	AGCGC	2	10	25572	25581	20 %	0 %	40 %	40 %	297559004
25	NC_014210	CCCTG	2	10	25599	25608	0 %	20 %	20 %	60 %	297559004
26	NC_014210	CGCGG	2	10	26987	26996	0 %	0 %	60 %	40 %	297559005
27	NC_014210	ACTGG	2	10	28072	28081	20 %	20 %	40 %	20 %	297559005
28	NC_014210	CAGCG	2	10	28289	28298	20 %	0 %	40 %	40 %	297559005
29	NC_014210	GCGAG	2	10	29832	29841	20 %	0 %	60 %	20 %	297559006
30	NC_014210	GCGAG	2	10	30536	30545	20 %	0 %	60 %	20 %	297559007
31	NC_014210	GGCAG	2	10	31213	31222	20 %	0 %	60 %	20 %	297559007
32	NC_014210	CGCGG	2	10	32186	32195	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
33	NC_014210	TCCCC	2	10	34595	34604	0 %	20 %	0 %	80 %	297559011
34	NC_014210	GACGT	2	10	35054	35063	20 %	20 %	40 %	20 %	297559011
35	NC_014210	GGGCC	2	10	35556	35565	0 %	0 %	60 %	40 %	297559011
36	NC_014210	CCGTC	2	10	37892	37901	0 %	20 %	20 %	60 %	297559013
37	NC_014210	CCGGG	2	10	38427	38436	0 %	0 %	60 %	40 %	297559013
38	NC_014210	GCCAC	2	10	40137	40146	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
39	NC_014210	CCGGT	2	10	42083	42092	0 %	20 %	40 %	40 %	297559015
40	NC_014210	TCCTC	2	10	42362	42371	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
41	NC_014210	CCCTG	2	10	42801	42810	0 %	20 %	20 %	60 %	297559016
42	NC_014210	CCTGG	2	10	43003	43012	0 %	20 %	40 %	40 %	297559016
43	NC_014210	CCCCG	2	10	43767	43776	0 %	0 %	20 %	80 %	297559017
44	NC_014210	CCCGG	2	10	45136	45145	0 %	0 %	40 %	60 %	297559019
45	NC_014210	GCCGC	2	10	45396	45405	0 %	0 %	40 %	60 %	297559019
46	NC_014210	GGGGA	2	10	46040	46049	20 %	0 %	80 %	0 %	297559019
47	NC_014210	AGGCC	2	10	48520	48529	20 %	0 %	40 %	40 %	297559021
48	NC_014210	CGGCG	2	10	49037	49046	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
49	NC_014210	ACCTG	2	10	50603	50612	20 %	20 %	20 %	40 %	297559023
50	NC_014210	CTGCC	2	10	54744	54753	0 %	20 %	20 %	60 %	297559027
51	NC_014210	CCGCC	2	10	55242	55251	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
52	NC_014210	GCGTC	2	10	55905	55914	0 %	20 %	40 %	40 %	297559028
53	NC_014210	GCCCG	2	10	57637	57646	0 %	0 %	40 %	60 %	297559030
54	NC_014210	GGCAC	2	10	60461	60470	20 %	0 %	40 %	40 %	297559032
55	NC_014210	CCGGG	2	10	60821	60830	0 %	0 %	60 %	40 %	297559032
56	NC_014210	AGGCC	2	10	64493	64502	20 %	0 %	40 %	40 %	297559036
57	NC_014210	ACCGG	2	10	66676	66685	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
58	NC_014210	AACCG	2	10	66711	66720	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
59	NC_014210	TAAAG	2	10	66855	66864	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
60	NC_014210	CGGGT	2	10	67101	67110	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
61	NC_014210	TCGTG	2	10	68174	68183	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
62	NC_014210	CGTCA	2	10	68511	68520	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
63	NC_014210	GGGTG	2	10	72335	72344	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
64	NC_014210	GGCAC	2	10	73772	73781	20 %	0 %	40 %	40 %	297559040
65	NC_014210	AGGGG	2	10	74741	74750	20 %	0 %	80 %	0 %	297559041
66	NC_014210	CTGGT	2	10	76511	76520	0 %	40 %	40 %	20 %	297559042
67	NC_014210	TCGTC	2	10	76614	76623	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
68	NC_014210	GCCGG	2	10	79161	79170	0 %	0 %	60 %	40 %	297559045
69	NC_014210	CCGCC	2	10	79615	79624	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
70	NC_014210	GGCGG	2	10	79683	79692	0 %	0 %	80 %	20 %	297559046
71	NC_014210	GCCGC	2	10	80478	80487	0 %	0 %	40 %	60 %	297559047
72	NC_014210	CTGGC	2	10	80535	80544	0 %	20 %	40 %	40 %	297559047
73	NC_014210	CAGCG	2	10	81297	81306	20 %	0 %	40 %	40 %	297559047
74	NC_014210	CCGCT	2	10	81328	81337	0 %	20 %	20 %	60 %	297559047
75	NC_014210	CGTGG	2	10	81497	81506	0 %	20 %	60 %	20 %	297559047
76	NC_014210	GCCGC	2	10	84304	84313	0 %	0 %	40 %	60 %	297559048
77	NC_014210	GGTCA	2	10	84463	84472	20 %	20 %	40 %	20 %	297559048
78	NC_014210	GCCGC	2	10	84668	84677	0 %	0 %	40 %	60 %	297559048
79	NC_014210	CCCGG	2	10	87145	87154	0 %	0 %	40 %	60 %	297559049
80	NC_014210	GCCCG	2	10	87180	87189	0 %	0 %	40 %	60 %	297559049
81	NC_014210	GGCGC	2	10	89179	89188	0 %	0 %	60 %	40 %	297559051
82	NC_014210	CAGCG	2	10	91782	91791	20 %	0 %	40 %	40 %	297559053
83	NC_014210	CCGGG	2	10	95051	95060	0 %	0 %	60 %	40 %	297559058
84	NC_014210	AGCCC	2	10	96376	96385	20 %	0 %	20 %	60 %	297559059
85	NC_014210	GCCAA	2	10	96984	96993	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
86	NC_014210	GCCGC	2	10	98316	98325	0 %	0 %	40 %	60 %	297559060
87	NC_014210	CCGGG	2	10	98626	98635	0 %	0 %	60 %	40 %	297559060
88	NC_014210	CCGAC	2	10	100348	100357	20 %	0 %	20 %	60 %	297559061
89	NC_014210	AGCCC	2	10	102841	102850	20 %	0 %	20 %	60 %	297559063
90	NC_014210	TGCCC	2	10	103813	103822	0 %	20 %	20 %	60 %	297559065
91	NC_014210	GAGGC	2	10	105598	105607	20 %	0 %	60 %	20 %	297559066
92	NC_014210	GCCTG	2	10	106082	106091	0 %	20 %	40 %	40 %	297559066
93	NC_014210	CTGGG	2	10	108707	108716	0 %	20 %	60 %	20 %	297559068
94	NC_014210	GGCCT	2	10	109240	109249	0 %	20 %	40 %	40 %	297559069
95	NC_014210	CCGCG	2	10	110206	110215	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
96	NC_014210	AGGGG	2	10	110624	110633	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
97	NC_014210	CGGCG	2	10	117257	117266	0 %	0 %	60 %	40 %	297559075
98	NC_014210	ACCGG	2	10	117375	117384	20 %	0 %	40 %	40 %	297559075
99	NC_014210	GGGGA	2	10	117476	117485	20 %	0 %	80 %	0 %	297559075
100	NC_014210	GGGAC	2	10	117925	117934	20 %	0 %	60 %	20 %	297559075
101	NC_014210	GCGGG	3	15	118598	118612	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
102	NC_014210	CGGGG	2	10	118636	118645	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
103	NC_014210	ACCCC	2	10	119306	119315	20 %	0 %	0 %	80 %	297559076
104	NC_014210	CGGGG	2	10	119338	119347	0 %	0 %	80 %	20 %	297559076
105	NC_014210	GCGCC	2	10	121151	121160	0 %	0 %	40 %	60 %	297559079
106	NC_014210	CCGTG	2	10	122165	122174	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
107	NC_014210	GCGAC	2	10	122248	122257	20 %	0 %	40 %	40 %	297559081
108	NC_014210	TGCTC	2	10	125104	125113	0 %	40 %	20 %	40 %	297559082
109	NC_014210	CGCGG	2	10	129810	129819	0 %	0 %	60 %	40 %	297559086
110	NC_014210	GTGAT	2	10	132693	132702	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
111	NC_014210	GGCGC	2	10	138964	138973	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
112	NC_014210	CACCG	2	10	139169	139178	20 %	0 %	20 %	60 %	297559092
113	NC_014210	GCCGC	2	10	139214	139223	0 %	0 %	40 %	60 %	297559092
114	NC_014210	TGTGG	2	10	140723	140732	0 %	40 %	60 %	0 %	297559094
115	NC_014210	ACTCG	2	10	141084	141093	20 %	20 %	20 %	40 %	297559094
116	NC_014210	GCTCA	2	10	142922	142931	20 %	20 %	20 %	40 %	297559095
117	NC_014210	AGGTC	2	10	144074	144083	20 %	20 %	40 %	20 %	297559096
118	NC_014210	GACGA	2	10	144259	144268	40 %	0 %	40 %	20 %	297559096
119	NC_014210	CGCGC	2	10	148188	148197	0 %	0 %	40 %	60 %	297559101
120	NC_014210	GGGGA	2	10	150022	150031	20 %	0 %	80 %	0 %	297559103
121	NC_014210	GGTCT	2	10	150385	150394	0 %	40 %	40 %	20 %	297559103
122	NC_014210	CAGGA	2	10	151375	151384	40 %	0 %	40 %	20 %	297559104
123	NC_014210	TGGGG	2	10	152231	152240	0 %	20 %	80 %	0 %	297559104
124	NC_014210	CGGTC	2	10	152557	152566	0 %	20 %	40 %	40 %	297559105
125	NC_014210	CGGAG	2	10	152903	152912	20 %	0 %	60 %	20 %	297559105
126	NC_014210	TGCGG	2	10	154372	154381	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
127	NC_014210	CGGGG	2	10	154428	154437	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
128	NC_014210	GGACA	2	10	154551	154560	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
129	NC_014210	GTGGG	2	10	154619	154628	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
130	NC_014210	TGGAC	2	10	155064	155073	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
131	NC_014210	CCAGG	2	10	155114	155123	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
132	NC_014210	TATCC	2	10	155736	155745	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
133	NC_014210	GGCGG	2	10	158653	158662	0 %	0 %	80 %	20 %	297559111
134	NC_014210	TCCGT	2	10	158987	158996	0 %	40 %	20 %	40 %	297559112
135	NC_014210	GGCCC	2	10	159226	159235	0 %	0 %	40 %	60 %	297559112
136	NC_014210	GCCCG	2	10	160854	160863	0 %	0 %	40 %	60 %	297559113
137	NC_014210	GGCCC	2	10	161395	161404	0 %	0 %	40 %	60 %	297559114
138	NC_014210	CAGGC	2	10	161963	161972	20 %	0 %	40 %	40 %	297559114
139	NC_014210	TCGGC	2	10	162888	162897	0 %	20 %	40 %	40 %	297559115
140	NC_014210	CGCGG	2	10	164936	164945	0 %	0 %	60 %	40 %	297559117
141	NC_014210	GAGAA	2	10	165891	165900	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
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147	NC_014210	TGCCC	2	10	167892	167901	0 %	20 %	20 %	60 %	297559119
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149	NC_014210	CCGGA	2	10	168185	168194	20 %	0 %	40 %	40 %	297559119
150	NC_014210	TGCGT	2	10	172206	172215	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
151	NC_014210	ACGCG	2	10	173358	173367	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
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153	NC_014210	ACGCG	2	10	179256	179265	20 %	0 %	40 %	40 %	297559125
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165	NC_014210	CCGGG	2	10	191612	191621	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
166	NC_014210	GCGGA	2	10	192426	192435	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
167	NC_014210	CGGCG	2	10	192475	192484	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
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187	NC_014210	CCTCG	2	10	222556	222565	0 %	20 %	20 %	60 %	297559156
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191	NC_014210	GCTCC	2	10	224516	224525	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
192	NC_014210	GCGCG	2	10	224973	224982	0 %	0 %	60 %	40 %	297559158
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196	NC_014210	CCGGG	2	10	227549	227558	0 %	0 %	60 %	40 %	297559159
197	NC_014210	CGGAG	2	10	228670	228679	20 %	0 %	60 %	20 %	297559160
198	NC_014210	CGCGG	2	10	229146	229155	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
199	NC_014210	CCGCC	2	10	229585	229594	0 %	0 %	20 %	80 %	297559161
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236	NC_014210	CTGGA	2	10	265263	265272	20 %	20 %	40 %	20 %	297559194
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239	NC_014210	ACCGC	2	10	269477	269486	20 %	0 %	20 %	60 %	297559198
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242	NC_014210	CGCGC	2	10	272939	272948	0 %	0 %	40 %	60 %	297559199
243	NC_014210	GCCGA	2	10	273300	273309	20 %	0 %	40 %	40 %	297559199
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248	NC_014210	CCGCC	2	10	278266	278275	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
249	NC_014210	AGCCC	2	10	280534	280543	20 %	0 %	20 %	60 %	297559204
250	NC_014210	CCGGA	2	10	282635	282644	20 %	0 %	40 %	40 %	297559205
251	NC_014210	GTGTC	2	10	283598	283607	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
252	NC_014210	GCTCC	2	10	284036	284045	0 %	20 %	20 %	60 %	297559206
253	NC_014210	CCCCT	2	10	286036	286045	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
254	NC_014210	CTCGG	2	10	286548	286557	0 %	20 %	40 %	40 %	297559211
255	NC_014210	GGCCC	2	10	287971	287980	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
256	NC_014210	GGGCG	2	10	289960	289969	0 %	0 %	80 %	20 %	297559214
257	NC_014210	CGCGG	2	10	290245	290254	0 %	0 %	60 %	40 %	297559215
258	NC_014210	GGCCG	2	10	290331	290340	0 %	0 %	60 %	40 %	297559215
259	NC_014210	CGCGG	2	10	290393	290402	0 %	0 %	60 %	40 %	297559215
260	NC_014210	CCCGG	2	10	290849	290858	0 %	0 %	40 %	60 %	297559215
261	NC_014210	TCCGC	2	10	291708	291717	0 %	20 %	20 %	60 %	297559216
262	NC_014210	TCCGC	2	10	292855	292864	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
263	NC_014210	CTCCA	2	10	294727	294736	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
264	NC_014210	AAGGC	2	10	294961	294970	40 %	0 %	40 %	20 %	297559219
265	NC_014210	GCGCC	2	10	300650	300659	0 %	0 %	40 %	60 %	297559225
266	NC_014210	CGAAG	3	15	301889	301903	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
267	NC_014210	AGCCC	2	10	303307	303316	20 %	0 %	20 %	60 %	297559227
268	NC_014210	GAGCC	2	10	303873	303882	20 %	0 %	40 %	40 %	297559227
269	NC_014210	GCCCT	2	10	304158	304167	0 %	20 %	20 %	60 %	297559227
270	NC_014210	GCCCT	2	10	304194	304203	0 %	20 %	20 %	60 %	297559227
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272	NC_014210	GGCCG	2	10	305973	305982	0 %	0 %	60 %	40 %	297559229
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497	NC_014210	GCGCC	2	10	551549	551558	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
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