MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Nitrosococcus halophilus Nc4 chromosome

Total Repeats: 9985

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013960	CAAT	2	8	372	379	50 %	25 %	0 %	25 %	292490171
2	NC_013960	ATCG	2	8	562	569	25 %	25 %	25 %	25 %	292490171
3	NC_013960	ATGC	2	8	736	743	25 %	25 %	25 %	25 %	292490171
4	NC_013960	TCCA	2	8	2071	2078	25 %	25 %	0 %	50 %	292490172
5	NC_013960	TATT	2	8	3180	3187	25 %	75 %	0 %	0 %	292490173
6	NC_013960	GTAT	2	8	4244	4251	25 %	50 %	25 %	0 %	292490174
7	NC_013960	AGTG	2	8	4347	4354	25 %	25 %	50 %	0 %	292490174
8	NC_013960	GAGG	2	8	5064	5071	25 %	0 %	75 %	0 %	292490174
9	NC_013960	TCCT	2	8	5498	5505	0 %	50 %	0 %	50 %	292490174
10	NC_013960	TCAG	2	8	6455	6462	25 %	25 %	25 %	25 %	292490174
11	NC_013960	AACC	2	8	6804	6811	50 %	0 %	0 %	50 %	292490175
12	NC_013960	CGTT	2	8	7249	7256	0 %	50 %	25 %	25 %	292490175
13	NC_013960	TAAA	2	8	7400	7407	75 %	25 %	0 %	0 %	292490175
14	NC_013960	CCAT	2	8	7738	7745	25 %	25 %	0 %	50 %	292490175
15	NC_013960	CCGC	2	8	7746	7753	0 %	0 %	25 %	75 %	292490175
16	NC_013960	GACT	2	8	7868	7875	25 %	25 %	25 %	25 %	292490175
17	NC_013960	CCAC	2	8	7957	7964	25 %	0 %	0 %	75 %	292490175
18	NC_013960	GCTG	2	8	8182	8189	0 %	25 %	50 %	25 %	292490176
19	NC_013960	CAGT	2	8	8516	8523	25 %	25 %	25 %	25 %	292490176
20	NC_013960	GGTA	2	8	8962	8969	25 %	25 %	50 %	0 %	292490176
21	NC_013960	CGCC	2	8	9109	9116	0 %	0 %	25 %	75 %	292490176
22	NC_013960	TCAG	2	8	9270	9277	25 %	25 %	25 %	25 %	292490176
23	NC_013960	ATTT	2	8	9333	9340	25 %	75 %	0 %	0 %	292490176
24	NC_013960	GCTG	2	8	10137	10144	0 %	25 %	50 %	25 %	292490178
25	NC_013960	CTTG	2	8	10177	10184	0 %	50 %	25 %	25 %	292490178
26	NC_013960	TCAA	2	8	11230	11237	50 %	25 %	0 %	25 %	292490179
27	NC_013960	GCGA	2	8	11281	11288	25 %	0 %	50 %	25 %	292490179
28	NC_013960	CTGG	2	8	11555	11562	0 %	25 %	50 %	25 %	292490179
29	NC_013960	CCAG	2	8	11701	11708	25 %	0 %	25 %	50 %	292490179
30	NC_013960	ACCA	2	8	11720	11727	50 %	0 %	0 %	50 %	292490179
31	NC_013960	GGGT	2	8	11982	11989	0 %	25 %	75 %	0 %	292490179
32	NC_013960	TTTG	2	8	12189	12196	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
33	NC_013960	GCTT	2	8	12344	12351	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
34	NC_013960	CACC	2	8	12510	12517	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
35	NC_013960	TTGC	2	8	12673	12680	0 %	50 %	25 %	25 %	292490180
36	NC_013960	GATG	2	8	12924	12931	25 %	25 %	50 %	0 %	292490180
37	NC_013960	ACCG	2	8	13313	13320	25 %	0 %	25 %	50 %	292490180
38	NC_013960	GAAA	2	8	14110	14117	75 %	0 %	25 %	0 %	292490180
39	NC_013960	CCTT	2	8	14716	14723	0 %	50 %	0 %	50 %	292490181
40	NC_013960	ATGG	2	8	15466	15473	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
41	NC_013960	GCGG	2	8	16193	16200	0 %	0 %	75 %	25 %	292490182
42	NC_013960	GCAG	2	8	17049	17056	25 %	0 %	50 %	25 %	292490183
43	NC_013960	ATTA	2	8	17184	17191	50 %	50 %	0 %	0 %	292490183
44	NC_013960	TAGC	2	8	17700	17707	25 %	25 %	25 %	25 %	292490184
45	NC_013960	CCGG	2	8	17737	17744	0 %	0 %	50 %	50 %	292490184
46	NC_013960	GTGG	2	8	17750	17757	0 %	25 %	75 %	0 %	292490184
47	NC_013960	AAAG	2	8	18151	18158	75 %	0 %	25 %	0 %	292490184
48	NC_013960	TTGA	2	8	18662	18669	25 %	50 %	25 %	0 %	292490184
49	NC_013960	GCTT	2	8	18722	18729	0 %	50 %	25 %	25 %	292490184
50	NC_013960	CAGG	2	8	19268	19275	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
51	NC_013960	GGTA	2	8	19385	19392	25 %	25 %	50 %	0 %	292490185
52	NC_013960	GTAC	2	8	19624	19631	25 %	25 %	25 %	25 %	292490185
53	NC_013960	GCCC	2	8	19685	19692	0 %	0 %	25 %	75 %	292490185
54	NC_013960	TTTA	2	8	19719	19726	25 %	75 %	0 %	0 %	292490185
55	NC_013960	GCTT	2	8	19819	19826	0 %	50 %	25 %	25 %	292490185
56	NC_013960	CTTT	2	8	20925	20932	0 %	75 %	0 %	25 %	292490186
57	NC_013960	AGCG	2	8	22934	22941	25 %	0 %	50 %	25 %	292490188
58	NC_013960	GTCG	2	8	24304	24311	0 %	25 %	50 %	25 %	292490189
59	NC_013960	GCGG	2	8	24490	24497	0 %	0 %	75 %	25 %	292490189
60	NC_013960	ATCA	2	8	24506	24513	50 %	25 %	0 %	25 %	292490189
61	NC_013960	TCCT	2	8	24689	24696	0 %	50 %	0 %	50 %	292490189
62	NC_013960	AGGA	2	8	24706	24713	50 %	0 %	50 %	0 %	292490189
63	NC_013960	GGTA	2	8	25632	25639	25 %	25 %	50 %	0 %	292490189
64	NC_013960	TCAA	2	8	25865	25872	50 %	25 %	0 %	25 %	292490190
65	NC_013960	TATT	2	8	26469	26476	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_013960	TAAG	2	8	26513	26520	50 %	25 %	25 %	0 %	292490191
67	NC_013960	TGGA	2	8	26725	26732	25 %	25 %	50 %	0 %	292490191
68	NC_013960	AGCA	2	8	27564	27571	50 %	0 %	25 %	25 %	292490191
69	NC_013960	TATC	2	8	27796	27803	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
70	NC_013960	CCAG	2	8	27827	27834	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
71	NC_013960	GCTC	2	8	28344	28351	0 %	25 %	25 %	50 %	292490192
72	NC_013960	ATCC	2	8	29293	29300	25 %	25 %	0 %	50 %	292490192
73	NC_013960	CATC	2	8	29822	29829	25 %	25 %	0 %	50 %	292490192
74	NC_013960	CCTC	2	8	30109	30116	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
75	NC_013960	TGCA	2	8	30439	30446	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
76	NC_013960	ACCA	2	8	30687	30694	50 %	0 %	0 %	50 %	292490193
77	NC_013960	TGCT	2	8	30727	30734	0 %	50 %	25 %	25 %	292490193
78	NC_013960	ACCT	2	8	30886	30893	25 %	25 %	0 %	50 %	292490193
79	NC_013960	TGAT	2	8	31522	31529	25 %	50 %	25 %	0 %	292490194
80	NC_013960	CTTG	2	8	31641	31648	0 %	50 %	25 %	25 %	292490194
81	NC_013960	AGCA	2	8	31969	31976	50 %	0 %	25 %	25 %	292490195
82	NC_013960	TGCT	2	8	32315	32322	0 %	50 %	25 %	25 %	292490196
83	NC_013960	TCGG	2	8	32511	32518	0 %	25 %	50 %	25 %	292490196
84	NC_013960	ACCT	2	8	32664	32671	25 %	25 %	0 %	50 %	292490196
85	NC_013960	TGGT	2	8	33930	33937	0 %	50 %	50 %	0 %	292490197
86	NC_013960	AGGG	2	8	34117	34124	25 %	0 %	75 %	0 %	292490197
87	NC_013960	GCCT	2	8	34482	34489	0 %	25 %	25 %	50 %	292490198
88	NC_013960	GGCG	2	8	34775	34782	0 %	0 %	75 %	25 %	292490198
89	NC_013960	CAAA	2	8	34804	34811	75 %	0 %	0 %	25 %	292490198
90	NC_013960	GTTG	2	8	35464	35471	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
91	NC_013960	AATG	2	8	36428	36435	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
92	NC_013960	TGGT	2	8	36954	36961	0 %	50 %	50 %	0 %	292490201
93	NC_013960	CAGC	2	8	37166	37173	25 %	0 %	25 %	50 %	292490202
94	NC_013960	TTGG	2	8	37276	37283	0 %	50 %	50 %	0 %	292490202
95	NC_013960	CTTG	2	8	37875	37882	0 %	50 %	25 %	25 %	292490202
96	NC_013960	CTTC	2	8	38138	38145	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
97	NC_013960	GGCT	2	8	40113	40120	0 %	25 %	50 %	25 %	292490205
98	NC_013960	GGCG	2	8	40133	40140	0 %	0 %	75 %	25 %	292490205
99	NC_013960	GTGC	2	8	40225	40232	0 %	25 %	50 %	25 %	292490205
100	NC_013960	TGGA	2	8	40331	40338	25 %	25 %	50 %	0 %	292490205
101	NC_013960	AGCA	2	8	40442	40449	50 %	0 %	25 %	25 %	292490205
102	NC_013960	TTGA	2	8	40642	40649	25 %	50 %	25 %	0 %	292490205
103	NC_013960	CTTG	2	8	40686	40693	0 %	50 %	25 %	25 %	292490205
104	NC_013960	CCTT	2	8	40852	40859	0 %	50 %	0 %	50 %	292490205
105	NC_013960	TTGC	2	8	40882	40889	0 %	50 %	25 %	25 %	292490205
106	NC_013960	GGCA	2	8	42050	42057	25 %	0 %	50 %	25 %	292490206
107	NC_013960	GGCA	2	8	42307	42314	25 %	0 %	50 %	25 %	292490206
108	NC_013960	TAAC	2	8	42849	42856	50 %	25 %	0 %	25 %	292490206
109	NC_013960	CCTG	2	8	43208	43215	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
110	NC_013960	CGGT	2	8	43701	43708	0 %	25 %	50 %	25 %	292490207
111	NC_013960	ACGG	2	8	43954	43961	25 %	0 %	50 %	25 %	292490207
112	NC_013960	AATA	2	8	43979	43986	75 %	25 %	0 %	0 %	292490207
113	NC_013960	TATT	2	8	44418	44425	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_013960	AAAT	2	8	44685	44692	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_013960	AAGG	2	8	44928	44935	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
116	NC_013960	CTAT	2	8	45611	45618	25 %	50 %	0 %	25 %	292490210
117	NC_013960	ACTA	2	8	45856	45863	50 %	25 %	0 %	25 %	292490210
118	NC_013960	AAGG	2	8	46068	46075	50 %	0 %	50 %	0 %	292490210
119	NC_013960	AAGA	2	8	46423	46430	75 %	0 %	25 %	0 %	292490211
120	NC_013960	CGAC	2	8	46736	46743	25 %	0 %	25 %	50 %	292490211
121	NC_013960	GAAA	2	8	46999	47006	75 %	0 %	25 %	0 %	292490211
122	NC_013960	AACG	2	8	47446	47453	50 %	0 %	25 %	25 %	292490211
123	NC_013960	AGCC	2	8	47591	47598	25 %	0 %	25 %	50 %	292490211
124	NC_013960	TGCT	2	8	47667	47674	0 %	50 %	25 %	25 %	292490211
125	NC_013960	CAGG	2	8	47781	47788	25 %	0 %	50 %	25 %	292490211
126	NC_013960	TTAT	2	8	48194	48201	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_013960	GAAG	2	8	48206	48213	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
128	NC_013960	AAAT	2	8	48520	48527	75 %	25 %	0 %	0 %	292490212
129	NC_013960	AGGG	2	8	49021	49028	25 %	0 %	75 %	0 %	292490212
130	NC_013960	CAGC	2	8	49486	49493	25 %	0 %	25 %	50 %	292490212
131	NC_013960	CAAG	2	8	49760	49767	50 %	0 %	25 %	25 %	292490212
132	NC_013960	TGGG	2	8	50430	50437	0 %	25 %	75 %	0 %	292490213
133	NC_013960	CAAT	2	8	51865	51872	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
134	NC_013960	TAGA	2	8	52214	52221	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
135	NC_013960	TATT	2	8	52684	52691	25 %	75 %	0 %	0 %	292490215
136	NC_013960	GTCA	2	8	53283	53290	25 %	25 %	25 %	25 %	292490216
137	NC_013960	ATTA	2	8	54500	54507	50 %	50 %	0 %	0 %	292490219
138	NC_013960	CCTG	2	8	54519	54526	0 %	25 %	25 %	50 %	292490219
139	NC_013960	TCAT	2	8	55081	55088	25 %	50 %	0 %	25 %	292490220
140	NC_013960	GCAA	2	8	55193	55200	50 %	0 %	25 %	25 %	292490221
141	NC_013960	TTCC	2	8	55584	55591	0 %	50 %	0 %	50 %	292490222
142	NC_013960	TACC	2	8	55620	55627	25 %	25 %	0 %	50 %	292490222
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