MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Nitrosococcus halophilus Nc4 chromosome

Total Repeats: 78310

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_013960	CAG	2	6	180547	180552	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292490328
3502	NC_013960	CCTT	2	8	180559	180566	0 %	50 %	0 %	50 %	292490328
3503	NC_013960	CTT	2	6	180597	180602	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	292490328
3504	NC_013960	GC	3	6	180605	180610	0 %	0 %	50 %	50 %	292490328
3505	NC_013960	CGG	2	6	180636	180641	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	292490328
3506	NC_013960	AGCC	2	8	180645	180652	25 %	0 %	25 %	50 %	292490328
3507	NC_013960	ATG	2	6	180668	180673	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	292490328
3508	NC_013960	ACC	2	6	180707	180712	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	292490328
3509	NC_013960	TCC	2	6	180808	180813	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	292490328
3510	NC_013960	CAC	2	6	180949	180954	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	292490328
3511	NC_013960	TTG	2	6	180965	180970	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	292490328
3512	NC_013960	AGG	2	6	181063	181068	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	292490328
3513	NC_013960	TA	3	6	181124	181129	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3514	NC_013960	AATG	2	8	181153	181160	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
3515	NC_013960	GGC	2	6	181349	181354	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3516	NC_013960	TA	3	6	181378	181383	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3517	NC_013960	GCT	2	6	181410	181415	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3518	NC_013960	TCA	2	6	181466	181471	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3519	NC_013960	CGC	2	6	181475	181480	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3520	NC_013960	GTT	2	6	181505	181510	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3521	NC_013960	GCTCG	2	10	181525	181534	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
3522	NC_013960	GGA	2	6	181640	181645	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3523	NC_013960	TTG	2	6	181689	181694	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3524	NC_013960	GAT	2	6	181743	181748	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3525	NC_013960	ACCG	2	8	181815	181822	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
3526	NC_013960	TGG	2	6	181927	181932	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3527	NC_013960	T	6	6	181962	181967	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3528	NC_013960	T	7	7	181990	181996	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3529	NC_013960	GGT	2	6	182039	182044	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3530	NC_013960	TGC	2	6	182181	182186	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3531	NC_013960	CGG	2	6	182239	182244	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3532	NC_013960	GGC	2	6	182408	182413	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3533	NC_013960	TCC	2	6	182514	182519	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3534	NC_013960	TCA	2	6	182538	182543	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3535	NC_013960	GCT	2	6	182556	182561	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3536	NC_013960	TGGT	2	8	182570	182577	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3537	NC_013960	GGT	2	6	182605	182610	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3538	NC_013960	AGG	2	6	182612	182617	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3539	NC_013960	TGA	2	6	182621	182626	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3540	NC_013960	T	8	8	182714	182721	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3541	NC_013960	CCA	2	6	182735	182740	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3542	NC_013960	GGT	2	6	182751	182756	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3543	NC_013960	CGC	2	6	182762	182767	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3544	NC_013960	GTG	2	6	182782	182787	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3545	NC_013960	GCC	2	6	182797	182802	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3546	NC_013960	GCC	2	6	182808	182813	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3547	NC_013960	CTT	2	6	183071	183076	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3548	NC_013960	CGG	2	6	183111	183116	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3549	NC_013960	GCA	2	6	183149	183154	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3550	NC_013960	AGA	2	6	183164	183169	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3551	NC_013960	CTG	2	6	183246	183251	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3552	NC_013960	GCG	2	6	183294	183299	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3553	NC_013960	CTTGAG	2	12	183342	183353	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
3554	NC_013960	GAT	2	6	183397	183402	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3555	NC_013960	CATTG	2	10	183408	183417	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
3556	NC_013960	CAA	2	6	183523	183528	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3557	NC_013960	TG	3	6	183572	183577	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3558	NC_013960	GGA	2	6	183680	183685	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3559	NC_013960	CGA	2	6	183708	183713	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3560	NC_013960	CTT	2	6	183827	183832	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3561	NC_013960	TAT	2	6	183852	183857	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3562	NC_013960	GGA	2	6	183891	183896	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3563	NC_013960	AGC	2	6	183939	183944	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292490329
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3565	NC_013960	TGC	2	6	184105	184110	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292490329
3566	NC_013960	TCGA	2	8	184125	184132	25 %	25 %	25 %	25 %	292490329
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3569	NC_013960	TGC	2	6	184440	184445	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292490330
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3573	NC_013960	TAAG	2	8	184670	184677	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
3574	NC_013960	TTATT	2	10	184685	184694	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
3575	NC_013960	C	8	8	184742	184749	0 %	0 %	0 %	100 %	292490331
3576	NC_013960	GGGT	2	8	184805	184812	0 %	25 %	75 %	0 %	292490331
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3582	NC_013960	GCG	2	6	185030	185035	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	292490331
3583	NC_013960	TCG	2	6	185039	185044	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292490331
3584	NC_013960	TAT	2	6	185060	185065	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	292490331
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3588	NC_013960	GA	3	6	185314	185319	50 %	0 %	50 %	0 %	292490331
3589	NC_013960	CGG	2	6	185331	185336	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	292490331
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3591	NC_013960	GGCGC	2	10	185369	185378	0 %	0 %	60 %	40 %	292490331
3592	NC_013960	CGG	2	6	185404	185409	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	292490331
3593	NC_013960	TGG	2	6	185467	185472	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	292490331
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3598	NC_013960	GCG	2	6	185681	185686	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	292490331
3599	NC_013960	G	6	6	185772	185777	0 %	0 %	100 %	0 %	292490331
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3603	NC_013960	GCG	2	6	185891	185896	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	292490331
3604	NC_013960	CGG	2	6	185953	185958	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	292490331
3605	NC_013960	TGCC	2	8	185966	185973	0 %	25 %	25 %	50 %	292490331
3606	NC_013960	CGA	2	6	186023	186028	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292490331
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3609	NC_013960	GAA	2	6	186195	186200	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	292490331
3610	NC_013960	TTG	2	6	186291	186296	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	292490331
3611	NC_013960	GTG	2	6	186345	186350	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	292490331
3612	NC_013960	CTTA	2	8	186382	186389	25 %	50 %	0 %	25 %	292490331
3613	NC_013960	GC	3	6	186459	186464	0 %	0 %	50 %	50 %	292490331
3614	NC_013960	GAT	2	6	186585	186590	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	292490331
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3619	NC_013960	AGC	2	6	186786	186791	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292490331
3620	NC_013960	AGCA	2	8	186796	186803	50 %	0 %	25 %	25 %	292490331
3621	NC_013960	GGA	2	6	186843	186848	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	292490331
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3623	NC_013960	GCC	2	6	186894	186899	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	292490331
3624	NC_013960	C	6	6	186912	186917	0 %	0 %	0 %	100 %	292490331
3625	NC_013960	A	6	6	186928	186933	100 %	0 %	0 %	0 %	292490331
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3872	NC_013960	TCG	2	6	199801	199806	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3873	NC_013960	TCA	2	6	199832	199837	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3874	NC_013960	TGA	2	6	199908	199913	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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3876	NC_013960	GCT	2	6	200024	200029	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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3886	NC_013960	TTG	2	6	200354	200359	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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3998	NC_013960	AGG	2	6	206166	206171	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	292490352
3999	NC_013960	TGA	2	6	206172	206177	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	292490352
4000	NC_013960	TTG	2	6	206226	206231	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	292490352

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