MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Nitrosococcus halophilus Nc4 chromosome

Total Repeats: 78310

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
2501	NC_013960	T	6	6	131319	131324	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2502	NC_013960	GAT	2	6	131332	131337	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2503	NC_013960	GCTC	2	8	131366	131373	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
2504	NC_013960	GC	3	6	131508	131513	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2505	NC_013960	TGT	2	6	131611	131616	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2506	NC_013960	ATT	2	6	131622	131627	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	292490286
2507	NC_013960	CGA	2	6	131739	131744	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292490286
2508	NC_013960	GGC	2	6	131759	131764	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	292490286
2509	NC_013960	AAC	2	6	131795	131800	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	292490286
2510	NC_013960	CTT	2	6	131836	131841	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	292490286
2511	NC_013960	TGCT	2	8	131854	131861	0 %	50 %	25 %	25 %	292490286
2512	NC_013960	ACC	2	6	131870	131875	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	292490286
2513	NC_013960	CAA	2	6	132042	132047	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	292490287
2514	NC_013960	TCG	2	6	132070	132075	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292490287
2515	NC_013960	AC	3	6	132127	132132	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
2516	NC_013960	CTAC	2	8	132143	132150	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
2517	NC_013960	CGTA	3	12	132169	132180	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
2518	NC_013960	AAG	2	6	132181	132186	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2519	NC_013960	ATAC	2	8	132285	132292	50 %	25 %	0 %	25 %	292490288
2520	NC_013960	GAA	2	6	132297	132302	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	292490288
2521	NC_013960	TGA	2	6	132373	132378	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	292490288
2522	NC_013960	T	6	6	132403	132408	0 %	100 %	0 %	0 %	292490288
2523	NC_013960	CAG	2	6	132420	132425	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292490288
2524	NC_013960	CTT	2	6	132439	132444	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	292490288
2525	NC_013960	TTTC	2	8	132498	132505	0 %	75 %	0 %	25 %	292490288
2526	NC_013960	TCA	2	6	132512	132517	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	292490288
2527	NC_013960	AAG	2	6	132589	132594	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	292490289
2528	NC_013960	TA	3	6	132612	132617	50 %	50 %	0 %	0 %	292490289
2529	NC_013960	TCA	2	6	132637	132642	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	292490289
2530	NC_013960	TTG	2	6	132682	132687	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	292490289
2531	NC_013960	ATC	2	6	132699	132704	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	292490289
2532	NC_013960	CAA	2	6	132705	132710	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	292490289
2533	NC_013960	GAA	2	6	132726	132731	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	292490289
2534	NC_013960	TCT	2	6	132760	132765	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	292490289
2535	NC_013960	AT	3	6	132825	132830	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2536	NC_013960	TTTC	2	8	132849	132856	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
2537	NC_013960	GCGGG	2	10	132919	132928	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
2538	NC_013960	GTA	2	6	133034	133039	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	292490290
2539	NC_013960	CGG	3	9	133087	133095	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	292490290
2540	NC_013960	TGG	2	6	133096	133101	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	292490290
2541	NC_013960	CCG	2	6	133189	133194	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	292490290
2542	NC_013960	TCA	2	6	133234	133239	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	292490290
2543	NC_013960	GGC	2	6	133306	133311	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	292490290
2544	NC_013960	CGC	2	6	133345	133350	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	292490290
2545	NC_013960	CA	3	6	133367	133372	50 %	0 %	0 %	50 %	292490290
2546	NC_013960	GTA	2	6	133388	133393	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	292490290
2547	NC_013960	AG	3	6	133419	133424	50 %	0 %	50 %	0 %	292490290
2548	NC_013960	TGG	2	6	133438	133443	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	292490290
2549	NC_013960	CAA	2	6	133471	133476	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2550	NC_013960	CAG	2	6	133581	133586	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292490291
2551	NC_013960	CAG	2	6	133720	133725	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292490291
2552	NC_013960	ATG	2	6	133812	133817	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	292490292
2553	NC_013960	TTC	2	6	133857	133862	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	292490292
2554	NC_013960	TTC	2	6	133937	133942	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	292490292
2555	NC_013960	AGA	2	6	133954	133959	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	292490292
2556	NC_013960	CT	3	6	133969	133974	0 %	50 %	0 %	50 %	292490292
2557	NC_013960	TAG	2	6	133984	133989	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	292490292
2558	NC_013960	GCG	2	6	134030	134035	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2559	NC_013960	ATA	2	6	134048	134053	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2560	NC_013960	GAA	2	6	134096	134101	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2561	NC_013960	AC	3	6	134372	134377	50 %	0 %	0 %	50 %	292490293
2562	NC_013960	CAT	2	6	134396	134401	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	292490293
2563	NC_013960	GATC	2	8	134414	134421	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
2564	NC_013960	CAT	2	6	134546	134551	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2565	NC_013960	TG	3	6	134594	134599	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
2566	NC_013960	ATG	2	6	134607	134612	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2567	NC_013960	GAT	2	6	134637	134642	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2568	NC_013960	AAT	2	6	134746	134751	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2569	NC_013960	ATC	2	6	134782	134787	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2570	NC_013960	AAGA	2	8	134811	134818	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
2571	NC_013960	CGA	2	6	134845	134850	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2572	NC_013960	CTCC	2	8	134871	134878	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
2573	NC_013960	ATT	2	6	134891	134896	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2574	NC_013960	ATTAA	2	10	134901	134910	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
2575	NC_013960	AAT	2	6	134931	134936	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2576	NC_013960	CTTTG	2	10	135015	135024	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
2577	NC_013960	AAAGC	2	10	135288	135297	60 %	0 %	20 %	20 %	292490294
2578	NC_013960	A	8	8	135313	135320	100 %	0 %	0 %	0 %	292490294
2579	NC_013960	TCC	2	6	135358	135363	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	292490294
2580	NC_013960	GGCT	2	8	135380	135387	0 %	25 %	50 %	25 %	292490294
2581	NC_013960	GC	3	6	135425	135430	0 %	0 %	50 %	50 %	292490294
2582	NC_013960	TGG	2	6	135612	135617	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	292490294
2583	NC_013960	AGC	2	6	135679	135684	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292490294
2584	NC_013960	C	7	7	135684	135690	0 %	0 %	0 %	100 %	292490294
2585	NC_013960	CGA	2	6	135710	135715	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292490294
2586	NC_013960	T	6	6	135728	135733	0 %	100 %	0 %	0 %	292490294
2587	NC_013960	TCGCC	2	10	135818	135827	0 %	20 %	20 %	60 %	292490294
2588	NC_013960	GAA	2	6	135879	135884	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	292490294
2589	NC_013960	TAGT	2	8	135983	135990	25 %	50 %	25 %	0 %	292490294
2590	NC_013960	CCA	2	6	136005	136010	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	292490294
2591	NC_013960	TCC	2	6	136064	136069	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2592	NC_013960	CG	3	6	136115	136120	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2593	NC_013960	AGG	2	6	136133	136138	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2594	NC_013960	TCGC	2	8	136200	136207	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
2595	NC_013960	CGCGA	2	10	136320	136329	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
2596	NC_013960	GCG	2	6	136340	136345	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2597	NC_013960	GACT	2	8	136360	136367	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
2598	NC_013960	AAT	2	6	136429	136434	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2599	NC_013960	TTTC	2	8	136489	136496	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
2600	NC_013960	A	6	6	136546	136551	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2601	NC_013960	AT	4	8	136563	136570	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2602	NC_013960	GTT	2	6	136577	136582	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2603	NC_013960	CTC	2	6	136642	136647	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2604	NC_013960	T	8	8	136730	136737	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2605	NC_013960	T	6	6	136784	136789	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2606	NC_013960	GGT	2	6	136891	136896	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2607	NC_013960	A	6	6	136916	136921	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2608	NC_013960	GGT	2	6	136937	136942	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2609	NC_013960	GTT	2	6	136976	136981	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2610	NC_013960	TCT	2	6	137009	137014	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2611	NC_013960	GTGC	2	8	137042	137049	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
2612	NC_013960	GCG	2	6	137215	137220	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2613	NC_013960	TGGC	2	8	137276	137283	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
2614	NC_013960	GTG	2	6	137331	137336	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2615	NC_013960	CGC	2	6	137337	137342	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2616	NC_013960	CAT	2	6	137343	137348	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2617	NC_013960	GCA	2	6	137366	137371	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2618	NC_013960	CTG	2	6	137454	137459	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2619	NC_013960	ACT	2	6	137492	137497	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2620	NC_013960	GAT	2	6	137522	137527	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2621	NC_013960	AAAT	2	8	137591	137598	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
2622	NC_013960	TCG	2	6	137652	137657	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2623	NC_013960	C	6	6	137765	137770	0 %	0 %	0 %	100 %	292490295
2624	NC_013960	TTG	2	6	137810	137815	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	292490295
2625	NC_013960	AGT	2	6	137839	137844	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	292490295
2626	NC_013960	GGA	2	6	137881	137886	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	292490295
2627	NC_013960	GGAC	2	8	137909	137916	25 %	0 %	50 %	25 %	292490295
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2629	NC_013960	CATC	2	8	137977	137984	25 %	25 %	0 %	50 %	292490295
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