MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Nitrosococcus halophilus Nc4 chromosome

Total Repeats: 78310

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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2002	NC_013960	GT	3	6	105677	105682	0 %	50 %	50 %	0 %	292490263
2003	NC_013960	GGA	2	6	105730	105735	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	292490263
2004	NC_013960	GGT	2	6	105739	105744	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	292490263
2005	NC_013960	A	6	6	105756	105761	100 %	0 %	0 %	0 %	292490263
2006	NC_013960	TCA	2	6	105774	105779	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	292490263
2007	NC_013960	GGGT	2	8	105794	105801	0 %	25 %	75 %	0 %	292490263
2008	NC_013960	CTG	2	6	105853	105858	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292490263
2009	NC_013960	GAT	2	6	105859	105864	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	292490263
2010	NC_013960	TGC	2	6	105887	105892	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292490263
2011	NC_013960	ATATTG	2	12	105937	105948	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	292490263
2012	NC_013960	GAT	2	6	105997	106002	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	292490263
2013	NC_013960	A	7	7	106050	106056	100 %	0 %	0 %	0 %	292490263
2014	NC_013960	ATC	2	6	106072	106077	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	292490263
2015	NC_013960	GTA	2	6	106087	106092	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	292490263
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2029	NC_013960	T	7	7	106754	106760	0 %	100 %	0 %	0 %	292490264
2030	NC_013960	GCA	2	6	106823	106828	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292490264
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2123	NC_013960	TAC	2	6	111509	111514	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	292490267
2124	NC_013960	TGC	2	6	111557	111562	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292490267
2125	NC_013960	TCC	2	6	111580	111585	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	292490267
2126	NC_013960	TGG	2	6	111653	111658	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	292490267
2127	NC_013960	TAC	2	6	111688	111693	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	292490267
2128	NC_013960	GCG	2	6	111708	111713	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	292490267
2129	NC_013960	ATG	2	6	111728	111733	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	292490267
2130	NC_013960	TTC	2	6	111740	111745	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	292490267
2131	NC_013960	AGC	2	6	111752	111757	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292490267
2132	NC_013960	CAA	2	6	111775	111780	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	292490267
2133	NC_013960	GAA	3	9	111784	111792	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	292490267
2134	NC_013960	ATC	2	6	111820	111825	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	292490267
2135	NC_013960	GAA	2	6	111835	111840	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	292490267
2136	NC_013960	CGG	2	6	111935	111940	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	292490267
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2139	NC_013960	A	6	6	112114	112119	100 %	0 %	0 %	0 %	292490268
2140	NC_013960	CGG	2	6	112135	112140	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	292490268
2141	NC_013960	GTT	2	6	112149	112154	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	292490268
2142	NC_013960	GGT	2	6	112173	112178	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	292490268
2143	NC_013960	GAAAA	2	10	112223	112232	80 %	0 %	20 %	0 %	292490268
2144	NC_013960	GTAG	2	8	112243	112250	25 %	25 %	50 %	0 %	292490268
2145	NC_013960	GAA	2	6	112252	112257	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	292490268
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2149	NC_013960	A	6	6	112343	112348	100 %	0 %	0 %	0 %	292490268
2150	NC_013960	CCT	2	6	112405	112410	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	292490268
2151	NC_013960	GAA	2	6	112420	112425	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	292490268
2152	NC_013960	GCC	2	6	112434	112439	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	292490268
2153	NC_013960	CGC	2	6	112456	112461	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	292490268
2154	NC_013960	CCG	2	6	112597	112602	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	292490268
2155	NC_013960	GCG	2	6	112618	112623	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	292490268
2156	NC_013960	CGG	2	6	112651	112656	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	292490268
2157	NC_013960	CAA	2	6	112708	112713	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	292490268
2158	NC_013960	CGG	2	6	112718	112723	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	292490268
2159	NC_013960	ACC	2	6	112729	112734	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	292490268
2160	NC_013960	TGA	2	6	112760	112765	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	292490268
2161	NC_013960	TCTT	2	8	112828	112835	0 %	75 %	0 %	25 %	292490268
2162	NC_013960	CTA	2	6	112883	112888	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	292490268
2163	NC_013960	TAT	2	6	112909	112914	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	292490268
2164	NC_013960	TAT	2	6	112918	112923	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	292490268
2165	NC_013960	TGG	2	6	112958	112963	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	292490268
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2168	NC_013960	G	6	6	113074	113079	0 %	0 %	100 %	0 %	292490268
2169	NC_013960	GAT	2	6	113220	113225	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	292490268
2170	NC_013960	TGG	2	6	113285	113290	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	292490268
2171	NC_013960	AAG	2	6	113297	113302	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	292490268
2172	NC_013960	AGA	2	6	113307	113312	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	292490268
2173	NC_013960	TGT	2	6	113379	113384	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	292490269
2174	NC_013960	GCCGG	2	10	113395	113404	0 %	0 %	60 %	40 %	292490269
2175	NC_013960	GGC	2	6	113415	113420	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	292490269
2176	NC_013960	TTG	2	6	113539	113544	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	292490269
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2183	NC_013960	TGG	2	6	114020	114025	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	292490269
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2186	NC_013960	CCTG	2	8	114294	114301	0 %	25 %	25 %	50 %	292490269
2187	NC_013960	GTG	2	6	114322	114327	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	292490269
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2189	NC_013960	AGGA	2	8	114359	114366	50 %	0 %	50 %	0 %	292490269
2190	NC_013960	ACC	2	6	114403	114408	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	292490269
2191	NC_013960	ATA	2	6	114419	114424	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	292490269
2192	NC_013960	GATG	2	8	114552	114559	25 %	25 %	50 %	0 %	292490269
2193	NC_013960	GTG	2	6	114580	114585	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	292490269
2194	NC_013960	ATT	2	6	114622	114627	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	292490269
2195	NC_013960	CAG	2	6	114684	114689	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292490269
2196	NC_013960	GCG	2	6	114849	114854	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	292490270
2197	NC_013960	CAC	2	6	114909	114914	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	292490270
2198	NC_013960	CT	3	6	114964	114969	0 %	50 %	0 %	50 %	292490270
2199	NC_013960	GGTG	2	8	114987	114994	0 %	25 %	75 %	0 %	292490270
2200	NC_013960	G	7	7	115012	115018	0 %	0 %	100 %	0 %	292490270
2201	NC_013960	TGA	2	6	115090	115095	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	292490270
2202	NC_013960	GTTTCC	2	12	115126	115137	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	292490270
2203	NC_013960	A	7	7	115144	115150	100 %	0 %	0 %	0 %	292490270
2204	NC_013960	AAG	2	6	115173	115178	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	292490270
2205	NC_013960	TGA	2	6	115211	115216	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	292490270
2206	NC_013960	TTTTC	2	10	115221	115230	0 %	80 %	0 %	20 %	292490270
2207	NC_013960	GCA	2	6	115247	115252	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292490270
2208	NC_013960	TGC	2	6	115339	115344	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292490270
2209	NC_013960	GCC	2	6	115349	115354	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	292490270
2210	NC_013960	TCG	2	6	115381	115386	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292490270
2211	NC_013960	TGC	2	6	115390	115395	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292490270
2212	NC_013960	CAT	2	6	115570	115575	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	292490271
2213	NC_013960	AGA	2	6	115623	115628	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	292490271
2214	NC_013960	CTT	2	6	115636	115641	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	292490271
2215	NC_013960	GGC	3	9	115673	115681	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	292490271
2216	NC_013960	GAG	2	6	115781	115786	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	292490271
2217	NC_013960	GAG	2	6	115885	115890	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	292490271
2218	NC_013960	AACGGT	2	12	115897	115908	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	292490271
2219	NC_013960	CAT	2	6	116072	116077	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	292490271
2220	NC_013960	CTT	2	6	116105	116110	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	292490271
2221	NC_013960	CCGC	2	8	116146	116153	0 %	0 %	25 %	75 %	292490271
2222	NC_013960	CGC	2	6	116293	116298	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	292490271
2223	NC_013960	GCC	2	6	116322	116327	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	292490271
2224	NC_013960	AGC	2	6	116399	116404	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292490271
2225	NC_013960	ATC	2	6	116435	116440	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	292490271
2226	NC_013960	CCG	2	6	116443	116448	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	292490271
2227	NC_013960	CCCG	2	8	116488	116495	0 %	0 %	25 %	75 %	292490271
2228	NC_013960	TCC	2	6	116618	116623	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	292490271
2229	NC_013960	GA	3	6	116636	116641	50 %	0 %	50 %	0 %	292490271
2230	NC_013960	TGG	2	6	116670	116675	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	292490271
2231	NC_013960	GAA	2	6	116720	116725	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	292490271
2232	NC_013960	TTGG	2	8	116748	116755	0 %	50 %	50 %	0 %	292490271
2233	NC_013960	ATG	2	6	116810	116815	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	292490271
2234	NC_013960	TAA	2	6	116843	116848	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	292490271
2235	NC_013960	TTA	2	6	116868	116873	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	292490271
2236	NC_013960	A	6	6	116946	116951	100 %	0 %	0 %	0 %	292490271
2237	NC_013960	T	8	8	116972	116979	0 %	100 %	0 %	0 %	292490271
2238	NC_013960	GAA	2	6	117012	117017	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2239	NC_013960	ATC	2	6	117031	117036	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2240	NC_013960	TCT	2	6	117042	117047	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	292490272
2241	NC_013960	G	8	8	117054	117061	0 %	0 %	100 %	0 %	292490272
2242	NC_013960	AC	3	6	117069	117074	50 %	0 %	0 %	50 %	292490272
2243	NC_013960	CGG	2	6	117145	117150	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	292490272
2244	NC_013960	C	6	6	117179	117184	0 %	0 %	0 %	100 %	292490272
2245	NC_013960	TTC	3	9	117311	117319	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	292490272
2246	NC_013960	CTT	2	6	117334	117339	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	292490272
2247	NC_013960	GCC	2	6	117374	117379	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	292490272
2248	NC_013960	ACC	3	9	117393	117401	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	292490272
2249	NC_013960	TCC	2	6	117483	117488	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	292490272
2250	NC_013960	GCA	2	6	117520	117525	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292490272
2251	NC_013960	GAT	2	6	117548	117553	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	292490272
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2266	NC_013960	GGC	2	6	118244	118249	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	292490272
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2275	NC_013960	TTGGC	2	10	118524	118533	0 %	40 %	40 %	20 %	292490273
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2345	NC_013960	T	6	6	121798	121803	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2346	NC_013960	CCTA	2	8	121845	121852	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
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2348	NC_013960	T	7	7	121930	121936	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2349	NC_013960	A	6	6	121968	121973	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2350	NC_013960	ATA	2	6	121975	121980	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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2353	NC_013960	GAA	2	6	122202	122207	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	292490277
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2363	NC_013960	TATT	2	8	122908	122915	25 %	75 %	0 %	0 %	292490277
2364	NC_013960	T	7	7	122957	122963	0 %	100 %	0 %	0 %	292490277
2365	NC_013960	GGC	2	6	123044	123049	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	292490277
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2367	NC_013960	CAT	2	6	123138	123143	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	292490277
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2369	NC_013960	CAC	2	6	123184	123189	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	292490277
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2373	NC_013960	G	6	6	123339	123344	0 %	0 %	100 %	0 %	292490277
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2495	NC_013960	ATC	2	6	130639	130644	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	292490285
2496	NC_013960	CGT	2	6	130734	130739	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292490285
2497	NC_013960	GC	3	6	130868	130873	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2498	NC_013960	CAT	2	6	131134	131139	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2499	NC_013960	G	7	7	131288	131294	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
2500	NC_013960	ACA	2	6	131301	131306	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding

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