MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Nitrosococcus halophilus Nc4 chromosome

Total Repeats: 78310

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_013960	GCT	2	6	77861	77866	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1502	NC_013960	CGGT	2	8	77937	77944	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
1503	NC_013960	GTT	2	6	77989	77994	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1504	NC_013960	GCT	2	6	78078	78083	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1505	NC_013960	GTG	2	6	78145	78150	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1506	NC_013960	CCG	2	6	78205	78210	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1507	NC_013960	ATG	2	6	78310	78315	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1508	NC_013960	CT	3	6	78349	78354	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1509	NC_013960	GCG	2	6	78374	78379	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1510	NC_013960	ATT	2	6	78383	78388	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1511	NC_013960	ATT	2	6	78395	78400	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1512	NC_013960	ATT	2	6	78412	78417	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1513	NC_013960	CTACG	2	10	78497	78506	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
1514	NC_013960	GCG	2	6	78515	78520	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1515	NC_013960	TAG	2	6	78540	78545	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1516	NC_013960	TAA	2	6	78578	78583	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1517	NC_013960	CAGG	2	8	78604	78611	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
1518	NC_013960	GAA	2	6	78633	78638	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1519	NC_013960	TAAT	2	8	78698	78705	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1520	NC_013960	AAT	2	6	78832	78837	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	292490248
1521	NC_013960	GCTGC	2	10	78841	78850	0 %	20 %	40 %	40 %	292490248
1522	NC_013960	GTT	2	6	78859	78864	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	292490248
1523	NC_013960	AAATC	2	10	78867	78876	60 %	20 %	0 %	20 %	292490248
1524	NC_013960	T	6	6	78929	78934	0 %	100 %	0 %	0 %	292490248
1525	NC_013960	GATTC	2	10	78965	78974	20 %	40 %	20 %	20 %	292490248
1526	NC_013960	AGC	2	6	78993	78998	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292490248
1527	NC_013960	CAG	2	6	79058	79063	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292490248
1528	NC_013960	AGCA	2	8	79280	79287	50 %	0 %	25 %	25 %	292490248
1529	NC_013960	TTG	2	6	79397	79402	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	292490248
1530	NC_013960	ATGC	2	8	79417	79424	25 %	25 %	25 %	25 %	292490248
1531	NC_013960	CCA	2	6	79497	79502	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	292490248
1532	NC_013960	GCT	2	6	79566	79571	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292490248
1533	NC_013960	ATA	2	6	79604	79609	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	292490248
1534	NC_013960	GAG	2	6	79774	79779	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	292490248
1535	NC_013960	TCA	2	6	79856	79861	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	292490248
1536	NC_013960	GAG	2	6	79873	79878	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	292490248
1537	NC_013960	ACG	2	6	79967	79972	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292490248
1538	NC_013960	GAT	2	6	79977	79982	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	292490248
1539	NC_013960	CG	3	6	80001	80006	0 %	0 %	50 %	50 %	292490248
1540	NC_013960	GCA	2	6	80110	80115	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292490248
1541	NC_013960	GCGA	2	8	80166	80173	25 %	0 %	50 %	25 %	292490248
1542	NC_013960	TGG	2	6	80190	80195	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	292490248
1543	NC_013960	GGA	2	6	80277	80282	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	292490248
1544	NC_013960	ACAA	2	8	80314	80321	75 %	0 %	0 %	25 %	292490249
1545	NC_013960	ATG	2	6	80331	80336	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	292490249
1546	NC_013960	TCGC	2	8	80354	80361	0 %	25 %	25 %	50 %	292490249
1547	NC_013960	TCCA	2	8	80429	80436	25 %	25 %	0 %	50 %	292490249
1548	NC_013960	TCT	2	6	80460	80465	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	292490249
1549	NC_013960	CA	3	6	80590	80595	50 %	0 %	0 %	50 %	292490249
1550	NC_013960	CATA	2	8	80711	80718	50 %	25 %	0 %	25 %	292490249
1551	NC_013960	GGA	2	6	80844	80849	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	292490249
1552	NC_013960	TCA	2	6	80937	80942	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	292490249
1553	NC_013960	TGG	2	6	80967	80972	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	292490249
1554	NC_013960	CAAC	2	8	80998	81005	50 %	0 %	0 %	50 %	292490249
1555	NC_013960	CAA	2	6	81064	81069	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	292490249
1556	NC_013960	GGT	2	6	81318	81323	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	292490249
1557	NC_013960	TCC	2	6	81343	81348	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	292490249
1558	NC_013960	CAA	2	6	81376	81381	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	292490249
1559	NC_013960	GCT	2	6	81389	81394	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292490249
1560	NC_013960	TCT	2	6	81399	81404	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	292490249
1561	NC_013960	AT	3	6	81454	81459	50 %	50 %	0 %	0 %	292490249
1562	NC_013960	CGT	2	6	81470	81475	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292490249
1563	NC_013960	GAA	2	6	81479	81484	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	292490249
1564	NC_013960	CTT	2	6	81503	81508	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	292490249
1565	NC_013960	AAGG	2	8	81571	81578	50 %	0 %	50 %	0 %	292490249
1566	NC_013960	GTG	2	6	81588	81593	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	292490249
1567	NC_013960	ATG	2	6	81603	81608	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	292490249
1568	NC_013960	AGCA	2	8	81652	81659	50 %	0 %	25 %	25 %	292490249
1569	NC_013960	GAT	2	6	81680	81685	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	292490249
1570	NC_013960	GAT	3	9	81695	81703	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	292490249
1571	NC_013960	TTG	2	6	81717	81722	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	292490249
1572	NC_013960	CAAAA	2	10	81734	81743	80 %	0 %	0 %	20 %	292490249
1573	NC_013960	A	6	6	81740	81745	100 %	0 %	0 %	0 %	292490249
1574	NC_013960	TGC	2	6	81772	81777	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292490249
1575	NC_013960	ATC	2	6	81803	81808	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	292490249
1576	NC_013960	GGC	2	6	81863	81868	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	292490249
1577	NC_013960	TTTGG	2	10	81961	81970	0 %	60 %	40 %	0 %	292490249
1578	NC_013960	GAA	2	6	82028	82033	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	292490249
1579	NC_013960	GA	3	6	82050	82055	50 %	0 %	50 %	0 %	292490249
1580	NC_013960	GAA	2	6	82093	82098	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	292490249
1581	NC_013960	AAT	2	6	82116	82121	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	292490249
1582	NC_013960	TTG	2	6	82185	82190	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	292490250
1583	NC_013960	GGC	2	6	82275	82280	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	292490250
1584	NC_013960	CAGCG	2	10	82334	82343	20 %	0 %	40 %	40 %	292490250
1585	NC_013960	TTG	2	6	82407	82412	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	292490250
1586	NC_013960	GC	3	6	82434	82439	0 %	0 %	50 %	50 %	292490250
1587	NC_013960	GCT	2	6	82577	82582	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292490250
1588	NC_013960	GGA	2	6	82633	82638	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	292490250
1589	NC_013960	CT	3	6	82674	82679	0 %	50 %	0 %	50 %	292490250
1590	NC_013960	AGATC	2	10	82726	82735	40 %	20 %	20 %	20 %	292490250
1591	NC_013960	GTTG	2	8	82736	82743	0 %	50 %	50 %	0 %	292490250
1592	NC_013960	CCA	2	6	82787	82792	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	292490250
1593	NC_013960	CGA	2	6	82814	82819	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292490250
1594	NC_013960	CAG	2	6	82838	82843	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292490250
1595	NC_013960	AG	3	6	82857	82862	50 %	0 %	50 %	0 %	292490250
1596	NC_013960	TCA	2	6	82911	82916	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	292490250
1597	NC_013960	AG	3	6	83040	83045	50 %	0 %	50 %	0 %	292490250
1598	NC_013960	CGA	2	6	83148	83153	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1599	NC_013960	GAG	2	6	83365	83370	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	292490251
1600	NC_013960	CAG	2	6	83442	83447	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292490251
1601	NC_013960	ACGT	2	8	83533	83540	25 %	25 %	25 %	25 %	292490251
1602	NC_013960	AGA	2	6	83567	83572	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	292490251
1603	NC_013960	GAA	2	6	83790	83795	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	292490251
1604	NC_013960	TA	3	6	83811	83816	50 %	50 %	0 %	0 %	292490251
1605	NC_013960	ATCCGC	2	12	83836	83847	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	292490251
1606	NC_013960	GGT	2	6	83858	83863	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	292490251
1607	NC_013960	GATCA	2	10	83895	83904	40 %	20 %	20 %	20 %	292490251
1608	NC_013960	ATA	2	6	84018	84023	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	292490251
1609	NC_013960	GAT	2	6	84033	84038	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	292490251
1610	NC_013960	CTT	2	6	84063	84068	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	292490251
1611	NC_013960	TAC	2	6	84122	84127	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	292490251
1612	NC_013960	AAG	2	6	84128	84133	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	292490251
1613	NC_013960	CGA	2	6	84221	84226	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292490251
1614	NC_013960	GAGG	2	8	84426	84433	25 %	0 %	75 %	0 %	292490251
1615	NC_013960	CTT	2	6	84490	84495	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	292490251
1616	NC_013960	GAA	2	6	84527	84532	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	292490251
1617	NC_013960	T	7	7	84539	84545	0 %	100 %	0 %	0 %	292490251
1618	NC_013960	GAT	2	6	84561	84566	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	292490251
1619	NC_013960	CT	3	6	84627	84632	0 %	50 %	0 %	50 %	292490251
1620	NC_013960	CAG	2	6	84688	84693	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292490251
1621	NC_013960	TGGCG	2	10	84738	84747	0 %	20 %	60 %	20 %	292490251
1622	NC_013960	CGG	2	6	84752	84757	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	292490251
1623	NC_013960	TCC	2	6	84821	84826	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	292490251
1624	NC_013960	AAG	2	6	84879	84884	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	292490251
1625	NC_013960	GAA	2	6	84903	84908	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	292490251
1626	NC_013960	CAG	2	6	84923	84928	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292490251
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1628	NC_013960	CTT	2	6	84989	84994	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	292490251
1629	NC_013960	GAT	2	6	85173	85178	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	292490251
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1883	NC_013960	CGG	2	6	99267	99272	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	292490260
1884	NC_013960	TGC	2	6	99284	99289	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292490260
1885	NC_013960	ATT	2	6	99364	99369	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	292490260
1886	NC_013960	GTG	2	6	99370	99375	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	292490260
1887	NC_013960	TGG	2	6	99479	99484	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	292490260
1888	NC_013960	TGG	2	6	99518	99523	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	292490260
1889	NC_013960	GCTG	2	8	99552	99559	0 %	25 %	50 %	25 %	292490260
1890	NC_013960	CTC	2	6	99609	99614	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	292490260
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1895	NC_013960	TATTT	2	10	99825	99834	20 %	80 %	0 %	0 %	292490260
1896	NC_013960	T	6	6	99832	99837	0 %	100 %	0 %	0 %	292490260
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1903	NC_013960	ACG	2	6	100144	100149	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292490260
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1924	NC_013960	GTAA	2	8	101364	101371	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
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1952	NC_013960	TGC	2	6	102834	102839	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292490261
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1955	NC_013960	CCCG	2	8	103043	103050	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
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1959	NC_013960	TAA	2	6	103178	103183	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1960	NC_013960	T	6	6	103190	103195	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1961	NC_013960	CTTT	2	8	103228	103235	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
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1985	NC_013960	TCG	2	6	104512	104517	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292490262
1986	NC_013960	GGGT	2	8	104545	104552	0 %	25 %	75 %	0 %	292490262
1987	NC_013960	GC	3	6	104589	104594	0 %	0 %	50 %	50 %	292490262
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1992	NC_013960	CCA	2	6	104784	104789	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	292490262
1993	NC_013960	ATC	2	6	104913	104918	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1994	NC_013960	CTT	2	6	104931	104936	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	292490263
1995	NC_013960	GATA	2	8	104946	104953	50 %	25 %	25 %	0 %	292490263
1996	NC_013960	TGG	2	6	105284	105289	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	292490263
1997	NC_013960	TCA	2	6	105299	105304	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	292490263
1998	NC_013960	GGT	2	6	105342	105347	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	292490263
1999	NC_013960	AGA	2	6	105432	105437	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	292490263
2000	NC_013960	TGA	2	6	105483	105488	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	292490263

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