MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Nitrosococcus halophilus Nc4 chromosome

Total Repeats: 78310

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_013960	G	8	8	53103	53110	0 %	0 %	100 %	0 %	292490216
1002	NC_013960	CAA	2	6	53138	53143	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	292490216
1003	NC_013960	A	6	6	53244	53249	100 %	0 %	0 %	0 %	292490216
1004	NC_013960	GTCA	2	8	53283	53290	25 %	25 %	25 %	25 %	292490216
1005	NC_013960	TGC	2	6	53310	53315	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292490216
1006	NC_013960	AAGCAA	2	12	53357	53368	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	292490216
1007	NC_013960	AAG	2	6	53374	53379	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	292490216
1008	NC_013960	AGG	2	6	53383	53388	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	292490216
1009	NC_013960	AAT	2	6	53412	53417	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	292490216
1010	NC_013960	GCG	2	6	53418	53423	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	292490216
1011	NC_013960	CAA	2	6	53447	53452	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	292490216
1012	NC_013960	AG	3	6	53484	53489	50 %	0 %	50 %	0 %	292490216
1013	NC_013960	CGG	2	6	53654	53659	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	292490216
1014	NC_013960	GTT	2	6	53711	53716	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	292490216
1015	NC_013960	GGGAG	2	10	53758	53767	20 %	0 %	80 %	0 %	292490217
1016	NC_013960	GAG	3	9	53802	53810	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	292490217
1017	NC_013960	TCT	2	6	53849	53854	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	292490217
1018	NC_013960	TTC	2	6	53872	53877	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	292490217
1019	NC_013960	CTT	2	6	53889	53894	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	292490217
1020	NC_013960	CTT	2	6	53898	53903	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	292490217
1021	NC_013960	GCG	2	6	53923	53928	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	292490217
1022	NC_013960	GTA	2	6	53951	53956	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	292490217
1023	NC_013960	ACT	2	6	53987	53992	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	292490217
1024	NC_013960	CAG	2	6	53995	54000	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292490217
1025	NC_013960	ATA	2	6	54049	54054	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1026	NC_013960	ACTTT	2	10	54085	54094	20 %	60 %	0 %	20 %	292490218
1027	NC_013960	GAT	2	6	54109	54114	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	292490218
1028	NC_013960	TTC	2	6	54194	54199	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	292490218
1029	NC_013960	AGC	2	6	54279	54284	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292490218
1030	NC_013960	GAT	2	6	54299	54304	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	292490218
1031	NC_013960	AAG	2	6	54305	54310	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	292490218
1032	NC_013960	AAT	2	6	54361	54366	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1033	NC_013960	TAA	2	6	54449	54454	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	292490219
1034	NC_013960	GAT	2	6	54466	54471	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	292490219
1035	NC_013960	CTT	2	6	54475	54480	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	292490219
1036	NC_013960	ATTA	2	8	54500	54507	50 %	50 %	0 %	0 %	292490219
1037	NC_013960	CCTG	2	8	54519	54526	0 %	25 %	25 %	50 %	292490219
1038	NC_013960	GCAGTA	2	12	54553	54564	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	292490219
1039	NC_013960	GAG	2	6	54635	54640	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	292490219
1040	NC_013960	GTC	2	6	54689	54694	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292490219
1041	NC_013960	TCT	2	6	54793	54798	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	292490220
1042	NC_013960	CAG	2	6	54896	54901	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292490220
1043	NC_013960	ATA	2	6	54910	54915	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	292490220
1044	NC_013960	CTT	2	6	54972	54977	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	292490220
1045	NC_013960	TCCTG	2	10	54988	54997	0 %	40 %	20 %	40 %	292490220
1046	NC_013960	CTC	2	6	55047	55052	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	292490220
1047	NC_013960	TCAT	2	8	55081	55088	25 %	50 %	0 %	25 %	292490220
1048	NC_013960	CT	3	6	55152	55157	0 %	50 %	0 %	50 %	292490221
1049	NC_013960	GCAA	2	8	55193	55200	50 %	0 %	25 %	25 %	292490221
1050	NC_013960	TAA	2	6	55220	55225	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	292490221
1051	NC_013960	CGT	2	6	55234	55239	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292490221
1052	NC_013960	TAA	2	6	55264	55269	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	292490221
1053	NC_013960	CTT	2	6	55411	55416	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	292490221
1054	NC_013960	AGG	2	6	55468	55473	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	292490221
1055	NC_013960	CTT	2	6	55524	55529	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	292490222
1056	NC_013960	TTCC	2	8	55584	55591	0 %	50 %	0 %	50 %	292490222
1057	NC_013960	TACC	2	8	55620	55627	25 %	25 %	0 %	50 %	292490222
1058	NC_013960	CCA	2	6	55752	55757	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	292490222
1059	NC_013960	CGA	2	6	55760	55765	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292490222
1060	NC_013960	CCA	2	6	55802	55807	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	292490222
1061	NC_013960	GTG	2	6	55827	55832	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	292490222
1062	NC_013960	ACA	2	6	55871	55876	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	292490222
1063	NC_013960	GCT	2	6	55901	55906	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292490222
1064	NC_013960	TCT	2	6	55988	55993	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	292490222
1065	NC_013960	C	6	6	56005	56010	0 %	0 %	0 %	100 %	292490222
1066	NC_013960	GAAT	2	8	56025	56032	50 %	25 %	25 %	0 %	292490222
1067	NC_013960	ACG	2	6	56054	56059	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292490222
1068	NC_013960	GCT	2	6	56083	56088	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292490222
1069	NC_013960	TCG	2	6	56129	56134	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292490222
1070	NC_013960	GCG	2	6	56137	56142	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	292490222
1071	NC_013960	CAC	2	6	56197	56202	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	292490222
1072	NC_013960	AG	3	6	56325	56330	50 %	0 %	50 %	0 %	292490223
1073	NC_013960	GAT	2	6	56338	56343	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	292490223
1074	NC_013960	GAG	2	6	56399	56404	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	292490223
1075	NC_013960	CCT	2	6	56408	56413	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	292490223
1076	NC_013960	TCA	2	6	56478	56483	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	292490223
1077	NC_013960	AAT	2	6	56509	56514	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	292490223
1078	NC_013960	CG	3	6	56609	56614	0 %	0 %	50 %	50 %	292490223
1079	NC_013960	CGA	2	6	56661	56666	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292490223
1080	NC_013960	C	8	8	56756	56763	0 %	0 %	0 %	100 %	292490223
1081	NC_013960	ATA	2	6	56807	56812	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	292490223
1082	NC_013960	ATC	2	6	56911	56916	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	292490223
1083	NC_013960	ATC	2	6	56929	56934	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	292490223
1084	NC_013960	C	7	7	56968	56974	0 %	0 %	0 %	100 %	292490223
1085	NC_013960	TGG	2	6	57003	57008	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	292490223
1086	NC_013960	TTCC	2	8	57010	57017	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1087	NC_013960	TCCAT	2	10	57068	57077	20 %	40 %	0 %	40 %	292490224
1088	NC_013960	AGT	2	6	57093	57098	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	292490224
1089	NC_013960	TGGA	2	8	57125	57132	25 %	25 %	50 %	0 %	292490224
1090	NC_013960	CGG	2	6	57346	57351	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	292490224
1091	NC_013960	CAGA	2	8	57440	57447	50 %	0 %	25 %	25 %	292490224
1092	NC_013960	CAG	2	6	57466	57471	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292490224
1093	NC_013960	TTCA	2	8	57512	57519	25 %	50 %	0 %	25 %	292490224
1094	NC_013960	CCCAT	2	10	57654	57663	20 %	20 %	0 %	60 %	292490224
1095	NC_013960	AATC	2	8	57664	57671	50 %	25 %	0 %	25 %	292490224
1096	NC_013960	TATAAC	2	12	57705	57716	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	292490225
1097	NC_013960	TGG	2	6	57724	57729	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	292490225
1098	NC_013960	ATG	2	6	57815	57820	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	292490225
1099	NC_013960	GCG	2	6	57861	57866	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	292490225
1100	NC_013960	A	6	6	57884	57889	100 %	0 %	0 %	0 %	292490225
1101	NC_013960	GCC	2	6	57961	57966	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	292490225
1102	NC_013960	TAC	2	6	57980	57985	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	292490225
1103	NC_013960	GTG	2	6	58103	58108	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	292490225
1104	NC_013960	AAT	2	6	58152	58157	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	292490225
1105	NC_013960	CAT	2	6	58178	58183	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	292490225
1106	NC_013960	CGG	2	6	58210	58215	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	292490225
1107	NC_013960	GT	3	6	58339	58344	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1108	NC_013960	CTG	2	6	58418	58423	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1109	NC_013960	AATT	2	8	58492	58499	50 %	50 %	0 %	0 %	292490226
1110	NC_013960	CAA	2	6	58539	58544	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	292490226
1111	NC_013960	CGG	2	6	58601	58606	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	292490226
1112	NC_013960	A	6	6	58629	58634	100 %	0 %	0 %	0 %	292490226
1113	NC_013960	G	6	6	58660	58665	0 %	0 %	100 %	0 %	292490226
1114	NC_013960	AAT	2	6	58730	58735	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1115	NC_013960	A	7	7	58764	58770	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1116	NC_013960	AT	3	6	58815	58820	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1117	NC_013960	CCAT	2	8	58861	58868	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
1118	NC_013960	GC	3	6	58875	58880	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1119	NC_013960	CTG	2	6	58895	58900	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1120	NC_013960	GTC	2	6	59069	59074	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292490227
1121	NC_013960	TGG	2	6	59154	59159	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	292490227
1122	NC_013960	GCA	2	6	59160	59165	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292490227
1123	NC_013960	TGC	2	6	59181	59186	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292490227
1124	NC_013960	GCT	2	6	59239	59244	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292490227
1125	NC_013960	CTTTC	2	10	59279	59288	0 %	60 %	0 %	40 %	292490227
1126	NC_013960	GGT	2	6	59363	59368	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	292490228
1127	NC_013960	TCT	2	6	59412	59417	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	292490228
1128	NC_013960	AGC	2	6	59418	59423	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292490228
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1130	NC_013960	GCTG	2	8	59514	59521	0 %	25 %	50 %	25 %	292490228
1131	NC_013960	GCA	2	6	59523	59528	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292490228
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1143	NC_013960	TA	3	6	60383	60388	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1152	NC_013960	AAT	2	6	60891	60896	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1154	NC_013960	TTGG	2	8	60946	60953	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
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1159	NC_013960	TCCT	2	8	61179	61186	0 %	50 %	0 %	50 %	292490230
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1174	NC_013960	A	6	6	61990	61995	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1241	NC_013960	TGTT	2	8	65308	65315	0 %	75 %	25 %	0 %	292490233
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1243	NC_013960	TTA	2	6	65365	65370	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1244	NC_013960	CTAG	2	8	65372	65379	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1245	NC_013960	CTAG	2	8	65386	65393	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1246	NC_013960	TAA	2	6	65395	65400	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1247	NC_013960	T	6	6	65440	65445	0 %	100 %	0 %	0 %	292490234
1248	NC_013960	TAA	2	6	65470	65475	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	292490234
1249	NC_013960	ATAA	2	8	65505	65512	75 %	25 %	0 %	0 %	292490234
1250	NC_013960	ATC	2	6	65558	65563	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	292490234
1251	NC_013960	GCC	2	6	65570	65575	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	292490234
1252	NC_013960	GC	3	6	65596	65601	0 %	0 %	50 %	50 %	292490234
1253	NC_013960	GTTTA	2	10	65670	65679	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
1254	NC_013960	GAATCT	2	12	65680	65691	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
1255	NC_013960	TAG	2	6	65696	65701	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1257	NC_013960	CT	3	6	65798	65803	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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