MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Nitrosococcus halophilus Nc4 chromosome

Total Repeats: 78310

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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6502	NC_013960	T	7	7	336819	336825	0 %	100 %	0 %	0 %	292490486
6503	NC_013960	GC	3	6	336827	336832	0 %	0 %	50 %	50 %	292490486
6504	NC_013960	CTG	2	6	336833	336838	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292490486
6505	NC_013960	GCC	2	6	336848	336853	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	292490486
6506	NC_013960	TAT	2	6	336916	336921	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	292490486
6507	NC_013960	GTG	2	6	336923	336928	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	292490486
6508	NC_013960	GAG	2	6	336995	337000	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	292490486
6509	NC_013960	CT	4	8	337022	337029	0 %	50 %	0 %	50 %	292490486
6510	NC_013960	GGT	2	6	337048	337053	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	292490486
6511	NC_013960	TGCTT	2	10	337057	337066	0 %	60 %	20 %	20 %	292490486
6512	NC_013960	GCGGG	2	10	337070	337079	0 %	0 %	80 %	20 %	292490486
6513	NC_013960	CCG	2	6	337095	337100	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	292490486
6514	NC_013960	AAC	2	6	337125	337130	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	292490486
6515	NC_013960	ATG	2	6	337145	337150	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	292490486
6516	NC_013960	GCT	2	6	337175	337180	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292490486
6517	NC_013960	T	6	6	337187	337192	0 %	100 %	0 %	0 %	292490486
6518	NC_013960	GTT	2	6	337197	337202	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	292490486
6519	NC_013960	GGC	2	6	337219	337224	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	292490486
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6521	NC_013960	GAA	2	6	337331	337336	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	292490486
6522	NC_013960	GTG	2	6	337379	337384	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	292490486
6523	NC_013960	GTC	2	6	337460	337465	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292490486
6524	NC_013960	TGCTG	2	10	337477	337486	0 %	40 %	40 %	20 %	292490486
6525	NC_013960	AGG	2	6	337642	337647	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	292490487
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6529	NC_013960	CTG	2	6	337851	337856	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292490487
6530	NC_013960	AAG	2	6	337906	337911	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	292490487
6531	NC_013960	GCT	2	6	337983	337988	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292490487
6532	NC_013960	GGTTG	2	10	338010	338019	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
6533	NC_013960	AAT	2	6	338021	338026	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6534	NC_013960	CTTAA	2	10	338037	338046	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
6535	NC_013960	TAT	2	6	338116	338121	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	292490488
6536	NC_013960	CCCT	2	8	338167	338174	0 %	25 %	0 %	75 %	292490488
6537	NC_013960	A	6	6	338239	338244	100 %	0 %	0 %	0 %	292490488
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6542	NC_013960	G	6	6	338529	338534	0 %	0 %	100 %	0 %	292490488
6543	NC_013960	GCG	2	6	338572	338577	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	292490488
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6545	NC_013960	G	6	6	338661	338666	0 %	0 %	100 %	0 %	292490488
6546	NC_013960	TCAA	2	8	338668	338675	50 %	25 %	0 %	25 %	292490488
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6550	NC_013960	ATT	2	6	338819	338824	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	292490489
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6553	NC_013960	TTA	2	6	338899	338904	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	292490489
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6555	NC_013960	TTC	2	6	339004	339009	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	292490489
6556	NC_013960	A	6	6	339060	339065	100 %	0 %	0 %	0 %	292490489
6557	NC_013960	TTA	2	6	339108	339113	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6558	NC_013960	CGG	2	6	339267	339272	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6559	NC_013960	GGAA	2	8	339289	339296	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
6560	NC_013960	CGAC	2	8	339362	339369	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
6561	NC_013960	ACGG	2	8	339445	339452	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
6562	NC_013960	AAGCA	2	10	339487	339496	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
6563	NC_013960	TTAT	2	8	339505	339512	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
6564	NC_013960	CG	3	6	339551	339556	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6565	NC_013960	TAAAGA	2	12	339606	339617	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
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6567	NC_013960	TC	3	6	339719	339724	0 %	50 %	0 %	50 %	292490490
6568	NC_013960	GAA	2	6	339772	339777	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	292490490
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6573	NC_013960	GCG	2	6	340294	340299	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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6577	NC_013960	TTTG	2	8	340631	340638	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
6578	NC_013960	G	7	7	340698	340704	0 %	0 %	100 %	0 %	292490492
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6584	NC_013960	CGG	2	6	341019	341024	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	292490492
6585	NC_013960	CCGG	2	8	341040	341047	0 %	0 %	50 %	50 %	292490492
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6593	NC_013960	G	6	6	341418	341423	0 %	0 %	100 %	0 %	292490492
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6596	NC_013960	CG	3	6	341551	341556	0 %	0 %	50 %	50 %	292490492
6597	NC_013960	TGG	2	6	341825	341830	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	292490492
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6605	NC_013960	ATG	2	6	342257	342262	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	292490493
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6611	NC_013960	TAG	2	6	342438	342443	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	292490493
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6614	NC_013960	AGC	2	6	342655	342660	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292490494
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6620	NC_013960	CTC	2	6	343025	343030	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	292490494
6621	NC_013960	TGA	2	6	343036	343041	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	292490494
6622	NC_013960	TGG	2	6	343084	343089	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	292490494
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6624	NC_013960	G	8	8	343169	343176	0 %	0 %	100 %	0 %	292490494
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