MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Nitrosococcus halophilus Nc4 chromosome

Total Repeats: 78310

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
6001	NC_013960	GCG	2	6	311648	311653	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	292490455
6002	NC_013960	CGG	2	6	311661	311666	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	292490455
6003	NC_013960	ATGC	2	8	311678	311685	25 %	25 %	25 %	25 %	292490455
6004	NC_013960	T	6	6	311699	311704	0 %	100 %	0 %	0 %	292490455
6005	NC_013960	TTTC	2	8	311710	311717	0 %	75 %	0 %	25 %	292490455
6006	NC_013960	GGT	2	6	311839	311844	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	292490455
6007	NC_013960	TCG	2	6	311851	311856	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292490455
6008	NC_013960	CAC	2	6	311878	311883	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	292490455
6009	NC_013960	G	7	7	311887	311893	0 %	0 %	100 %	0 %	292490455
6010	NC_013960	CTTG	2	8	311921	311928	0 %	50 %	25 %	25 %	292490455
6011	NC_013960	GGCT	2	8	312057	312064	0 %	25 %	50 %	25 %	292490455
6012	NC_013960	GCC	2	6	312068	312073	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	292490455
6013	NC_013960	CGG	2	6	312215	312220	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	292490455
6014	NC_013960	ACC	2	6	312228	312233	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	292490455
6015	NC_013960	CGG	2	6	312250	312255	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	292490455
6016	NC_013960	GCT	2	6	312260	312265	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292490455
6017	NC_013960	CAG	2	6	312273	312278	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292490455
6018	NC_013960	CCAG	2	8	312450	312457	25 %	0 %	25 %	50 %	292490456
6019	NC_013960	ATCTGG	2	12	312494	312505	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	292490456
6020	NC_013960	CGC	2	6	312574	312579	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	292490456
6021	NC_013960	ACC	2	6	312584	312589	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	292490456
6022	NC_013960	G	6	6	312591	312596	0 %	0 %	100 %	0 %	292490456
6023	NC_013960	GCA	2	6	312636	312641	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292490456
6024	NC_013960	GCTT	2	8	312674	312681	0 %	50 %	25 %	25 %	292490456
6025	NC_013960	CAA	2	6	312780	312785	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	292490456
6026	NC_013960	G	6	6	312794	312799	0 %	0 %	100 %	0 %	292490456
6027	NC_013960	CAC	2	6	312927	312932	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	292490456
6028	NC_013960	GTT	2	6	313027	313032	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	292490457
6029	NC_013960	TGG	2	6	313054	313059	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	292490457
6030	NC_013960	AG	3	6	313107	313112	50 %	0 %	50 %	0 %	292490457
6031	NC_013960	TTGT	2	8	313175	313182	0 %	75 %	25 %	0 %	292490457
6032	NC_013960	CGG	2	6	313280	313285	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	292490457
6033	NC_013960	CTT	2	6	313349	313354	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	292490457
6034	NC_013960	T	8	8	313456	313463	0 %	100 %	0 %	0 %	292490457
6035	NC_013960	CGC	2	6	313473	313478	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	292490457
6036	NC_013960	ATA	2	6	313505	313510	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	292490457
6037	NC_013960	TC	3	6	313565	313570	0 %	50 %	0 %	50 %	292490457
6038	NC_013960	ATCA	2	8	313583	313590	50 %	25 %	0 %	25 %	292490457
6039	NC_013960	TCC	2	6	313629	313634	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	292490457
6040	NC_013960	ACC	2	6	313712	313717	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	292490457
6041	NC_013960	TACA	2	8	313758	313765	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
6042	NC_013960	AATATA	2	12	313767	313778	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6043	NC_013960	GCA	2	6	313798	313803	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6044	NC_013960	TGA	2	6	313889	313894	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6045	NC_013960	CTAT	2	8	313913	313920	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
6046	NC_013960	A	7	7	313945	313951	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6047	NC_013960	GCG	2	6	313981	313986	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6048	NC_013960	TAT	2	6	314043	314048	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	292490458
6049	NC_013960	GGTT	2	8	314064	314071	0 %	50 %	50 %	0 %	292490458
6050	NC_013960	TGG	2	6	314131	314136	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	292490458
6051	NC_013960	GCA	2	6	314248	314253	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292490458
6052	NC_013960	TTG	2	6	314322	314327	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	292490458
6053	NC_013960	GCC	2	6	314445	314450	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	292490458
6054	NC_013960	C	6	6	314596	314601	0 %	0 %	0 %	100 %	292490458
6055	NC_013960	CTG	2	6	314610	314615	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292490458
6056	NC_013960	AGC	2	6	314698	314703	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292490458
6057	NC_013960	GGA	2	6	314744	314749	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	292490458
6058	NC_013960	TGC	2	6	314761	314766	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292490458
6059	NC_013960	T	7	7	314855	314861	0 %	100 %	0 %	0 %	292490458
6060	NC_013960	GAA	2	6	315060	315065	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	292490458
6061	NC_013960	TGT	2	6	315235	315240	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	292490458
6062	NC_013960	CCTT	2	8	315276	315283	0 %	50 %	0 %	50 %	292490458
6063	NC_013960	CCGA	2	8	315291	315298	25 %	0 %	25 %	50 %	292490458
6064	NC_013960	GC	3	6	315299	315304	0 %	0 %	50 %	50 %	292490458
6065	NC_013960	TTG	2	6	315385	315390	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6066	NC_013960	TGG	2	6	315396	315401	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6067	NC_013960	AGC	2	6	315408	315413	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6068	NC_013960	GCT	2	6	315524	315529	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6069	NC_013960	TTC	2	6	315552	315557	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6070	NC_013960	A	9	9	315573	315581	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6071	NC_013960	CAG	2	6	315702	315707	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292490459
6072	NC_013960	CAGC	2	8	315745	315752	25 %	0 %	25 %	50 %	292490459
6073	NC_013960	GCC	2	6	315800	315805	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	292490459
6074	NC_013960	CGG	2	6	315891	315896	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	292490459
6075	NC_013960	CCGG	2	8	315928	315935	0 %	0 %	50 %	50 %	292490459
6076	NC_013960	GCC	2	6	316003	316008	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	292490459
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6078	NC_013960	GC	3	6	316099	316104	0 %	0 %	50 %	50 %	292490459
6079	NC_013960	CGGAT	2	10	316154	316163	20 %	20 %	40 %	20 %	292490459
6080	NC_013960	TCA	2	6	316202	316207	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	292490459
6081	NC_013960	GCGA	2	8	316218	316225	25 %	0 %	50 %	25 %	292490459
6082	NC_013960	TCCC	2	8	316231	316238	0 %	25 %	0 %	75 %	292490459
6083	NC_013960	TTG	2	6	316265	316270	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	292490459
6084	NC_013960	CG	3	6	316277	316282	0 %	0 %	50 %	50 %	292490459
6085	NC_013960	ATTC	2	8	316287	316294	25 %	50 %	0 %	25 %	292490459
6086	NC_013960	CGA	2	6	316344	316349	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292490459
6087	NC_013960	CGG	3	9	316371	316379	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	292490459
6088	NC_013960	TGG	2	6	316380	316385	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	292490459
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6091	NC_013960	GGC	2	6	316590	316595	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	292490459
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6093	NC_013960	CA	3	6	316651	316656	50 %	0 %	0 %	50 %	292490459
6094	NC_013960	GTA	2	6	316672	316677	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	292490459
6095	NC_013960	AG	3	6	316703	316708	50 %	0 %	50 %	0 %	292490459
6096	NC_013960	TGG	2	6	316722	316727	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	292490459
6097	NC_013960	CAA	2	6	316755	316760	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6098	NC_013960	TAT	2	6	316788	316793	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	292490460
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6100	NC_013960	TCAG	2	8	316890	316897	25 %	25 %	25 %	25 %	292490460
6101	NC_013960	CCA	2	6	316918	316923	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	292490460
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6104	NC_013960	TCA	2	6	317035	317040	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	292490460
6105	NC_013960	TTG	2	6	317052	317057	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6106	NC_013960	C	6	6	317095	317100	0 %	0 %	0 %	100 %	292490461
6107	NC_013960	CTGC	2	8	317114	317121	0 %	25 %	25 %	50 %	292490461
6108	NC_013960	CAC	2	6	317204	317209	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	292490461
6109	NC_013960	ATC	2	6	317241	317246	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	292490461
6110	NC_013960	CTG	2	6	317295	317300	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292490461
6111	NC_013960	TTC	2	6	317304	317309	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	292490461
6112	NC_013960	T	6	6	317317	317322	0 %	100 %	0 %	0 %	292490461
6113	NC_013960	TCA	2	6	317467	317472	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	292490461
6114	NC_013960	GTG	2	6	317501	317506	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6115	NC_013960	GAAT	2	8	317519	317526	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
6116	NC_013960	TCC	2	6	317555	317560	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6117	NC_013960	T	6	6	317569	317574	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6118	NC_013960	TTTG	2	8	317640	317647	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
6119	NC_013960	TCAT	2	8	317652	317659	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
6120	NC_013960	GAG	2	6	317858	317863	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6121	NC_013960	AAT	2	6	317882	317887	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6122	NC_013960	ACC	2	6	318017	318022	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	292490462
6123	NC_013960	GCG	2	6	318119	318124	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	292490462
6124	NC_013960	CTGG	2	8	318173	318180	0 %	25 %	50 %	25 %	292490462
6125	NC_013960	TC	3	6	318201	318206	0 %	50 %	0 %	50 %	292490462
6126	NC_013960	CTT	2	6	318215	318220	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	292490463
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6151	NC_013960	TA	3	6	319209	319214	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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6241	NC_013960	TCC	2	6	323905	323910	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	292490470
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6257	NC_013960	CTG	2	6	324389	324394	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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6373	NC_013960	GA	3	6	329538	329543	50 %	0 %	50 %	0 %	292490478
6374	NC_013960	TGG	2	6	329544	329549	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	292490478
6375	NC_013960	CATG	2	8	329553	329560	25 %	25 %	25 %	25 %	292490478
6376	NC_013960	CTT	2	6	329604	329609	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	292490478
6377	NC_013960	CTG	2	6	329629	329634	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292490478
6378	NC_013960	GCA	2	6	329647	329652	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292490478
6379	NC_013960	CTT	2	6	329709	329714	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	292490478
6380	NC_013960	ATC	2	6	329749	329754	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	292490478
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6382	NC_013960	TAC	2	6	329866	329871	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	292490478
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6384	NC_013960	CTT	2	6	330039	330044	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	292490478
6385	NC_013960	G	6	6	330062	330067	0 %	0 %	100 %	0 %	292490478
6386	NC_013960	CAG	2	6	330085	330090	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292490478
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6391	NC_013960	AATCG	2	10	330244	330253	40 %	20 %	20 %	20 %	292490478
6392	NC_013960	ATG	2	6	330254	330259	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	292490478
6393	NC_013960	TTC	2	6	330334	330339	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	292490478
6394	NC_013960	AGC	2	6	330385	330390	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292490478
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6397	NC_013960	GTT	2	6	330663	330668	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	292490478
6398	NC_013960	GA	3	6	330685	330690	50 %	0 %	50 %	0 %	292490478
6399	NC_013960	TATT	2	8	330728	330735	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
6400	NC_013960	TTCA	2	8	330857	330864	25 %	50 %	0 %	25 %	292490479
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6426	NC_013960	AAT	2	6	332757	332762	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6427	NC_013960	AAC	2	6	332816	332821	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6428	NC_013960	GCA	2	6	332837	332842	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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6432	NC_013960	TCG	2	6	333072	333077	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292490482
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6461	NC_013960	TAT	2	6	334554	334559	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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6478	NC_013960	TGT	2	6	335398	335403	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6479	NC_013960	GA	3	6	335516	335521	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
6480	NC_013960	CAT	2	6	335557	335562	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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6485	NC_013960	TAA	2	6	335791	335796	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6486	NC_013960	GCG	2	6	335801	335806	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6487	NC_013960	TCGC	2	8	335822	335829	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
6488	NC_013960	TAG	2	6	335843	335848	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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6492	NC_013960	G	6	6	336318	336323	0 %	0 %	100 %	0 %	292490485
6493	NC_013960	GAT	3	9	336368	336376	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	292490485
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6495	NC_013960	ATG	2	6	336451	336456	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	292490485
6496	NC_013960	TTATAT	2	12	336518	336529	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	292490485
6497	NC_013960	GCC	2	6	336591	336596	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	292490485
6498	NC_013960	CCATT	2	10	336636	336645	20 %	40 %	0 %	40 %	292490485
6499	NC_013960	GGC	2	6	336724	336729	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	292490485
6500	NC_013960	GCA	2	6	336744	336749	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292490485

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