MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Nitrosococcus halophilus Nc4 chromosome

Total Repeats: 78310

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5501	NC_013960	GTG	2	6	286300	286305	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	292490427
5502	NC_013960	ATG	2	6	286396	286401	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	292490427
5503	NC_013960	CAC	2	6	286472	286477	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	292490427
5504	NC_013960	TCC	2	6	286690	286695	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	292490427
5505	NC_013960	TTG	2	6	286713	286718	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	292490427
5506	NC_013960	G	6	6	286770	286775	0 %	0 %	100 %	0 %	292490427
5507	NC_013960	CGCT	2	8	286874	286881	0 %	25 %	25 %	50 %	292490427
5508	NC_013960	GCC	2	6	286911	286916	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	292490427
5509	NC_013960	GTGATG	2	12	286951	286962	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	292490427
5510	NC_013960	CGG	2	6	286994	286999	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	292490427
5511	NC_013960	GCC	2	6	287034	287039	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	292490427
5512	NC_013960	ACC	2	6	287058	287063	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5513	NC_013960	GGT	2	6	287112	287117	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5514	NC_013960	GTT	2	6	287177	287182	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5515	NC_013960	A	7	7	287241	287247	100 %	0 %	0 %	0 %	292490428
5516	NC_013960	GTTGGC	2	12	287367	287378	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	292490428
5517	NC_013960	CAT	2	6	287387	287392	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	292490428
5518	NC_013960	TGG	2	6	287408	287413	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	292490428
5519	NC_013960	GAA	2	6	287421	287426	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	292490428
5520	NC_013960	CTG	2	6	287467	287472	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292490428
5521	NC_013960	TGG	2	6	287513	287518	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	292490428
5522	NC_013960	GTT	2	6	287568	287573	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	292490428
5523	NC_013960	TCC	2	6	287578	287583	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	292490428
5524	NC_013960	GGA	2	6	287601	287606	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	292490428
5525	NC_013960	G	6	6	287735	287740	0 %	0 %	100 %	0 %	292490428
5526	NC_013960	AGG	2	6	287768	287773	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	292490428
5527	NC_013960	AG	3	6	287792	287797	50 %	0 %	50 %	0 %	292490428
5528	NC_013960	TGA	2	6	287802	287807	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	292490428
5529	NC_013960	T	6	6	287817	287822	0 %	100 %	0 %	0 %	292490428
5530	NC_013960	CGAG	2	8	287939	287946	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
5531	NC_013960	TGG	2	6	287962	287967	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5532	NC_013960	T	7	7	287979	287985	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5533	NC_013960	TAC	2	6	287993	287998	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5534	NC_013960	TTTAA	2	10	288036	288045	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
5535	NC_013960	AAG	2	6	288062	288067	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5536	NC_013960	AGC	2	6	288084	288089	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5537	NC_013960	TCA	2	6	288102	288107	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	292490429
5538	NC_013960	A	6	6	288107	288112	100 %	0 %	0 %	0 %	292490429
5539	NC_013960	AAAGAT	2	12	288137	288148	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	292490429
5540	NC_013960	AAC	2	6	288177	288182	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	292490429
5541	NC_013960	CAA	2	6	288224	288229	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	292490429
5542	NC_013960	TCC	2	6	288250	288255	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	292490429
5543	NC_013960	CTT	2	6	288264	288269	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	292490429
5544	NC_013960	CCG	2	6	288296	288301	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	292490429
5545	NC_013960	GAA	2	6	288355	288360	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	292490429
5546	NC_013960	CTT	2	6	288380	288385	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	292490429
5547	NC_013960	T	7	7	288455	288461	0 %	100 %	0 %	0 %	292490429
5548	NC_013960	GGA	2	6	288514	288519	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	292490429
5549	NC_013960	TGG	2	6	288539	288544	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	292490429
5550	NC_013960	CTC	2	6	288549	288554	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	292490429
5551	NC_013960	TCC	2	6	288565	288570	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	292490429
5552	NC_013960	TCC	2	6	288580	288585	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	292490429
5553	NC_013960	AGA	2	6	288586	288591	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	292490429
5554	NC_013960	G	6	6	288597	288602	0 %	0 %	100 %	0 %	292490429
5555	NC_013960	TCT	2	6	288617	288622	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	292490429
5556	NC_013960	TCA	2	6	288628	288633	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	292490429
5557	NC_013960	TGA	2	6	288721	288726	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5558	NC_013960	T	6	6	288786	288791	0 %	100 %	0 %	0 %	292490430
5559	NC_013960	CTA	2	6	288855	288860	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	292490430
5560	NC_013960	CTC	2	6	289008	289013	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	292490430
5561	NC_013960	CTA	2	6	289086	289091	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	292490430
5562	NC_013960	GGTG	2	8	289153	289160	0 %	25 %	75 %	0 %	292490430
5563	NC_013960	GTA	2	6	289273	289278	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	292490430
5564	NC_013960	AG	3	6	289458	289463	50 %	0 %	50 %	0 %	292490430
5565	NC_013960	GTT	2	6	289512	289517	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	292490430
5566	NC_013960	AAAT	2	8	289554	289561	75 %	25 %	0 %	0 %	292490430
5567	NC_013960	AAG	2	6	289583	289588	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	292490430
5568	NC_013960	ATCGTT	2	12	289761	289772	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
5569	NC_013960	TAAA	2	8	289806	289813	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
5570	NC_013960	T	6	6	289839	289844	0 %	100 %	0 %	0 %	292490431
5571	NC_013960	ACCT	2	8	289866	289873	25 %	25 %	0 %	50 %	292490431
5572	NC_013960	AGG	2	6	289901	289906	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	292490431
5573	NC_013960	GGC	2	6	289921	289926	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	292490431
5574	NC_013960	TGA	2	6	289936	289941	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	292490431
5575	NC_013960	TCC	2	6	289948	289953	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	292490431
5576	NC_013960	TCT	2	6	289964	289969	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	292490431
5577	NC_013960	CTGG	2	8	289982	289989	0 %	25 %	50 %	25 %	292490431
5578	NC_013960	CGA	2	6	290000	290005	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292490431
5579	NC_013960	GTGTCC	2	12	290031	290042	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292490431
5580	NC_013960	ACC	2	6	290063	290068	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	292490431
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5582	NC_013960	CTG	2	6	290085	290090	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292490431
5583	NC_013960	CAC	2	6	290120	290125	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	292490431
5584	NC_013960	ACC	2	6	290130	290135	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	292490431
5585	NC_013960	GTT	2	6	290228	290233	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	292490431
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5587	NC_013960	G	7	7	290258	290264	0 %	0 %	100 %	0 %	292490431
5588	NC_013960	GAA	2	6	290301	290306	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	292490431
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5590	NC_013960	CCCTTT	2	12	290355	290366	0 %	50 %	0 %	50 %	292490431
5591	NC_013960	T	7	7	290390	290396	0 %	100 %	0 %	0 %	292490431
5592	NC_013960	ATT	2	6	290437	290442	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	292490431
5593	NC_013960	TGTA	2	8	290467	290474	25 %	50 %	25 %	0 %	292490431
5594	NC_013960	GCT	2	6	290492	290497	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292490431
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5596	NC_013960	CTG	2	6	290567	290572	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292490431
5597	NC_013960	CT	3	6	290607	290612	0 %	50 %	0 %	50 %	292490431
5598	NC_013960	CCT	2	6	290733	290738	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	292490431
5599	NC_013960	CCG	2	6	290741	290746	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	292490431
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5604	NC_013960	CTA	2	6	290954	290959	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	292490431
5605	NC_013960	GCT	2	6	290982	290987	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292490431
5606	NC_013960	CAG	2	6	291023	291028	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292490431
5607	NC_013960	GCATCC	2	12	291068	291079	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	292490432
5608	NC_013960	C	6	6	291093	291098	0 %	0 %	0 %	100 %	292490432
5609	NC_013960	AGC	2	6	291108	291113	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292490432
5610	NC_013960	GTG	2	6	291128	291133	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	292490432
5611	NC_013960	T	6	6	291135	291140	0 %	100 %	0 %	0 %	292490432
5612	NC_013960	GCG	2	6	291146	291151	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	292490432
5613	NC_013960	GCC	2	6	291313	291318	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	292490432
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5617	NC_013960	AG	3	6	291644	291649	50 %	0 %	50 %	0 %	292490432
5618	NC_013960	CGG	2	6	291666	291671	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	292490432
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5621	NC_013960	AGA	2	6	291723	291728	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	292490432
5622	NC_013960	GGC	2	6	291748	291753	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	292490432
5623	NC_013960	GTTG	2	8	291855	291862	0 %	50 %	50 %	0 %	292490432
5624	NC_013960	CTG	2	6	291902	291907	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292490432
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5997	NC_013960	GCG	2	6	311473	311478	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	292490455
5998	NC_013960	CTG	2	6	311483	311488	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292490455
5999	NC_013960	AGCC	2	8	311609	311616	25 %	0 %	25 %	50 %	292490455
6000	NC_013960	CAT	2	6	311632	311637	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	292490455

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