MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Nitrosococcus halophilus Nc4 chromosome

Total Repeats: 78310

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4501	NC_013960	GC	3	6	233237	233242	0 %	0 %	50 %	50 %	292490374
4502	NC_013960	CGC	3	9	233240	233248	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	292490374
4503	NC_013960	AGCG	2	8	233270	233277	25 %	0 %	50 %	25 %	292490374
4504	NC_013960	GAC	2	6	233390	233395	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292490374
4505	NC_013960	CTG	2	6	233411	233416	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292490374
4506	NC_013960	TGG	2	6	233421	233426	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	292490374
4507	NC_013960	GAG	2	6	233432	233437	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	292490374
4508	NC_013960	AGGG	2	8	233477	233484	25 %	0 %	75 %	0 %	292490374
4509	NC_013960	G	6	6	233482	233487	0 %	0 %	100 %	0 %	292490374
4510	NC_013960	GGA	2	6	233626	233631	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	292490374
4511	NC_013960	CAA	2	6	233648	233653	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	292490374
4512	NC_013960	CAG	2	6	233846	233851	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292490374
4513	NC_013960	TGG	2	6	233979	233984	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	292490374
4514	NC_013960	GCA	2	6	234058	234063	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292490374
4515	NC_013960	AGG	2	6	234102	234107	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	292490374
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4517	NC_013960	GAA	2	6	234263	234268	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	292490374
4518	NC_013960	TTG	2	6	234281	234286	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	292490374
4519	NC_013960	GAA	2	6	234323	234328	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	292490374
4520	NC_013960	GA	3	6	234510	234515	50 %	0 %	50 %	0 %	292490374
4521	NC_013960	ATT	2	6	234570	234575	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	292490374
4522	NC_013960	TGC	2	6	234620	234625	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292490374
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4524	NC_013960	CGT	2	6	234751	234756	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292490374
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4527	NC_013960	CAA	2	6	234971	234976	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4528	NC_013960	GGC	2	6	235002	235007	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4529	NC_013960	ATC	2	6	235169	235174	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4530	NC_013960	GCC	2	6	235198	235203	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4531	NC_013960	GGCA	2	8	235264	235271	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
4532	NC_013960	GAT	2	6	235282	235287	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4533	NC_013960	GGT	2	6	235288	235293	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4534	NC_013960	TCA	2	6	235346	235351	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	292490375
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4537	NC_013960	GC	3	6	235524	235529	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4538	NC_013960	ACC	2	6	235616	235621	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4539	NC_013960	CCA	2	6	235626	235631	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4540	NC_013960	AGG	2	6	235858	235863	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4541	NC_013960	AG	3	6	235877	235882	50 %	0 %	50 %	0 %	292490376
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4557	NC_013960	CT	3	6	236838	236843	0 %	50 %	0 %	50 %	292490377
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4560	NC_013960	CGG	2	6	236914	236919	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	292490377
4561	NC_013960	TGC	2	6	236921	236926	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292490377
4562	NC_013960	GGA	2	6	236954	236959	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	292490377
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4571	NC_013960	CAG	2	6	237225	237230	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292490377
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4583	NC_013960	TCG	2	6	237799	237804	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292490379
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4595	NC_013960	AAG	2	6	238380	238385	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4596	NC_013960	GAA	2	6	238390	238395	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4597	NC_013960	G	6	6	238399	238404	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
4598	NC_013960	ATA	2	6	238431	238436	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4604	NC_013960	TGCT	2	8	238739	238746	0 %	50 %	25 %	25 %	292490380
4605	NC_013960	GCT	2	6	238782	238787	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292490380
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4608	NC_013960	A	6	6	239010	239015	100 %	0 %	0 %	0 %	292490380
4609	NC_013960	CGC	2	6	239191	239196	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	292490380
4610	NC_013960	TGG	2	6	239223	239228	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	292490380
4611	NC_013960	GAC	2	6	239239	239244	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292490380
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4614	NC_013960	GAT	2	6	239333	239338	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	292490380
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4622	NC_013960	AGAT	2	8	239790	239797	50 %	25 %	25 %	0 %	292490380
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4624	NC_013960	AGT	2	6	239839	239844	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	292490380
4625	NC_013960	GGC	2	6	239845	239850	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	292490380
4626	NC_013960	T	6	6	239894	239899	0 %	100 %	0 %	0 %	292490380
4627	NC_013960	CCAG	2	8	239929	239936	25 %	0 %	25 %	50 %	292490380
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4633	NC_013960	AGGGT	2	10	240240	240249	20 %	20 %	60 %	0 %	292490381
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4745	NC_013960	T	7	7	246472	246478	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4746	NC_013960	A	9	9	246496	246504	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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