MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Natrialba magadii ATCC 43099 plasmid pNMAG03

Total Repeats: 183

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013925	CAGC	2	8	64	71	25 %	0 %	25 %	50 %	289594274
2	NC_013925	CGCT	2	8	584	591	0 %	25 %	25 %	50 %	289594274
3	NC_013925	CGAT	2	8	627	634	25 %	25 %	25 %	25 %	289594274
4	NC_013925	GGAC	2	8	1005	1012	25 %	0 %	50 %	25 %	289594275
5	NC_013925	TCGA	2	8	1451	1458	25 %	25 %	25 %	25 %	289594277
6	NC_013925	CGCC	2	8	1551	1558	0 %	0 %	25 %	75 %	289594277
7	NC_013925	GTGA	2	8	1918	1925	25 %	25 %	50 %	0 %	289594278
8	NC_013925	ACGA	2	8	2763	2770	50 %	0 %	25 %	25 %	289594282
9	NC_013925	ACCG	2	8	3008	3015	25 %	0 %	25 %	50 %	289594283
10	NC_013925	GAGC	2	8	3119	3126	25 %	0 %	50 %	25 %	289594283
11	NC_013925	CGGG	2	8	3727	3734	0 %	0 %	75 %	25 %	289594284
12	NC_013925	GACG	2	8	3756	3763	25 %	0 %	50 %	25 %	289594284
13	NC_013925	CCGG	2	8	3818	3825	0 %	0 %	50 %	50 %	289594284
14	NC_013925	GTCG	2	8	4418	4425	0 %	25 %	50 %	25 %	289594286
15	NC_013925	GCGA	2	8	4437	4444	25 %	0 %	50 %	25 %	289594286
16	NC_013925	GGCT	2	8	4475	4482	0 %	25 %	50 %	25 %	289594286
17	NC_013925	GCCC	2	8	4723	4730	0 %	0 %	25 %	75 %	289594286
18	NC_013925	CGGT	2	8	4885	4892	0 %	25 %	50 %	25 %	289594287
19	NC_013925	GAAC	2	8	5458	5465	50 %	0 %	25 %	25 %	289594288
20	NC_013925	GTCG	2	8	5702	5709	0 %	25 %	50 %	25 %	289594289
21	NC_013925	ACGA	2	8	5863	5870	50 %	0 %	25 %	25 %	289594289
22	NC_013925	CCGA	2	8	6566	6573	25 %	0 %	25 %	50 %	289594290
23	NC_013925	CGAT	2	8	7004	7011	25 %	25 %	25 %	25 %	289594293
24	NC_013925	CGAT	2	8	7097	7104	25 %	25 %	25 %	25 %	289594293
25	NC_013925	CGAG	2	8	7207	7214	25 %	0 %	50 %	25 %	289594294
26	NC_013925	GAAC	2	8	7312	7319	50 %	0 %	25 %	25 %	289594294
27	NC_013925	TCGA	2	8	7927	7934	25 %	25 %	25 %	25 %	289594295
28	NC_013925	ACGA	2	8	8026	8033	50 %	0 %	25 %	25 %	289594295
29	NC_013925	CAGT	2	8	8485	8492	25 %	25 %	25 %	25 %	289594296
30	NC_013925	ACGA	2	8	9236	9243	50 %	0 %	25 %	25 %	289594296
31	NC_013925	ATCC	2	8	9293	9300	25 %	25 %	0 %	50 %	289594296
32	NC_013925	CGAG	2	8	9931	9938	25 %	0 %	50 %	25 %	289594298
33	NC_013925	GAAC	2	8	10031	10038	50 %	0 %	25 %	25 %	289594298
34	NC_013925	CTCG	2	8	10385	10392	0 %	25 %	25 %	50 %	289594298
35	NC_013925	CGAC	2	8	11334	11341	25 %	0 %	25 %	50 %	289594299
36	NC_013925	CGGA	2	8	11782	11789	25 %	0 %	50 %	25 %	289594300
37	NC_013925	CGCC	2	8	11898	11905	0 %	0 %	25 %	75 %	289594300
38	NC_013925	GAGC	2	8	12112	12119	25 %	0 %	50 %	25 %	289594300
39	NC_013925	TCGA	2	8	12308	12315	25 %	25 %	25 %	25 %	289594300
40	NC_013925	GAAC	2	8	12387	12394	50 %	0 %	25 %	25 %	289594300
41	NC_013925	TGAC	2	8	12414	12421	25 %	25 %	25 %	25 %	289594300
42	NC_013925	ACGG	2	8	12434	12441	25 %	0 %	50 %	25 %	289594301
43	NC_013925	GAGC	2	8	12500	12507	25 %	0 %	50 %	25 %	289594301
44	NC_013925	CCGA	2	8	12888	12895	25 %	0 %	25 %	50 %	289594302
45	NC_013925	TGAC	2	8	13248	13255	25 %	25 %	25 %	25 %	289594303
46	NC_013925	CGTC	2	8	13267	13274	0 %	25 %	25 %	50 %	289594304
47	NC_013925	GCGG	2	8	13321	13328	0 %	0 %	75 %	25 %	289594304
48	NC_013925	ACCC	2	8	13808	13815	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
49	NC_013925	ACGA	2	8	13905	13912	50 %	0 %	25 %	25 %	289594305
50	NC_013925	CTGT	2	8	14050	14057	0 %	50 %	25 %	25 %	289594305
51	NC_013925	AGTC	2	8	14685	14692	25 %	25 %	25 %	25 %	289594306
52	NC_013925	ATGA	2	8	15211	15218	50 %	25 %	25 %	0 %	289594307
53	NC_013925	ATCC	2	8	15558	15565	25 %	25 %	0 %	50 %	289594308
54	NC_013925	GCTG	2	8	15629	15636	0 %	25 %	50 %	25 %	289594308
55	NC_013925	AGCG	2	8	16284	16291	25 %	0 %	50 %	25 %	289594309
56	NC_013925	GACC	2	8	16977	16984	25 %	0 %	25 %	50 %	289594309
57	NC_013925	CGAT	2	8	17139	17146	25 %	25 %	25 %	25 %	289594310
58	NC_013925	CGAG	2	8	17215	17222	25 %	0 %	50 %	25 %	289594310
59	NC_013925	ACCG	2	8	17540	17547	25 %	0 %	25 %	50 %	289594310
60	NC_013925	GGAC	2	8	17741	17748	25 %	0 %	50 %	25 %	289594311
61	NC_013925	GTGC	2	8	17806	17813	0 %	25 %	50 %	25 %	289594311
62	NC_013925	TGCA	2	8	18012	18019	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
63	NC_013925	CGTG	2	8	18550	18557	0 %	25 %	50 %	25 %	289594313
64	NC_013925	GCGA	2	8	18756	18763	25 %	0 %	50 %	25 %	289594314
65	NC_013925	GAGC	2	8	18928	18935	25 %	0 %	50 %	25 %	289594314
66	NC_013925	CGCC	2	8	19057	19064	0 %	0 %	25 %	75 %	289594314
67	NC_013925	GCTG	2	8	19737	19744	0 %	25 %	50 %	25 %	289594315
68	NC_013925	CTCG	2	8	20177	20184	0 %	25 %	25 %	50 %	289594315
69	NC_013925	GACG	2	8	20385	20392	25 %	0 %	50 %	25 %	289594315
70	NC_013925	CCGA	2	8	20433	20440	25 %	0 %	25 %	50 %	289594315
71	NC_013925	TCGC	2	8	20617	20624	0 %	25 %	25 %	50 %	289594315
72	NC_013925	GATC	2	8	21339	21346	25 %	25 %	25 %	25 %	289594318
73	NC_013925	ACGC	2	8	21938	21945	25 %	0 %	25 %	50 %	289594320
74	NC_013925	GGTC	2	8	22090	22097	0 %	25 %	50 %	25 %	289594320
75	NC_013925	AGCG	2	8	22106	22113	25 %	0 %	50 %	25 %	289594320
76	NC_013925	GACG	2	8	22123	22130	25 %	0 %	50 %	25 %	289594320
77	NC_013925	GGCT	2	8	22166	22173	0 %	25 %	50 %	25 %	289594320
78	NC_013925	AACG	2	8	22327	22334	50 %	0 %	25 %	25 %	289594320
79	NC_013925	CGAA	2	8	22407	22414	50 %	0 %	25 %	25 %	289594320
80	NC_013925	CGGG	2	8	23187	23194	0 %	0 %	75 %	25 %	289594320
81	NC_013925	CGAC	2	8	23676	23683	25 %	0 %	25 %	50 %	289594321
82	NC_013925	TCGA	2	8	23708	23715	25 %	25 %	25 %	25 %	289594321
83	NC_013925	GCGG	2	8	23878	23885	0 %	0 %	75 %	25 %	289594321
84	NC_013925	GTGG	2	8	24050	24057	0 %	25 %	75 %	0 %	289594321
85	NC_013925	TCGT	2	8	24662	24669	0 %	50 %	25 %	25 %	289594322
86	NC_013925	AATC	2	8	24729	24736	50 %	25 %	0 %	25 %	289594322
87	NC_013925	TGGC	2	8	25407	25414	0 %	25 %	50 %	25 %	289594322
88	NC_013925	CAGC	2	8	26134	26141	25 %	0 %	25 %	50 %	289594322
89	NC_013925	CAAC	2	8	26243	26250	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
90	NC_013925	GGAC	2	8	26392	26399	25 %	0 %	50 %	25 %	289594323
91	NC_013925	GACC	2	8	26921	26928	25 %	0 %	25 %	50 %	289594323
92	NC_013925	GAGC	2	8	27110	27117	25 %	0 %	50 %	25 %	289594323
93	NC_013925	CGTC	2	8	27668	27675	0 %	25 %	25 %	50 %	289594324
94	NC_013925	CCGA	3	12	28053	28064	25 %	0 %	25 %	50 %	289594325
95	NC_013925	GACG	2	8	29014	29021	25 %	0 %	50 %	25 %	289594328
96	NC_013925	CCGA	2	8	29293	29300	25 %	0 %	25 %	50 %	289594328
97	NC_013925	AGTC	2	8	29554	29561	25 %	25 %	25 %	25 %	289594329
98	NC_013925	TCGA	2	8	29640	29647	25 %	25 %	25 %	25 %	289594329
99	NC_013925	AGTG	2	8	29693	29700	25 %	25 %	50 %	0 %	289594329
100	NC_013925	AACT	2	8	30070	30077	50 %	25 %	0 %	25 %	289594330
101	NC_013925	CGAC	2	8	30400	30407	25 %	0 %	25 %	50 %	289594330
102	NC_013925	TCGA	2	8	30486	30493	25 %	25 %	25 %	25 %	289594330
103	NC_013925	GCGA	2	8	30621	30628	25 %	0 %	50 %	25 %	289594330
104	NC_013925	GATG	2	8	30692	30699	25 %	25 %	50 %	0 %	289594330
105	NC_013925	GAGC	2	8	30803	30810	25 %	0 %	50 %	25 %	289594330
106	NC_013925	GAAC	2	8	30830	30837	50 %	0 %	25 %	25 %	289594330
107	NC_013925	TCGG	2	8	31167	31174	0 %	25 %	50 %	25 %	289594330
108	NC_013925	GTTG	2	8	31518	31525	0 %	50 %	50 %	0 %	289594331
109	NC_013925	TCGA	2	8	31543	31550	25 %	25 %	25 %	25 %	289594331
110	NC_013925	AATA	2	8	32549	32556	75 %	25 %	0 %	0 %	289594333
111	NC_013925	ACGT	2	8	32774	32781	25 %	25 %	25 %	25 %	289594333
112	NC_013925	GATC	2	8	33081	33088	25 %	25 %	25 %	25 %	289594333
113	NC_013925	TCAA	2	8	33224	33231	50 %	25 %	0 %	25 %	289594334
114	NC_013925	TGAT	2	8	33735	33742	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
115	NC_013925	GTCG	2	8	34103	34110	0 %	25 %	50 %	25 %	289594335
116	NC_013925	CTCG	2	8	34940	34947	0 %	25 %	25 %	50 %	289594335
117	NC_013925	CAGG	2	8	35376	35383	25 %	0 %	50 %	25 %	289594335
118	NC_013925	TGAC	2	8	35599	35606	25 %	25 %	25 %	25 %	289594335
119	NC_013925	GAGG	2	8	35724	35731	25 %	0 %	75 %	0 %	289594335
120	NC_013925	GTCG	2	8	36403	36410	0 %	25 %	50 %	25 %	289594336
121	NC_013925	CGAT	2	8	36644	36651	25 %	25 %	25 %	25 %	289594337
122	NC_013925	GGCG	2	8	36948	36955	0 %	0 %	75 %	25 %	289594338
123	NC_013925	GATG	2	8	37161	37168	25 %	25 %	50 %	0 %	289594338
124	NC_013925	GGTT	2	8	37990	37997	0 %	50 %	50 %	0 %	289594339
125	NC_013925	GTCG	2	8	38680	38687	0 %	25 %	50 %	25 %	289594340
126	NC_013925	CCCG	2	8	39102	39109	0 %	0 %	25 %	75 %	289594341
127	NC_013925	ATCG	2	8	39172	39179	25 %	25 %	25 %	25 %	289594341
128	NC_013925	CTCG	2	8	39388	39395	0 %	25 %	25 %	50 %	289594341
129	NC_013925	ATCG	2	8	39592	39599	25 %	25 %	25 %	25 %	289594341
130	NC_013925	CGAC	2	8	40030	40037	25 %	0 %	25 %	50 %	289594342
131	NC_013925	TCGG	2	8	40452	40459	0 %	25 %	50 %	25 %	289594342
132	NC_013925	TGAC	2	8	40693	40700	25 %	25 %	25 %	25 %	289594343
133	NC_013925	CGGA	2	8	40908	40915	25 %	0 %	50 %	25 %	289594343
134	NC_013925	GATG	2	8	41249	41256	25 %	25 %	50 %	0 %	289594344
135	NC_013925	GCGA	2	8	41267	41274	25 %	0 %	50 %	25 %	289594344
136	NC_013925	CCGA	2	8	41523	41530	25 %	0 %	25 %	50 %	289594344
137	NC_013925	CGAG	2	8	41547	41554	25 %	0 %	50 %	25 %	289594344
138	NC_013925	GTCG	2	8	41572	41579	0 %	25 %	50 %	25 %	289594344
139	NC_013925	GATG	2	8	42503	42510	25 %	25 %	50 %	0 %	289594345
140	NC_013925	ACGC	2	8	43888	43895	25 %	0 %	25 %	50 %	289594347
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177	NC_013925	CTCG	2	8	54948	54955	0 %	25 %	25 %	50 %	289594362
178	NC_013925	CGGA	2	8	55159	55166	25 %	0 %	50 %	25 %	289594362
179	NC_013925	CTGA	2	8	56093	56100	25 %	25 %	25 %	25 %	289594362
180	NC_013925	CGGC	2	8	57014	57021	0 %	0 %	50 %	50 %	289594364
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182	NC_013925	TCCA	2	8	57439	57446	25 %	25 %	0 %	50 %	289594365
183	NC_013925	GCCG	2	8	57999	58006	0 %	0 %	50 %	50 %	289594366

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.