MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Natrialba magadii ATCC 43099 plasmid pNMAG02

Total Repeats: 5550

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_013924	GCCCT	2	10	46242	46251	0 %	20 %	20 %	60 %	289937495
1002	NC_013924	CTG	2	6	46272	46277	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289937495
1003	NC_013924	CGG	2	6	46299	46304	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	289937495
1004	NC_013924	AC	3	6	46327	46332	50 %	0 %	0 %	50 %	289937495
1005	NC_013924	GGGAAA	2	12	46364	46375	50 %	0 %	50 %	0 %	289937495
1006	NC_013924	AGT	2	6	46384	46389	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	289937495
1007	NC_013924	ACT	2	6	46427	46432	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	289937495
1008	NC_013924	AGG	2	6	46443	46448	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	289937495
1009	NC_013924	AGG	2	6	46450	46455	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	289937495
1010	NC_013924	GTT	2	6	46457	46462	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	289937495
1011	NC_013924	GA	3	6	46463	46468	50 %	0 %	50 %	0 %	289937495
1012	NC_013924	TCG	3	9	46473	46481	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289937495
1013	NC_013924	TG	3	6	46588	46593	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1014	NC_013924	CGT	3	9	46709	46717	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289937496
1015	NC_013924	TCG	2	6	46722	46727	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289937496
1016	NC_013924	CGGC	2	8	46749	46756	0 %	0 %	50 %	50 %	289937496
1017	NC_013924	TCG	2	6	46771	46776	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289937496
1018	NC_013924	CCG	2	6	46786	46791	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	289937496
1019	NC_013924	TCG	2	6	46884	46889	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289937496
1020	NC_013924	ATCG	2	8	46912	46919	25 %	25 %	25 %	25 %	289937496
1021	NC_013924	GCT	2	6	46947	46952	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289937496
1022	NC_013924	AAGC	2	8	47034	47041	50 %	0 %	25 %	25 %	289937496
1023	NC_013924	CACC	2	8	47056	47063	25 %	0 %	0 %	75 %	289937496
1024	NC_013924	CGA	2	6	47155	47160	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289937496
1025	NC_013924	CGA	2	6	47180	47185	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289937496
1026	NC_013924	CAT	2	6	47195	47200	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	289937496
1027	NC_013924	TGA	2	6	47224	47229	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	289937496
1028	NC_013924	CTCG	2	8	47250	47257	0 %	25 %	25 %	50 %	289937496
1029	NC_013924	CGT	2	6	47284	47289	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289937496
1030	NC_013924	CGT	2	6	47344	47349	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289937496
1031	NC_013924	CGA	2	6	47350	47355	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289937496
1032	NC_013924	GAC	2	6	47393	47398	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289937496
1033	NC_013924	CGG	2	6	47437	47442	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	289937496
1034	NC_013924	ATG	2	6	47513	47518	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1035	NC_013924	GCC	2	6	47754	47759	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	289937498
1036	NC_013924	TCG	2	6	47790	47795	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289937498
1037	NC_013924	TCG	2	6	47808	47813	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289937498
1038	NC_013924	GT	3	6	47817	47822	0 %	50 %	50 %	0 %	289937498
1039	NC_013924	TGAT	2	8	47871	47878	25 %	50 %	25 %	0 %	289937498
1040	NC_013924	GTCG	2	8	47891	47898	0 %	25 %	50 %	25 %	289937498
1041	NC_013924	TCG	2	6	48009	48014	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289937498
1042	NC_013924	GAC	2	6	48059	48064	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289937498
1043	NC_013924	TCG	2	6	48075	48080	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289937498
1044	NC_013924	ATCG	2	8	48089	48096	25 %	25 %	25 %	25 %	289937498
1045	NC_013924	TCG	2	6	48099	48104	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289937498
1046	NC_013924	CCG	2	6	48113	48118	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	289937498
1047	NC_013924	AG	3	6	48211	48216	50 %	0 %	50 %	0 %	289937498
1048	NC_013924	CGT	2	6	48222	48227	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289937498
1049	NC_013924	CGT	2	6	48241	48246	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289937498
1050	NC_013924	TCGC	2	8	48309	48316	0 %	25 %	25 %	50 %	289937498
1051	NC_013924	GAC	2	6	48485	48490	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289937498
1052	NC_013924	GGA	2	6	48627	48632	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	289937498
1053	NC_013924	GAC	2	6	48662	48667	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289937498
1054	NC_013924	CGGC	2	8	48699	48706	0 %	0 %	50 %	50 %	289937498
1055	NC_013924	CTG	2	6	48725	48730	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289937498
1056	NC_013924	GGGTT	2	10	48738	48747	0 %	40 %	60 %	0 %	289937498
1057	NC_013924	GTG	2	6	48773	48778	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	289937498
1058	NC_013924	TG	3	6	48777	48782	0 %	50 %	50 %	0 %	289937498
1059	NC_013924	GCAC	2	8	48806	48813	25 %	0 %	25 %	50 %	289937498
1060	NC_013924	GCG	3	9	48855	48863	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	289937498
1061	NC_013924	CGC	2	6	48940	48945	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	289937499
1062	NC_013924	CGT	2	6	48963	48968	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289937499
1063	NC_013924	GTCAC	2	10	48989	48998	20 %	20 %	20 %	40 %	289937499
1064	NC_013924	CGCT	2	8	49003	49010	0 %	25 %	25 %	50 %	289937499
1065	NC_013924	GAC	2	6	49045	49050	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289937499
1066	NC_013924	CGA	2	6	49053	49058	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289937499
1067	NC_013924	TCG	2	6	49064	49069	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289937499
1068	NC_013924	TGA	2	6	49074	49079	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	289937499
1069	NC_013924	CGG	2	6	49097	49102	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	289937499
1070	NC_013924	GTC	3	9	49183	49191	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289937499
1071	NC_013924	CTC	2	6	49219	49224	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	289937500
1072	NC_013924	TCG	2	6	49264	49269	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289937500
1073	NC_013924	TCG	2	6	49273	49278	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289937500
1074	NC_013924	CGCT	2	8	49304	49311	0 %	25 %	25 %	50 %	289937500
1075	NC_013924	TCG	2	6	49363	49368	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289937500
1076	NC_013924	CAG	2	6	49387	49392	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289937500
1077	NC_013924	CCG	2	6	49393	49398	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	289937500
1078	NC_013924	GAC	2	6	49425	49430	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289937500
1079	NC_013924	GAATC	2	10	49439	49448	40 %	20 %	20 %	20 %	289937500
1080	NC_013924	CGC	2	6	49512	49517	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	289937500
1081	NC_013924	TCG	2	6	49573	49578	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289937500
1082	NC_013924	GCG	2	6	49708	49713	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	289937500
1083	NC_013924	GCGTG	2	10	49753	49762	0 %	20 %	60 %	20 %	289937500
1084	NC_013924	AGC	2	6	49799	49804	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289937500
1085	NC_013924	CGT	2	6	49820	49825	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289937500
1086	NC_013924	GTCC	2	8	49881	49888	0 %	25 %	25 %	50 %	289937500
1087	NC_013924	GGA	2	6	49931	49936	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	289937500
1088	NC_013924	CGT	2	6	50003	50008	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289937500
1089	NC_013924	ACC	2	6	50017	50022	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	289937500
1090	NC_013924	CGT	2	6	50042	50047	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289937500
1091	NC_013924	CTG	2	6	50150	50155	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1092	NC_013924	TATAT	2	10	50157	50166	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
1093	NC_013924	GTT	2	6	50226	50231	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1094	NC_013924	CAAT	2	8	50307	50314	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
1095	NC_013924	CCA	2	6	50332	50337	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1096	NC_013924	GTG	2	6	50449	50454	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	289937501
1097	NC_013924	TGGT	2	8	50581	50588	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1098	NC_013924	CTTC	2	8	50625	50632	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1099	NC_013924	CAA	2	6	50644	50649	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1100	NC_013924	AG	7	14	50652	50665	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1101	NC_013924	CAG	2	6	50686	50691	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1102	NC_013924	ATCC	2	8	50744	50751	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
1103	NC_013924	CTA	2	6	50767	50772	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1104	NC_013924	ATA	2	6	50816	50821	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1105	NC_013924	AAT	2	6	50901	50906	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1106	NC_013924	CGC	2	6	51042	51047	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	289937502
1107	NC_013924	CGT	2	6	51060	51065	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289937502
1108	NC_013924	GCCA	2	8	51145	51152	25 %	0 %	25 %	50 %	289937502
1109	NC_013924	CGG	2	6	51195	51200	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	289937502
1110	NC_013924	CA	4	8	51218	51225	50 %	0 %	0 %	50 %	289937502
1111	NC_013924	TAC	2	6	51226	51231	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	289937502
1112	NC_013924	GCC	2	6	51301	51306	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	289937502
1113	NC_013924	GAA	2	6	51327	51332	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	289937502
1114	NC_013924	GCG	2	6	51344	51349	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	289937502
1115	NC_013924	CGA	2	6	51399	51404	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289937502
1116	NC_013924	CGA	2	6	51423	51428	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289937502
1117	NC_013924	GAG	2	6	51448	51453	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	289937502
1118	NC_013924	CG	3	6	51463	51468	0 %	0 %	50 %	50 %	289937502
1119	NC_013924	GCT	2	6	51477	51482	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289937502
1120	NC_013924	CG	3	6	51524	51529	0 %	0 %	50 %	50 %	289937502
1121	NC_013924	CGA	2	6	51535	51540	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289937502
1122	NC_013924	GCG	2	6	51651	51656	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	289937502
1123	NC_013924	C	6	6	51675	51680	0 %	0 %	0 %	100 %	289937502
1124	NC_013924	CACC	2	8	51712	51719	25 %	0 %	0 %	75 %	289937502
1125	NC_013924	CGC	2	6	51741	51746	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	289937502
1126	NC_013924	CCG	2	6	51805	51810	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	289937502
1127	NC_013924	CGA	2	6	51855	51860	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289937502
1128	NC_013924	CGA	2	6	51876	51881	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289937502
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1130	NC_013924	GCC	2	6	51955	51960	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	289937502
1131	NC_013924	AGCG	2	8	52026	52033	25 %	0 %	50 %	25 %	289937502
1132	NC_013924	CGG	2	6	52052	52057	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	289937502
1133	NC_013924	CGA	2	6	52062	52067	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289937502
1134	NC_013924	CGC	2	6	52101	52106	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1135	NC_013924	CTT	2	6	52110	52115	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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1138	NC_013924	CAAC	2	8	52437	52444	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1139	NC_013924	CGT	2	6	52504	52509	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1140	NC_013924	GATCG	2	10	52520	52529	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
1141	NC_013924	CGT	2	6	52599	52604	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1142	NC_013924	ACG	2	6	52708	52713	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1143	NC_013924	CTC	2	6	52735	52740	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1144	NC_013924	TC	3	6	52806	52811	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1145	NC_013924	TG	3	6	52910	52915	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1146	NC_013924	ACC	2	6	52916	52921	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1147	NC_013924	GAG	2	6	52922	52927	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1148	NC_013924	GTC	2	6	52943	52948	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1161	NC_013924	TTA	2	6	53268	53273	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1162	NC_013924	TAA	2	6	53316	53321	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1165	NC_013924	CTC	2	6	53500	53505	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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1224	NC_013924	CGCGA	2	10	56485	56494	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
1225	NC_013924	GAT	2	6	56501	56506	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1230	NC_013924	G	6	6	57045	57050	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
1231	NC_013924	ACT	2	6	57099	57104	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1232	NC_013924	TG	3	6	57146	57151	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1233	NC_013924	TGT	2	6	57198	57203	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1234	NC_013924	ACC	2	6	57211	57216	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1235	NC_013924	CGT	2	6	57312	57317	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1236	NC_013924	CGA	2	6	57321	57326	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1237	NC_013924	AAG	2	6	57420	57425	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1238	NC_013924	TATTG	2	10	57439	57448	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
1239	NC_013924	GT	3	6	57654	57659	0 %	50 %	50 %	0 %	289937508
1240	NC_013924	GGT	2	6	57672	57677	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	289937508
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1242	NC_013924	CTGAA	2	10	57706	57715	40 %	20 %	20 %	20 %	289937508
1243	NC_013924	GAC	2	6	57737	57742	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289937508
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1246	NC_013924	ATCG	2	8	57780	57787	25 %	25 %	25 %	25 %	289937508
1247	NC_013924	TGA	2	6	57922	57927	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	289937508
1248	NC_013924	GTC	2	6	57947	57952	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289937508
1249	NC_013924	AGAT	2	8	58041	58048	50 %	25 %	25 %	0 %	289937508
1250	NC_013924	GC	3	6	58107	58112	0 %	0 %	50 %	50 %	289937508
1251	NC_013924	TCC	2	6	58208	58213	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	289937508
1252	NC_013924	CG	3	6	58286	58291	0 %	0 %	50 %	50 %	289937508
1253	NC_013924	GAT	2	6	58421	58426	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	289937508
1254	NC_013924	TTCGT	2	10	58430	58439	0 %	60 %	20 %	20 %	289937508
1255	NC_013924	CGA	3	9	58498	58506	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289937508
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1257	NC_013924	TCG	2	6	58548	58553	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289937508
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1259	NC_013924	CTT	2	6	58893	58898	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1260	NC_013924	TTC	2	6	58950	58955	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1261	NC_013924	GATA	2	8	58959	58966	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
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1289	NC_013924	GGC	2	6	60373	60378	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1290	NC_013924	AAT	2	6	60459	60464	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1291	NC_013924	CAC	2	6	60508	60513	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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1294	NC_013924	AC	3	6	60754	60759	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
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1296	NC_013924	AAC	2	6	60843	60848	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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1367	NC_013924	GCAGA	2	10	64064	64073	40 %	0 %	40 %	20 %	289937512
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1369	NC_013924	GTC	3	9	64133	64141	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289937512
1370	NC_013924	CAG	2	6	64230	64235	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289937512
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1372	NC_013924	CCA	2	6	64367	64372	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	289937512
1373	NC_013924	GAAA	2	8	64410	64417	75 %	0 %	25 %	0 %	289937512
1374	NC_013924	GGA	2	6	64441	64446	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	289937512
1375	NC_013924	GCA	2	6	64503	64508	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1376	NC_013924	GGA	2	6	64687	64692	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	289937513
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1382	NC_013924	ATCGG	2	10	64850	64859	20 %	20 %	40 %	20 %	289937513
1383	NC_013924	GAAC	2	8	64881	64888	50 %	0 %	25 %	25 %	289937513
1384	NC_013924	TCG	2	6	64893	64898	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289937513
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1403	NC_013924	TTTA	2	8	66002	66009	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1499	NC_013924	CTGC	2	8	70157	70164	0 %	25 %	25 %	50 %	289937516
1500	NC_013924	GA	3	6	70242	70247	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding

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