MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Natrialba magadii ATCC 43099 plasmid pNMAG01

Total Repeats: 9085

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_013923	GCG	2	6	146692	146697	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	289583460
3502	NC_013923	GTC	2	6	146787	146792	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289583460
3503	NC_013923	CGACG	2	10	146828	146837	20 %	0 %	40 %	40 %	289583460
3504	NC_013923	GGA	2	6	146873	146878	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	289583460
3505	NC_013923	CG	3	6	146973	146978	0 %	0 %	50 %	50 %	289583460
3506	NC_013923	GC	3	6	147033	147038	0 %	0 %	50 %	50 %	289583460
3507	NC_013923	GAC	2	6	147044	147049	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289583460
3508	NC_013923	CGA	2	6	147103	147108	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289583460
3509	NC_013923	GTC	2	6	147135	147140	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289583460
3510	NC_013923	GCCG	2	8	147230	147237	0 %	0 %	50 %	50 %	289583460
3511	NC_013923	GCGA	2	8	147249	147256	25 %	0 %	50 %	25 %	289583460
3512	NC_013923	ACC	2	6	147328	147333	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	289583460
3513	NC_013923	ACACGG	2	12	147478	147489	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289583460
3514	NC_013923	TGAC	2	8	147516	147523	25 %	25 %	25 %	25 %	289583460
3515	NC_013923	ACG	2	6	147534	147539	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289583461
3516	NC_013923	GC	3	6	147575	147580	0 %	0 %	50 %	50 %	289583461
3517	NC_013923	CGA	2	6	147589	147594	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289583461
3518	NC_013923	GCG	2	6	147645	147650	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	289583461
3519	NC_013923	CGTC	2	8	147654	147661	0 %	25 %	25 %	50 %	289583461
3520	NC_013923	GTTC	2	8	147693	147700	0 %	50 %	25 %	25 %	289583461
3521	NC_013923	ACA	2	6	147717	147722	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	289583461
3522	NC_013923	CGA	2	6	147742	147747	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289583461
3523	NC_013923	GGCAG	2	10	147805	147814	20 %	0 %	60 %	20 %	289583461
3524	NC_013923	CGACAC	2	12	147820	147831	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	289583461
3525	NC_013923	TCG	2	6	147837	147842	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289583461
3526	NC_013923	GTC	3	9	147899	147907	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289583461
3527	NC_013923	ACGA	2	8	147921	147928	50 %	0 %	25 %	25 %	289583461
3528	NC_013923	GCC	2	6	147953	147958	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	289583461
3529	NC_013923	CGA	3	9	147988	147996	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289583461
3530	NC_013923	ATC	2	6	148001	148006	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	289583461
3531	NC_013923	CGG	4	12	148078	148089	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	289583461
3532	NC_013923	CGA	2	6	148131	148136	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289583461
3533	NC_013923	CG	3	6	148137	148142	0 %	0 %	50 %	50 %	289583461
3534	NC_013923	GCC	2	6	148166	148171	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	289583461
3535	NC_013923	GA	3	6	148203	148208	50 %	0 %	50 %	0 %	289583461
3536	NC_013923	CTC	2	6	148262	148267	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	289583461
3537	NC_013923	GAC	2	6	148270	148275	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289583461
3538	NC_013923	GCG	2	6	148277	148282	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	289583461
3539	NC_013923	GGT	2	6	148294	148299	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	289583461
3540	NC_013923	CGA	2	6	148300	148305	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289583461
3541	NC_013923	AGTG	2	8	148309	148316	25 %	25 %	50 %	0 %	289583461
3542	NC_013923	GC	3	6	148360	148365	0 %	0 %	50 %	50 %	289583461
3543	NC_013923	CGT	2	6	148372	148377	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289583461
3544	NC_013923	TGC	2	6	148390	148395	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289583461
3545	NC_013923	CGT	2	6	148450	148455	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289583461
3546	NC_013923	GC	3	6	148627	148632	0 %	0 %	50 %	50 %	289583461
3547	NC_013923	CCG	2	6	148633	148638	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	289583461
3548	NC_013923	ACC	2	6	148668	148673	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	289583461
3549	NC_013923	TTC	2	6	148774	148779	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	289583461
3550	NC_013923	TC	4	8	148800	148807	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3551	NC_013923	TGACT	2	10	148908	148917	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
3552	NC_013923	TGT	2	6	148921	148926	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3553	NC_013923	TCC	2	6	148941	148946	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3554	NC_013923	GTCT	2	8	148972	148979	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
3555	NC_013923	GTG	2	6	149014	149019	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3556	NC_013923	G	6	6	149039	149044	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
3557	NC_013923	TG	3	6	149078	149083	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3558	NC_013923	GTA	2	6	149158	149163	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3559	NC_013923	TCG	2	6	149178	149183	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3560	NC_013923	GTCA	2	8	149296	149303	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
3561	NC_013923	CCT	2	6	149312	149317	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3562	NC_013923	ACG	2	6	149352	149357	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3563	NC_013923	CG	3	6	149426	149431	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3564	NC_013923	AGGAT	2	10	149476	149485	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
3565	NC_013923	GAG	2	6	149942	149947	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3566	NC_013923	GGT	2	6	149965	149970	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3567	NC_013923	TAC	2	6	149984	149989	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3568	NC_013923	TCT	2	6	150094	150099	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3569	NC_013923	TTGG	2	8	150342	150349	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3570	NC_013923	TC	3	6	150378	150383	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3571	NC_013923	GTG	2	6	150400	150405	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3572	NC_013923	TG	3	6	150436	150441	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3573	NC_013923	TC	3	6	150477	150482	0 %	50 %	0 %	50 %	289583462
3574	NC_013923	GCA	2	6	150493	150498	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289583462
3575	NC_013923	ATT	2	6	150673	150678	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	289583462
3576	NC_013923	TCAG	2	8	150713	150720	25 %	25 %	25 %	25 %	289583462
3577	NC_013923	TC	3	6	150759	150764	0 %	50 %	0 %	50 %	289583462
3578	NC_013923	TCAG	2	8	150940	150947	25 %	25 %	25 %	25 %	289583463
3579	NC_013923	CAG	2	6	150958	150963	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289583463
3580	NC_013923	CGA	2	6	151017	151022	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289583463
3581	NC_013923	GTC	2	6	151250	151255	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289583463
3582	NC_013923	GCC	2	6	151363	151368	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	289583463
3583	NC_013923	AGT	2	6	151373	151378	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	289583463
3584	NC_013923	GAA	2	6	151381	151386	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	289583463
3585	NC_013923	GCG	2	6	151424	151429	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	289583463
3586	NC_013923	A	6	6	151489	151494	100 %	0 %	0 %	0 %	289583463
3587	NC_013923	ACG	2	6	151499	151504	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289583463
3588	NC_013923	ACTC	2	8	151566	151573	25 %	25 %	0 %	50 %	289583463
3589	NC_013923	GCC	2	6	151576	151581	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	289583463
3590	NC_013923	TCG	3	9	151607	151615	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289583463
3591	NC_013923	CTC	2	6	151642	151647	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	289583463
3592	NC_013923	GAC	2	6	151666	151671	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289583463
3593	NC_013923	GCG	2	6	151736	151741	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	289583463
3594	NC_013923	CGC	2	6	151743	151748	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	289583463
3595	NC_013923	CGA	2	6	151749	151754	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289583463
3596	NC_013923	CCGAAG	2	12	151787	151798	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289583463
3597	NC_013923	CGA	2	6	151902	151907	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289583463
3598	NC_013923	TCG	2	6	151923	151928	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289583463
3599	NC_013923	CTA	2	6	151938	151943	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	289583463
3600	NC_013923	GCCA	2	8	151951	151958	25 %	0 %	25 %	50 %	289583463
3601	NC_013923	GAA	2	6	152047	152052	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	289583463
3602	NC_013923	CGCC	2	8	152067	152074	0 %	0 %	25 %	75 %	289583463
3603	NC_013923	GAA	2	6	152137	152142	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	289583463
3604	NC_013923	GTC	2	6	152205	152210	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3605	NC_013923	AGC	2	6	152213	152218	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3606	NC_013923	ACG	2	6	152260	152265	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3607	NC_013923	GCG	2	6	152313	152318	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3608	NC_013923	ACT	7	21	152340	152360	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3609	NC_013923	TAC	2	6	152362	152367	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3610	NC_013923	ACT	2	6	152369	152374	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3611	NC_013923	CAC	2	6	152404	152409	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3612	NC_013923	CGT	2	6	152468	152473	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3613	NC_013923	GACG	2	8	152491	152498	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
3614	NC_013923	CGA	2	6	152566	152571	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289583464
3615	NC_013923	CG	3	6	152648	152653	0 %	0 %	50 %	50 %	289583464
3616	NC_013923	TCG	2	6	152673	152678	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289583464
3617	NC_013923	CTC	2	6	152696	152701	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	289583464
3618	NC_013923	CGTT	2	8	152760	152767	0 %	50 %	25 %	25 %	289583464
3619	NC_013923	CGG	2	6	152779	152784	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	289583464
3620	NC_013923	GT	3	6	152787	152792	0 %	50 %	50 %	0 %	289583464
3621	NC_013923	CAC	2	6	152819	152824	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	289583464
3622	NC_013923	TCG	2	6	152826	152831	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289583464
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3624	NC_013923	CTG	2	6	152851	152856	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289583464
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3747	NC_013923	AGA	2	6	158187	158192	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	289583470
3748	NC_013923	GCC	2	6	158221	158226	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	289583470
3749	NC_013923	CGT	2	6	158227	158232	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289583470
3750	NC_013923	CAT	2	6	158233	158238	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	289583470
3751	NC_013923	GAG	2	6	158255	158260	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	289583470
3752	NC_013923	TGA	2	6	158271	158276	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	289583470
3753	NC_013923	CGT	2	6	158281	158286	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289583470
3754	NC_013923	CCG	2	6	158474	158479	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	289583470
3755	NC_013923	TCG	2	6	158499	158504	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289583470
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3762	NC_013923	ATCGTC	2	12	158858	158869	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	289583470
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3764	NC_013923	CGAG	2	8	158955	158962	25 %	0 %	50 %	25 %	289583470
3765	NC_013923	CCG	2	6	158972	158977	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	289583470
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3768	NC_013923	ATG	2	6	159122	159127	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	289583470
3769	NC_013923	CTG	2	6	159169	159174	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289583470
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3771	NC_013923	GTA	2	6	159238	159243	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	289583470
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3773	NC_013923	AGCC	2	8	159288	159295	25 %	0 %	25 %	50 %	289583470
3774	NC_013923	TCG	2	6	159341	159346	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289583470
3775	NC_013923	AGG	2	6	159386	159391	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	289583470
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3779	NC_013923	GAC	2	6	159544	159549	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289583470
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3782	NC_013923	AACC	2	8	159645	159652	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3783	NC_013923	GAA	2	6	159789	159794	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3784	NC_013923	GC	3	6	159816	159821	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3785	NC_013923	CATT	2	8	159838	159845	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
3786	NC_013923	CTG	2	6	159991	159996	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3787	NC_013923	CTG	2	6	159999	160004	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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3789	NC_013923	ACC	2	6	160028	160033	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3790	NC_013923	AGC	2	6	160071	160076	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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3808	NC_013923	GCT	2	6	160802	160807	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289583472
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3811	NC_013923	GGT	2	6	160892	160897	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	289583472
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3817	NC_013923	CCGC	2	8	161078	161085	0 %	0 %	25 %	75 %	289583472
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3822	NC_013923	GCG	2	6	161332	161337	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	289583472
3823	NC_013923	TTCG	2	8	161358	161365	0 %	50 %	25 %	25 %	289583472
3824	NC_013923	CGA	2	6	161444	161449	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289583472
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3844	NC_013923	TG	3	6	162180	162185	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3845	NC_013923	TGG	2	6	162204	162209	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3846	NC_013923	TACCA	2	10	162259	162268	40 %	20 %	0 %	40 %	289583473
3847	NC_013923	GAG	2	6	162436	162441	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	289583473
3848	NC_013923	GGA	2	6	162450	162455	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	289583473
3849	NC_013923	AGA	2	6	162480	162485	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	289583473
3850	NC_013923	TAC	2	6	162490	162495	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	289583473
3851	NC_013923	GAA	2	6	162499	162504	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	289583473
3852	NC_013923	ACG	2	6	162510	162515	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289583473
3853	NC_013923	CGC	2	6	162538	162543	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3854	NC_013923	TCG	2	6	162698	162703	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289583474
3855	NC_013923	GGC	2	6	162801	162806	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	289583474
3856	NC_013923	TCG	3	9	162808	162816	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289583474
3857	NC_013923	CGGTG	2	10	162845	162854	0 %	20 %	60 %	20 %	289583474
3858	NC_013923	CTA	2	6	162860	162865	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	289583474
3859	NC_013923	GTC	2	6	162873	162878	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289583474
3860	NC_013923	TC	3	6	162923	162928	0 %	50 %	0 %	50 %	289583474
3861	NC_013923	CCA	2	6	162970	162975	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	289583474
3862	NC_013923	GCCGTC	2	12	162987	162998	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	289583474
3863	NC_013923	TGGGTC	2	12	163038	163049	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	289583474
3864	NC_013923	TCG	2	6	163051	163056	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289583474
3865	NC_013923	CCT	2	6	163058	163063	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	289583474
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3990	NC_013923	CG	4	8	167807	167814	0 %	0 %	50 %	50 %	289583479
3991	NC_013923	CGG	2	6	167837	167842	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	289583479
3992	NC_013923	GCC	2	6	167853	167858	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	289583479
3993	NC_013923	GCG	2	6	167947	167952	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	289583479
3994	NC_013923	AGT	2	6	168101	168106	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	289583479
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3997	NC_013923	GTC	2	6	168237	168242	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289583479
3998	NC_013923	TCGACG	2	12	168301	168312	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	289583479
3999	NC_013923	CGGGT	2	10	168324	168333	0 %	20 %	60 %	20 %	289583479
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