MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Natrialba magadii ATCC 43099 chromosome

Total Repeats: 93199

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_013922	ACG	2	6	43413	43418	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289579732
1002	NC_013922	AACTCG	2	12	43419	43430	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	289579732
1003	NC_013922	GAC	2	6	43520	43525	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289579732
1004	NC_013922	CGACGG	2	12	43540	43551	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	289579732
1005	NC_013922	CGC	2	6	43574	43579	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	289579732
1006	NC_013922	CCGA	2	8	43585	43592	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
1007	NC_013922	CGAC	2	8	43614	43621	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
1008	NC_013922	TAT	2	6	43656	43661	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1009	NC_013922	ACT	2	6	43739	43744	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	289579733
1010	NC_013922	TC	3	6	43827	43832	0 %	50 %	0 %	50 %	289579733
1011	NC_013922	CGA	2	6	43967	43972	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289579733
1012	NC_013922	CGA	2	6	43976	43981	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289579733
1013	NC_013922	CGA	2	6	43991	43996	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289579733
1014	NC_013922	CGA	2	6	44024	44029	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289579733
1015	NC_013922	AGC	2	6	44062	44067	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289579733
1016	NC_013922	GCC	2	6	44133	44138	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	289579733
1017	NC_013922	GAC	2	6	44166	44171	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289579733
1018	NC_013922	CGA	2	6	44174	44179	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289579733
1019	NC_013922	TC	3	6	44228	44233	0 %	50 %	0 %	50 %	289579733
1020	NC_013922	TCA	2	6	44245	44250	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	289579733
1021	NC_013922	TCGAT	2	10	44269	44278	20 %	40 %	20 %	20 %	289579733
1022	NC_013922	GGT	2	6	44339	44344	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	289579733
1023	NC_013922	CGA	2	6	44390	44395	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289579733
1024	NC_013922	CGA	3	9	44450	44458	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289579733
1025	NC_013922	AAC	2	6	44470	44475	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	289579733
1026	NC_013922	TCGA	2	8	44511	44518	25 %	25 %	25 %	25 %	289579733
1027	NC_013922	GTC	2	6	44550	44555	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289579733
1028	NC_013922	AAC	2	6	44557	44562	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	289579733
1029	NC_013922	CGC	2	6	44582	44587	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	289579733
1030	NC_013922	CGA	2	6	44621	44626	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289579733
1031	NC_013922	AC	3	6	44645	44650	50 %	0 %	0 %	50 %	289579733
1032	NC_013922	ATCG	2	8	44660	44667	25 %	25 %	25 %	25 %	289579733
1033	NC_013922	CGA	2	6	44708	44713	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289579733
1034	NC_013922	CGA	2	6	44723	44728	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289579733
1035	NC_013922	GGAG	2	8	44744	44751	25 %	0 %	75 %	0 %	289579733
1036	NC_013922	CGA	2	6	44804	44809	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289579733
1037	NC_013922	TAC	3	9	44826	44834	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	289579733
1038	NC_013922	GAC	2	6	44867	44872	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289579733
1039	NC_013922	CTC	2	6	44937	44942	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	289579733
1040	NC_013922	CGGA	2	8	44955	44962	25 %	0 %	50 %	25 %	289579733
1041	NC_013922	CGAT	2	8	44978	44985	25 %	25 %	25 %	25 %	289579733
1042	NC_013922	CGG	2	6	44986	44991	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	289579733
1043	NC_013922	CGG	2	6	45013	45018	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	289579733
1044	NC_013922	GCCA	2	8	45080	45087	25 %	0 %	25 %	50 %	289579733
1045	NC_013922	CCT	2	6	45115	45120	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	289579733
1046	NC_013922	GAC	2	6	45186	45191	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289579733
1047	NC_013922	CGA	3	9	45227	45235	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289579733
1048	NC_013922	GCAC	2	8	45316	45323	25 %	0 %	25 %	50 %	289579733
1049	NC_013922	TCG	3	9	45325	45333	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289579733
1050	NC_013922	CGA	2	6	45347	45352	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289579733
1051	NC_013922	GTC	2	6	45375	45380	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289579733
1052	NC_013922	ACG	3	9	45409	45417	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289579733
1053	NC_013922	CAGC	2	8	45510	45517	25 %	0 %	25 %	50 %	289579733
1054	NC_013922	CTG	2	6	45637	45642	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289579733
1055	NC_013922	CGT	2	6	45724	45729	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289579733
1056	NC_013922	AGG	2	6	45874	45879	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	289579733
1057	NC_013922	CT	4	8	45902	45909	0 %	50 %	0 %	50 %	289579733
1058	NC_013922	GTTC	2	8	46099	46106	0 %	50 %	25 %	25 %	289579733
1059	NC_013922	CGGT	2	8	46155	46162	0 %	25 %	50 %	25 %	289579733
1060	NC_013922	CGT	3	9	46172	46180	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289579733
1061	NC_013922	ACG	2	6	46207	46212	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289579733
1062	NC_013922	CGA	2	6	46220	46225	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289579733
1063	NC_013922	TCG	2	6	46282	46287	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289579733
1064	NC_013922	ACG	3	9	46347	46355	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289579733
1065	NC_013922	CGAT	2	8	46363	46370	25 %	25 %	25 %	25 %	289579733
1066	NC_013922	CA	3	6	46381	46386	50 %	0 %	0 %	50 %	289579733
1067	NC_013922	GGT	2	6	46403	46408	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	289579733
1068	NC_013922	AG	3	6	46422	46427	50 %	0 %	50 %	0 %	289579733
1069	NC_013922	CGAA	2	8	46445	46452	50 %	0 %	25 %	25 %	289579733
1070	NC_013922	CGA	2	6	46473	46478	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1071	NC_013922	CT	3	6	46520	46525	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1072	NC_013922	CT	3	6	46529	46534	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1073	NC_013922	CTC	2	6	46553	46558	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1074	NC_013922	AGC	2	6	46595	46600	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289579734
1075	NC_013922	CAG	2	6	46634	46639	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289579734
1076	NC_013922	GAC	3	9	46678	46686	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289579734
1077	NC_013922	GCG	2	6	46710	46715	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	289579734
1078	NC_013922	CGAA	2	8	46800	46807	50 %	0 %	25 %	25 %	289579734
1079	NC_013922	GGC	2	6	46836	46841	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	289579734
1080	NC_013922	GTG	2	6	46859	46864	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	289579734
1081	NC_013922	AGG	2	6	46865	46870	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	289579734
1082	NC_013922	CGA	2	6	46890	46895	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289579734
1083	NC_013922	CGGT	2	8	46902	46909	0 %	25 %	50 %	25 %	289579734
1084	NC_013922	ACCC	2	8	46943	46950	25 %	0 %	0 %	75 %	289579734
1085	NC_013922	GGC	2	6	46951	46956	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	289579734
1086	NC_013922	CCG	2	6	46992	46997	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	289579734
1087	NC_013922	GT	3	6	47001	47006	0 %	50 %	50 %	0 %	289579734
1088	NC_013922	TCGAA	2	10	47016	47025	40 %	20 %	20 %	20 %	289579734
1089	NC_013922	AGG	2	6	47054	47059	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	289579734
1090	NC_013922	GCC	2	6	47081	47086	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	289579734
1091	NC_013922	ACG	2	6	47102	47107	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289579734
1092	NC_013922	AGCG	2	8	47128	47135	25 %	0 %	50 %	25 %	289579734
1093	NC_013922	CGA	2	6	47139	47144	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289579734
1094	NC_013922	CAGCG	2	10	47155	47164	20 %	0 %	40 %	40 %	289579734
1095	NC_013922	CGA	2	6	47172	47177	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1096	NC_013922	CA	4	8	47236	47243	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1097	NC_013922	GGGT	2	8	47256	47263	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
1098	NC_013922	GAT	2	6	47274	47279	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1099	NC_013922	CGA	2	6	47328	47333	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1100	NC_013922	GGC	2	6	47359	47364	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1101	NC_013922	TC	3	6	47383	47388	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1102	NC_013922	TTG	2	6	47406	47411	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1103	NC_013922	GTGG	2	8	47423	47430	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
1104	NC_013922	GTG	2	6	47528	47533	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1105	NC_013922	AAC	2	6	47562	47567	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	289579735
1106	NC_013922	AGGAC	2	10	47568	47577	40 %	0 %	40 %	20 %	289579735
1107	NC_013922	CT	3	6	47579	47584	0 %	50 %	0 %	50 %	289579735
1108	NC_013922	GTC	2	6	47591	47596	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289579735
1109	NC_013922	TGA	2	6	47656	47661	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	289579735
1110	NC_013922	GCTC	2	8	47685	47692	0 %	25 %	25 %	50 %	289579735
1111	NC_013922	CGC	2	6	47698	47703	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	289579735
1112	NC_013922	GAG	2	6	47765	47770	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	289579735
1113	NC_013922	CGA	2	6	47788	47793	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289579735
1114	NC_013922	GAC	2	6	47825	47830	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289579735
1115	NC_013922	GAG	2	6	47870	47875	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	289579735
1116	NC_013922	GAC	2	6	47888	47893	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289579735
1117	NC_013922	G	6	6	47908	47913	0 %	0 %	100 %	0 %	289579735
1118	NC_013922	CAT	2	6	47923	47928	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	289579735
1119	NC_013922	CTG	2	6	47939	47944	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289579735
1120	NC_013922	GCA	2	6	47948	47953	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289579735
1121	NC_013922	GCGA	2	8	47987	47994	25 %	0 %	50 %	25 %	289579735
1122	NC_013922	GAG	3	9	47996	48004	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	289579735
1123	NC_013922	GAG	2	6	48017	48022	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	289579735
1124	NC_013922	GGA	2	6	48055	48060	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	289579735
1125	NC_013922	GACG	2	8	48121	48128	25 %	0 %	50 %	25 %	289579735
1126	NC_013922	GGA	2	6	48145	48150	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	289579735
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1128	NC_013922	GAC	2	6	48191	48196	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289579735
1129	NC_013922	TCG	2	6	48206	48211	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1130	NC_013922	CT	3	6	48219	48224	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1131	NC_013922	CTGTCA	2	12	48290	48301	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
1132	NC_013922	C	6	6	48302	48307	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
1133	NC_013922	GCCGAC	2	12	48375	48386	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
1134	NC_013922	GAC	2	6	48404	48409	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289579736
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1147	NC_013922	CG	3	6	48745	48750	0 %	0 %	50 %	50 %	289579736
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1248	NC_013922	CGA	3	9	53026	53034	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289579738
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1250	NC_013922	CGA	2	6	53179	53184	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289579738
1251	NC_013922	ATC	2	6	53207	53212	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	289579738
1252	NC_013922	ACG	2	6	53271	53276	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289579738
1253	NC_013922	TCGAA	2	10	53298	53307	40 %	20 %	20 %	20 %	289579738
1254	NC_013922	GCC	2	6	53312	53317	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	289579738
1255	NC_013922	GCC	2	6	53408	53413	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	289579738
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1259	NC_013922	CCGT	2	8	53504	53511	0 %	25 %	25 %	50 %	289579738
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1273	NC_013922	CGCA	2	8	54022	54029	25 %	0 %	25 %	50 %	289579738
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1281	NC_013922	CGA	2	6	54283	54288	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289579738
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1292	NC_013922	TTC	2	6	54854	54859	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	289579738
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1296	NC_013922	GAAG	2	8	55069	55076	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1297	NC_013922	CAG	2	6	55103	55108	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1303	NC_013922	TAG	2	6	55496	55501	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1305	NC_013922	GTAGCT	2	12	55526	55537	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
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1316	NC_013922	GAGC	2	8	56179	56186	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
1317	NC_013922	CTA	2	6	56230	56235	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1318	NC_013922	AT	3	6	56322	56327	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1328	NC_013922	GTAGC	2	10	57228	57237	20 %	20 %	40 %	20 %	289579741
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1342	NC_013922	CAA	2	6	57978	57983	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1343	NC_013922	TCGG	2	8	58035	58042	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
1344	NC_013922	CTG	2	6	58084	58089	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1357	NC_013922	GTA	2	6	58718	58723	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	289579744
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1363	NC_013922	GAAGA	2	10	58961	58970	60 %	0 %	40 %	0 %	289579744
1364	NC_013922	AG	3	6	58993	58998	50 %	0 %	50 %	0 %	289579744
1365	NC_013922	GAAGG	2	10	59042	59051	40 %	0 %	60 %	0 %	289579744
1366	NC_013922	GAA	2	6	59165	59170	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	289579744
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1370	NC_013922	AGA	2	6	59665	59670	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	289579744
1371	NC_013922	CAGA	2	8	59683	59690	50 %	0 %	25 %	25 %	289579744
1372	NC_013922	TGA	2	6	59743	59748	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1373	NC_013922	CT	3	6	59764	59769	0 %	50 %	0 %	50 %	289579745
1374	NC_013922	ATC	2	6	59831	59836	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	289579745
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1377	NC_013922	TG	5	10	59940	59949	0 %	50 %	50 %	0 %	289579745
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1481	NC_013922	GCG	2	6	65760	65765	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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1483	NC_013922	TCG	2	6	65838	65843	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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