MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Natrialba magadii ATCC 43099 chromosome

Total Repeats: 93199

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_013922	GT	3	6	20490	20495	0 %	50 %	50 %	0 %	289579712
502	NC_013922	CTG	2	6	20562	20567	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289579712
503	NC_013922	ACG	2	6	20578	20583	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289579712
504	NC_013922	TCG	2	6	20608	20613	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289579712
505	NC_013922	CT	3	6	20620	20625	0 %	50 %	0 %	50 %	289579712
506	NC_013922	CGA	2	6	20627	20632	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289579712
507	NC_013922	GAC	2	6	20646	20651	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289579712
508	NC_013922	CGAT	2	8	20675	20682	25 %	25 %	25 %	25 %	289579712
509	NC_013922	T	6	6	20695	20700	0 %	100 %	0 %	0 %	289579712
510	NC_013922	TTC	2	6	20719	20724	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	289579712
511	NC_013922	CGC	2	6	20760	20765	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	289579712
512	NC_013922	CCT	2	6	20792	20797	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	289579712
513	NC_013922	CCG	2	6	20805	20810	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	289579712
514	NC_013922	CG	3	6	20878	20883	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
515	NC_013922	CAT	2	6	20925	20930	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
516	NC_013922	GACA	2	8	20967	20974	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
517	NC_013922	CGAT	2	8	21010	21017	25 %	25 %	25 %	25 %	289579713
518	NC_013922	TCG	2	6	21089	21094	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289579713
519	NC_013922	GGT	2	6	21128	21133	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	289579713
520	NC_013922	GCA	2	6	21232	21237	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289579713
521	NC_013922	GGC	2	6	21247	21252	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
522	NC_013922	TCG	2	6	21265	21270	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
523	NC_013922	CCGT	2	8	21287	21294	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
524	NC_013922	TC	3	6	21306	21311	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
525	NC_013922	CAA	2	6	21366	21371	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
526	NC_013922	TCG	2	6	21398	21403	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
527	NC_013922	TCG	2	6	21485	21490	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289579714
528	NC_013922	CG	3	6	21562	21567	0 %	0 %	50 %	50 %	289579714
529	NC_013922	GTC	2	6	21574	21579	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289579714
530	NC_013922	TCG	2	6	21622	21627	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289579714
531	NC_013922	TCG	2	6	21647	21652	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289579714
532	NC_013922	CTT	2	6	21688	21693	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	289579714
533	NC_013922	CAT	2	6	21720	21725	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	289579714
534	NC_013922	GAC	2	6	21739	21744	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289579714
535	NC_013922	CG	3	6	21773	21778	0 %	0 %	50 %	50 %	289579714
536	NC_013922	CGCAC	2	10	21818	21827	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
537	NC_013922	TCC	2	6	21895	21900	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
538	NC_013922	CACTC	2	10	21927	21936	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
539	NC_013922	CCG	2	6	21956	21961	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
540	NC_013922	CACTC	2	10	21964	21973	20 %	20 %	0 %	60 %	289579715
541	NC_013922	AG	3	6	21978	21983	50 %	0 %	50 %	0 %	289579715
542	NC_013922	CCG	2	6	21995	22000	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	289579715
543	NC_013922	AC	3	6	22001	22006	50 %	0 %	0 %	50 %	289579715
544	NC_013922	ACG	2	6	22063	22068	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289579715
545	NC_013922	CGGGC	2	10	22082	22091	0 %	0 %	60 %	40 %	289579715
546	NC_013922	TC	3	6	22121	22126	0 %	50 %	0 %	50 %	289579715
547	NC_013922	CGT	2	6	22196	22201	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289579715
548	NC_013922	GC	3	6	22298	22303	0 %	0 %	50 %	50 %	289579715
549	NC_013922	GC	3	6	22320	22325	0 %	0 %	50 %	50 %	289579715
550	NC_013922	TTC	2	6	22332	22337	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	289579715
551	NC_013922	TTCC	2	8	22340	22347	0 %	50 %	0 %	50 %	289579715
552	NC_013922	CGA	2	6	22352	22357	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289579715
553	NC_013922	GTG	2	6	22404	22409	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	289579715
554	NC_013922	TCG	2	6	22420	22425	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289579715
555	NC_013922	TCC	2	6	22474	22479	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	289579715
556	NC_013922	GA	3	6	22546	22551	50 %	0 %	50 %	0 %	289579715
557	NC_013922	TCG	2	6	22591	22596	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289579715
558	NC_013922	TGGC	2	8	22772	22779	0 %	25 %	50 %	25 %	289579715
559	NC_013922	GCC	2	6	22854	22859	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	289579715
560	NC_013922	TCG	2	6	22871	22876	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289579715
561	NC_013922	CGA	2	6	22901	22906	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289579715
562	NC_013922	TCCG	2	8	22972	22979	0 %	25 %	25 %	50 %	289579715
563	NC_013922	CGA	2	6	23021	23026	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289579715
564	NC_013922	ACG	2	6	23027	23032	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289579715
565	NC_013922	GCG	2	6	23051	23056	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	289579715
566	NC_013922	CG	3	6	23075	23080	0 %	0 %	50 %	50 %	289579715
567	NC_013922	CGG	2	6	23121	23126	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	289579715
568	NC_013922	CGAC	2	8	23153	23160	25 %	0 %	25 %	50 %	289579715
569	NC_013922	ATAG	2	8	23185	23192	50 %	25 %	25 %	0 %	289579715
570	NC_013922	CGT	2	6	23244	23249	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
571	NC_013922	GTC	2	6	23271	23276	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
572	NC_013922	GTC	2	6	23300	23305	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
573	NC_013922	GTC	2	6	23329	23334	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
574	NC_013922	GTC	2	6	23358	23363	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
575	NC_013922	AAG	2	6	23436	23441	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	289579716
576	NC_013922	CGA	2	6	23474	23479	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289579716
577	NC_013922	AGA	2	6	23507	23512	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	289579716
578	NC_013922	CGA	2	6	23543	23548	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289579716
579	NC_013922	GACG	2	8	23694	23701	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
580	NC_013922	CTC	3	9	23723	23731	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
581	NC_013922	GCCACA	2	12	23753	23764	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	289579717
582	NC_013922	CTCA	2	8	23765	23772	25 %	25 %	0 %	50 %	289579717
583	NC_013922	AT	3	6	23844	23849	50 %	50 %	0 %	0 %	289579717
584	NC_013922	CGA	2	6	23866	23871	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289579717
585	NC_013922	GTG	2	6	23885	23890	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	289579717
586	NC_013922	GTC	2	6	23903	23908	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289579717
587	NC_013922	CGT	2	6	23920	23925	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289579717
588	NC_013922	CTG	2	6	23963	23968	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289579717
589	NC_013922	TTCG	2	8	23990	23997	0 %	50 %	25 %	25 %	289579717
590	NC_013922	CCAT	2	8	24087	24094	25 %	25 %	0 %	50 %	289579717
591	NC_013922	CGA	2	6	24127	24132	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
592	NC_013922	CGG	2	6	24181	24186	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
593	NC_013922	CGCC	2	8	24226	24233	0 %	0 %	25 %	75 %	289579718
594	NC_013922	GTA	2	6	24244	24249	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	289579718
595	NC_013922	GAG	2	6	24346	24351	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	289579718
596	NC_013922	CCCG	2	8	24393	24400	0 %	0 %	25 %	75 %	289579718
597	NC_013922	TCGG	2	8	24401	24408	0 %	25 %	50 %	25 %	289579718
598	NC_013922	CAT	2	6	24427	24432	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	289579718
599	NC_013922	GTC	2	6	24513	24518	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289579719
600	NC_013922	TCCGC	2	10	24526	24535	0 %	20 %	20 %	60 %	289579719
601	NC_013922	CGT	2	6	24597	24602	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289579719
602	NC_013922	CGA	2	6	24633	24638	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289579719
603	NC_013922	GTC	2	6	24652	24657	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289579719
604	NC_013922	CCA	2	6	24685	24690	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	289579719
605	NC_013922	CCG	2	6	24703	24708	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	289579719
606	NC_013922	TCG	2	6	24710	24715	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289579719
607	NC_013922	GCCG	2	8	24747	24754	0 %	0 %	50 %	50 %	289579719
608	NC_013922	TCG	3	9	24817	24825	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289579719
609	NC_013922	GA	3	6	24838	24843	50 %	0 %	50 %	0 %	289579719
610	NC_013922	CTC	2	6	24858	24863	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	289579719
611	NC_013922	CGCT	2	8	24949	24956	0 %	25 %	25 %	50 %	289579719
612	NC_013922	TTGCCG	2	12	24989	25000	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289579719
613	NC_013922	TCA	2	6	25009	25014	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	289579719
614	NC_013922	CGA	2	6	25022	25027	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289579719
615	NC_013922	AACT	2	8	25059	25066	50 %	25 %	0 %	25 %	289579719
616	NC_013922	CGA	2	6	25073	25078	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289579719
617	NC_013922	TCG	2	6	25096	25101	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289579719
618	NC_013922	CGA	4	12	25103	25114	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289579719
619	NC_013922	GTTCA	2	10	25323	25332	20 %	40 %	20 %	20 %	289579719
620	NC_013922	GGC	2	6	25339	25344	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	289579719
621	NC_013922	CGA	2	6	25373	25378	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289579719
622	NC_013922	CCG	2	6	25379	25384	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	289579719
623	NC_013922	GAC	2	6	25386	25391	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289579719
624	NC_013922	TGC	2	6	25416	25421	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289579719
625	NC_013922	CCG	2	6	25426	25431	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	289579719
626	NC_013922	CGAT	2	8	25450	25457	25 %	25 %	25 %	25 %	289579719
627	NC_013922	TCG	2	6	25467	25472	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289579719
628	NC_013922	TCG	2	6	25591	25596	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289579719
629	NC_013922	CG	3	6	25599	25604	0 %	0 %	50 %	50 %	289579719
630	NC_013922	CTC	2	6	25686	25691	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	289579719
631	NC_013922	TC	3	6	25709	25714	0 %	50 %	0 %	50 %	289579719
632	NC_013922	A	6	6	25756	25761	100 %	0 %	0 %	0 %	289579719
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636	NC_013922	TTTG	2	8	25898	25905	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
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644	NC_013922	CT	3	6	26172	26177	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
645	NC_013922	AGTAC	2	10	26241	26250	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
646	NC_013922	GGA	2	6	26263	26268	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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648	NC_013922	TA	3	6	26371	26376	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
649	NC_013922	CTC	2	6	26385	26390	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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651	NC_013922	CGC	2	6	26417	26422	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
652	NC_013922	TC	4	8	26478	26485	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
653	NC_013922	GTC	2	6	26516	26521	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
654	NC_013922	GAC	2	6	26552	26557	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
655	NC_013922	TGAC	2	8	26605	26612	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
656	NC_013922	TCG	3	9	26629	26637	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
657	NC_013922	CCG	2	6	26720	26725	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
658	NC_013922	TGGT	2	8	26786	26793	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
659	NC_013922	TG	3	6	26811	26816	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
660	NC_013922	C	6	6	26847	26852	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
661	NC_013922	TGGAG	2	10	27041	27050	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
662	NC_013922	AG	3	6	27049	27054	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
663	NC_013922	GCA	2	6	27202	27207	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
664	NC_013922	GGT	2	6	27293	27298	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
665	NC_013922	GCC	2	6	27331	27336	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
666	NC_013922	GCA	2	6	27349	27354	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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672	NC_013922	TGA	2	6	27832	27837	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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675	NC_013922	CGAG	2	8	27914	27921	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
676	NC_013922	TGG	2	6	27954	27959	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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681	NC_013922	ACC	2	6	28399	28404	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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688	NC_013922	TGG	2	6	28766	28771	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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767	NC_013922	GTT	2	6	33488	33493	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	289579722
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