MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Natrialba magadii ATCC 43099 chromosome

Total Repeats: 93199

< Previous12...175176177178179180181182183184185186187Next >

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
93001	NC_013922	CGT	3	9	3745688	3745696	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289583252
93002	NC_013922	TCT	2	6	3745786	3745791	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	289583252
93003	NC_013922	TCG	2	6	3745822	3745827	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289583252
93004	NC_013922	CGC	2	6	3745856	3745861	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	289583252
93005	NC_013922	TGC	3	9	3745880	3745888	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289583252
93006	NC_013922	TTC	2	6	3745908	3745913	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	289583252
93007	NC_013922	ATC	2	6	3745938	3745943	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	289583252
93008	NC_013922	CTC	2	6	3745949	3745954	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	289583252
93009	NC_013922	GCG	2	6	3745962	3745967	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	289583252
93010	NC_013922	GC	3	6	3746038	3746043	0 %	0 %	50 %	50 %	289583252
93011	NC_013922	ACGC	2	8	3746087	3746094	25 %	0 %	25 %	50 %	289583252
93012	NC_013922	GC	3	6	3746143	3746148	0 %	0 %	50 %	50 %	289583252
93013	NC_013922	GCG	2	6	3746173	3746178	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	289583252
93014	NC_013922	CGT	2	6	3746195	3746200	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289583252
93015	NC_013922	GAT	2	6	3746204	3746209	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	289583252
93016	NC_013922	GCT	2	6	3746264	3746269	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289583252
93017	NC_013922	TCC	2	6	3746311	3746316	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	289583252
93018	NC_013922	GAG	2	6	3746325	3746330	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	289583252
93019	NC_013922	CAC	2	6	3746337	3746342	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	289583252
93020	NC_013922	CGTCGA	2	12	3746348	3746359	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	289583252
93021	NC_013922	CTC	2	6	3746370	3746375	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	289583252
93022	NC_013922	GCTC	2	8	3746378	3746385	0 %	25 %	25 %	50 %	289583252
93023	NC_013922	TCG	2	6	3746437	3746442	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289583252
93024	NC_013922	TCG	2	6	3746446	3746451	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289583252
93025	NC_013922	CAT	2	6	3746459	3746464	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	289583252
93026	NC_013922	TCG	2	6	3746473	3746478	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289583252
93027	NC_013922	ATC	2	6	3746485	3746490	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	289583252
93028	NC_013922	CGA	2	6	3746503	3746508	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289583252
93029	NC_013922	TCCT	2	8	3746526	3746533	0 %	50 %	0 %	50 %	289583252
93030	NC_013922	CGT	2	6	3746534	3746539	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289583252
93031	NC_013922	GCCG	2	8	3746564	3746571	0 %	0 %	50 %	50 %	289583252
93032	NC_013922	TCG	2	6	3746599	3746604	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289583252
93033	NC_013922	TTCCTG	2	12	3746616	3746627	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	289583252
93034	NC_013922	CGACC	2	10	3746659	3746668	20 %	0 %	20 %	60 %	289583253
93035	NC_013922	TCGA	2	8	3746672	3746679	25 %	25 %	25 %	25 %	289583253
93036	NC_013922	CGAC	2	8	3746682	3746689	25 %	0 %	25 %	50 %	289583253
93037	NC_013922	TCGA	2	8	3746690	3746697	25 %	25 %	25 %	25 %	289583253
93038	NC_013922	CGAC	2	8	3746700	3746707	25 %	0 %	25 %	50 %	289583253
93039	NC_013922	CGAC	2	8	3746709	3746716	25 %	0 %	25 %	50 %	289583253
93040	NC_013922	GAC	2	6	3746729	3746734	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289583253
93041	NC_013922	AGG	2	6	3746754	3746759	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	289583253
93042	NC_013922	AC	3	6	3746760	3746765	50 %	0 %	0 %	50 %	289583253
93043	NC_013922	TCGA	2	8	3746849	3746856	25 %	25 %	25 %	25 %	289583253
93044	NC_013922	TCG	2	6	3746868	3746873	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289583253
93045	NC_013922	TCG	2	6	3746877	3746882	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289583253
93046	NC_013922	CTG	2	6	3746909	3746914	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289583253
93047	NC_013922	GCG	2	6	3746925	3746930	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	289583253
93048	NC_013922	CGAT	2	8	3746958	3746965	25 %	25 %	25 %	25 %	289583253
93049	NC_013922	CG	3	6	3746991	3746996	0 %	0 %	50 %	50 %	289583253
93050	NC_013922	TCG	2	6	3747009	3747014	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289583253
93051	NC_013922	CGT	2	6	3747016	3747021	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289583253
93052	NC_013922	CGT	2	6	3747064	3747069	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289583253
93053	NC_013922	GCC	2	6	3747078	3747083	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	289583253
93054	NC_013922	AC	3	6	3747113	3747118	50 %	0 %	0 %	50 %	289583253
93055	NC_013922	GAC	2	6	3747160	3747165	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289583253
93056	NC_013922	CGA	2	6	3747187	3747192	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289583253
93057	NC_013922	GCG	2	6	3747198	3747203	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	289583253
93058	NC_013922	GCCAGC	2	12	3747204	3747215	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	289583253
93059	NC_013922	GTC	2	6	3747218	3747223	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289583253
93060	NC_013922	CG	4	8	3747226	3747233	0 %	0 %	50 %	50 %	289583253
93061	NC_013922	CGA	2	6	3747265	3747270	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289583253
93062	NC_013922	CGG	2	6	3747348	3747353	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	289583253
93063	NC_013922	GGC	2	6	3747379	3747384	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	289583253
93064	NC_013922	GC	3	6	3747383	3747388	0 %	0 %	50 %	50 %	289583253
93065	NC_013922	CGAC	2	8	3747394	3747401	25 %	0 %	25 %	50 %	289583253
93066	NC_013922	GTG	2	6	3747404	3747409	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	289583253
93067	NC_013922	ACG	2	6	3747429	3747434	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289583253
93068	NC_013922	GC	3	6	3747438	3747443	0 %	0 %	50 %	50 %	289583253
93069	NC_013922	CCG	2	6	3747459	3747464	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	289583253
93070	NC_013922	ACGCGA	2	12	3747486	3747497	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289583253
93071	NC_013922	ACG	2	6	3747503	3747508	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289583253
93072	NC_013922	CGG	2	6	3747555	3747560	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	289583253
93073	NC_013922	CGC	2	6	3747595	3747600	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	289583253
93074	NC_013922	CGC	2	6	3747619	3747624	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	289583253
93075	NC_013922	CCG	2	6	3747654	3747659	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	289583253
93076	NC_013922	CCG	2	6	3747684	3747689	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	289583253
93077	NC_013922	CA	3	6	3747715	3747720	50 %	0 %	0 %	50 %	289583253
93078	NC_013922	TCC	2	6	3747767	3747772	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	289583253
93079	NC_013922	GCA	2	6	3747789	3747794	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289583253
93080	NC_013922	CGC	2	6	3747829	3747834	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	289583253
93081	NC_013922	CGAC	2	8	3747840	3747847	25 %	0 %	25 %	50 %	289583253
93082	NC_013922	CAAC	2	8	3747922	3747929	50 %	0 %	0 %	50 %	289583253
93083	NC_013922	TCG	2	6	3747969	3747974	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289583253
93084	NC_013922	ACG	2	6	3747977	3747982	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289583253
93085	NC_013922	GCG	2	6	3748010	3748015	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	289583253
93086	NC_013922	GAC	2	6	3748256	3748261	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289583253
93087	NC_013922	TAG	2	6	3748270	3748275	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
93088	NC_013922	GAGC	2	8	3748324	3748331	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
93089	NC_013922	ACGA	2	8	3748342	3748349	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
93090	NC_013922	AGTG	2	8	3748350	3748357	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
93091	NC_013922	AAC	2	6	3748381	3748386	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
93092	NC_013922	CGAG	2	8	3748395	3748402	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
93093	NC_013922	AAC	2	6	3748437	3748442	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
93094	NC_013922	CGAG	2	8	3748451	3748458	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
93095	NC_013922	GT	3	6	3748491	3748496	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
93096	NC_013922	GTT	2	6	3748508	3748513	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
93097	NC_013922	GCG	3	9	3748563	3748571	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
93098	NC_013922	ATC	2	6	3748610	3748615	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
93099	NC_013922	T	6	6	3748631	3748636	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
93100	NC_013922	CCA	2	6	3748643	3748648	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
93101	NC_013922	ACG	2	6	3748715	3748720	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289583254
93102	NC_013922	CGA	2	6	3748769	3748774	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289583254
93103	NC_013922	CGA	2	6	3748875	3748880	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289583254
93104	NC_013922	GCC	2	6	3748882	3748887	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	289583254
93105	NC_013922	GGA	2	6	3748890	3748895	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	289583254
93106	NC_013922	GAC	2	6	3748957	3748962	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289583254
93107	NC_013922	TCG	3	9	3749066	3749074	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289583254
93108	NC_013922	CGAC	2	8	3749117	3749124	25 %	0 %	25 %	50 %	289583254
93109	NC_013922	CGGT	2	8	3749150	3749157	0 %	25 %	50 %	25 %	289583254
93110	NC_013922	CGA	2	6	3749208	3749213	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289583254
93111	NC_013922	TCGA	2	8	3749231	3749238	25 %	25 %	25 %	25 %	289583254
93112	NC_013922	GCC	2	6	3749305	3749310	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	289583254
93113	NC_013922	GAC	2	6	3749437	3749442	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289583254
93114	NC_013922	CGA	2	6	3749445	3749450	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289583254
93115	NC_013922	GCC	2	6	3749467	3749472	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	289583254
93116	NC_013922	TCG	2	6	3749486	3749491	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289583254
93117	NC_013922	GAG	2	6	3749500	3749505	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	289583254
93118	NC_013922	ACGCG	2	10	3749514	3749523	20 %	0 %	40 %	40 %	289583254
93119	NC_013922	GACG	2	8	3749547	3749554	25 %	0 %	50 %	25 %	289583254
93120	NC_013922	TGG	2	6	3749583	3749588	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	289583254
93121	NC_013922	GGT	2	6	3749602	3749607	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	289583254
93122	NC_013922	TCG	2	6	3749645	3749650	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289583254
93123	NC_013922	GCGG	2	8	3749716	3749723	0 %	0 %	75 %	25 %	289583254
93124	NC_013922	CGA	2	6	3749736	3749741	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289583254
93125	NC_013922	GCCGG	2	10	3749800	3749809	0 %	0 %	60 %	40 %	289583254
93126	NC_013922	ACG	2	6	3749810	3749815	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289583254
93127	NC_013922	TCG	2	6	3749825	3749830	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289583254
93128	NC_013922	CCG	2	6	3749831	3749836	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	289583254
93129	NC_013922	GCC	3	9	3749866	3749874	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	289583254
93130	NC_013922	GC	3	6	3749877	3749882	0 %	0 %	50 %	50 %	289583254
93131	NC_013922	ACG	3	9	3749927	3749935	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289583254
93132	NC_013922	CGAG	2	8	3750017	3750024	25 %	0 %	50 %	25 %	289583254
93133	NC_013922	CGC	2	6	3750171	3750176	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	289583254
93134	NC_013922	GAC	2	6	3750177	3750182	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289583254
93135	NC_013922	GAC	2	6	3750214	3750219	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289583254
93136	NC_013922	GTG	2	6	3750278	3750283	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	289583254
93137	NC_013922	CGAA	2	8	3750290	3750297	50 %	0 %	25 %	25 %	289583254
93138	NC_013922	GAA	2	6	3750328	3750333	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	289583254
93139	NC_013922	GAG	2	6	3750349	3750354	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	289583254
93140	NC_013922	CGG	2	6	3750375	3750380	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	289583254
93141	NC_013922	CGA	2	6	3750384	3750389	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289583254
93142	NC_013922	CGT	2	6	3750408	3750413	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289583254
93143	NC_013922	CGT	2	6	3750417	3750422	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289583254
93144	NC_013922	GAG	2	6	3750433	3750438	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	289583254
93145	NC_013922	GGA	2	6	3750447	3750452	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	289583254
93146	NC_013922	TGC	2	6	3750536	3750541	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289583254
93147	NC_013922	GAG	2	6	3750544	3750549	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	289583254
93148	NC_013922	GGCG	2	8	3750573	3750580	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
93149	NC_013922	ATTG	2	8	3750650	3750657	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
93150	NC_013922	CTG	2	6	3750687	3750692	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289583255
93151	NC_013922	CCGTT	2	10	3750694	3750703	0 %	40 %	20 %	40 %	289583255
93152	NC_013922	GGA	2	6	3750711	3750716	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	289583255
93153	NC_013922	TCT	2	6	3750789	3750794	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	289583255
93154	NC_013922	CGGG	2	8	3750804	3750811	0 %	0 %	75 %	25 %	289583255
93155	NC_013922	TGAT	2	8	3750812	3750819	25 %	50 %	25 %	0 %	289583255
93156	NC_013922	GAG	2	6	3750826	3750831	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	289583255
93157	NC_013922	GTCG	2	8	3750852	3750859	0 %	25 %	50 %	25 %	289583255
93158	NC_013922	CG	3	6	3750874	3750879	0 %	0 %	50 %	50 %	289583255
93159	NC_013922	AGCG	2	8	3750926	3750933	25 %	0 %	50 %	25 %	289583255
93160	NC_013922	TCG	2	6	3750951	3750956	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289583255
93161	NC_013922	CTC	2	6	3750985	3750990	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	289583255
93162	NC_013922	TCG	2	6	3751013	3751018	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289583255
93163	NC_013922	TTC	2	6	3751030	3751035	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	289583255
93164	NC_013922	CGG	2	6	3751167	3751172	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	289583255
93165	NC_013922	TCG	2	6	3751205	3751210	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289583255
93166	NC_013922	TCG	2	6	3751241	3751246	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289583255
93167	NC_013922	CGTG	2	8	3751247	3751254	0 %	25 %	50 %	25 %	289583255
93168	NC_013922	GATC	2	8	3751299	3751306	25 %	25 %	25 %	25 %	289583255
93169	NC_013922	AGG	3	9	3751307	3751315	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	289583255
93170	NC_013922	TTC	2	6	3751331	3751336	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	289583255
93171	NC_013922	CGA	2	6	3751380	3751385	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289583255
93172	NC_013922	GGT	2	6	3751397	3751402	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	289583255
93173	NC_013922	GACGG	2	10	3751407	3751416	20 %	0 %	60 %	20 %	289583255
93174	NC_013922	GTC	2	6	3751420	3751425	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289583255
93175	NC_013922	CTG	2	6	3751428	3751433	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289583255
93176	NC_013922	CTG	2	6	3751438	3751443	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289583255
93177	NC_013922	GGT	2	6	3751446	3751451	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	289583255
93178	NC_013922	GTCA	2	8	3751459	3751466	25 %	25 %	25 %	25 %	289583255
93179	NC_013922	AC	3	6	3751481	3751486	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
93180	NC_013922	TG	4	8	3751524	3751531	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
93181	NC_013922	TGG	2	6	3751547	3751552	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
93182	NC_013922	GT	3	6	3751562	3751567	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
93183	NC_013922	GT	3	6	3751571	3751576	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
93184	NC_013922	GT	3	6	3751580	3751585	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
93185	NC_013922	GT	3	6	3751589	3751594	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
93186	NC_013922	GT	3	6	3751598	3751603	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
93187	NC_013922	GT	3	6	3751607	3751612	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
93188	NC_013922	GT	3	6	3751614	3751619	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
93189	NC_013922	TGA	2	6	3751623	3751628	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
93190	NC_013922	TG	3	6	3751632	3751637	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
93191	NC_013922	GT	4	8	3751644	3751651	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
93192	NC_013922	TGG	2	6	3751666	3751671	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
93193	NC_013922	TTGG	2	8	3751682	3751689	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
93194	NC_013922	GTT	2	6	3751762	3751767	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
93195	NC_013922	TCTG	2	8	3751794	3751801	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
93196	NC_013922	ACT	2	6	3751817	3751822	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
93197	NC_013922	ACT	2	6	3751827	3751832	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
93198	NC_013922	TCG	2	6	3751833	3751838	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
93199	NC_013922	TAC	2	6	3751839	3751844	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding

< Previous12...175176177178179180181182183184185186187Next >

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.