MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Natrialba magadii ATCC 43099 chromosome

Total Repeats: 93199

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
6001	NC_013922	GCG	2	6	257500	257505	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	289579951
6002	NC_013922	ACG	2	6	257614	257619	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289579951
6003	NC_013922	GGT	2	6	257653	257658	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	289579951
6004	NC_013922	CGT	2	6	257691	257696	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289579951
6005	NC_013922	CCA	2	6	257810	257815	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	289579951
6006	NC_013922	GTA	2	6	257816	257821	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	289579951
6007	NC_013922	ACG	2	6	257913	257918	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289579951
6008	NC_013922	CCG	2	6	257943	257948	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	289579951
6009	NC_013922	GTC	2	6	258072	258077	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289579951
6010	NC_013922	CAT	2	6	258080	258085	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	289579951
6011	NC_013922	GTC	2	6	258111	258116	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289579951
6012	NC_013922	GAT	2	6	258173	258178	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	289579951
6013	NC_013922	CGA	2	6	258193	258198	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289579951
6014	NC_013922	CGT	2	6	258201	258206	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289579951
6015	NC_013922	GAA	2	6	258251	258256	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	289579951
6016	NC_013922	GAA	2	6	258281	258286	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	289579951
6017	NC_013922	CAG	2	6	258305	258310	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289579951
6018	NC_013922	CAACAG	2	12	258365	258376	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	289579951
6019	NC_013922	AGT	2	6	258384	258389	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	289579951
6020	NC_013922	CAT	2	6	258407	258412	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	289579951
6021	NC_013922	GT	3	6	258589	258594	0 %	50 %	50 %	0 %	289579951
6022	NC_013922	TCCA	2	8	258625	258632	25 %	25 %	0 %	50 %	289579951
6023	NC_013922	GAA	2	6	258653	258658	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	289579951
6024	NC_013922	ACC	2	6	258666	258671	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	289579951
6025	NC_013922	GT	3	6	258818	258823	0 %	50 %	50 %	0 %	289579951
6026	NC_013922	CCCG	2	8	258866	258873	0 %	0 %	25 %	75 %	289579951
6027	NC_013922	CAG	2	6	258917	258922	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289579951
6028	NC_013922	GAA	2	6	258926	258931	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	289579951
6029	NC_013922	TCG	2	6	258973	258978	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289579951
6030	NC_013922	TGG	2	6	259007	259012	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	289579951
6031	NC_013922	ATT	2	6	259023	259028	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	289579951
6032	NC_013922	CCTC	2	8	259034	259041	0 %	25 %	0 %	75 %	289579952
6033	NC_013922	GTC	2	6	259045	259050	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289579952
6034	NC_013922	TCG	2	6	259082	259087	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289579952
6035	NC_013922	CTT	2	6	259107	259112	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	289579952
6036	NC_013922	CAT	2	6	259113	259118	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	289579952
6037	NC_013922	TCG	2	6	259124	259129	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289579952
6038	NC_013922	TCG	2	6	259208	259213	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289579952
6039	NC_013922	TCG	2	6	259289	259294	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289579952
6040	NC_013922	TCC	2	6	259316	259321	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	289579952
6041	NC_013922	CGAGTT	2	12	259347	259358	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	289579952
6042	NC_013922	TTC	2	6	259378	259383	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	289579952
6043	NC_013922	CTC	2	6	259441	259446	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	289579952
6044	NC_013922	CAG	2	6	259467	259472	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289579952
6045	NC_013922	CA	3	6	259494	259499	50 %	0 %	0 %	50 %	289579952
6046	NC_013922	TCT	2	6	259529	259534	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	289579952
6047	NC_013922	CGA	2	6	259539	259544	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289579952
6048	NC_013922	TC	3	6	259560	259565	0 %	50 %	0 %	50 %	289579952
6049	NC_013922	ACG	2	6	259664	259669	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289579952
6050	NC_013922	TCGACC	2	12	259730	259741	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	289579952
6051	NC_013922	GTCCG	2	10	259765	259774	0 %	20 %	40 %	40 %	289579952
6052	NC_013922	CGA	3	9	259779	259787	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289579952
6053	NC_013922	ACC	2	6	259808	259813	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	289579952
6054	NC_013922	GAT	2	6	259825	259830	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	289579952
6055	NC_013922	CTT	2	6	259858	259863	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	289579952
6056	NC_013922	TCG	2	6	259910	259915	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289579952
6057	NC_013922	ACG	2	6	259973	259978	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289579952
6058	NC_013922	CGA	2	6	259983	259988	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289579952
6059	NC_013922	CCGAGG	2	12	259994	260005	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	289579952
6060	NC_013922	GCC	2	6	260099	260104	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6061	NC_013922	GGT	2	6	260117	260122	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6062	NC_013922	CTGT	2	8	260179	260186	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
6063	NC_013922	CTT	2	6	260254	260259	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6064	NC_013922	CGG	2	6	260304	260309	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6065	NC_013922	AGC	2	6	260312	260317	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6066	NC_013922	ATCG	2	8	260365	260372	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
6067	NC_013922	TCAT	2	8	260382	260389	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
6068	NC_013922	TCGC	2	8	260399	260406	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
6069	NC_013922	GC	3	6	260405	260410	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6070	NC_013922	ATT	2	6	260419	260424	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6071	NC_013922	TAG	2	6	260444	260449	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6072	NC_013922	GACA	2	8	260484	260491	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
6073	NC_013922	CAG	2	6	260495	260500	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6074	NC_013922	CTG	2	6	260508	260513	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6075	NC_013922	AGA	2	6	260617	260622	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	289579953
6076	NC_013922	CGA	2	6	260656	260661	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289579953
6077	NC_013922	CGA	2	6	260707	260712	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289579953
6078	NC_013922	CCA	2	6	260753	260758	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	289579953
6079	NC_013922	GAA	2	6	260848	260853	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	289579953
6080	NC_013922	CGA	2	6	260866	260871	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289579953
6081	NC_013922	GAC	2	6	260975	260980	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289579954
6082	NC_013922	ACG	3	9	260992	261000	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289579954
6083	NC_013922	TTCGG	2	10	261046	261055	0 %	40 %	40 %	20 %	289579954
6084	NC_013922	GGGC	2	8	261102	261109	0 %	0 %	75 %	25 %	289579954
6085	NC_013922	TCG	2	6	261168	261173	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289579954
6086	NC_013922	CGT	2	6	261274	261279	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289579954
6087	NC_013922	TGC	2	6	261509	261514	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289579954
6088	NC_013922	CAG	2	6	261543	261548	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6089	NC_013922	GCGCTG	2	12	261578	261589	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
6090	NC_013922	GGCA	2	8	261639	261646	25 %	0 %	50 %	25 %	289579955
6091	NC_013922	CGA	2	6	261672	261677	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289579955
6092	NC_013922	CGA	2	6	261801	261806	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289579955
6093	NC_013922	GTC	2	6	261808	261813	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289579955
6094	NC_013922	TCG	2	6	261821	261826	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289579955
6095	NC_013922	GGA	2	6	261891	261896	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	289579955
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6097	NC_013922	GAG	2	6	261946	261951	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	289579955
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6099	NC_013922	GAG	2	6	262078	262083	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	289579955
6100	NC_013922	GA	3	6	262112	262117	50 %	0 %	50 %	0 %	289579955
6101	NC_013922	TAC	2	6	262138	262143	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	289579955
6102	NC_013922	GAC	2	6	262144	262149	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289579955
6103	NC_013922	CGA	2	6	262188	262193	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289579955
6104	NC_013922	GTT	2	6	262246	262251	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	289579956
6105	NC_013922	AGGT	2	8	262283	262290	25 %	25 %	50 %	0 %	289579956
6106	NC_013922	TTG	2	6	262368	262373	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	289579956
6107	NC_013922	TAGA	2	8	262385	262392	50 %	25 %	25 %	0 %	289579956
6108	NC_013922	CCA	4	12	262424	262435	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	289579956
6109	NC_013922	TAC	2	6	262464	262469	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	289579956
6110	NC_013922	TCA	2	6	262484	262489	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	289579956
6111	NC_013922	TGA	2	6	262546	262551	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	289579956
6112	NC_013922	CGC	2	6	262665	262670	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	289579956
6113	NC_013922	AAC	2	6	262717	262722	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	289579956
6114	NC_013922	CT	3	6	262778	262783	0 %	50 %	0 %	50 %	289579956
6115	NC_013922	GTA	2	6	262786	262791	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	289579956
6116	NC_013922	TCG	2	6	262832	262837	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289579956
6117	NC_013922	GTT	2	6	262857	262862	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	289579956
6118	NC_013922	CTT	2	6	262902	262907	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	289579956
6119	NC_013922	TCG	2	6	263024	263029	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289579956
6120	NC_013922	TCCCA	2	10	263093	263102	20 %	20 %	0 %	60 %	289579956
6121	NC_013922	ACTC	2	8	263109	263116	25 %	25 %	0 %	50 %	289579956
6122	NC_013922	GTC	2	6	263137	263142	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289579956
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6124	NC_013922	ATCG	2	8	263203	263210	25 %	25 %	25 %	25 %	289579956
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6143	NC_013922	CAC	2	6	263789	263794	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6144	NC_013922	ATG	2	6	263852	263857	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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6146	NC_013922	GCCCTA	2	12	263927	263938	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
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6233	NC_013922	TCG	2	6	268146	268151	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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6241	NC_013922	TCG	2	6	268585	268590	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289579962
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6243	NC_013922	GGCC	2	8	268601	268608	0 %	0 %	50 %	50 %	289579962
6244	NC_013922	GGT	2	6	268609	268614	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	289579962
6245	NC_013922	CGA	2	6	268699	268704	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289579962
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6247	NC_013922	CGC	2	6	268756	268761	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	289579963
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6251	NC_013922	CCGA	2	8	268886	268893	25 %	0 %	25 %	50 %	289579963
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6268	NC_013922	CGAGT	2	10	269517	269526	20 %	20 %	40 %	20 %	289579964
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6364	NC_013922	GAC	2	6	273286	273291	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289579970
6365	NC_013922	CGT	2	6	273306	273311	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289579970
6366	NC_013922	TCG	2	6	273384	273389	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289579970
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6369	NC_013922	GCTC	2	8	273440	273447	0 %	25 %	25 %	50 %	289579970
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6372	NC_013922	TCG	2	6	273565	273570	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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6464	NC_013922	TAC	2	6	277707	277712	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	289579976
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6470	NC_013922	GAC	2	6	277953	277958	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289579976
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6484	NC_013922	TCGT	2	8	278659	278666	0 %	50 %	25 %	25 %	289579976
6485	NC_013922	TCG	2	6	278689	278694	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289579976
6486	NC_013922	CGA	2	6	278711	278716	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289579976
6487	NC_013922	TCT	2	6	278734	278739	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	289579976
6488	NC_013922	CGT	3	9	278741	278749	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289579976
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6492	NC_013922	GA	3	6	278854	278859	50 %	0 %	50 %	0 %	289579976
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