MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Natrialba magadii ATCC 43099 chromosome

Total Repeats: 93199

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5501	NC_013922	GTC	2	6	234457	234462	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289579918
5502	NC_013922	GAC	2	6	234508	234513	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289579918
5503	NC_013922	CAT	2	6	234561	234566	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	289579918
5504	NC_013922	GGA	2	6	234594	234599	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	289579918
5505	NC_013922	GAC	2	6	234633	234638	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289579918
5506	NC_013922	GTCGAG	2	12	234655	234666	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	289579918
5507	NC_013922	CGC	2	6	234696	234701	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	289579918
5508	NC_013922	ACG	2	6	234778	234783	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289579918
5509	NC_013922	GCCA	2	8	234836	234843	25 %	0 %	25 %	50 %	289579918
5510	NC_013922	GTG	2	6	234851	234856	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	289579918
5511	NC_013922	TGACAG	2	12	234861	234872	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	289579918
5512	NC_013922	CGA	2	6	234873	234878	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289579918
5513	NC_013922	CGT	2	6	234905	234910	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289579919
5514	NC_013922	AAC	2	6	234981	234986	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	289579919
5515	NC_013922	GC	3	6	234991	234996	0 %	0 %	50 %	50 %	289579919
5516	NC_013922	CAA	2	6	235031	235036	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	289579919
5517	NC_013922	GCT	2	6	235088	235093	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289579919
5518	NC_013922	AGCG	2	8	235099	235106	25 %	0 %	50 %	25 %	289579919
5519	NC_013922	GAG	2	6	235140	235145	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	289579919
5520	NC_013922	ACG	2	6	235168	235173	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289579919
5521	NC_013922	CGA	2	6	235202	235207	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289579919
5522	NC_013922	GAC	2	6	235211	235216	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289579919
5523	NC_013922	CACC	2	8	235254	235261	25 %	0 %	0 %	75 %	289579919
5524	NC_013922	ACG	2	6	235273	235278	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289579919
5525	NC_013922	AAG	2	6	235284	235289	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	289579919
5526	NC_013922	GGC	2	6	235302	235307	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	289579919
5527	NC_013922	A	6	6	235376	235381	100 %	0 %	0 %	0 %	289579920
5528	NC_013922	GTG	2	6	235449	235454	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	289579920
5529	NC_013922	GAC	2	6	235625	235630	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289579920
5530	NC_013922	ACGC	2	8	235644	235651	25 %	0 %	25 %	50 %	289579920
5531	NC_013922	TCG	2	6	235656	235661	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289579920
5532	NC_013922	CGT	2	6	235681	235686	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289579920
5533	NC_013922	AGA	2	6	235761	235766	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	289579920
5534	NC_013922	GGC	2	6	235778	235783	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	289579920
5535	NC_013922	GACGCT	2	12	235838	235849	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	289579920
5536	NC_013922	CGA	3	9	235858	235866	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289579920
5537	NC_013922	GAG	2	6	235874	235879	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	289579920
5538	NC_013922	GGAA	2	8	235893	235900	50 %	0 %	50 %	0 %	289579921
5539	NC_013922	CGGC	2	8	235983	235990	0 %	0 %	50 %	50 %	289579921
5540	NC_013922	TGT	2	6	235998	236003	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	289579921
5541	NC_013922	CTT	2	6	236005	236010	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	289579921
5542	NC_013922	GCAG	2	8	236047	236054	25 %	0 %	50 %	25 %	289579921
5543	NC_013922	CTG	2	6	236105	236110	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289579921
5544	NC_013922	CTG	2	6	236174	236179	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289579921
5545	NC_013922	TGA	2	6	236247	236252	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	289579921
5546	NC_013922	CGG	2	6	236284	236289	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	289579921
5547	NC_013922	CAG	2	6	236303	236308	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289579921
5548	NC_013922	GCT	2	6	236353	236358	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289579921
5549	NC_013922	GGC	2	6	236381	236386	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	289579921
5550	NC_013922	GTC	2	6	236411	236416	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289579921
5551	NC_013922	CCG	2	6	236499	236504	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	289579921
5552	NC_013922	TTC	2	6	236513	236518	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	289579921
5553	NC_013922	CGG	2	6	236605	236610	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	289579921
5554	NC_013922	ATC	2	6	236615	236620	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	289579921
5555	NC_013922	GAC	2	6	236629	236634	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289579921
5556	NC_013922	TCG	2	6	236652	236657	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289579921
5557	NC_013922	GAC	2	6	236831	236836	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289579921
5558	NC_013922	CCGT	2	8	236840	236847	0 %	25 %	25 %	50 %	289579921
5559	NC_013922	TTC	2	6	236888	236893	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	289579921
5560	NC_013922	TAC	2	6	236894	236899	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	289579921
5561	NC_013922	TGG	2	6	236933	236938	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	289579921
5562	NC_013922	TGA	2	6	236970	236975	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	289579921
5563	NC_013922	CGG	2	6	237010	237015	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	289579921
5564	NC_013922	TCT	2	6	237030	237035	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	289579921
5565	NC_013922	ACC	2	6	237044	237049	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	289579921
5566	NC_013922	CAG	2	6	237074	237079	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289579921
5567	NC_013922	GGT	2	6	237176	237181	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	289579921
5568	NC_013922	TCG	2	6	237186	237191	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289579921
5569	NC_013922	CTG	3	9	237251	237259	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289579921
5570	NC_013922	GAG	2	6	237287	237292	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	289579921
5571	NC_013922	GAT	2	6	237307	237312	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	289579921
5572	NC_013922	GAT	2	6	237325	237330	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	289579921
5573	NC_013922	TTG	2	6	237389	237394	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5574	NC_013922	TGT	2	6	237401	237406	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5575	NC_013922	TTA	2	6	237433	237438	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5576	NC_013922	TCTCG	2	10	237446	237455	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
5577	NC_013922	CGA	2	6	237475	237480	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289579922
5578	NC_013922	CGA	2	6	237488	237493	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289579922
5579	NC_013922	A	7	7	237531	237537	100 %	0 %	0 %	0 %	289579922
5580	NC_013922	ATCT	2	8	237577	237584	25 %	50 %	0 %	25 %	289579922
5581	NC_013922	TCG	3	9	237589	237597	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289579922
5582	NC_013922	ACG	2	6	237619	237624	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289579922
5583	NC_013922	GAC	3	9	237684	237692	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289579922
5584	NC_013922	CA	4	8	237860	237867	50 %	0 %	0 %	50 %	289579922
5585	NC_013922	ACC	2	6	237898	237903	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	289579922
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5587	NC_013922	CTG	2	6	237981	237986	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289579922
5588	NC_013922	ACCCT	2	10	238048	238057	20 %	20 %	0 %	60 %	289579922
5589	NC_013922	AGAA	2	8	238141	238148	75 %	0 %	25 %	0 %	289579922
5590	NC_013922	AGG	2	6	238165	238170	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	289579922
5591	NC_013922	GAC	2	6	238177	238182	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289579922
5592	NC_013922	GAG	2	6	238232	238237	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	289579923
5593	NC_013922	GAG	2	6	238337	238342	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	289579923
5594	NC_013922	GAA	2	6	238367	238372	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	289579923
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5601	NC_013922	CG	3	6	238721	238726	0 %	0 %	50 %	50 %	289579923
5602	NC_013922	TGG	2	6	238841	238846	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	289579923
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5604	NC_013922	CAA	2	6	238942	238947	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	289579923
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5607	NC_013922	AG	3	6	238964	238969	50 %	0 %	50 %	0 %	289579923
5608	NC_013922	GAC	2	6	238970	238975	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289579923
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5612	NC_013922	ACG	2	6	239133	239138	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289579923
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5615	NC_013922	G	6	6	239308	239313	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
5616	NC_013922	ACTG	2	8	239330	239337	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
5617	NC_013922	GGGGA	2	10	239362	239371	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
5618	NC_013922	ACG	2	6	239399	239404	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5619	NC_013922	GGGGA	2	10	239466	239475	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
5620	NC_013922	CGC	2	6	239504	239509	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5621	NC_013922	CGG	2	6	239522	239527	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5622	NC_013922	GCA	2	6	239648	239653	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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5624	NC_013922	TGA	2	6	239736	239741	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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5626	NC_013922	ATTTC	2	10	239808	239817	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
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5739	NC_013922	ACATA	2	10	245592	245601	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
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5744	NC_013922	GAC	2	6	245761	245766	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289579931
5745	NC_013922	AGG	2	6	245798	245803	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	289579931
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5747	NC_013922	CGC	2	6	245890	245895	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5748	NC_013922	GAG	2	6	245981	245986	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	289579932
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5750	NC_013922	TCG	2	6	246144	246149	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289579933
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5760	NC_013922	ACGT	2	8	246385	246392	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
5761	NC_013922	ACGT	2	8	246421	246428	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
5762	NC_013922	ATA	2	6	246447	246452	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5763	NC_013922	ATA	2	6	246456	246461	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5764	NC_013922	GAT	2	6	246494	246499	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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5772	NC_013922	TCA	2	6	246818	246823	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	289579935
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5775	NC_013922	TCT	2	6	246877	246882	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	289579935
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5845	NC_013922	TAG	2	6	250851	250856	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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5847	NC_013922	CAAC	2	8	250942	250949	50 %	0 %	0 %	50 %	289579943
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5852	NC_013922	ACG	2	6	251068	251073	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289579943
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5857	NC_013922	TCGAC	2	10	251290	251299	20 %	20 %	20 %	40 %	289579943
5858	NC_013922	CAA	2	6	251405	251410	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5859	NC_013922	ATG	2	6	251426	251431	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	289579944
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5863	NC_013922	CTG	2	6	251532	251537	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289579944
5864	NC_013922	CAT	2	6	251542	251547	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	289579944
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5866	NC_013922	CGA	2	6	251560	251565	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289579944
5867	NC_013922	CTGA	2	8	251763	251770	25 %	25 %	25 %	25 %	289579945
5868	NC_013922	ATC	2	6	251795	251800	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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5896	NC_013922	CA	3	6	253046	253051	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
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5899	NC_013922	GCG	2	6	253125	253130	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5900	NC_013922	CGT	2	6	253164	253169	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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5904	NC_013922	CACAAC	4	24	253271	253294	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5905	NC_013922	CAA	2	6	253321	253326	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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5988	NC_013922	AGC	2	6	256935	256940	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289579951
5989	NC_013922	GTC	2	6	256965	256970	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289579951
5990	NC_013922	GAC	2	6	257030	257035	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289579951
5991	NC_013922	CCG	2	6	257085	257090	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	289579951
5992	NC_013922	ATG	2	6	257202	257207	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	289579951
5993	NC_013922	CAG	2	6	257215	257220	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289579951
5994	NC_013922	GGGT	2	8	257240	257247	0 %	25 %	75 %	0 %	289579951
5995	NC_013922	GAT	2	6	257270	257275	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	289579951
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5997	NC_013922	TTC	3	9	257363	257371	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	289579951
5998	NC_013922	TCG	2	6	257380	257385	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289579951
5999	NC_013922	CCGT	2	8	257421	257428	0 %	25 %	25 %	50 %	289579951
6000	NC_013922	CGA	2	6	257446	257451	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289579951

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