MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Nakamurella multipartita DSM 44233 chromosome

Total Repeats: 6688

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013235	ACCAC	2	10	1731	1740	40 %	0 %	0 %	60 %	258650272
2	NC_013235	GCTCG	2	10	1958	1967	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
3	NC_013235	CCGCC	2	10	2377	2386	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
4	NC_013235	GCTGG	2	10	3005	3014	0 %	20 %	60 %	20 %	258650273
5	NC_013235	GGTCC	2	10	4907	4916	0 %	20 %	40 %	40 %	258650275
6	NC_013235	GGCCG	3	15	7420	7434	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
7	NC_013235	CGGGC	2	10	9602	9611	0 %	0 %	60 %	40 %	258650278
8	NC_013235	GGGCA	2	10	10339	10348	20 %	0 %	60 %	20 %	258650279
9	NC_013235	CGGCC	2	10	12486	12495	0 %	0 %	40 %	60 %	258650279
10	NC_013235	GCCGG	2	10	12628	12637	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
11	NC_013235	TCGGA	2	10	15541	15550	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
12	NC_013235	CGGGG	2	10	18172	18181	0 %	0 %	80 %	20 %	258650287
13	NC_013235	CGGGC	2	10	18730	18739	0 %	0 %	60 %	40 %	258650287
14	NC_013235	GCCCG	2	10	19183	19192	0 %	0 %	40 %	60 %	258650287
15	NC_013235	ACCCC	2	10	20086	20095	20 %	0 %	0 %	80 %	258650288
16	NC_013235	CGCAG	2	10	20131	20140	20 %	0 %	40 %	40 %	258650288
17	NC_013235	TGCGC	2	10	20159	20168	0 %	20 %	40 %	40 %	258650288
18	NC_013235	GTCCT	2	10	20235	20244	0 %	40 %	20 %	40 %	258650288
19	NC_013235	GCCGA	2	10	21505	21514	20 %	0 %	40 %	40 %	258650289
20	NC_013235	GGCGA	2	10	21811	21820	20 %	0 %	60 %	20 %	258650289
21	NC_013235	GGCCG	2	10	23161	23170	0 %	0 %	60 %	40 %	258650291
22	NC_013235	TGCTC	2	10	24267	24276	0 %	40 %	20 %	40 %	258650291
23	NC_013235	CGGTC	2	10	24464	24473	0 %	20 %	40 %	40 %	258650291
24	NC_013235	CCCGA	2	10	24639	24648	20 %	0 %	20 %	60 %	258650291
25	NC_013235	CCGGC	2	10	24863	24872	0 %	0 %	40 %	60 %	258650291
26	NC_013235	AACCG	2	10	25395	25404	40 %	0 %	20 %	40 %	258650292
27	NC_013235	ACCGG	2	10	25692	25701	20 %	0 %	40 %	40 %	258650292
28	NC_013235	CGGAT	2	10	25767	25776	20 %	20 %	40 %	20 %	258650292
29	NC_013235	CAGCG	2	10	26467	26476	20 %	0 %	40 %	40 %	258650293
30	NC_013235	CGACC	2	10	26830	26839	20 %	0 %	20 %	60 %	258650294
31	NC_013235	GACCC	2	10	27480	27489	20 %	0 %	20 %	60 %	258650295
32	NC_013235	CCGGG	2	10	32244	32253	0 %	0 %	60 %	40 %	258650298
33	NC_013235	GCGGG	2	10	34795	34804	0 %	0 %	80 %	20 %	258650300
34	NC_013235	TCGGT	2	10	37779	37788	0 %	40 %	40 %	20 %	258650302
35	NC_013235	GCCCC	2	10	39032	39041	0 %	0 %	20 %	80 %	258650304
36	NC_013235	CACCG	2	10	41338	41347	20 %	0 %	20 %	60 %	258650305
37	NC_013235	CCGGA	2	10	42558	42567	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
38	NC_013235	TCCGC	2	10	42690	42699	0 %	20 %	20 %	60 %	258650307
39	NC_013235	GACCG	2	10	43900	43909	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
40	NC_013235	GCCGA	2	10	44782	44791	20 %	0 %	40 %	40 %	258650310
41	NC_013235	CGGGC	2	10	45140	45149	0 %	0 %	60 %	40 %	258650310
42	NC_013235	GCCGT	2	10	46245	46254	0 %	20 %	40 %	40 %	258650311
43	NC_013235	TGGTC	2	10	46981	46990	0 %	40 %	40 %	20 %	258650311
44	NC_013235	TGCGC	2	10	47077	47086	0 %	20 %	40 %	40 %	258650311
45	NC_013235	CGGAC	2	10	47739	47748	20 %	0 %	40 %	40 %	258650311
46	NC_013235	ACCGG	2	10	48150	48159	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
47	NC_013235	CCGTC	2	10	49857	49866	0 %	20 %	20 %	60 %	258650313
48	NC_013235	TCACC	2	10	50401	50410	20 %	20 %	0 %	60 %	258650313
49	NC_013235	GAGGG	2	10	51398	51407	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
50	NC_013235	CCGCG	2	10	51589	51598	0 %	0 %	40 %	60 %	258650314
51	NC_013235	GACCG	2	10	51930	51939	20 %	0 %	40 %	40 %	258650314
52	NC_013235	CCCGG	2	10	53049	53058	0 %	0 %	40 %	60 %	258650315
53	NC_013235	CGGCC	3	15	53549	53563	0 %	0 %	40 %	60 %	258650316
54	NC_013235	CCCGA	2	10	54532	54541	20 %	0 %	20 %	60 %	258650317
55	NC_013235	CGGCG	2	10	55563	55572	0 %	0 %	60 %	40 %	258650318
56	NC_013235	CGAGG	2	10	58772	58781	20 %	0 %	60 %	20 %	258650323
57	NC_013235	GACTC	2	10	59079	59088	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
58	NC_013235	GGGCC	2	10	59532	59541	0 %	0 %	60 %	40 %	258650324
59	NC_013235	CCCGG	2	10	59585	59594	0 %	0 %	40 %	60 %	258650324
60	NC_013235	GGCTG	2	10	61425	61434	0 %	20 %	60 %	20 %	258650324
61	NC_013235	CCGGG	2	10	65471	65480	0 %	0 %	60 %	40 %	258650327
62	NC_013235	GATCG	2	10	65880	65889	20 %	20 %	40 %	20 %	258650327
63	NC_013235	GGTCG	2	10	67121	67130	0 %	20 %	60 %	20 %	258650328
64	NC_013235	TTCCA	2	10	67791	67800	20 %	40 %	0 %	40 %	258650328
65	NC_013235	CGGGG	2	10	68025	68034	0 %	0 %	80 %	20 %	258650328
66	NC_013235	GCGGG	2	10	69187	69196	0 %	0 %	80 %	20 %	258650329
67	NC_013235	CGGGC	2	10	70492	70501	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
68	NC_013235	CGGGG	2	10	72919	72928	0 %	0 %	80 %	20 %	258650331
69	NC_013235	TCAGG	2	10	74558	74567	20 %	20 %	40 %	20 %	258650334
70	NC_013235	CCGAG	2	10	74827	74836	20 %	0 %	40 %	40 %	258650334
71	NC_013235	CCGAC	2	10	75741	75750	20 %	0 %	20 %	60 %	258650335
72	NC_013235	CGGTC	2	10	76948	76957	0 %	20 %	40 %	40 %	258650337
73	NC_013235	GTCGA	2	10	77250	77259	20 %	20 %	40 %	20 %	258650337
74	NC_013235	GAGCT	2	10	77767	77776	20 %	20 %	40 %	20 %	258650338
75	NC_013235	GGACC	2	10	79125	79134	20 %	0 %	40 %	40 %	258650340
76	NC_013235	CCGGG	2	10	79370	79379	0 %	0 %	60 %	40 %	258650340
77	NC_013235	ACCAG	2	10	79606	79615	40 %	0 %	20 %	40 %	258650341
78	NC_013235	CGGGT	2	10	79920	79929	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
79	NC_013235	GGGCC	2	10	80250	80259	0 %	0 %	60 %	40 %	258650342
80	NC_013235	CCGCC	2	10	84458	84467	0 %	0 %	20 %	80 %	258650346
81	NC_013235	TGGCC	2	10	85742	85751	0 %	20 %	40 %	40 %	258650346
82	NC_013235	TGCCG	2	10	85847	85856	0 %	20 %	40 %	40 %	258650346
83	NC_013235	GGCCG	2	10	86603	86612	0 %	0 %	60 %	40 %	258650347
84	NC_013235	CGCGG	2	10	86681	86690	0 %	0 %	60 %	40 %	258650347
85	NC_013235	GGCGT	2	10	86954	86963	0 %	20 %	60 %	20 %	258650347
86	NC_013235	ACACC	2	10	90029	90038	40 %	0 %	0 %	60 %	258650349
87	NC_013235	CTCGG	2	10	90753	90762	0 %	20 %	40 %	40 %	258650350
88	NC_013235	GCCGG	2	10	91117	91126	0 %	0 %	60 %	40 %	258650350
89	NC_013235	CGGCC	2	10	92342	92351	0 %	0 %	40 %	60 %	258650351
90	NC_013235	TGGCC	2	10	93269	93278	0 %	20 %	40 %	40 %	258650352
91	NC_013235	CAGTG	2	10	93591	93600	20 %	20 %	40 %	20 %	258650352
92	NC_013235	CGGCC	2	10	94131	94140	0 %	0 %	40 %	60 %	258650353
93	NC_013235	CCGGC	2	10	94643	94652	0 %	0 %	40 %	60 %	258650353
94	NC_013235	GGGGC	2	10	94788	94797	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
95	NC_013235	GCGGT	2	10	94804	94813	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
96	NC_013235	TCGGG	2	10	95513	95522	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
97	NC_013235	GAGTG	2	10	96241	96250	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
98	NC_013235	CCCAG	2	10	96339	96348	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
99	NC_013235	GCCGC	2	10	99891	99900	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
100	NC_013235	TGGCC	2	10	101302	101311	0 %	20 %	40 %	40 %	258650357
101	NC_013235	CTGTG	2	10	103168	103177	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
102	NC_013235	TCTGG	2	10	103494	103503	0 %	40 %	40 %	20 %	258650359
103	NC_013235	CATCT	2	10	104720	104729	20 %	40 %	0 %	40 %	258650360
104	NC_013235	CCGAG	2	10	105022	105031	20 %	0 %	40 %	40 %	258650360
105	NC_013235	GGGTC	2	10	105961	105970	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
106	NC_013235	CGGCG	2	10	106437	106446	0 %	0 %	60 %	40 %	258650361
107	NC_013235	GGGCA	2	10	107352	107361	20 %	0 %	60 %	20 %	258650362
108	NC_013235	CCGGG	2	10	108747	108756	0 %	0 %	60 %	40 %	258650363
109	NC_013235	TGGCA	2	10	109020	109029	20 %	20 %	40 %	20 %	258650364
110	NC_013235	CTCGG	2	10	109348	109357	0 %	20 %	40 %	40 %	258650364
111	NC_013235	CCGAG	2	10	109856	109865	20 %	0 %	40 %	40 %	258650364
112	NC_013235	GCCGG	2	10	110963	110972	0 %	0 %	60 %	40 %	258650365
113	NC_013235	CGGGC	2	10	110977	110986	0 %	0 %	60 %	40 %	258650365
114	NC_013235	CTGGG	2	10	111233	111242	0 %	20 %	60 %	20 %	258650366
115	NC_013235	ACCGG	2	10	111351	111360	20 %	0 %	40 %	40 %	258650366
116	NC_013235	CCGGC	2	10	111603	111612	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
117	NC_013235	GGCCG	2	10	112331	112340	0 %	0 %	60 %	40 %	258650367
118	NC_013235	CCGGG	2	10	112699	112708	0 %	0 %	60 %	40 %	258650368
119	NC_013235	CCGGG	2	10	113946	113955	0 %	0 %	60 %	40 %	258650371
120	NC_013235	CTCGG	2	10	113971	113980	0 %	20 %	40 %	40 %	258650371
121	NC_013235	CGGCG	2	10	117780	117789	0 %	0 %	60 %	40 %	258650374
122	NC_013235	CGGCC	2	10	118211	118220	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
123	NC_013235	ACGGC	2	10	119622	119631	20 %	0 %	40 %	40 %	258650375
124	NC_013235	CGGTC	2	10	120333	120342	0 %	20 %	40 %	40 %	258650375
125	NC_013235	GGCCC	2	10	121760	121769	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
126	NC_013235	GTCCG	2	10	121916	121925	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
127	NC_013235	CCCGA	2	10	124259	124268	20 %	0 %	20 %	60 %	258650378
128	NC_013235	GAGCG	2	10	127025	127034	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
129	NC_013235	TCGGC	2	10	131590	131599	0 %	20 %	40 %	40 %	258650385
130	NC_013235	GCCCG	2	10	133542	133551	0 %	0 %	40 %	60 %	258650386
131	NC_013235	GGACG	2	10	133720	133729	20 %	0 %	60 %	20 %	258650386
132	NC_013235	GCTGG	2	10	134393	134402	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
133	NC_013235	GCCCG	2	10	134431	134440	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
134	NC_013235	GTCAG	2	10	134623	134632	20 %	20 %	40 %	20 %	258650388
135	NC_013235	GGCCG	2	10	135331	135340	0 %	0 %	60 %	40 %	258650388
136	NC_013235	CGAGG	2	10	135701	135710	20 %	0 %	60 %	20 %	258650388
137	NC_013235	GTCGG	2	10	135732	135741	0 %	20 %	60 %	20 %	258650388
138	NC_013235	GGCGG	2	10	137521	137530	0 %	0 %	80 %	20 %	258650389
139	NC_013235	CGCTG	2	10	142533	142542	0 %	20 %	40 %	40 %	258650394
140	NC_013235	CAGCG	2	10	142543	142552	20 %	0 %	40 %	40 %	258650394
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142	NC_013235	TGCGC	2	10	145350	145359	0 %	20 %	40 %	40 %	258650395
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209	NC_013235	GCTCG	2	10	202202	202211	0 %	20 %	40 %	40 %	258650446
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212	NC_013235	CCGGT	2	10	204395	204404	0 %	20 %	40 %	40 %	258650448
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242	NC_013235	CCGGC	2	10	237438	237447	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
243	NC_013235	CCGGG	2	10	238931	238940	0 %	0 %	60 %	40 %	258650476
244	NC_013235	CCTGC	2	10	239432	239441	0 %	20 %	20 %	60 %	258650476
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246	NC_013235	CGGGC	2	10	241203	241212	0 %	0 %	60 %	40 %	258650478
247	NC_013235	GCCGT	2	10	241695	241704	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
248	NC_013235	CCCGC	2	10	242339	242348	0 %	0 %	20 %	80 %	258650480
249	NC_013235	CCCGG	2	10	242451	242460	0 %	0 %	40 %	60 %	258650480
250	NC_013235	CCGCC	2	10	242461	242470	0 %	0 %	20 %	80 %	258650480
251	NC_013235	CGGCC	2	10	244148	244157	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
252	NC_013235	ACACC	2	10	244285	244294	40 %	0 %	0 %	60 %	258650482
253	NC_013235	GACGG	2	10	245406	245415	20 %	0 %	60 %	20 %	258650483
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255	NC_013235	CGTTC	2	10	246347	246356	0 %	40 %	20 %	40 %	258650483
256	NC_013235	CGGCC	2	10	246438	246447	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
257	NC_013235	GGCTC	2	10	247324	247333	0 %	20 %	40 %	40 %	258650484
258	NC_013235	GCCTG	2	10	247515	247524	0 %	20 %	40 %	40 %	258650485
259	NC_013235	CGGCC	2	10	248097	248106	0 %	0 %	40 %	60 %	258650485
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263	NC_013235	CCCGG	2	10	251856	251865	0 %	0 %	40 %	60 %	258650489
264	NC_013235	GACCG	2	10	254004	254013	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
265	NC_013235	CCGGC	2	10	254463	254472	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
266	NC_013235	CCGGG	2	10	254955	254964	0 %	0 %	60 %	40 %	258650491
267	NC_013235	CCGGA	2	10	255812	255821	20 %	0 %	40 %	40 %	258650492
268	NC_013235	CCTGG	2	10	256548	256557	0 %	20 %	40 %	40 %	258650492
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