MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Neisseria meningitidis alpha14 chromosome

Total Repeats: 45989

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_013016	GCCGC	2	10	161310	161319	0 %	0 %	40 %	60 %	254804180
3502	NC_013016	CGC	2	6	161365	161370	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	254804180
3503	NC_013016	GTT	2	6	161393	161398	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	254804180
3504	NC_013016	ATG	2	6	161469	161474	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	254804180
3505	NC_013016	CGCC	2	8	161506	161513	0 %	0 %	25 %	75 %	254804180
3506	NC_013016	GCG	2	6	161515	161520	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	254804180
3507	NC_013016	CCGC	2	8	161541	161548	0 %	0 %	25 %	75 %	254804180
3508	NC_013016	CGCC	2	8	161551	161558	0 %	0 %	25 %	75 %	254804180
3509	NC_013016	CAC	2	6	161610	161615	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	254804180
3510	NC_013016	ACGG	2	8	161652	161659	25 %	0 %	50 %	25 %	254804180
3511	NC_013016	CAG	2	6	161717	161722	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	254804180
3512	NC_013016	CGG	2	6	161806	161811	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	254804180
3513	NC_013016	TTG	2	6	161891	161896	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	254804180
3514	NC_013016	A	6	6	161942	161947	100 %	0 %	0 %	0 %	254804180
3515	NC_013016	CGA	2	6	161962	161967	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	254804180
3516	NC_013016	GGC	2	6	162016	162021	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	254804180
3517	NC_013016	GGC	2	6	162046	162051	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	254804180
3518	NC_013016	TGT	2	6	162075	162080	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3519	NC_013016	CGG	2	6	162082	162087	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3520	NC_013016	TATG	2	8	162102	162109	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
3521	NC_013016	GGC	3	9	162193	162201	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	254804181
3522	NC_013016	GCG	2	6	162281	162286	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	254804181
3523	NC_013016	CCG	2	6	162290	162295	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	254804181
3524	NC_013016	TCG	2	6	162314	162319	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	254804181
3525	NC_013016	GGC	2	6	162373	162378	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	254804181
3526	NC_013016	GCG	2	6	162429	162434	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	254804181
3527	NC_013016	GGC	2	6	162451	162456	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	254804181
3528	NC_013016	TCG	2	6	162467	162472	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	254804181
3529	NC_013016	TGA	2	6	162501	162506	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	254804181
3530	NC_013016	CAA	2	6	162568	162573	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	254804181
3531	NC_013016	TGT	2	6	162606	162611	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	254804181
3532	NC_013016	GAT	2	6	162643	162648	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	254804181
3533	NC_013016	TCG	2	6	162704	162709	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	254804181
3534	NC_013016	TCA	2	6	162723	162728	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	254804181
3535	NC_013016	GGA	2	6	162732	162737	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	254804181
3536	NC_013016	GT	3	6	162839	162844	0 %	50 %	50 %	0 %	254804181
3537	NC_013016	CG	3	6	162864	162869	0 %	0 %	50 %	50 %	254804181
3538	NC_013016	GGC	2	6	162871	162876	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	254804181
3539	NC_013016	GGT	2	6	162892	162897	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	254804181
3540	NC_013016	ATG	2	6	162899	162904	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	254804181
3541	NC_013016	AGGC	2	8	162927	162934	25 %	0 %	50 %	25 %	254804181
3542	NC_013016	GCG	2	6	162950	162955	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	254804181
3543	NC_013016	GCA	2	6	163005	163010	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	254804181
3544	NC_013016	GCG	3	9	163040	163048	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	254804181
3545	NC_013016	CA	3	6	163050	163055	50 %	0 %	0 %	50 %	254804181
3546	NC_013016	TGA	3	9	163113	163121	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	254804181
3547	NC_013016	GC	3	6	163124	163129	0 %	0 %	50 %	50 %	254804181
3548	NC_013016	TCG	2	6	163139	163144	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	254804181
3549	NC_013016	TGC	2	6	163215	163220	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	254804181
3550	NC_013016	CGG	2	6	163221	163226	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	254804181
3551	NC_013016	CTT	2	6	163261	163266	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	254804181
3552	NC_013016	GTT	2	6	163314	163319	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	254804181
3553	NC_013016	CGG	2	6	163320	163325	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	254804181
3554	NC_013016	T	6	6	163326	163331	0 %	100 %	0 %	0 %	254804181
3555	NC_013016	GT	3	6	163368	163373	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3556	NC_013016	AGC	2	6	163439	163444	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	254804182
3557	NC_013016	CAGCCC	2	12	163480	163491	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	254804182
3558	NC_013016	GCC	2	6	163499	163504	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	254804182
3559	NC_013016	GCG	2	6	163507	163512	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	254804182
3560	NC_013016	CGAG	2	8	163521	163528	25 %	0 %	50 %	25 %	254804182
3561	NC_013016	TTC	2	6	163598	163603	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	254804182
3562	NC_013016	ATG	2	6	163643	163648	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	254804182
3563	NC_013016	GGC	2	6	163654	163659	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	254804182
3564	NC_013016	GCC	2	6	163675	163680	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	254804182
3565	NC_013016	CGAG	2	8	163731	163738	25 %	0 %	50 %	25 %	254804182
3566	NC_013016	GAC	2	6	163741	163746	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	254804182
3567	NC_013016	CGG	2	6	163856	163861	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	254804182
3568	NC_013016	CGGCA	2	10	163873	163882	20 %	0 %	40 %	40 %	254804182
3569	NC_013016	ACG	3	9	163886	163894	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	254804182
3570	NC_013016	GCG	2	6	163925	163930	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	254804182
3571	NC_013016	AGA	2	6	164010	164015	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	254804182
3572	NC_013016	CGTGCG	2	12	164023	164034	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	254804182
3573	NC_013016	TCA	2	6	164106	164111	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	254804182
3574	NC_013016	CAG	2	6	164151	164156	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	254804183
3575	NC_013016	GGCGGA	2	12	164172	164183	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	254804183
3576	NC_013016	TCG	2	6	164203	164208	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	254804183
3577	NC_013016	TGA	2	6	164228	164233	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	254804183
3578	NC_013016	GGC	2	6	164245	164250	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	254804183
3579	NC_013016	CGA	2	6	164354	164359	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	254804183
3580	NC_013016	TGC	2	6	164360	164365	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	254804183
3581	NC_013016	CGG	2	6	164393	164398	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	254804183
3582	NC_013016	CGG	2	6	164405	164410	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	254804183
3583	NC_013016	GAT	2	6	164424	164429	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	254804183
3584	NC_013016	GAG	2	6	164430	164435	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	254804183
3585	NC_013016	CG	3	6	164436	164441	0 %	0 %	50 %	50 %	254804183
3586	NC_013016	GAT	2	6	164442	164447	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	254804183
3587	NC_013016	TGT	2	6	164453	164458	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	254804183
3588	NC_013016	GT	3	6	164457	164462	0 %	50 %	50 %	0 %	254804184
3589	NC_013016	AAGCCG	2	12	164532	164543	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	254804184
3590	NC_013016	GCA	2	6	164580	164585	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3591	NC_013016	CGC	2	6	164666	164671	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	254804185
3592	NC_013016	CAG	2	6	164679	164684	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	254804185
3593	NC_013016	TCG	2	6	164782	164787	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	254804185
3594	NC_013016	CGG	2	6	164872	164877	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	254804186
3595	NC_013016	GCGCG	2	10	164943	164952	0 %	0 %	60 %	40 %	254804186
3596	NC_013016	GTT	2	6	164964	164969	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	254804186
3597	NC_013016	GCC	2	6	165003	165008	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	254804186
3598	NC_013016	TGC	2	6	165130	165135	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	254804186
3599	NC_013016	GCC	2	6	165174	165179	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	254804186
3600	NC_013016	TCG	2	6	165226	165231	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	254804186
3601	NC_013016	GCCC	2	8	165237	165244	0 %	0 %	25 %	75 %	254804186
3602	NC_013016	TCG	2	6	165313	165318	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	254804186
3603	NC_013016	GCCC	2	8	165324	165331	0 %	0 %	25 %	75 %	254804186
3604	NC_013016	CGGG	2	8	165334	165341	0 %	0 %	75 %	25 %	254804186
3605	NC_013016	TCG	2	6	165400	165405	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	254804186
3606	NC_013016	GCCC	2	8	165411	165418	0 %	0 %	25 %	75 %	254804186
3607	NC_013016	CGGG	2	8	165421	165428	0 %	0 %	75 %	25 %	254804186
3608	NC_013016	GCT	2	6	165492	165497	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	254804186
3609	NC_013016	TCG	2	6	165514	165519	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	254804186
3610	NC_013016	GGGCG	2	10	165524	165533	0 %	0 %	80 %	20 %	254804186
3611	NC_013016	A	6	6	165577	165582	100 %	0 %	0 %	0 %	254804186
3612	NC_013016	AGG	2	6	165607	165612	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3613	NC_013016	GCC	2	6	165619	165624	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3614	NC_013016	TTG	2	6	165658	165663	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3615	NC_013016	TA	3	6	165668	165673	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3616	NC_013016	A	7	7	165673	165679	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3617	NC_013016	A	6	6	165692	165697	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3618	NC_013016	TA	3	6	165731	165736	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3619	NC_013016	CCG	2	6	165763	165768	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3620	NC_013016	GCC	2	6	165803	165808	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3621	NC_013016	TCAG	2	8	165819	165826	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
3622	NC_013016	CGA	2	6	165885	165890	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	254804187
3623	NC_013016	CGTC	2	8	165912	165919	0 %	25 %	25 %	50 %	254804187
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3988	NC_013016	CTG	2	6	181593	181598	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	254804196
3989	NC_013016	GCA	2	6	181616	181621	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	254804196
3990	NC_013016	CGC	2	6	181664	181669	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	254804196
3991	NC_013016	AAT	2	6	181674	181679	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	254804196
3992	NC_013016	CGG	2	6	181710	181715	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	254804196
3993	NC_013016	GGC	2	6	181718	181723	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	254804196
3994	NC_013016	CAG	2	6	181728	181733	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	254804196
3995	NC_013016	CGG	2	6	181766	181771	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	254804196
3996	NC_013016	GCG	2	6	181793	181798	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	254804196
3997	NC_013016	GGCA	2	8	181800	181807	25 %	0 %	50 %	25 %	254804196
3998	NC_013016	GCA	3	9	181805	181813	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	254804196
3999	NC_013016	CGCC	2	8	181853	181860	0 %	0 %	25 %	75 %	254804196
4000	NC_013016	ATC	2	6	181903	181908	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	254804196

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