MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Neisseria meningitidis alpha14 chromosome

Total Repeats: 45989

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_013016	TTTTC	2	10	45773	45782	0 %	80 %	0 %	20 %	254804071
1002	NC_013016	CAG	2	6	45804	45809	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	254804071
1003	NC_013016	GGC	2	6	45810	45815	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	254804071
1004	NC_013016	GAT	2	6	45819	45824	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	254804071
1005	NC_013016	GAA	2	6	45858	45863	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	254804071
1006	NC_013016	GAAAA	2	10	45878	45887	80 %	0 %	20 %	0 %	254804071
1007	NC_013016	CAG	3	9	45903	45911	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	254804071
1008	NC_013016	GAC	2	6	45979	45984	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	254804072
1009	NC_013016	CAG	2	6	46006	46011	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	254804072
1010	NC_013016	GTTT	2	8	46061	46068	0 %	75 %	25 %	0 %	254804072
1011	NC_013016	GAC	2	6	46150	46155	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	254804072
1012	NC_013016	ATC	2	6	46193	46198	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	254804072
1013	NC_013016	GAC	2	6	46205	46210	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1014	NC_013016	ATG	2	6	46225	46230	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1015	NC_013016	AATA	2	8	46310	46317	75 %	25 %	0 %	0 %	254804073
1016	NC_013016	AGT	2	6	46469	46474	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	254804073
1017	NC_013016	GCCGC	2	10	46479	46488	0 %	0 %	40 %	60 %	254804073
1018	NC_013016	AAC	2	6	46681	46686	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	254804073
1019	NC_013016	CG	3	6	46712	46717	0 %	0 %	50 %	50 %	254804073
1020	NC_013016	GAT	2	6	46728	46733	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	254804073
1021	NC_013016	GCC	2	6	46773	46778	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	254804073
1022	NC_013016	CTT	2	6	46850	46855	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	254804073
1023	NC_013016	CTT	2	6	46871	46876	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	254804073
1024	NC_013016	GTGG	2	8	46974	46981	0 %	25 %	75 %	0 %	254804073
1025	NC_013016	GCC	2	6	47076	47081	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	254804073
1026	NC_013016	TCG	2	6	47086	47091	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	254804073
1027	NC_013016	TGC	2	6	47189	47194	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	254804073
1028	NC_013016	TCT	2	6	47218	47223	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	254804073
1029	NC_013016	GTG	2	6	47272	47277	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	254804073
1030	NC_013016	GCC	2	6	47292	47297	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	254804073
1031	NC_013016	CGC	2	6	47315	47320	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	254804073
1032	NC_013016	GGC	2	6	47328	47333	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	254804073
1033	NC_013016	TG	3	6	47353	47358	0 %	50 %	50 %	0 %	254804073
1034	NC_013016	GGCG	2	8	47372	47379	0 %	0 %	75 %	25 %	254804073
1035	NC_013016	T	6	6	47403	47408	0 %	100 %	0 %	0 %	254804073
1036	NC_013016	GTC	2	6	47424	47429	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	254804073
1037	NC_013016	GC	3	6	47471	47476	0 %	0 %	50 %	50 %	254804073
1038	NC_013016	CCG	2	6	47518	47523	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	254804073
1039	NC_013016	TCG	2	6	47620	47625	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1040	NC_013016	GTC	2	6	47752	47757	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1041	NC_013016	GT	3	6	47760	47765	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1042	NC_013016	AAG	2	6	47819	47824	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1043	NC_013016	CTCC	2	8	47882	47889	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
1044	NC_013016	CAG	2	6	47922	47927	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1045	NC_013016	ATC	3	9	48070	48078	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	254804074
1046	NC_013016	CGA	2	6	48081	48086	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	254804074
1047	NC_013016	GCC	2	6	48101	48106	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	254804074
1048	NC_013016	CGA	2	6	48183	48188	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	254804074
1049	NC_013016	CGG	2	6	48252	48257	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	254804074
1050	NC_013016	CGA	2	6	48273	48278	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	254804074
1051	NC_013016	GCT	2	6	48301	48306	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	254804074
1052	NC_013016	GTC	2	6	48319	48324	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	254804074
1053	NC_013016	GCC	2	6	48337	48342	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	254804074
1054	NC_013016	TAA	2	6	48459	48464	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	254804074
1055	NC_013016	ATT	2	6	48491	48496	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	254804074
1056	NC_013016	T	6	6	48495	48500	0 %	100 %	0 %	0 %	254804074
1057	NC_013016	TTA	2	6	48552	48557	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	254804074
1058	NC_013016	AGC	2	6	48611	48616	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	254804074
1059	NC_013016	CGC	2	6	48632	48637	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	254804074
1060	NC_013016	AGA	2	6	48907	48912	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	254804075
1061	NC_013016	A	6	6	48933	48938	100 %	0 %	0 %	0 %	254804075
1062	NC_013016	TGC	2	6	48980	48985	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	254804075
1063	NC_013016	GC	3	6	49035	49040	0 %	0 %	50 %	50 %	254804075
1064	NC_013016	CGC	2	6	49121	49126	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	254804075
1065	NC_013016	GTC	2	6	49135	49140	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	254804075
1066	NC_013016	AGA	2	6	49170	49175	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	254804075
1067	NC_013016	A	6	6	49183	49188	100 %	0 %	0 %	0 %	254804075
1068	NC_013016	GCC	2	6	49207	49212	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	254804075
1069	NC_013016	CAT	3	9	49236	49244	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	254804075
1070	NC_013016	CGG	2	6	49260	49265	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	254804075
1071	NC_013016	GAA	2	6	49294	49299	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	254804075
1072	NC_013016	GCA	2	6	49317	49322	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	254804075
1073	NC_013016	GCT	2	6	49370	49375	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	254804075
1074	NC_013016	CGG	4	12	49385	49396	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	254804075
1075	NC_013016	TCG	2	6	49424	49429	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	254804075
1076	NC_013016	GCA	2	6	49430	49435	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	254804075
1077	NC_013016	GCA	2	6	49448	49453	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	254804075
1078	NC_013016	A	6	6	49478	49483	100 %	0 %	0 %	0 %	254804075
1079	NC_013016	GCA	2	6	49514	49519	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	254804075
1080	NC_013016	GAA	2	6	49576	49581	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	254804075
1081	NC_013016	TCA	2	6	49607	49612	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	254804075
1082	NC_013016	CGG	2	6	49632	49637	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	254804075
1083	NC_013016	TGG	2	6	49715	49720	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	254804075
1084	NC_013016	TGG	2	6	49775	49780	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	254804075
1085	NC_013016	AAGC	2	8	49841	49848	50 %	0 %	25 %	25 %	254804075
1086	NC_013016	GTT	2	6	49880	49885	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1087	NC_013016	AAAATA	2	12	49909	49920	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1088	NC_013016	TGC	2	6	49948	49953	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1089	NC_013016	GTTGCT	2	12	50046	50057	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
1090	NC_013016	TGC	2	6	50153	50158	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1091	NC_013016	TAA	2	6	50275	50280	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1092	NC_013016	TTGG	2	8	50286	50293	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1093	NC_013016	TGC	2	6	50417	50422	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1094	NC_013016	TTA	2	6	50424	50429	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1095	NC_013016	GA	3	6	50488	50493	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1096	NC_013016	GTC	2	6	50496	50501	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1097	NC_013016	ATG	2	6	50545	50550	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1098	NC_013016	ATCA	2	8	50583	50590	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
1099	NC_013016	CA	3	6	50594	50599	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1100	NC_013016	AAC	2	6	50733	50738	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1101	NC_013016	GCT	2	6	50830	50835	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1102	NC_013016	A	6	6	50883	50888	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1103	NC_013016	TAT	2	6	50903	50908	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1104	NC_013016	CAT	2	6	50945	50950	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1105	NC_013016	CAGG	2	8	51008	51015	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
1106	NC_013016	AT	3	6	51029	51034	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1107	NC_013016	TAAAT	2	10	51183	51192	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
1108	NC_013016	AAT	2	6	51201	51206	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1109	NC_013016	TAC	2	6	51232	51237	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1110	NC_013016	TGG	2	6	51263	51268	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1111	NC_013016	T	6	6	51290	51295	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1112	NC_013016	TGC	2	6	51339	51344	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1113	NC_013016	T	6	6	51402	51407	0 %	100 %	0 %	0 %	254804076
1114	NC_013016	T	6	6	51410	51415	0 %	100 %	0 %	0 %	254804076
1115	NC_013016	AAT	2	6	51436	51441	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	254804076
1116	NC_013016	AAT	2	6	51604	51609	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	254804076
1117	NC_013016	CAAT	2	8	51662	51669	50 %	25 %	0 %	25 %	254804076
1118	NC_013016	TTCA	2	8	51730	51737	25 %	50 %	0 %	25 %	254804076
1119	NC_013016	TGT	3	9	51763	51771	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	254804077
1120	NC_013016	AAT	2	6	51773	51778	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	254804077
1121	NC_013016	TGCT	2	8	51783	51790	0 %	50 %	25 %	25 %	254804077
1122	NC_013016	GAT	2	6	51824	51829	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	254804077
1123	NC_013016	ATC	2	6	51839	51844	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	254804077
1124	NC_013016	CCA	2	6	51857	51862	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	254804077
1125	NC_013016	TCA	2	6	51903	51908	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	254804077
1126	NC_013016	CCCA	2	8	51933	51940	25 %	0 %	0 %	75 %	254804077
1127	NC_013016	CAA	2	6	51984	51989	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1128	NC_013016	AT	3	6	52028	52033	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1129	NC_013016	T	7	7	52033	52039	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1262	NC_013016	GGC	2	6	58240	58245	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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