MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Neorickettsia risticii str. Illinois

Total Repeats: 653

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013009	TTCTA	2	10	1014	1023	20 %	60 %	0 %	20 %	254796402
2	NC_013009	AAAAG	2	10	1578	1587	80 %	0 %	20 %	0 %	254796402
3	NC_013009	GAGAA	2	10	1743	1752	60 %	0 %	40 %	0 %	254796402
4	NC_013009	AATTT	2	10	4145	4154	40 %	60 %	0 %	0 %	254796404
5	NC_013009	GAATA	2	10	7814	7823	60 %	20 %	20 %	0 %	254796407
6	NC_013009	TATTT	2	10	7892	7901	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_013009	GTGCT	2	10	9340	9349	0 %	40 %	40 %	20 %	254796410
8	NC_013009	TTTCT	2	10	9800	9809	0 %	80 %	0 %	20 %	254796411
9	NC_013009	TGTAG	2	10	10121	10130	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
10	NC_013009	CGTTT	2	10	10631	10640	0 %	60 %	20 %	20 %	254796413
11	NC_013009	AGAAA	2	10	12837	12846	80 %	0 %	20 %	0 %	254796414
12	NC_013009	CTTTC	2	10	13626	13635	0 %	60 %	0 %	40 %	254796415
13	NC_013009	TTTTC	2	10	13949	13958	0 %	80 %	0 %	20 %	254796415
14	NC_013009	GTTTT	2	10	14430	14439	0 %	80 %	20 %	0 %	254796416
15	NC_013009	CGCTG	2	10	15112	15121	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
16	NC_013009	CATTG	2	10	21828	21837	20 %	40 %	20 %	20 %	254796423
17	NC_013009	TTTTG	2	10	23404	23413	0 %	80 %	20 %	0 %	254796425
18	NC_013009	TCCTC	2	10	23916	23925	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
19	NC_013009	ACCAC	2	10	26784	26793	40 %	0 %	0 %	60 %	254796430
20	NC_013009	AATAA	2	10	27487	27496	80 %	20 %	0 %	0 %	254796433
21	NC_013009	GCCCA	2	10	27776	27785	20 %	0 %	20 %	60 %	254796433
22	NC_013009	TAACA	2	10	29235	29244	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
23	NC_013009	TAGTA	2	10	29679	29688	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
24	NC_013009	GTTTA	2	10	31430	31439	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
25	NC_013009	GCGTA	2	10	32598	32607	20 %	20 %	40 %	20 %	254796440
26	NC_013009	CTGAA	2	10	34048	34057	40 %	20 %	20 %	20 %	254796440
27	NC_013009	ATTCA	2	10	35374	35383	40 %	40 %	0 %	20 %	254796442
28	NC_013009	TCGTG	2	10	37416	37425	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
29	NC_013009	TATGG	2	10	37558	37567	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
30	NC_013009	GGTGG	2	10	37817	37826	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
31	NC_013009	TTTCT	2	10	38796	38805	0 %	80 %	0 %	20 %	254796447
32	NC_013009	TTGAT	2	10	40104	40113	20 %	60 %	20 %	0 %	254796447
33	NC_013009	CTTCT	2	10	40134	40143	0 %	60 %	0 %	40 %	254796447
34	NC_013009	TTTGT	2	10	41559	41568	0 %	80 %	20 %	0 %	254796449
35	NC_013009	TTTGA	2	10	41616	41625	20 %	60 %	20 %	0 %	254796449
36	NC_013009	CAAAT	2	10	43344	43353	60 %	20 %	0 %	20 %	254796449
37	NC_013009	ATTTG	2	10	43783	43792	20 %	60 %	20 %	0 %	254796449
38	NC_013009	CTTTT	2	10	43878	43887	0 %	80 %	0 %	20 %	254796449
39	NC_013009	AATCT	2	10	44180	44189	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
40	NC_013009	TGTTT	2	10	47404	47413	0 %	80 %	20 %	0 %	254796452
41	NC_013009	TGTTT	2	10	47675	47684	0 %	80 %	20 %	0 %	254796453
42	NC_013009	GCAAA	2	10	48108	48117	60 %	0 %	20 %	20 %	254796453
43	NC_013009	ATTCC	2	10	50805	50814	20 %	40 %	0 %	40 %	254796456
44	NC_013009	ACTAT	2	10	57319	57328	40 %	40 %	0 %	20 %	254796464
45	NC_013009	GACTA	2	10	57842	57851	40 %	20 %	20 %	20 %	254796465
46	NC_013009	GCTTT	2	10	60011	60020	0 %	60 %	20 %	20 %	254796467
47	NC_013009	GAAAG	2	10	61216	61225	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
48	NC_013009	TTCAA	2	10	61533	61542	40 %	40 %	0 %	20 %	254796468
49	NC_013009	AGGTG	2	10	62367	62376	20 %	20 %	60 %	0 %	254796468
50	NC_013009	GGACT	2	10	62605	62614	20 %	20 %	40 %	20 %	254796468
51	NC_013009	GATAG	2	10	62644	62653	40 %	20 %	40 %	0 %	254796468
52	NC_013009	TTAAT	2	10	65454	65463	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_013009	TTTTC	2	10	68659	68668	0 %	80 %	0 %	20 %	254796476
54	NC_013009	TTCAT	2	10	69159	69168	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
55	NC_013009	AAGCT	2	10	70716	70725	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
56	NC_013009	AAACA	2	10	72864	72873	80 %	0 %	0 %	20 %	254796479
57	NC_013009	ATGTG	2	10	73502	73511	20 %	40 %	40 %	0 %	254796480
58	NC_013009	GGATA	2	10	73520	73529	40 %	20 %	40 %	0 %	254796480
59	NC_013009	CAGAT	2	10	74015	74024	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
60	NC_013009	ACAAT	2	10	74032	74041	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
61	NC_013009	GTTTG	2	10	74418	74427	0 %	60 %	40 %	0 %	254796481
62	NC_013009	GGTAA	2	10	74642	74651	40 %	20 %	40 %	0 %	254796481
63	NC_013009	TTTGT	2	10	75599	75608	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
64	NC_013009	TGTAT	2	10	75822	75831	20 %	60 %	20 %	0 %	254796482
65	NC_013009	TTTCT	2	10	78433	78442	0 %	80 %	0 %	20 %	254796484
66	NC_013009	TCTGC	2	10	78734	78743	0 %	40 %	20 %	40 %	254796484
67	NC_013009	ACGTT	2	10	78842	78851	20 %	40 %	20 %	20 %	254796484
68	NC_013009	GGGCT	2	10	78869	78878	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
69	NC_013009	TCGTG	2	10	78956	78965	0 %	40 %	40 %	20 %	254796485
70	NC_013009	TGCTT	2	10	79358	79367	0 %	60 %	20 %	20 %	254796486
71	NC_013009	TTGAG	2	10	79555	79564	20 %	40 %	40 %	0 %	254796486
72	NC_013009	ACTGC	2	10	79879	79888	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
73	NC_013009	TAGTA	2	10	80284	80293	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
74	NC_013009	AATTC	2	10	83294	83303	40 %	40 %	0 %	20 %	254796492
75	NC_013009	AGGTC	2	10	83319	83328	20 %	20 %	40 %	20 %	254796492
76	NC_013009	ATGGA	2	10	84647	84656	40 %	20 %	40 %	0 %	254796494
77	NC_013009	TAAAA	2	10	87062	87071	80 %	20 %	0 %	0 %	254796499
78	NC_013009	CTTGT	2	10	88198	88207	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
79	NC_013009	CTTTC	2	10	88208	88217	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
80	NC_013009	TTTTA	2	10	88517	88526	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_013009	CAATT	2	10	89734	89743	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
82	NC_013009	TGTCT	2	10	91288	91297	0 %	60 %	20 %	20 %	254796504
83	NC_013009	TCTGT	2	10	91646	91655	0 %	60 %	20 %	20 %	254796504
84	NC_013009	TGGGT	2	10	93914	93923	0 %	40 %	60 %	0 %	254796507
85	NC_013009	AGCTG	2	10	95962	95971	20 %	20 %	40 %	20 %	254796508
86	NC_013009	AAGAT	2	10	102324	102333	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
87	NC_013009	TACCT	2	10	103275	103284	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
88	NC_013009	CAGGA	2	10	105824	105833	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
89	NC_013009	CTTTT	2	10	107169	107178	0 %	80 %	0 %	20 %	254796519
90	NC_013009	GAGAA	2	10	109150	109159	60 %	0 %	40 %	0 %	254796520
91	NC_013009	AACAT	2	10	110006	110015	60 %	20 %	0 %	20 %	254796520
92	NC_013009	ATAGC	2	10	111857	111866	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
93	NC_013009	TAGAA	2	10	112192	112201	60 %	20 %	20 %	0 %	254796522
94	NC_013009	AGCAT	2	10	115620	115629	40 %	20 %	20 %	20 %	254796526
95	NC_013009	CGACA	2	10	115679	115688	40 %	0 %	20 %	40 %	254796526
96	NC_013009	GGCTA	2	10	116840	116849	20 %	20 %	40 %	20 %	254796528
97	NC_013009	GGTTT	2	10	117241	117250	0 %	60 %	40 %	0 %	254796528
98	NC_013009	GGAAC	2	10	117633	117642	40 %	0 %	40 %	20 %	254796528
99	NC_013009	TTTCA	2	10	117704	117713	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
100	NC_013009	AAGCT	2	10	119202	119211	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
101	NC_013009	ACAGT	2	10	120137	120146	40 %	20 %	20 %	20 %	254796531
102	NC_013009	ACCAC	2	10	126195	126204	40 %	0 %	0 %	60 %	254796540
103	NC_013009	AACCT	2	10	126312	126321	40 %	20 %	0 %	40 %	254796540
104	NC_013009	CAACG	2	10	127327	127336	40 %	0 %	20 %	40 %	254796542
105	NC_013009	AATGG	2	10	127889	127898	40 %	20 %	40 %	0 %	254796542
106	NC_013009	TAAAT	2	10	131313	131322	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_013009	GAGCT	2	10	132899	132908	20 %	20 %	40 %	20 %	254796546
108	NC_013009	ACACC	2	10	135185	135194	40 %	0 %	0 %	60 %	254796548
109	NC_013009	GAACA	2	10	135261	135270	60 %	0 %	20 %	20 %	254796548
110	NC_013009	ATGTT	2	10	138482	138491	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
111	NC_013009	TAAAG	2	10	138502	138511	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
112	NC_013009	AAAGG	2	10	138672	138681	60 %	0 %	40 %	0 %	254796551
113	NC_013009	TTTTG	2	10	139392	139401	0 %	80 %	20 %	0 %	254796551
114	NC_013009	AAGGA	2	10	139648	139657	60 %	0 %	40 %	0 %	254796551
115	NC_013009	TAGAT	2	10	141619	141628	40 %	40 %	20 %	0 %	254796554
116	NC_013009	AGAGG	2	10	144230	144239	40 %	0 %	60 %	0 %	254796557
117	NC_013009	CTTTT	2	10	144729	144738	0 %	80 %	0 %	20 %	254796558
118	NC_013009	TTTGG	2	10	145210	145219	0 %	60 %	40 %	0 %	254796558
119	NC_013009	TGCAA	2	10	145339	145348	40 %	20 %	20 %	20 %	254796558
120	NC_013009	GTCGA	2	10	147382	147391	20 %	20 %	40 %	20 %	254796559
121	NC_013009	ATTCC	2	10	147772	147781	20 %	40 %	0 %	40 %	254796559
122	NC_013009	AACTG	2	10	148892	148901	40 %	20 %	20 %	20 %	254796559
123	NC_013009	CTTTC	2	10	150177	150186	0 %	60 %	0 %	40 %	254796560
124	NC_013009	CGTTA	2	10	153521	153530	20 %	40 %	20 %	20 %	254796562
125	NC_013009	TGTAT	2	10	154303	154312	20 %	60 %	20 %	0 %	254796563
126	NC_013009	TTTAG	2	10	156419	156428	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
127	NC_013009	GTGAT	2	10	156794	156803	20 %	40 %	40 %	0 %	254796565
128	NC_013009	AGGCA	2	10	158539	158548	40 %	0 %	40 %	20 %	254796567
129	NC_013009	TTTGA	2	10	159101	159110	20 %	60 %	20 %	0 %	254796567
130	NC_013009	GCTAT	2	10	160417	160426	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
131	NC_013009	TACTC	2	10	161957	161966	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
132	NC_013009	TTTTG	2	10	162807	162816	0 %	80 %	20 %	0 %	254796570
133	NC_013009	CCGCT	2	10	164183	164192	0 %	20 %	20 %	60 %	254796570
134	NC_013009	TTTTC	2	10	164195	164204	0 %	80 %	0 %	20 %	254796570
135	NC_013009	TTGAC	2	10	166222	166231	20 %	40 %	20 %	20 %	254796574
136	NC_013009	TGATT	2	10	167272	167281	20 %	60 %	20 %	0 %	254796574
137	NC_013009	GCCAG	2	10	169533	169542	20 %	0 %	40 %	40 %	254796577
138	NC_013009	CAGAT	2	10	170409	170418	40 %	20 %	20 %	20 %	254796577
139	NC_013009	TTTCT	2	10	173216	173225	0 %	80 %	0 %	20 %	254796580
140	NC_013009	CCACC	2	10	174863	174872	20 %	0 %	0 %	80 %	254796580
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256	NC_013009	TGATT	2	10	337897	337906	20 %	60 %	20 %	0 %	254796769
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262	NC_013009	TTTAT	2	10	349329	349338	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
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393	NC_013009	CATTG	2	10	518287	518296	20 %	40 %	20 %	20 %	254796934
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399	NC_013009	TGCAT	2	10	522614	522623	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
400	NC_013009	CCGAG	2	10	523565	523574	20 %	0 %	40 %	40 %	254796943
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