MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Neorickettsia risticii str. Illinois

Total Repeats: 2264

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013009	CTTT	2	8	430	437	0 %	75 %	0 %	25 %	254796401
2	NC_013009	TAAA	2	8	1198	1205	75 %	25 %	0 %	0 %	254796402
3	NC_013009	AGTT	2	8	1456	1463	25 %	50 %	25 %	0 %	254796402
4	NC_013009	TAAC	2	8	1837	1844	50 %	25 %	0 %	25 %	254796402
5	NC_013009	TTGG	2	8	1881	1888	0 %	50 %	50 %	0 %	254796402
6	NC_013009	GTTT	2	8	1924	1931	0 %	75 %	25 %	0 %	254796402
7	NC_013009	CTTC	2	8	2294	2301	0 %	50 %	0 %	50 %	254796403
8	NC_013009	CTTT	2	8	2945	2952	0 %	75 %	0 %	25 %	254796403
9	NC_013009	GTTC	2	8	2985	2992	0 %	50 %	25 %	25 %	254796403
10	NC_013009	TGGA	2	8	3874	3881	25 %	25 %	50 %	0 %	254796404
11	NC_013009	ATAG	2	8	3887	3894	50 %	25 %	25 %	0 %	254796404
12	NC_013009	CTAA	2	8	4232	4239	50 %	25 %	0 %	25 %	254796404
13	NC_013009	AGAT	2	8	4278	4285	50 %	25 %	25 %	0 %	254796404
14	NC_013009	ATTT	2	8	4686	4693	25 %	75 %	0 %	0 %	254796404
15	NC_013009	CTAG	2	8	5285	5292	25 %	25 %	25 %	25 %	254796405
16	NC_013009	ACTG	2	8	6359	6366	25 %	25 %	25 %	25 %	254796406
17	NC_013009	GAGG	2	8	7388	7395	25 %	0 %	75 %	0 %	254796407
18	NC_013009	GAAA	2	8	7405	7412	75 %	0 %	25 %	0 %	254796407
19	NC_013009	CAAT	2	8	7734	7741	50 %	25 %	0 %	25 %	254796407
20	NC_013009	TCCA	2	8	7957	7964	25 %	25 %	0 %	50 %	254796408
21	NC_013009	CAGC	2	8	8180	8187	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
22	NC_013009	TGCT	2	8	8272	8279	0 %	50 %	25 %	25 %	254796409
23	NC_013009	TTGA	2	8	8581	8588	25 %	50 %	25 %	0 %	254796409
24	NC_013009	GTAA	2	8	8733	8740	50 %	25 %	25 %	0 %	254796409
25	NC_013009	AAAT	2	8	8964	8971	75 %	25 %	0 %	0 %	254796410
26	NC_013009	GTCC	2	8	9653	9660	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
27	NC_013009	TAGT	2	8	10198	10205	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
28	NC_013009	TGTT	2	8	10398	10405	0 %	75 %	25 %	0 %	254796412
29	NC_013009	CTTT	2	8	11374	11381	0 %	75 %	0 %	25 %	254796413
30	NC_013009	ATTC	2	8	11415	11422	25 %	50 %	0 %	25 %	254796413
31	NC_013009	TCCT	2	8	11854	11861	0 %	50 %	0 %	50 %	254796413
32	NC_013009	TTTG	2	8	11949	11956	0 %	75 %	25 %	0 %	254796413
33	NC_013009	TTTA	2	8	11995	12002	25 %	75 %	0 %	0 %	254796413
34	NC_013009	GTTA	2	8	12038	12045	25 %	50 %	25 %	0 %	254796413
35	NC_013009	TGTT	2	8	12124	12131	0 %	75 %	25 %	0 %	254796413
36	NC_013009	TTGC	2	8	12204	12211	0 %	50 %	25 %	25 %	254796413
37	NC_013009	AAAT	2	8	12463	12470	75 %	25 %	0 %	0 %	254796414
38	NC_013009	TTGC	2	8	12617	12624	0 %	50 %	25 %	25 %	254796414
39	NC_013009	TTTA	2	8	13175	13182	25 %	75 %	0 %	0 %	254796415
40	NC_013009	TTTC	2	8	13737	13744	0 %	75 %	0 %	25 %	254796415
41	NC_013009	CATC	2	8	13834	13841	25 %	25 %	0 %	50 %	254796415
42	NC_013009	GGTA	2	8	14107	14114	25 %	25 %	50 %	0 %	254796415
43	NC_013009	AGTA	2	8	14995	15002	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
44	NC_013009	TGTT	2	8	15596	15603	0 %	75 %	25 %	0 %	254796417
45	NC_013009	TCTT	2	8	16356	16363	0 %	75 %	0 %	25 %	254796417
46	NC_013009	ACCT	2	8	16736	16743	25 %	25 %	0 %	50 %	254796417
47	NC_013009	TGTT	2	8	17170	17177	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
48	NC_013009	TCGT	2	8	17754	17761	0 %	50 %	25 %	25 %	254796418
49	NC_013009	TGGT	2	8	17882	17889	0 %	50 %	50 %	0 %	254796418
50	NC_013009	AAGC	2	8	18219	18226	50 %	0 %	25 %	25 %	254796419
51	NC_013009	TGGT	2	8	18576	18583	0 %	50 %	50 %	0 %	254796421
52	NC_013009	CGTG	2	8	18826	18833	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
53	NC_013009	CGTA	2	8	18848	18855	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
54	NC_013009	GGGA	2	8	18917	18924	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
55	NC_013009	GAGC	2	8	19011	19018	25 %	0 %	50 %	25 %	254796422
56	NC_013009	GGAA	2	8	19657	19664	50 %	0 %	50 %	0 %	254796422
57	NC_013009	CTGC	2	8	19874	19881	0 %	25 %	25 %	50 %	254796422
58	NC_013009	TGCT	2	8	20037	20044	0 %	50 %	25 %	25 %	254796422
59	NC_013009	TGCT	2	8	20223	20230	0 %	50 %	25 %	25 %	254796422
60	NC_013009	ATGG	2	8	20339	20346	25 %	25 %	50 %	0 %	254796422
61	NC_013009	TAAA	2	8	20577	20584	75 %	25 %	0 %	0 %	254796422
62	NC_013009	GATT	2	8	20742	20749	25 %	50 %	25 %	0 %	254796422
63	NC_013009	CTTT	2	8	20778	20785	0 %	75 %	0 %	25 %	254796422
64	NC_013009	AGGA	2	8	21770	21777	50 %	0 %	50 %	0 %	254796423
65	NC_013009	TCTT	2	8	23232	23239	0 %	75 %	0 %	25 %	254796425
66	NC_013009	TCAT	2	8	23654	23661	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
67	NC_013009	CTGA	2	8	24576	24583	25 %	25 %	25 %	25 %	254796427
68	NC_013009	GCAT	2	8	24641	24648	25 %	25 %	25 %	25 %	254796427
69	NC_013009	GAAA	2	8	24839	24846	75 %	0 %	25 %	0 %	254796427
70	NC_013009	CAAA	2	8	25363	25370	75 %	0 %	0 %	25 %	254796429
71	NC_013009	GCTC	2	8	26387	26394	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
72	NC_013009	TAAC	2	8	26541	26548	50 %	25 %	0 %	25 %	254796430
73	NC_013009	GAGT	2	8	27314	27321	25 %	25 %	50 %	0 %	254796432
74	NC_013009	GCAA	2	8	27339	27346	50 %	0 %	25 %	25 %	254796432
75	NC_013009	CAAA	2	8	27406	27413	75 %	0 %	0 %	25 %	254796432
76	NC_013009	CATT	2	8	27848	27855	25 %	50 %	0 %	25 %	254796433
77	NC_013009	AGAT	2	8	27895	27902	50 %	25 %	25 %	0 %	254796433
78	NC_013009	AGTA	2	8	28459	28466	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
79	NC_013009	ATCA	2	8	28615	28622	50 %	25 %	0 %	25 %	254796435
80	NC_013009	GCCT	2	8	28919	28926	0 %	25 %	25 %	50 %	254796435
81	NC_013009	GAAA	2	8	29698	29705	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
82	NC_013009	GATC	2	8	29890	29897	25 %	25 %	25 %	25 %	254796436
83	NC_013009	TTGG	2	8	29976	29983	0 %	50 %	50 %	0 %	254796436
84	NC_013009	AAGT	2	8	30005	30012	50 %	25 %	25 %	0 %	254796436
85	NC_013009	CTTT	2	8	30045	30052	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
86	NC_013009	GTAG	2	8	30445	30452	25 %	25 %	50 %	0 %	254796437
87	NC_013009	CAAT	2	8	31076	31083	50 %	25 %	0 %	25 %	254796438
88	NC_013009	TCCG	2	8	31311	31318	0 %	25 %	25 %	50 %	254796438
89	NC_013009	AAGA	2	8	31739	31746	75 %	0 %	25 %	0 %	254796439
90	NC_013009	GTAT	2	8	32948	32955	25 %	50 %	25 %	0 %	254796440
91	NC_013009	GAAA	2	8	33080	33087	75 %	0 %	25 %	0 %	254796440
92	NC_013009	TATG	2	8	33419	33426	25 %	50 %	25 %	0 %	254796440
93	NC_013009	ATCT	2	8	35245	35252	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
94	NC_013009	CCAT	2	8	35743	35750	25 %	25 %	0 %	50 %	254796443
95	NC_013009	TGCA	2	8	35792	35799	25 %	25 %	25 %	25 %	254796443
96	NC_013009	CGGT	2	8	36312	36319	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
97	NC_013009	AGTA	2	8	36337	36344	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
98	NC_013009	GAAC	2	8	36419	36426	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
99	NC_013009	AGGG	2	8	37360	37367	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
100	NC_013009	AGCT	2	8	37600	37607	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
101	NC_013009	TTTA	2	8	37888	37895	25 %	75 %	0 %	0 %	254796445
102	NC_013009	CTTT	2	8	37931	37938	0 %	75 %	0 %	25 %	254796445
103	NC_013009	TGCT	2	8	38083	38090	0 %	50 %	25 %	25 %	254796445
104	NC_013009	TTTC	2	8	38167	38174	0 %	75 %	0 %	25 %	254796445
105	NC_013009	GTAA	2	8	38261	38268	50 %	25 %	25 %	0 %	254796445
106	NC_013009	GTTG	2	8	38348	38355	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
107	NC_013009	ATTA	2	8	38499	38506	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_013009	ACTG	2	8	38692	38699	25 %	25 %	25 %	25 %	254796447
109	NC_013009	GTGA	2	8	38966	38973	25 %	25 %	50 %	0 %	254796447
110	NC_013009	AGAA	2	8	39559	39566	75 %	0 %	25 %	0 %	254796447
111	NC_013009	TCTT	2	8	39576	39583	0 %	75 %	0 %	25 %	254796447
112	NC_013009	CTTA	2	8	40039	40046	25 %	50 %	0 %	25 %	254796447
113	NC_013009	AGAA	2	8	40363	40370	75 %	0 %	25 %	0 %	254796447
114	NC_013009	TCTA	2	8	40455	40462	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
115	NC_013009	ATAG	2	8	40696	40703	50 %	25 %	25 %	0 %	254796448
116	NC_013009	AAGA	2	8	40714	40721	75 %	0 %	25 %	0 %	254796448
117	NC_013009	AACA	2	8	41223	41230	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
118	NC_013009	TTTC	2	8	42017	42024	0 %	75 %	0 %	25 %	254796449
119	NC_013009	GAAA	2	8	42090	42097	75 %	0 %	25 %	0 %	254796449
120	NC_013009	AGGT	2	8	42743	42750	25 %	25 %	50 %	0 %	254796449
121	NC_013009	GAAG	2	8	42856	42863	50 %	0 %	50 %	0 %	254796449
122	NC_013009	TTAC	2	8	43402	43409	25 %	50 %	0 %	25 %	254796449
123	NC_013009	TAAG	2	8	43996	44003	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
124	NC_013009	TGAA	2	8	44063	44070	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
125	NC_013009	TGGC	2	8	44592	44599	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
126	NC_013009	TACA	2	8	45056	45063	50 %	25 %	0 %	25 %	254796451
127	NC_013009	TGAA	2	8	45261	45268	50 %	25 %	25 %	0 %	254796451
128	NC_013009	AAAT	2	8	45270	45277	75 %	25 %	0 %	0 %	254796451
129	NC_013009	AGTC	2	8	45474	45481	25 %	25 %	25 %	25 %	254796451
130	NC_013009	GCAG	2	8	45531	45538	25 %	0 %	50 %	25 %	254796451
131	NC_013009	AAAC	2	8	47164	47171	75 %	0 %	0 %	25 %	254796452
132	NC_013009	GGTG	2	8	47319	47326	0 %	25 %	75 %	0 %	254796452
133	NC_013009	CCTG	2	8	47686	47693	0 %	25 %	25 %	50 %	254796453
134	NC_013009	TTAT	2	8	47867	47874	25 %	75 %	0 %	0 %	254796453
135	NC_013009	GCGT	2	8	47879	47886	0 %	25 %	50 %	25 %	254796453
136	NC_013009	ATTG	2	8	48617	48624	25 %	50 %	25 %	0 %	254796454
137	NC_013009	TTCA	2	8	48790	48797	25 %	50 %	0 %	25 %	254796454
138	NC_013009	AAAG	2	8	49809	49816	75 %	0 %	25 %	0 %	254796455
139	NC_013009	CAAA	2	8	49992	49999	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
140	NC_013009	CTAC	2	8	50196	50203	25 %	25 %	0 %	50 %	254796456
141	NC_013009	ACTG	2	8	50274	50281	25 %	25 %	25 %	25 %	254796456
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