MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Neisseria gonorrhoeae NCCP11945 chromosome

Total Repeats: 49268

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5501	NC_011035	GCA	2	6	243240	243245	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194097879
5502	NC_011035	CCCGT	2	10	243254	243263	0 %	20 %	20 %	60 %	194097879
5503	NC_011035	AAG	2	6	243297	243302	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	194097879
5504	NC_011035	GAA	2	6	243374	243379	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	194097879
5505	NC_011035	A	6	6	243470	243475	100 %	0 %	0 %	0 %	194097879
5506	NC_011035	TCG	3	9	243480	243488	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194097879
5507	NC_011035	CGAA	2	8	243510	243517	50 %	0 %	25 %	25 %	194097879
5508	NC_011035	CAC	2	6	243536	243541	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	194097879
5509	NC_011035	CGA	2	6	243577	243582	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194097879
5510	NC_011035	A	6	6	243582	243587	100 %	0 %	0 %	0 %	194097879
5511	NC_011035	TCG	2	6	243609	243614	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194097879
5512	NC_011035	A	6	6	243617	243622	100 %	0 %	0 %	0 %	194097879
5513	NC_011035	AGA	2	6	243640	243645	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	194097879
5514	NC_011035	CGA	2	6	243709	243714	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194097879
5515	NC_011035	AAAGA	2	10	243777	243786	80 %	0 %	20 %	0 %	194097879
5516	NC_011035	TCCG	2	8	243824	243831	0 %	25 %	25 %	50 %	194097880
5517	NC_011035	CG	3	6	243843	243848	0 %	0 %	50 %	50 %	194097880
5518	NC_011035	CAT	2	6	243886	243891	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	194097880
5519	NC_011035	CGG	2	6	243913	243918	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194097881
5520	NC_011035	CGC	3	9	243946	243954	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194097881
5521	NC_011035	GCC	2	6	243962	243967	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194097881
5522	NC_011035	CG	3	6	243978	243983	0 %	0 %	50 %	50 %	194097881
5523	NC_011035	CGA	2	6	244075	244080	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194097881
5524	NC_011035	CGC	2	6	244142	244147	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194097881
5525	NC_011035	ACG	2	6	244195	244200	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194097881
5526	NC_011035	GGC	2	6	244214	244219	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194097881
5527	NC_011035	CGA	2	6	244246	244251	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194097881
5528	NC_011035	CGC	2	6	244259	244264	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194097881
5529	NC_011035	GCG	2	6	244277	244282	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194097881
5530	NC_011035	CGG	2	6	244309	244314	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194097881
5531	NC_011035	CAA	2	6	244384	244389	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	194097881
5532	NC_011035	CGC	3	9	244426	244434	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194097881
5533	NC_011035	GAAA	2	8	244471	244478	75 %	0 %	25 %	0 %	194097881
5534	NC_011035	CGC	2	6	244547	244552	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194097881
5535	NC_011035	GC	3	6	244582	244587	0 %	0 %	50 %	50 %	194097881
5536	NC_011035	TGC	2	6	244635	244640	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194097881
5537	NC_011035	ACA	2	6	244656	244661	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	194097881
5538	NC_011035	GCA	2	6	244690	244695	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194097881
5539	NC_011035	A	7	7	244715	244721	100 %	0 %	0 %	0 %	194097881
5540	NC_011035	AC	3	6	244747	244752	50 %	0 %	0 %	50 %	194097881
5541	NC_011035	ATTG	2	8	244807	244814	25 %	50 %	25 %	0 %	194097881
5542	NC_011035	CGG	2	6	244942	244947	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194097881
5543	NC_011035	CG	3	6	244956	244961	0 %	0 %	50 %	50 %	194097881
5544	NC_011035	CGC	2	6	244978	244983	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194097881
5545	NC_011035	AAC	2	6	245003	245008	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	194097881
5546	NC_011035	CGT	2	6	245125	245130	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194097881
5547	NC_011035	CCG	2	6	245154	245159	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194097881
5548	NC_011035	CCG	2	6	245187	245192	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194097881
5549	NC_011035	GGC	2	6	245198	245203	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194097881
5550	NC_011035	GC	3	6	245217	245222	0 %	0 %	50 %	50 %	194097881
5551	NC_011035	AAG	2	6	245223	245228	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	194097881
5552	NC_011035	GCAG	2	8	245240	245247	25 %	0 %	50 %	25 %	194097881
5553	NC_011035	CGCCAC	2	12	245288	245299	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	194097881
5554	NC_011035	CAA	3	9	245311	245319	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	194097881
5555	NC_011035	CAGG	2	8	245339	245346	25 %	0 %	50 %	25 %	194097881
5556	NC_011035	CGG	2	6	245356	245361	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194097881
5557	NC_011035	CCG	2	6	245367	245372	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194097881
5558	NC_011035	TTC	2	6	245420	245425	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	194097881
5559	NC_011035	A	6	6	245513	245518	100 %	0 %	0 %	0 %	194097881
5560	NC_011035	TGA	2	6	245537	245542	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	194097882
5561	NC_011035	AATTT	2	10	245617	245626	40 %	60 %	0 %	0 %	194097882
5562	NC_011035	AC	3	6	245675	245680	50 %	0 %	0 %	50 %	194097882
5563	NC_011035	AAAG	2	8	245689	245696	75 %	0 %	25 %	0 %	194097883
5564	NC_011035	GCC	2	6	245750	245755	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194097883
5565	NC_011035	ATCC	2	8	245768	245775	25 %	25 %	0 %	50 %	194097883
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5567	NC_011035	GCCGG	2	10	245864	245873	0 %	0 %	60 %	40 %	194097883
5568	NC_011035	CGCGG	2	10	245915	245924	0 %	0 %	60 %	40 %	194097883
5569	NC_011035	ATCG	2	8	246212	246219	25 %	25 %	25 %	25 %	194097883
5570	NC_011035	GTT	2	6	246235	246240	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	194097883
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5573	NC_011035	TCG	2	6	246413	246418	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194097886
5574	NC_011035	GGC	2	6	246419	246424	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194097886
5575	NC_011035	GCA	2	6	246453	246458	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194097886
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5578	NC_011035	TTTG	2	8	246626	246633	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
5579	NC_011035	TGT	2	6	246662	246667	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5580	NC_011035	TTG	2	6	246681	246686	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	194097885
5581	NC_011035	TCAA	2	8	246767	246774	50 %	25 %	0 %	25 %	194097885
5582	NC_011035	CA	3	6	246793	246798	50 %	0 %	0 %	50 %	194097885
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5586	NC_011035	GAA	2	6	246958	246963	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	194097887
5587	NC_011035	CAT	3	9	247000	247008	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	194097887
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5589	NC_011035	TG	3	6	247088	247093	0 %	50 %	50 %	0 %	194097887
5590	NC_011035	T	8	8	247199	247206	0 %	100 %	0 %	0 %	194097887
5591	NC_011035	T	8	8	247226	247233	0 %	100 %	0 %	0 %	194097887
5592	NC_011035	CAAT	2	8	247356	247363	50 %	25 %	0 %	25 %	194097887
5593	NC_011035	CGCGTT	2	12	247396	247407	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194097887
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5595	NC_011035	TA	3	6	247471	247476	50 %	50 %	0 %	0 %	194097887
5596	NC_011035	TTTC	2	8	247489	247496	0 %	75 %	0 %	25 %	194097887
5597	NC_011035	TAAG	2	8	247551	247558	50 %	25 %	25 %	0 %	194097887
5598	NC_011035	AT	3	6	247569	247574	50 %	50 %	0 %	0 %	194097887
5599	NC_011035	AAT	2	6	247579	247584	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	194097887
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5602	NC_011035	CTT	2	6	247827	247832	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	194097887
5603	NC_011035	TGCA	2	8	247840	247847	25 %	25 %	25 %	25 %	194097887
5604	NC_011035	CCCG	2	8	247910	247917	0 %	0 %	25 %	75 %	194097887
5605	NC_011035	A	6	6	247924	247929	100 %	0 %	0 %	0 %	194097887
5606	NC_011035	TAT	2	6	247961	247966	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	194097888
5607	NC_011035	TG	3	6	247974	247979	0 %	50 %	50 %	0 %	194097888
5608	NC_011035	CCCG	2	8	248041	248048	0 %	0 %	25 %	75 %	194097888
5609	NC_011035	CTG	2	6	248265	248270	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194097888
5610	NC_011035	CTTG	2	8	248328	248335	0 %	50 %	25 %	25 %	194097888
5611	NC_011035	TTGT	2	8	248408	248415	0 %	75 %	25 %	0 %	194097888
5612	NC_011035	GGA	2	6	248478	248483	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	194097888
5613	NC_011035	A	6	6	248507	248512	100 %	0 %	0 %	0 %	194097888
5614	NC_011035	GATA	2	8	248554	248561	50 %	25 %	25 %	0 %	194097888
5615	NC_011035	TGCT	2	8	248562	248569	0 %	50 %	25 %	25 %	194097888
5616	NC_011035	ATT	2	6	248579	248584	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	194097888
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5619	NC_011035	CAATC	2	10	248730	248739	40 %	20 %	0 %	40 %	194097889
5620	NC_011035	TTGCCT	2	12	248786	248797	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	194097889
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5622	NC_011035	GGT	2	6	248851	248856	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	194097889
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5624	NC_011035	CGC	2	6	248934	248939	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194097889
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5745	NC_011035	TCG	2	6	254116	254121	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194097892
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5990	NC_011035	AGGC	2	8	266376	266383	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
5991	NC_011035	T	8	8	266408	266415	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5993	NC_011035	CTT	2	6	266527	266532	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	194097905
5994	NC_011035	ATT	2	6	266533	266538	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	194097905
5995	NC_011035	CGG	3	9	266609	266617	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194097905
5996	NC_011035	CGT	2	6	266669	266674	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194097905
5997	NC_011035	TGG	2	6	266827	266832	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	194097905
5998	NC_011035	CGATTG	2	12	266858	266869	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	194097905
5999	NC_011035	CCGT	2	8	266893	266900	0 %	25 %	25 %	50 %	194097905
6000	NC_011035	GCA	2	6	266903	266908	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194097905

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