MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF plasmid pNTHE01

Total Repeats: 42

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_010715	TTTC	2	8	39	46	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
2	NC_010715	TAAA	2	8	73	80	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_010715	AATT	2	8	113	120	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_010715	TTTG	2	8	241	248	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
5	NC_010715	TCTT	2	8	413	420	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
6	NC_010715	TATT	2	8	475	482	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_010715	AAAT	2	8	984	991	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_010715	TAAA	2	8	1000	1007	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_010715	GTTT	2	8	1283	1290	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
10	NC_010715	ATTT	2	8	1450	1457	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_010715	TCTG	2	8	1764	1771	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
12	NC_010715	TTGA	2	8	1883	1890	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
13	NC_010715	AAAG	2	8	2397	2404	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
14	NC_010715	CTTC	2	8	4364	4371	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
15	NC_010715	CAAT	2	8	4441	4448	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
16	NC_010715	CTTT	2	8	5078	5085	0 %	75 %	0 %	25 %	188584628
17	NC_010715	CTTT	2	8	5178	5185	0 %	75 %	0 %	25 %	188584628
18	NC_010715	CATT	2	8	7487	7494	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
19	NC_010715	TTTG	2	8	7643	7650	0 %	75 %	25 %	0 %	188584632
20	NC_010715	TTTC	2	8	7943	7950	0 %	75 %	0 %	25 %	188584632
21	NC_010715	TTTC	2	8	8065	8072	0 %	75 %	0 %	25 %	188584632
22	NC_010715	TTTC	2	8	8401	8408	0 %	75 %	0 %	25 %	188584632
23	NC_010715	CATT	2	8	8421	8428	25 %	50 %	0 %	25 %	188584632
24	NC_010715	TCTT	2	8	8823	8830	0 %	75 %	0 %	25 %	188584632
25	NC_010715	CTAC	3	12	9724	9735	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
26	NC_010715	CTAA	2	8	10227	10234	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
27	NC_010715	CCAT	2	8	10623	10630	25 %	25 %	0 %	50 %	188584634
28	NC_010715	CAAC	2	8	10660	10667	50 %	0 %	0 %	50 %	188584634
29	NC_010715	TCAT	2	8	11474	11481	25 %	50 %	0 %	25 %	188584635
30	NC_010715	ATCA	2	8	11534	11541	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
31	NC_010715	TTGT	2	8	12881	12888	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
32	NC_010715	AGTT	2	8	13199	13206	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
33	NC_010715	ATTA	2	8	13495	13502	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_010715	TAAA	2	8	13903	13910	75 %	25 %	0 %	0 %	188584637
35	NC_010715	TTTC	2	8	14788	14795	0 %	75 %	0 %	25 %	188584639
36	NC_010715	TACT	2	8	15526	15533	25 %	50 %	0 %	25 %	188584640
37	NC_010715	CTTT	2	8	15709	15716	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
38	NC_010715	ATTT	2	8	15774	15781	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_010715	CAAA	2	8	16111	16118	75 %	0 %	0 %	25 %	188584641
40	NC_010715	ATAA	2	8	16127	16134	75 %	25 %	0 %	0 %	188584641
41	NC_010715	GTAT	2	8	16589	16596	25 %	50 %	25 %	0 %	188584641
42	NC_010715	TATT	2	8	17089	17096	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.