MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Nostoc punctiforme PCC 73102 chromosome

Total Repeats: 5367

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_010628	AAAAT	2	10	1745	1754	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_010628	CAACT	2	10	3186	3195	40 %	20 %	0 %	40 %	186680553
3	NC_010628	TAATC	2	10	3576	3585	40 %	40 %	0 %	20 %	186680553
4	NC_010628	ATTTC	2	10	4010	4019	20 %	60 %	0 %	20 %	186680553
5	NC_010628	GTAAA	2	10	4913	4922	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
6	NC_010628	AATCT	2	10	10769	10778	40 %	40 %	0 %	20 %	186680556
7	NC_010628	AACAG	2	10	11530	11539	60 %	0 %	20 %	20 %	186680556
8	NC_010628	CAAAT	2	10	12975	12984	60 %	20 %	0 %	20 %	186680556
9	NC_010628	AAAAG	2	10	15092	15101	80 %	0 %	20 %	0 %	186680558
10	NC_010628	TTTGC	2	10	15270	15279	0 %	60 %	20 %	20 %	186680558
11	NC_010628	GCTTG	2	10	16430	16439	0 %	40 %	40 %	20 %	186680559
12	NC_010628	TTCAG	2	10	18304	18313	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
13	NC_010628	GTCGA	2	10	19522	19531	20 %	20 %	40 %	20 %	186680561
14	NC_010628	TTTGG	2	10	21691	21700	0 %	60 %	40 %	0 %	186680562
15	NC_010628	GGGGA	2	10	23969	23978	20 %	0 %	80 %	0 %	186680563
16	NC_010628	AAAAT	2	10	25725	25734	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_010628	CAAAA	2	10	26297	26306	80 %	0 %	0 %	20 %	186680565
18	NC_010628	GTACT	2	10	27431	27440	20 %	40 %	20 %	20 %	186680566
19	NC_010628	TGCTT	2	10	28195	28204	0 %	60 %	20 %	20 %	186680567
20	NC_010628	ATGTG	2	10	29798	29807	20 %	40 %	40 %	0 %	186680567
21	NC_010628	GTAAT	2	10	29819	29828	40 %	40 %	20 %	0 %	186680567
22	NC_010628	TTTAG	2	10	30345	30354	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
23	NC_010628	CTTAT	2	10	31559	31568	20 %	60 %	0 %	20 %	186680569
24	NC_010628	TTAAT	2	10	32871	32880	40 %	60 %	0 %	0 %	186680570
25	NC_010628	AGAGA	2	10	33797	33806	60 %	0 %	40 %	0 %	186680570
26	NC_010628	TTATT	2	10	35838	35847	20 %	80 %	0 %	0 %	186680572
27	NC_010628	AAATT	2	10	36928	36937	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_010628	AGCGA	2	10	37207	37216	40 %	0 %	40 %	20 %	186680573
29	NC_010628	AATTG	2	10	37361	37370	40 %	40 %	20 %	0 %	186680573
30	NC_010628	ACCTA	2	10	39644	39653	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
31	NC_010628	TTCGG	2	10	40186	40195	0 %	40 %	40 %	20 %	186680575
32	NC_010628	TTCCC	2	10	45335	45344	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
33	NC_010628	CAAAA	2	10	47806	47815	80 %	0 %	0 %	20 %	186680579
34	NC_010628	ATCAA	2	10	48433	48442	60 %	20 %	0 %	20 %	186680580
35	NC_010628	TCGCT	2	10	50714	50723	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
36	NC_010628	AAATT	2	10	50747	50756	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_010628	TGGTT	2	10	51515	51524	0 %	60 %	40 %	0 %	186680582
38	NC_010628	AAAAG	2	10	51903	51912	80 %	0 %	20 %	0 %	186680582
39	NC_010628	AGGGT	2	10	52280	52289	20 %	20 %	60 %	0 %	186680582
40	NC_010628	AAACT	2	10	55236	55245	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
41	NC_010628	AAATC	2	10	56226	56235	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
42	NC_010628	AGATA	2	10	57350	57359	60 %	20 %	20 %	0 %	186680587
43	NC_010628	TTGTT	2	10	58320	58329	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
44	NC_010628	TTTGA	2	10	59165	59174	20 %	60 %	20 %	0 %	186680588
45	NC_010628	ATTTT	2	10	60941	60950	20 %	80 %	0 %	0 %	186680589
46	NC_010628	AATTA	2	10	61114	61123	60 %	40 %	0 %	0 %	186680589
47	NC_010628	AGAGG	2	10	61309	61318	40 %	0 %	60 %	0 %	186680589
48	NC_010628	ATCGC	2	10	62845	62854	20 %	20 %	20 %	40 %	186680590
49	NC_010628	TTGAG	2	10	67457	67466	20 %	40 %	40 %	0 %	186680591
50	NC_010628	ACATG	2	10	67997	68006	40 %	20 %	20 %	20 %	186680591
51	NC_010628	TTTTC	2	10	68211	68220	0 %	80 %	0 %	20 %	186680591
52	NC_010628	GTTGT	2	10	74077	74086	0 %	60 %	40 %	0 %	186680592
53	NC_010628	TATCT	2	10	74329	74338	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
54	NC_010628	TTTAA	2	10	74900	74909	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_010628	GTTAA	2	10	75041	75050	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
56	NC_010628	TAGTT	2	10	76277	76286	20 %	60 %	20 %	0 %	186680593
57	NC_010628	TCAAA	2	10	77663	77672	60 %	20 %	0 %	20 %	186680594
58	NC_010628	CTTAA	2	10	78272	78281	40 %	40 %	0 %	20 %	186680594
59	NC_010628	CTCCG	2	10	78602	78611	0 %	20 %	20 %	60 %	186680594
60	NC_010628	CAAGT	2	10	78804	78813	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
61	NC_010628	AACAA	2	10	78960	78969	80 %	0 %	0 %	20 %	186680595
62	NC_010628	AGAGG	2	10	81595	81604	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
63	NC_010628	ATTAT	2	10	83074	83083	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_010628	GTTAT	2	10	87568	87577	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
65	NC_010628	AAGAA	2	10	89285	89294	80 %	0 %	20 %	0 %	186680605
66	NC_010628	ATGCA	2	10	89448	89457	40 %	20 %	20 %	20 %	186680605
67	NC_010628	GGTTG	2	10	92468	92477	0 %	40 %	60 %	0 %	186680607
68	NC_010628	TGAAA	2	10	93696	93705	60 %	20 %	20 %	0 %	186680609
69	NC_010628	GTGCT	2	10	99642	99651	0 %	40 %	40 %	20 %	186680613
70	NC_010628	GATGG	2	10	100418	100427	20 %	20 %	60 %	0 %	186680613
71	NC_010628	GACTG	2	10	102744	102753	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
72	NC_010628	GTTTG	2	10	104454	104463	0 %	60 %	40 %	0 %	186680614
73	NC_010628	AGCAA	2	10	107399	107408	60 %	0 %	20 %	20 %	186680614
74	NC_010628	TAAAA	2	10	110937	110946	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_010628	AATAC	2	10	111832	111841	60 %	20 %	0 %	20 %	186680618
76	NC_010628	AAATA	2	10	112127	112136	80 %	20 %	0 %	0 %	186680619
77	NC_010628	ATCTT	2	10	112304	112313	20 %	60 %	0 %	20 %	186680619
78	NC_010628	AAACA	2	10	112971	112980	80 %	0 %	0 %	20 %	186680620
79	NC_010628	TCCTA	2	10	113155	113164	20 %	40 %	0 %	40 %	186680620
80	NC_010628	TATTT	2	10	113809	113818	20 %	80 %	0 %	0 %	186680620
81	NC_010628	TGCTT	2	10	114971	114980	0 %	60 %	20 %	20 %	186680622
82	NC_010628	GGTGA	2	10	116234	116243	20 %	20 %	60 %	0 %	186680623
83	NC_010628	CTCAA	2	10	118422	118431	40 %	20 %	0 %	40 %	186680625
84	NC_010628	CCAAA	2	10	118504	118513	60 %	0 %	0 %	40 %	186680625
85	NC_010628	TGGCA	2	10	118879	118888	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
86	NC_010628	CTACC	2	10	120014	120023	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
87	NC_010628	GAAAT	2	10	121822	121831	60 %	20 %	20 %	0 %	186680628
88	NC_010628	TTAAA	2	10	122169	122178	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_010628	ACAGC	2	10	122550	122559	40 %	0 %	20 %	40 %	186680629
90	NC_010628	TGTGG	2	10	124162	124171	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
91	NC_010628	AAATA	2	10	125151	125160	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_010628	GAACA	2	10	125404	125413	60 %	0 %	20 %	20 %	186680630
93	NC_010628	TAAGG	2	10	128694	128703	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
94	NC_010628	CAAAG	2	10	130497	130506	60 %	0 %	20 %	20 %	186680634
95	NC_010628	CCTAG	2	10	133246	133255	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
96	NC_010628	AATTC	2	10	133305	133314	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
97	NC_010628	TTTCA	2	10	133846	133855	20 %	60 %	0 %	20 %	186680638
98	NC_010628	TGCAG	2	10	135295	135304	20 %	20 %	40 %	20 %	186680639
99	NC_010628	CAAAC	2	10	136480	136489	60 %	0 %	0 %	40 %	186680640
100	NC_010628	TTAAG	2	10	137512	137521	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
101	NC_010628	AGGAT	2	10	139222	139231	40 %	20 %	40 %	0 %	186680642
102	NC_010628	AAACC	2	10	144073	144082	60 %	0 %	0 %	40 %	186680646
103	NC_010628	TCCTT	2	10	147851	147860	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
104	NC_010628	CTAAA	2	10	148124	148133	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
105	NC_010628	ATTTT	2	10	148688	148697	20 %	80 %	0 %	0 %	186680650
106	NC_010628	ACCAC	2	10	149674	149683	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
107	NC_010628	GGTAC	2	10	152072	152081	20 %	20 %	40 %	20 %	186680652
108	NC_010628	AAGAT	2	10	153880	153889	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
109	NC_010628	TGATT	2	10	153916	153925	20 %	60 %	20 %	0 %	186680655
110	NC_010628	AAACT	2	10	158255	158264	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
111	NC_010628	TCAGT	2	10	158897	158906	20 %	40 %	20 %	20 %	186680659
112	NC_010628	GCAGC	2	10	160251	160260	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
113	NC_010628	ATTTT	2	10	160918	160927	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_010628	ACCTA	2	10	161430	161439	40 %	20 %	0 %	40 %	186680662
115	NC_010628	CCATT	2	10	162152	162161	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
116	NC_010628	TTGGA	2	10	170394	170403	20 %	40 %	40 %	0 %	186680669
117	NC_010628	AAGAT	2	10	170607	170616	60 %	20 %	20 %	0 %	186680669
118	NC_010628	AGAGG	2	10	173531	173540	40 %	0 %	60 %	0 %	186680670
119	NC_010628	CTCTT	2	10	173635	173644	0 %	60 %	0 %	40 %	186680671
120	NC_010628	GGCAT	2	10	176135	176144	20 %	20 %	40 %	20 %	186680673
121	NC_010628	ACTCA	2	10	178282	178291	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
122	NC_010628	GATAA	2	10	179352	179361	60 %	20 %	20 %	0 %	186680676
123	NC_010628	GTACT	2	10	181746	181755	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
124	NC_010628	GACAG	2	10	181932	181941	40 %	0 %	40 %	20 %	186680680
125	NC_010628	ATTTT	2	10	182585	182594	20 %	80 %	0 %	0 %	186680681
126	NC_010628	GAAAT	2	10	185208	185217	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
127	NC_010628	CCTAA	2	10	186646	186655	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
128	NC_010628	TCCCT	2	10	187179	187188	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
129	NC_010628	TGCTT	2	10	187407	187416	0 %	60 %	20 %	20 %	186680687
130	NC_010628	TAGTT	2	10	188888	188897	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
131	NC_010628	ATTTT	2	10	191283	191292	20 %	80 %	0 %	0 %	186680689
132	NC_010628	TCCTT	2	10	192461	192470	0 %	60 %	0 %	40 %	186680689
133	NC_010628	AATTG	2	10	192702	192711	40 %	40 %	20 %	0 %	186680689
134	NC_010628	AGACA	2	10	193956	193965	60 %	0 %	20 %	20 %	186680689
135	NC_010628	AGACA	2	10	194079	194088	60 %	0 %	20 %	20 %	186680689
136	NC_010628	TATTT	2	10	197205	197214	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_010628	TGATT	2	10	197312	197321	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
138	NC_010628	AAAAT	2	10	199646	199655	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_010628	TCAAT	2	10	200021	200030	40 %	40 %	0 %	20 %	186680696
140	NC_010628	AGGTA	2	10	202902	202911	40 %	20 %	40 %	0 %	186680698
141	NC_010628	ACTAA	2	10	205722	205731	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
142	NC_010628	TGCTT	2	10	207182	207191	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
143	NC_010628	CAATT	2	10	209780	209789	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
144	NC_010628	ACTGC	2	10	210211	210220	20 %	20 %	20 %	40 %	186680703
145	NC_010628	AGCAT	2	10	212226	212235	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
146	NC_010628	ATAAC	2	10	212694	212703	60 %	20 %	0 %	20 %	186680706
147	NC_010628	AGCCC	2	10	215393	215402	20 %	0 %	20 %	60 %	186680708
148	NC_010628	CCAAA	2	10	218110	218119	60 %	0 %	0 %	40 %	186680710
149	NC_010628	CTGAG	2	10	224944	224953	20 %	20 %	40 %	20 %	186680716
150	NC_010628	TAAAA	2	10	225528	225537	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
151	NC_010628	AACCG	2	10	226071	226080	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
152	NC_010628	AATAT	2	10	226177	226186	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
153	NC_010628	ACTGA	2	10	226638	226647	40 %	20 %	20 %	20 %	186680717
154	NC_010628	GCGAG	2	10	226820	226829	20 %	0 %	60 %	20 %	186680717
155	NC_010628	AGCAA	2	10	227933	227942	60 %	0 %	20 %	20 %	186680717
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158	NC_010628	TGCTT	2	10	232820	232829	0 %	60 %	20 %	20 %	186680723
159	NC_010628	CAATA	2	10	233612	233621	60 %	20 %	0 %	20 %	186680724
160	NC_010628	AGTGA	2	10	237435	237444	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
161	NC_010628	TGTTA	2	10	239777	239786	20 %	60 %	20 %	0 %	186680727
162	NC_010628	AAGTA	2	10	239862	239871	60 %	20 %	20 %	0 %	186680727
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168	NC_010628	ATTTT	2	10	247101	247110	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
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171	NC_010628	AAGTA	2	10	249266	249275	60 %	20 %	20 %	0 %	186680734
172	NC_010628	GGATT	2	10	249692	249701	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
173	NC_010628	TGTGA	2	10	251951	251960	20 %	40 %	40 %	0 %	186680736
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175	NC_010628	TGGGG	2	10	256686	256695	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
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178	NC_010628	ATCTA	2	10	259928	259937	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
179	NC_010628	GCTGG	2	10	260629	260638	0 %	20 %	60 %	20 %	186680742
180	NC_010628	GAAAT	2	10	261637	261646	60 %	20 %	20 %	0 %	186680742
181	NC_010628	TAATT	2	10	262929	262938	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
182	NC_010628	GTTAG	2	10	263960	263969	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
183	NC_010628	ATTGA	2	10	264385	264394	40 %	40 %	20 %	0 %	186680745
184	NC_010628	TGTGT	2	10	265124	265133	0 %	60 %	40 %	0 %	186680745
185	NC_010628	TGTGC	2	10	265173	265182	0 %	40 %	40 %	20 %	186680745
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194	NC_010628	TGAAT	2	10	274371	274380	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
195	NC_010628	TACCC	2	10	274414	274423	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
196	NC_010628	TGCAA	2	10	276217	276226	40 %	20 %	20 %	20 %	186680755
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198	NC_010628	AAATA	2	10	277950	277959	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
199	NC_010628	CTCAT	2	10	280867	280876	20 %	40 %	0 %	40 %	186680757
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202	NC_010628	AAACT	2	10	282579	282588	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
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210	NC_010628	TAAAA	2	10	288827	288836	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
211	NC_010628	TTGGT	2	10	290497	290506	0 %	60 %	40 %	0 %	186680763
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219	NC_010628	TAAGT	2	10	300625	300634	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
220	NC_010628	TTTGC	2	10	304228	304237	0 %	60 %	20 %	20 %	186680772
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223	NC_010628	CAGAG	2	10	305307	305316	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
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239	NC_010628	TAGTT	2	10	319713	319722	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
240	NC_010628	TGCTT	2	10	321007	321016	0 %	60 %	20 %	20 %	186680787
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242	NC_010628	ATAGC	2	10	322380	322389	40 %	20 %	20 %	20 %	186680788
243	NC_010628	AGTTT	2	10	323417	323426	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
244	NC_010628	GAAAT	2	10	324088	324097	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
245	NC_010628	AAGTA	2	10	325059	325068	60 %	20 %	20 %	0 %	186680789
246	NC_010628	ATTAT	2	10	329322	329331	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
247	NC_010628	GTTTG	2	10	329787	329796	0 %	60 %	40 %	0 %	186680792
248	NC_010628	ATTTT	2	10	329996	330005	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
249	NC_010628	CGAAT	2	10	330728	330737	40 %	20 %	20 %	20 %	186680793
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251	NC_010628	GATTT	2	10	331987	331996	20 %	60 %	20 %	0 %	186680795
252	NC_010628	ATAAA	2	10	334553	334562	80 %	20 %	0 %	0 %	186680796
253	NC_010628	TTTCC	2	10	336093	336102	0 %	60 %	0 %	40 %	186680797
254	NC_010628	TTTCC	2	10	336213	336222	0 %	60 %	0 %	40 %	186680797
255	NC_010628	TGCTG	2	10	340508	340517	0 %	40 %	40 %	20 %	186680801
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257	NC_010628	TGGGG	2	10	343975	343984	0 %	20 %	80 %	0 %	186680804
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259	NC_010628	TAATA	2	10	347334	347343	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
260	NC_010628	TCTGT	2	10	350446	350455	0 %	60 %	20 %	20 %	186680812
261	NC_010628	GATTG	2	10	351290	351299	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
262	NC_010628	CATCG	2	10	356486	356495	20 %	20 %	20 %	40 %	186680817
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264	NC_010628	ATCAA	2	10	359196	359205	60 %	20 %	0 %	20 %	186680819
265	NC_010628	AAAGC	2	10	359835	359844	60 %	0 %	20 %	20 %	186680819
266	NC_010628	ATGCA	2	10	362590	362599	40 %	20 %	20 %	20 %	186680821
267	NC_010628	ATATC	2	10	364220	364229	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
268	NC_010628	ATGGG	2	10	365427	365436	20 %	20 %	60 %	0 %	186680824
269	NC_010628	GCTTG	2	10	366155	366164	0 %	40 %	40 %	20 %	186680824
270	NC_010628	TTTGT	2	10	367370	367379	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
271	NC_010628	CGTTA	2	10	369513	369522	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
272	NC_010628	CGCCC	2	10	370382	370391	0 %	0 %	20 %	80 %	186680827
273	NC_010628	TCAAA	2	10	371434	371443	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
274	NC_010628	TCTAT	2	10	371975	371984	20 %	60 %	0 %	20 %	186680828
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405	NC_010628	TTCTT	2	10	571553	571562	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
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