MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Neisseria meningitidis 053442 chromosome

Total Repeats: 1555

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_010120	TCAAA	2	10	1430	1439	60 %	20 %	0 %	20 %	161869021
2	NC_010120	GCCCA	2	10	1486	1495	20 %	0 %	20 %	60 %	161869021
3	NC_010120	CCAGC	2	10	4695	4704	20 %	0 %	20 %	60 %	161869025
4	NC_010120	AAGGC	2	10	6004	6013	40 %	0 %	40 %	20 %	161869027
5	NC_010120	GAATG	2	10	6114	6123	40 %	20 %	40 %	0 %	161869027
6	NC_010120	GCTTT	2	10	6365	6374	0 %	60 %	20 %	20 %	161869028
7	NC_010120	GGTGC	2	10	8286	8295	0 %	20 %	60 %	20 %	161869029
8	NC_010120	TACCG	2	10	9564	9573	20 %	20 %	20 %	40 %	161869030
9	NC_010120	TCAAT	2	10	10477	10486	40 %	40 %	0 %	20 %	161869031
10	NC_010120	CCCGT	2	10	11511	11520	0 %	20 %	20 %	60 %	161869032
11	NC_010120	TCCCG	2	10	12660	12669	0 %	20 %	20 %	60 %	161869033
12	NC_010120	TGTCG	2	10	14116	14125	0 %	40 %	40 %	20 %	161869034
13	NC_010120	ATTTA	2	10	14463	14472	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_010120	AGGGC	2	10	25243	25252	20 %	0 %	60 %	20 %	161869048
15	NC_010120	GGCGC	2	10	25523	25532	0 %	0 %	60 %	40 %	161869049
16	NC_010120	AAACC	2	10	25946	25955	60 %	0 %	0 %	40 %	161869049
17	NC_010120	CAAAC	2	10	27912	27921	60 %	0 %	0 %	40 %	161869050
18	NC_010120	TCCGC	2	10	29246	29255	0 %	20 %	20 %	60 %	161869051
19	NC_010120	GCCTT	2	10	32082	32091	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
20	NC_010120	CATTC	2	10	33834	33843	20 %	40 %	0 %	40 %	161869055
21	NC_010120	AGGTG	2	10	34282	34291	20 %	20 %	60 %	0 %	161869056
22	NC_010120	GTCGG	2	10	34971	34980	0 %	20 %	60 %	20 %	161869056
23	NC_010120	GGGCT	2	10	36946	36955	0 %	20 %	60 %	20 %	161869059
24	NC_010120	GGCGG	2	10	40444	40453	0 %	0 %	80 %	20 %	161869062
25	NC_010120	GCGGT	2	10	40919	40928	0 %	20 %	60 %	20 %	161869063
26	NC_010120	GCGCG	2	10	41316	41325	0 %	0 %	60 %	40 %	161869063
27	NC_010120	ACGGC	2	10	41861	41870	20 %	0 %	40 %	40 %	161869063
28	NC_010120	CCCGT	2	10	44073	44082	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
29	NC_010120	CGGCG	2	10	44411	44420	0 %	0 %	60 %	40 %	161869066
30	NC_010120	TTTGA	2	10	46395	46404	20 %	60 %	20 %	0 %	161869066
31	NC_010120	GGGCA	2	10	46617	46626	20 %	0 %	60 %	20 %	161869066
32	NC_010120	GAAAA	2	10	47058	47067	80 %	0 %	20 %	0 %	161869066
33	NC_010120	CAATT	2	10	47401	47410	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
34	NC_010120	GTTGG	2	10	49629	49638	0 %	40 %	60 %	0 %	161869067
35	NC_010120	AAACC	2	10	51851	51860	60 %	0 %	0 %	40 %	161869068
36	NC_010120	CCCGC	2	10	52348	52357	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
37	NC_010120	GTGCG	2	10	54202	54211	0 %	20 %	60 %	20 %	161869070
38	NC_010120	GTAGC	2	10	57376	57385	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
39	NC_010120	TCGTG	2	10	57593	57602	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
40	NC_010120	AGAAA	2	10	58555	58564	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
41	NC_010120	GGGAG	2	10	59219	59228	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
42	NC_010120	AGGTT	2	10	60161	60170	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
43	NC_010120	ATTTT	2	10	62575	62584	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_010120	TGCCG	2	10	64627	64636	0 %	20 %	40 %	40 %	161869079
45	NC_010120	TGGCT	2	10	64956	64965	0 %	40 %	40 %	20 %	161869079
46	NC_010120	TGCCC	2	10	65563	65572	0 %	20 %	20 %	60 %	161869079
47	NC_010120	TCTTT	2	10	67456	67465	0 %	80 %	0 %	20 %	161869081
48	NC_010120	TCGGC	2	10	69439	69448	0 %	20 %	40 %	40 %	161869083
49	NC_010120	TGCTA	2	10	70848	70857	20 %	40 %	20 %	20 %	161869084
50	NC_010120	ACATA	2	10	73616	73625	60 %	20 %	0 %	20 %	161869086
51	NC_010120	AAGCA	2	10	74590	74599	60 %	0 %	20 %	20 %	161869087
52	NC_010120	TTTAA	2	10	74840	74849	40 %	60 %	0 %	0 %	161869087
53	NC_010120	GATTT	2	10	76753	76762	20 %	60 %	20 %	0 %	161869089
54	NC_010120	TGTAT	2	10	78160	78169	20 %	60 %	20 %	0 %	161869090
55	NC_010120	AAAAG	2	10	78344	78353	80 %	0 %	20 %	0 %	161869091
56	NC_010120	TTTGA	2	10	78967	78976	20 %	60 %	20 %	0 %	161869091
57	NC_010120	TGGCT	2	10	79900	79909	0 %	40 %	40 %	20 %	161869092
58	NC_010120	GCAAG	2	10	81181	81190	40 %	0 %	40 %	20 %	161869094
59	NC_010120	GCGCG	2	10	82240	82249	0 %	0 %	60 %	40 %	161869094
60	NC_010120	CAACG	2	10	83162	83171	40 %	0 %	20 %	40 %	161869094
61	NC_010120	TTGAT	2	10	83475	83484	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
62	NC_010120	TTTCC	2	10	83796	83805	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
63	NC_010120	ATTTT	2	10	84145	84154	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_010120	CCCGT	2	10	89392	89401	0 %	20 %	20 %	60 %	161869100
65	NC_010120	CCGTA	2	10	89629	89638	20 %	20 %	20 %	40 %	161869100
66	NC_010120	ACATC	2	10	90530	90539	40 %	20 %	0 %	40 %	161869101
67	NC_010120	GGCAA	2	10	91785	91794	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
68	NC_010120	CGCAA	2	10	92239	92248	40 %	0 %	20 %	40 %	161869102
69	NC_010120	CAAGC	2	10	92604	92613	40 %	0 %	20 %	40 %	161869102
70	NC_010120	GATAT	2	10	96642	96651	40 %	40 %	20 %	0 %	161869107
71	NC_010120	GGCAA	2	10	97960	97969	40 %	0 %	40 %	20 %	161869107
72	NC_010120	AAACC	2	10	98948	98957	60 %	0 %	0 %	40 %	161869108
73	NC_010120	TTCAA	2	10	99358	99367	40 %	40 %	0 %	20 %	161869108
74	NC_010120	GTCGG	2	10	100630	100639	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
75	NC_010120	GAACA	2	10	103792	103801	60 %	0 %	20 %	20 %	161869111
76	NC_010120	TCCGC	2	10	105380	105389	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
77	NC_010120	GGCGG	2	10	106456	106465	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
78	NC_010120	TGCCG	2	10	106821	106830	0 %	20 %	40 %	40 %	161869113
79	NC_010120	TGGCT	2	10	107507	107516	0 %	40 %	40 %	20 %	161869114
80	NC_010120	ACCGA	2	10	108298	108307	40 %	0 %	20 %	40 %	161869114
81	NC_010120	AGGCA	2	10	110061	110070	40 %	0 %	40 %	20 %	161869116
82	NC_010120	AAATA	2	10	110261	110270	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_010120	CGGCG	2	10	113539	113548	0 %	0 %	60 %	40 %	161869119
84	NC_010120	CGGGC	2	10	115472	115481	0 %	0 %	60 %	40 %	161869120
85	NC_010120	AGGAG	2	10	119346	119355	40 %	0 %	60 %	0 %	161869124
86	NC_010120	TCGAT	2	10	120021	120030	20 %	40 %	20 %	20 %	161869125
87	NC_010120	CCCGC	2	10	120468	120477	0 %	0 %	20 %	80 %	161869125
88	NC_010120	CGGGG	2	10	121819	121828	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
89	NC_010120	AATCC	2	10	124057	124066	40 %	20 %	0 %	40 %	161869129
90	NC_010120	CAGGA	2	10	124172	124181	40 %	0 %	40 %	20 %	161869129
91	NC_010120	AGGGC	2	10	125414	125423	20 %	0 %	60 %	20 %	161869131
92	NC_010120	TCCGT	2	10	126895	126904	0 %	40 %	20 %	40 %	161869130
93	NC_010120	TTTCC	2	10	128715	128724	0 %	60 %	0 %	40 %	161869132
94	NC_010120	GAACA	2	10	129866	129875	60 %	0 %	20 %	20 %	161869133
95	NC_010120	TTTGC	2	10	131822	131831	0 %	60 %	20 %	20 %	161869137
96	NC_010120	CGGCG	2	10	131967	131976	0 %	0 %	60 %	40 %	161869137
97	NC_010120	GTTTT	2	10	132161	132170	0 %	80 %	20 %	0 %	161869137
98	NC_010120	CGATA	2	10	132242	132251	40 %	20 %	20 %	20 %	161869137
99	NC_010120	GGCAA	2	10	133833	133842	40 %	0 %	40 %	20 %	161869139
100	NC_010120	CAAAC	2	10	134238	134247	60 %	0 %	0 %	40 %	161869140
101	NC_010120	AGCAA	2	10	134252	134261	60 %	0 %	20 %	20 %	161869140
102	NC_010120	GGTAT	2	10	135145	135154	20 %	40 %	40 %	0 %	161869140
103	NC_010120	TGCCG	2	10	140411	140420	0 %	20 %	40 %	40 %	161869145
104	NC_010120	GGCAG	2	10	141421	141430	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
105	NC_010120	GGGCA	2	10	142187	142196	20 %	0 %	60 %	20 %	161869148
106	NC_010120	GTTCA	2	10	145725	145734	20 %	40 %	20 %	20 %	161869150
107	NC_010120	CAAAA	2	10	146763	146772	80 %	0 %	0 %	20 %	161869151
108	NC_010120	ACGGC	2	10	148703	148712	20 %	0 %	40 %	40 %	161869152
109	NC_010120	GTTAC	2	10	148721	148730	20 %	40 %	20 %	20 %	161869152
110	NC_010120	TAATG	2	10	150802	150811	40 %	40 %	20 %	0 %	161869153
111	NC_010120	CTTTG	2	10	151016	151025	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
112	NC_010120	CGCGG	2	10	152648	152657	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
113	NC_010120	GGCGG	2	10	153392	153401	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
114	NC_010120	AACAT	2	10	155142	155151	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
115	NC_010120	TAATT	2	10	155163	155172	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_010120	GAATT	2	10	155193	155202	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
117	NC_010120	GAAAA	2	10	156162	156171	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
118	NC_010120	CATTT	2	10	156336	156345	20 %	60 %	0 %	20 %	161869159
119	NC_010120	TCAAC	2	10	157684	157693	40 %	20 %	0 %	40 %	161869161
120	NC_010120	AACCT	2	10	157750	157759	40 %	20 %	0 %	40 %	161869161
121	NC_010120	TGAAA	2	10	165766	165775	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
122	NC_010120	GGCGT	2	10	166257	166266	0 %	20 %	60 %	20 %	161869168
123	NC_010120	AGGCG	2	10	167327	167336	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
124	NC_010120	TGCGG	2	10	167453	167462	0 %	20 %	60 %	20 %	161869170
125	NC_010120	TTGGG	2	10	168017	168026	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
126	NC_010120	GGGAT	2	10	168035	168044	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
127	NC_010120	GCGCC	2	10	171775	171784	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
128	NC_010120	GGCGC	3	15	172075	172089	0 %	0 %	60 %	40 %	161869172
129	NC_010120	TGGCG	2	10	176149	176158	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
130	NC_010120	CGCGG	2	10	179424	179433	0 %	0 %	60 %	40 %	229597122
131	NC_010120	CCGCG	2	10	181086	181095	0 %	0 %	40 %	60 %	161869183
132	NC_010120	GTAGC	2	10	183462	183471	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
133	NC_010120	TCGTG	2	10	183679	183688	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
134	NC_010120	AGAAA	2	10	184641	184650	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
135	NC_010120	GGGAG	2	10	185305	185314	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
136	NC_010120	AGGTT	2	10	186247	186256	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
137	NC_010120	AAGTA	2	10	188495	188504	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
138	NC_010120	GTTTT	2	10	189178	189187	0 %	80 %	20 %	0 %	161869187
139	NC_010120	GGTTG	2	10	193874	193883	0 %	40 %	60 %	0 %	161869191
140	NC_010120	CAACC	2	10	193927	193936	40 %	0 %	0 %	60 %	161869191
141	NC_010120	AAGTG	2	10	197479	197488	40 %	20 %	40 %	0 %	161869193
142	NC_010120	CGGCA	2	10	203154	203163	20 %	0 %	40 %	40 %	161869197
143	NC_010120	GCGCG	2	10	204224	204233	0 %	0 %	60 %	40 %	161869201
144	NC_010120	GGGCG	2	10	204805	204814	0 %	0 %	80 %	20 %	161869201
145	NC_010120	ACCGT	2	10	205384	205393	20 %	20 %	20 %	40 %	161869202
146	NC_010120	GCTTG	2	10	208026	208035	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
147	NC_010120	TGCGG	2	10	210602	210611	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
148	NC_010120	TATAT	2	10	212457	212466	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
149	NC_010120	GCGCG	2	10	213520	213529	0 %	0 %	60 %	40 %	161869205
150	NC_010120	CGGCG	2	10	214223	214232	0 %	0 %	60 %	40 %	161869205
151	NC_010120	CCGCG	2	10	215854	215863	0 %	0 %	40 %	60 %	161869205
152	NC_010120	GCCGC	2	10	216066	216075	0 %	0 %	40 %	60 %	161869205
153	NC_010120	TGGAA	2	10	218232	218241	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
154	NC_010120	AGGAG	2	10	218899	218908	40 %	0 %	60 %	0 %	161869207
155	NC_010120	GCGCC	2	10	219657	219666	0 %	0 %	40 %	60 %	161869208
156	NC_010120	GTACG	2	10	225598	225607	20 %	20 %	40 %	20 %	161869212
157	NC_010120	CGGAT	2	10	228912	228921	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
158	NC_010120	CGGCG	2	10	229732	229741	0 %	0 %	60 %	40 %	161869216
159	NC_010120	TCATA	2	10	231825	231834	40 %	40 %	0 %	20 %	161869219
160	NC_010120	GCGCC	2	10	233967	233976	0 %	0 %	40 %	60 %	161869219
161	NC_010120	CCGGC	2	10	234477	234486	0 %	0 %	40 %	60 %	161869219
162	NC_010120	ACAAA	2	10	237086	237095	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
163	NC_010120	AATCC	2	10	237199	237208	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
164	NC_010120	TGATT	2	10	237648	237657	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
165	NC_010120	CAAAC	2	10	239325	239334	60 %	0 %	0 %	40 %	161869225
166	NC_010120	ACTAT	2	10	241162	241171	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
167	NC_010120	AAATT	2	10	241198	241207	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
168	NC_010120	TGCGG	2	10	241943	241952	0 %	20 %	60 %	20 %	161869227
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171	NC_010120	TGATA	2	10	246068	246077	40 %	40 %	20 %	0 %	161869230
172	NC_010120	GAAAA	2	10	248970	248979	80 %	0 %	20 %	0 %	161871031
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174	NC_010120	AAAAC	2	10	254404	254413	80 %	0 %	0 %	20 %	161869237
175	NC_010120	GCAAC	2	10	254832	254841	40 %	0 %	20 %	40 %	161869237
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179	NC_010120	TTGAT	2	10	256553	256562	20 %	60 %	20 %	0 %	161869238
180	NC_010120	TTTTC	2	10	258283	258292	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
181	NC_010120	ATTAT	2	10	261642	261651	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
182	NC_010120	TTTCA	2	10	264188	264197	20 %	60 %	0 %	20 %	161869240
183	NC_010120	TTGTT	2	10	264847	264856	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
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193	NC_010120	CGGCG	2	10	281665	281674	0 %	0 %	60 %	40 %	161869266
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199	NC_010120	TCCGT	2	10	287507	287516	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
200	NC_010120	GGAAG	2	10	288157	288166	40 %	0 %	60 %	0 %	161869276
201	NC_010120	ATGCA	2	10	288718	288727	40 %	20 %	20 %	20 %	161869277
202	NC_010120	GTTTG	2	10	292902	292911	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
203	NC_010120	TTTAT	2	10	293197	293206	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
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218	NC_010120	ATGGG	2	10	316885	316894	20 %	20 %	60 %	0 %	161869306
219	NC_010120	ATATT	2	10	321171	321180	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
220	NC_010120	CCGTC	2	10	322425	322434	0 %	20 %	20 %	60 %	161869312
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253	NC_010120	AATTG	2	10	376673	376682	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
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262	NC_010120	GGATA	2	10	385186	385195	40 %	20 %	40 %	0 %	161869375
263	NC_010120	AAAAT	2	10	388568	388577	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
264	NC_010120	TGCCT	2	10	389951	389960	0 %	40 %	20 %	40 %	161869379
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269	NC_010120	CGCGG	2	10	393120	393129	0 %	0 %	60 %	40 %	161869381
270	NC_010120	CGGTG	2	10	397488	397497	0 %	20 %	60 %	20 %	161869383
271	NC_010120	AAACC	2	10	398518	398527	60 %	0 %	0 %	40 %	161869384
272	NC_010120	CAGGG	2	10	399009	399018	20 %	0 %	60 %	20 %	161869385
273	NC_010120	GTTTG	2	10	399481	399490	0 %	60 %	40 %	0 %	161869386
274	NC_010120	TTGCT	2	10	400551	400560	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
275	NC_010120	TGACC	2	10	400860	400869	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
276	NC_010120	TCAGT	2	10	401940	401949	20 %	40 %	20 %	20 %	161869388
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284	NC_010120	ACCGA	2	10	414201	414210	40 %	0 %	20 %	40 %	161869396
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286	NC_010120	ACGGC	2	10	421711	421720	20 %	0 %	40 %	40 %	161869402
287	NC_010120	GCGTT	2	10	424569	424578	0 %	40 %	40 %	20 %	161869404
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289	NC_010120	GTTTT	2	10	430846	430855	0 %	80 %	20 %	0 %	161869408
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291	NC_010120	TCGCG	2	10	432278	432287	0 %	20 %	40 %	40 %	161869409
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293	NC_010120	CGGTT	2	10	436394	436403	0 %	40 %	40 %	20 %	161869413
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306	NC_010120	CGGTA	2	10	455096	455105	20 %	20 %	40 %	20 %	161869429
307	NC_010120	GGCGT	2	10	456412	456421	0 %	20 %	60 %	20 %	161869430
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366	NC_010120	GCAGA	2	10	543202	543211	40 %	0 %	40 %	20 %	161869509
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370	NC_010120	GCGAC	2	10	544998	545007	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
371	NC_010120	GCCTT	2	10	546363	546372	0 %	40 %	20 %	40 %	161869511
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389	NC_010120	CATGC	2	10	574697	574706	20 %	20 %	20 %	40 %	161869537
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391	NC_010120	TGCGG	2	10	575034	575043	0 %	20 %	60 %	20 %	161869537
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393	NC_010120	TTTCT	2	10	577102	577111	0 %	80 %	0 %	20 %	161869539
394	NC_010120	CATTG	2	10	577114	577123	20 %	40 %	20 %	20 %	161869539
395	NC_010120	TGCCG	2	10	578242	578251	0 %	20 %	40 %	40 %	161869540
396	NC_010120	TTTTC	2	10	579036	579045	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
397	NC_010120	GGCAA	3	15	579138	579152	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
398	NC_010120	TAATA	2	10	579205	579214	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
399	NC_010120	CCGTA	2	10	580580	580589	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
400	NC_010120	ACTGA	2	10	582985	582994	40 %	20 %	20 %	20 %	161869545
401	NC_010120	CGGCG	2	10	585429	585438	0 %	0 %	60 %	40 %	161869546
402	NC_010120	TTTTA	2	10	585645	585654	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
403	NC_010120	CGCGC	2	10	589593	589602	0 %	0 %	40 %	60 %	161869551
404	NC_010120	TCCAA	2	10	591438	591447	40 %	20 %	0 %	40 %	161869551
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