MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Neisseria meningitidis 053442 chromosome

Total Repeats: 46026

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_010120	T	6	6	161060	161065	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3502	NC_010120	T	6	6	161091	161096	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3503	NC_010120	ACA	2	6	161112	161117	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3504	NC_010120	A	6	6	161171	161176	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3505	NC_010120	TTTC	2	8	161188	161195	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
3506	NC_010120	CGA	2	6	161263	161268	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3507	NC_010120	TGT	2	6	161446	161451	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3508	NC_010120	ATCC	2	8	161489	161496	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
3509	NC_010120	CGA	2	6	161746	161751	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3510	NC_010120	TGT	2	6	161929	161934	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3511	NC_010120	ATCC	2	8	162178	162185	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
3512	NC_010120	CGA	2	6	162510	162515	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3513	NC_010120	TGT	2	6	162711	162716	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	161869164
3514	NC_010120	AGG	2	6	162886	162891	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	161869164
3515	NC_010120	TAC	2	6	162895	162900	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	161869164
3516	NC_010120	AGAT	2	8	162956	162963	50 %	25 %	25 %	0 %	161869164
3517	NC_010120	CCG	2	6	162965	162970	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	161869164
3518	NC_010120	TAC	2	6	162973	162978	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	161869164
3519	NC_010120	A	8	8	163016	163023	100 %	0 %	0 %	0 %	161869165
3520	NC_010120	ATA	2	6	163096	163101	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	161869165
3521	NC_010120	AAT	2	6	163153	163158	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	161869165
3522	NC_010120	TAA	2	6	163241	163246	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3523	NC_010120	TTA	2	6	163252	163257	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3524	NC_010120	TGA	2	6	163261	163266	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3525	NC_010120	GAT	2	6	163364	163369	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	161869166
3526	NC_010120	CGG	2	6	163427	163432	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	161869166
3527	NC_010120	GGC	2	6	163441	163446	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	161869166
3528	NC_010120	GCG	2	6	163464	163469	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	161869166
3529	NC_010120	CTGCCG	2	12	163488	163499	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	161869166
3530	NC_010120	GC	3	6	163510	163515	0 %	0 %	50 %	50 %	161869166
3531	NC_010120	ATG	2	6	163518	163523	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	161869166
3532	NC_010120	CGG	2	6	163639	163644	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	161869166
3533	NC_010120	GGC	2	6	163682	163687	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	161869166
3534	NC_010120	G	6	6	163750	163755	0 %	0 %	100 %	0 %	161869166
3535	NC_010120	ACGG	2	8	163757	163764	25 %	0 %	50 %	25 %	161869166
3536	NC_010120	CCGT	2	8	163793	163800	0 %	25 %	25 %	50 %	161869166
3537	NC_010120	CGC	2	6	163882	163887	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	161869166
3538	NC_010120	CGGA	2	8	163904	163911	25 %	0 %	50 %	25 %	161869166
3539	NC_010120	CGG	2	6	163912	163917	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	161869166
3540	NC_010120	GGT	2	6	163979	163984	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	161869166
3541	NC_010120	GCC	2	6	164028	164033	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	161869166
3542	NC_010120	CGGT	2	8	164038	164045	0 %	25 %	50 %	25 %	161869166
3543	NC_010120	CAT	2	6	164086	164091	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	161869166
3544	NC_010120	GTT	2	6	164113	164118	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	161869166
3545	NC_010120	GCG	2	6	164213	164218	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3546	NC_010120	G	7	7	164233	164239	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
3547	NC_010120	TCG	2	6	164471	164476	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3548	NC_010120	AAC	2	6	164640	164645	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3549	NC_010120	ATGG	2	8	164749	164756	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
3550	NC_010120	GGAT	2	8	164911	164918	25 %	25 %	50 %	0 %	161869167
3551	NC_010120	A	6	6	164990	164995	100 %	0 %	0 %	0 %	161869167
3552	NC_010120	ATGG	2	8	165088	165095	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
3553	NC_010120	A	6	6	165169	165174	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3554	NC_010120	AAC	2	6	165258	165263	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3555	NC_010120	ATGG	2	8	165367	165374	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
3556	NC_010120	A	6	6	165448	165453	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3557	NC_010120	CGG	2	6	165535	165540	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3558	NC_010120	GCG	2	6	165555	165560	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3559	NC_010120	CCG	2	6	165615	165620	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3560	NC_010120	A	7	7	165637	165643	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3561	NC_010120	CGGG	2	8	165735	165742	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
3562	NC_010120	TGAAA	2	10	165766	165775	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
3563	NC_010120	GCC	2	6	165795	165800	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3564	NC_010120	CGG	2	6	165815	165820	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3565	NC_010120	CGGG	2	8	165844	165851	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
3566	NC_010120	TGC	2	6	165918	165923	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3567	NC_010120	GAG	2	6	165943	165948	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3568	NC_010120	TGCC	2	8	165964	165971	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
3569	NC_010120	GCG	2	6	166053	166058	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	161869168
3570	NC_010120	GCC	2	6	166157	166162	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	161869168
3571	NC_010120	GAG	3	9	166225	166233	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	161869168
3572	NC_010120	TG	3	6	166246	166251	0 %	50 %	50 %	0 %	161869168
3573	NC_010120	GGCGT	2	10	166257	166266	0 %	20 %	60 %	20 %	161869168
3574	NC_010120	GCA	2	6	166316	166321	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	161869168
3575	NC_010120	CAG	2	6	166374	166379	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	161869168
3576	NC_010120	GGAT	2	8	166430	166437	25 %	25 %	50 %	0 %	161869168
3577	NC_010120	GCG	3	9	166463	166471	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	161869168
3578	NC_010120	CAGC	2	8	166515	166522	25 %	0 %	25 %	50 %	161869168
3579	NC_010120	CGGAGA	2	12	166532	166543	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	161869168
3580	NC_010120	TG	3	6	166573	166578	0 %	50 %	50 %	0 %	161869168
3581	NC_010120	CGG	2	6	166580	166585	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	161869168
3582	NC_010120	GGC	2	6	166694	166699	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	161869169
3583	NC_010120	GCT	2	6	166726	166731	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	161869169
3584	NC_010120	TGCG	2	8	166784	166791	0 %	25 %	50 %	25 %	161869169
3585	NC_010120	GAC	2	6	166808	166813	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	161869169
3586	NC_010120	CGC	2	6	166861	166866	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	161869169
3587	NC_010120	GC	4	8	166913	166920	0 %	0 %	50 %	50 %	161869169
3588	NC_010120	GC	3	6	167003	167008	0 %	0 %	50 %	50 %	161869169
3589	NC_010120	GCT	2	6	167026	167031	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	161869169
3590	NC_010120	CGG	2	6	167043	167048	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	161869169
3591	NC_010120	TTG	2	6	167049	167054	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	161869169
3592	NC_010120	AAC	2	6	167112	167117	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	161869169
3593	NC_010120	GCG	2	6	167140	167145	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	161869169
3594	NC_010120	CGG	2	6	167203	167208	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	161869169
3595	NC_010120	GAT	2	6	167234	167239	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	161869169
3596	NC_010120	CGA	2	6	167254	167259	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	161869169
3597	NC_010120	AGGCG	2	10	167327	167336	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
3598	NC_010120	AGC	2	6	167337	167342	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3599	NC_010120	GAT	2	6	167402	167407	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3600	NC_010120	TGCGG	2	10	167453	167462	0 %	20 %	60 %	20 %	161869170
3601	NC_010120	ATG	2	6	167474	167479	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	161869170
3602	NC_010120	TG	4	8	167513	167520	0 %	50 %	50 %	0 %	161869170
3603	NC_010120	T	7	7	167553	167559	0 %	100 %	0 %	0 %	161869170
3604	NC_010120	GCC	2	6	167590	167595	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	161869170
3605	NC_010120	GCAGCC	2	12	167710	167721	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	161869170
3606	NC_010120	CGC	2	6	167763	167768	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	161869170
3607	NC_010120	GACG	2	8	167775	167782	25 %	0 %	50 %	25 %	161869170
3608	NC_010120	GCAT	2	8	167798	167805	25 %	25 %	25 %	25 %	161869170
3609	NC_010120	TTGG	2	8	167851	167858	0 %	50 %	50 %	0 %	161869170
3610	NC_010120	GCCT	2	8	167878	167885	0 %	25 %	25 %	50 %	161869170
3611	NC_010120	TGC	2	6	167910	167915	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	161869170
3612	NC_010120	TGAT	2	8	167966	167973	25 %	50 %	25 %	0 %	161869170
3613	NC_010120	ATG	2	6	167993	167998	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	161869170
3614	NC_010120	TTGGG	2	10	168017	168026	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
3615	NC_010120	GGGAT	2	10	168035	168044	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
3616	NC_010120	T	6	6	168169	168174	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3617	NC_010120	T	6	6	168282	168287	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3618	NC_010120	C	11	11	168327	168337	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
3619	NC_010120	ATC	2	6	168343	168348	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3620	NC_010120	TAA	2	6	168357	168362	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3621	NC_010120	CCA	3	9	168410	168418	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3622	NC_010120	ATA	2	6	168419	168424	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3623	NC_010120	ATG	2	6	168432	168437	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3624	NC_010120	AT	3	6	168438	168443	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3625	NC_010120	TC	3	6	168468	168473	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3626	NC_010120	A	6	6	168481	168486	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3627	NC_010120	ATC	2	6	168493	168498	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3628	NC_010120	AAT	2	6	168507	168512	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3629	NC_010120	T	6	6	168532	168537	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3631	NC_010120	AAT	2	6	168633	168638	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3754	NC_010120	ATGG	2	8	175160	175167	25 %	25 %	50 %	0 %	161869175
3755	NC_010120	TGA	2	6	175213	175218	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	161869175
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3772	NC_010120	CGG	2	6	175938	175943	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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3774	NC_010120	CTG	2	6	176079	176084	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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3998	NC_010120	TCT	2	6	186316	186321	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3999	NC_010120	GAC	2	6	186336	186341	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4000	NC_010120	GA	3	6	186464	186469	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding

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