MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Neisseria meningitidis 053442 chromosome

Total Repeats: 46026

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_010120	CGG	2	6	46865	46870	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	161869066
1002	NC_010120	GC	4	8	46888	46895	0 %	0 %	50 %	50 %	161869066
1003	NC_010120	GCCG	2	8	46904	46911	0 %	0 %	50 %	50 %	161869066
1004	NC_010120	ATCC	2	8	46964	46971	25 %	25 %	0 %	50 %	161869066
1005	NC_010120	GAAAA	2	10	47058	47067	80 %	0 %	20 %	0 %	161869066
1006	NC_010120	CAA	2	6	47080	47085	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	161869066
1007	NC_010120	GCGG	2	8	47100	47107	0 %	0 %	75 %	25 %	161869066
1008	NC_010120	A	6	6	47130	47135	100 %	0 %	0 %	0 %	161869066
1009	NC_010120	CCCG	2	8	47136	47143	0 %	0 %	25 %	75 %	161869066
1010	NC_010120	CTG	2	6	47181	47186	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	161869066
1011	NC_010120	TCT	2	6	47257	47262	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	161869066
1012	NC_010120	T	6	6	47309	47314	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1013	NC_010120	CAATT	2	10	47401	47410	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
1014	NC_010120	CGG	2	6	47589	47594	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1015	NC_010120	CCCT	2	8	47628	47635	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
1016	NC_010120	AAC	2	6	47740	47745	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1017	NC_010120	ATG	2	6	47923	47928	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1018	NC_010120	A	6	6	47956	47961	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1019	NC_010120	GTC	2	6	47975	47980	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1020	NC_010120	A	6	6	48047	48052	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1021	NC_010120	ATG	2	6	48195	48200	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1022	NC_010120	A	6	6	48228	48233	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1023	NC_010120	CCG	2	6	48245	48250	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1024	NC_010120	AAC	2	6	48284	48289	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1025	NC_010120	A	6	6	48393	48398	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1026	NC_010120	CGAA	2	8	48463	48470	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
1027	NC_010120	GTG	2	6	48498	48503	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1028	NC_010120	GGAT	2	8	48517	48524	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
1029	NC_010120	AAC	2	6	48561	48566	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1030	NC_010120	CT	3	6	48724	48729	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1031	NC_010120	GTA	2	6	48798	48803	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	161869067
1032	NC_010120	GGA	3	9	48839	48847	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	161869067
1033	NC_010120	GCT	2	6	48864	48869	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	161869067
1034	NC_010120	CGC	2	6	48893	48898	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	161869067
1035	NC_010120	GTC	2	6	48924	48929	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	161869067
1036	NC_010120	GT	3	6	48967	48972	0 %	50 %	50 %	0 %	161869067
1037	NC_010120	CGG	2	6	48974	48979	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	161869067
1038	NC_010120	TTC	2	6	49014	49019	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	161869067
1039	NC_010120	GCT	2	6	49131	49136	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	161869067
1040	NC_010120	TGC	2	6	49151	49156	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	161869067
1041	NC_010120	GCG	2	6	49162	49167	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	161869067
1042	NC_010120	GT	3	6	49168	49173	0 %	50 %	50 %	0 %	161869067
1043	NC_010120	GCG	3	9	49182	49190	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	161869067
1044	NC_010120	CGT	2	6	49208	49213	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	161869067
1045	NC_010120	CGC	2	6	49223	49228	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	161869067
1046	NC_010120	T	6	6	49247	49252	0 %	100 %	0 %	0 %	161869067
1047	NC_010120	TGC	2	6	49268	49273	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	161869067
1048	NC_010120	GCG	2	6	49285	49290	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	161869067
1049	NC_010120	GCC	2	6	49339	49344	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	161869067
1050	NC_010120	GAT	2	6	49374	49379	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	161869067
1051	NC_010120	GGC	2	6	49392	49397	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	161869067
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1054	NC_010120	CGAG	2	8	49556	49563	25 %	0 %	50 %	25 %	161869067
1055	NC_010120	CGA	2	6	49565	49570	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	161869067
1056	NC_010120	TGG	2	6	49616	49621	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	161869067
1057	NC_010120	GTTGG	2	10	49629	49638	0 %	40 %	60 %	0 %	161869067
1058	NC_010120	AGT	2	6	49657	49662	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	161869067
1059	NC_010120	GAGGTT	2	12	49674	49685	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	161869067
1060	NC_010120	CGA	2	6	49694	49699	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	161869067
1061	NC_010120	GGC	3	9	49707	49715	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	161869067
1062	NC_010120	CGGA	2	8	49773	49780	25 %	0 %	50 %	25 %	161869067
1063	NC_010120	TGCC	2	8	49782	49789	0 %	25 %	25 %	50 %	161869067
1064	NC_010120	GCG	2	6	49819	49824	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	161869067
1065	NC_010120	CGG	2	6	49853	49858	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	161869067
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1070	NC_010120	GC	3	6	50035	50040	0 %	0 %	50 %	50 %	161869067
1071	NC_010120	GAT	2	6	50103	50108	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	161869067
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1073	NC_010120	AGT	2	6	50192	50197	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	161869067
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1083	NC_010120	GAG	2	6	50683	50688	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	161869067
1084	NC_010120	GAT	2	6	50712	50717	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	161869067
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1089	NC_010120	CGGATG	2	12	50946	50957	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	161869067
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1094	NC_010120	TGA	2	6	51146	51151	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	161869068
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1096	NC_010120	GGCG	2	8	51270	51277	0 %	0 %	75 %	25 %	161869068
1097	NC_010120	TGA	2	6	51281	51286	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	161869068
1098	NC_010120	CCG	2	6	51299	51304	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	161869068
1099	NC_010120	GAT	2	6	51345	51350	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	161869068
1100	NC_010120	GCG	2	6	51434	51439	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	161869068
1101	NC_010120	CTG	2	6	51514	51519	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	161869068
1102	NC_010120	CCG	2	6	51572	51577	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	161869068
1103	NC_010120	GCG	2	6	51627	51632	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	161869068
1104	NC_010120	TTG	2	6	51691	51696	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	161869068
1105	NC_010120	GTG	2	6	51721	51726	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	161869068
1106	NC_010120	CGA	2	6	51749	51754	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	161869068
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1108	NC_010120	CG	3	6	51767	51772	0 %	0 %	50 %	50 %	161869068
1109	NC_010120	AAACC	2	10	51851	51860	60 %	0 %	0 %	40 %	161869068
1110	NC_010120	AGT	2	6	51923	51928	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	161869068
1111	NC_010120	TCG	2	6	51974	51979	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	161869068
1112	NC_010120	GCG	2	6	51982	51987	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	161869068
1113	NC_010120	GGC	2	6	51990	51995	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	161869068
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1116	NC_010120	CTT	2	6	52251	52256	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1117	NC_010120	GCG	2	6	52279	52284	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1118	NC_010120	CTT	2	6	52310	52315	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1119	NC_010120	CGGG	2	8	52331	52338	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
1120	NC_010120	TGC	2	6	52340	52345	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1121	NC_010120	CCCGC	2	10	52348	52357	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
1122	NC_010120	CCG	2	6	52377	52382	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1123	NC_010120	TG	3	6	52401	52406	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1124	NC_010120	GC	3	6	52433	52438	0 %	0 %	50 %	50 %	161869069
1125	NC_010120	TGCG	2	8	52442	52449	0 %	25 %	50 %	25 %	161869069
1126	NC_010120	CGG	2	6	52583	52588	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	161869069
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1242	NC_010120	GAA	2	6	58344	58349	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1256	NC_010120	AGT	2	6	58970	58975	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1258	NC_010120	GGA	2	6	58989	58994	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1259	NC_010120	TAA	2	6	59004	59009	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1262	NC_010120	TCC	2	6	59147	59152	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1263	NC_010120	TCA	2	6	59165	59170	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1264	NC_010120	GGGAG	2	10	59219	59228	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
1265	NC_010120	GGA	2	6	59454	59459	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1266	NC_010120	AAAC	2	8	59517	59524	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
1267	NC_010120	GACA	2	8	59672	59679	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
1268	NC_010120	AAC	2	6	59710	59715	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1269	NC_010120	AGC	2	6	59800	59805	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1270	NC_010120	CAT	2	6	59806	59811	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1271	NC_010120	AAAG	2	8	59814	59821	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
1272	NC_010120	GTC	2	6	59842	59847	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1273	NC_010120	AGGTT	2	10	60161	60170	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
1274	NC_010120	TCT	2	6	60230	60235	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1275	NC_010120	GAC	2	6	60250	60255	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1276	NC_010120	GA	3	6	60378	60383	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1277	NC_010120	TTA	2	6	60504	60509	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1278	NC_010120	CGG	2	6	60619	60624	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1279	NC_010120	TCC	2	6	60712	60717	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1280	NC_010120	GCT	2	6	60763	60768	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1281	NC_010120	ACC	2	6	60890	60895	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1282	NC_010120	TCC	2	6	60976	60981	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1283	NC_010120	GGA	2	6	60993	60998	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1284	NC_010120	GGT	2	6	61113	61118	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1285	NC_010120	CGG	2	6	61200	61205	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1286	NC_010120	TCA	2	6	61228	61233	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1287	NC_010120	CGT	2	6	61308	61313	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1288	NC_010120	GCT	2	6	61362	61367	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1290	NC_010120	ACTG	2	8	61654	61661	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1291	NC_010120	AT	3	6	61678	61683	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1292	NC_010120	GGC	2	6	61721	61726	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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1294	NC_010120	TTC	2	6	61800	61805	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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