MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Neisseria meningitidis 053442 chromosome

Total Repeats: 46026

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_010120	GTT	2	6	24659	24664	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	161869048
502	NC_010120	GAA	3	9	24710	24718	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	161869048
503	NC_010120	CGG	2	6	24757	24762	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	161869048
504	NC_010120	TCGG	2	8	24780	24787	0 %	25 %	50 %	25 %	161869048
505	NC_010120	GCT	2	6	24907	24912	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	161869048
506	NC_010120	GC	3	6	24949	24954	0 %	0 %	50 %	50 %	161869048
507	NC_010120	TGTT	2	8	24975	24982	0 %	75 %	25 %	0 %	161869048
508	NC_010120	TAA	2	6	25002	25007	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	161869048
509	NC_010120	GTC	2	6	25130	25135	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	161869048
510	NC_010120	GCA	2	6	25139	25144	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	161869048
511	NC_010120	TGC	2	6	25228	25233	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	161869048
512	NC_010120	AGGGC	2	10	25243	25252	20 %	0 %	60 %	20 %	161869048
513	NC_010120	CAAA	2	8	25291	25298	75 %	0 %	0 %	25 %	161869048
514	NC_010120	CGG	2	6	25386	25391	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
515	NC_010120	TATT	2	8	25392	25399	25 %	75 %	0 %	0 %	161869049
516	NC_010120	CG	4	8	25448	25455	0 %	0 %	50 %	50 %	161869049
517	NC_010120	GAG	2	6	25473	25478	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	161869049
518	NC_010120	ACG	2	6	25498	25503	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	161869049
519	NC_010120	GGCGC	2	10	25523	25532	0 %	0 %	60 %	40 %	161869049
520	NC_010120	CGC	3	9	25598	25606	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	161869049
521	NC_010120	GC	4	8	25605	25612	0 %	0 %	50 %	50 %	161869049
522	NC_010120	GAC	3	9	25668	25676	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	161869049
523	NC_010120	GC	3	6	25820	25825	0 %	0 %	50 %	50 %	161869049
524	NC_010120	TGC	2	6	25885	25890	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	161869049
525	NC_010120	TTC	2	6	25914	25919	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	161869049
526	NC_010120	AAACC	2	10	25946	25955	60 %	0 %	0 %	40 %	161869049
527	NC_010120	GCT	2	6	26067	26072	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	161869049
528	NC_010120	CG	3	6	26075	26080	0 %	0 %	50 %	50 %	161869049
529	NC_010120	CGGTAT	2	12	26227	26238	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	161869049
530	NC_010120	CCAA	2	8	26282	26289	50 %	0 %	0 %	50 %	161869049
531	NC_010120	GCG	2	6	26305	26310	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	161869049
532	NC_010120	GCC	2	6	26400	26405	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	161869049
533	NC_010120	CCG	2	6	26420	26425	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	161869049
534	NC_010120	CG	4	8	26436	26443	0 %	0 %	50 %	50 %	161869049
535	NC_010120	GCT	2	6	26444	26449	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	161869049
536	NC_010120	GCGA	2	8	26500	26507	25 %	0 %	50 %	25 %	161869049
537	NC_010120	GGCA	2	8	26535	26542	25 %	0 %	50 %	25 %	161869049
538	NC_010120	CAG	2	6	26583	26588	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	161869049
539	NC_010120	CGG	2	6	26639	26644	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	161869049
540	NC_010120	TCG	2	6	26671	26676	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	161869049
541	NC_010120	TCA	2	6	26722	26727	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	161869049
542	NC_010120	CTT	2	6	26783	26788	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	161869049
543	NC_010120	GCC	2	6	26808	26813	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	161869049
544	NC_010120	TGAT	2	8	26830	26837	25 %	50 %	25 %	0 %	161869049
545	NC_010120	TG	3	6	26840	26845	0 %	50 %	50 %	0 %	161869049
546	NC_010120	GAT	2	6	26925	26930	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	161869049
547	NC_010120	CCG	2	6	26956	26961	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	161869049
548	NC_010120	CGC	2	6	26993	26998	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	161869049
549	NC_010120	GT	3	6	27000	27005	0 %	50 %	50 %	0 %	161869049
550	NC_010120	CCGATG	2	12	27022	27033	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	161869049
551	NC_010120	CCG	2	6	27034	27039	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	161869049
552	NC_010120	TCC	2	6	27064	27069	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	161869049
553	NC_010120	TGA	2	6	27135	27140	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	161869049
554	NC_010120	CGA	2	6	27188	27193	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	161869049
555	NC_010120	CGA	2	6	27218	27223	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	161869049
556	NC_010120	A	8	8	27257	27264	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
557	NC_010120	GGCTTG	2	12	27351	27362	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
558	NC_010120	A	6	6	27366	27371	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
559	NC_010120	GGGA	2	8	27372	27379	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
560	NC_010120	TGCC	2	8	27417	27424	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
561	NC_010120	A	11	11	27464	27474	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
562	NC_010120	CTCG	2	8	27482	27489	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
563	NC_010120	GGC	2	6	27544	27549	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	161869050
564	NC_010120	CGG	2	6	27577	27582	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	161869050
565	NC_010120	A	6	6	27614	27619	100 %	0 %	0 %	0 %	161869050
566	NC_010120	A	6	6	27638	27643	100 %	0 %	0 %	0 %	161869050
567	NC_010120	TAA	2	6	27664	27669	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	161869050
568	NC_010120	GAA	2	6	27692	27697	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	161869050
569	NC_010120	CGA	2	6	27772	27777	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	161869050
570	NC_010120	GCAG	2	8	27801	27808	25 %	0 %	50 %	25 %	161869050
571	NC_010120	GCG	2	6	27824	27829	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	161869050
572	NC_010120	ATC	2	6	27842	27847	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	161869050
573	NC_010120	CCA	2	6	27850	27855	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	161869050
574	NC_010120	CG	3	6	27892	27897	0 %	0 %	50 %	50 %	161869050
575	NC_010120	CAAAC	2	10	27912	27921	60 %	0 %	0 %	40 %	161869050
576	NC_010120	CAG	2	6	27926	27931	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	161869050
577	NC_010120	GGC	2	6	27937	27942	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	161869050
578	NC_010120	CGG	2	6	27959	27964	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	161869050
579	NC_010120	TTG	2	6	28025	28030	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	161869050
580	NC_010120	GCC	2	6	28057	28062	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
581	NC_010120	TG	3	6	28075	28080	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
582	NC_010120	CGGG	2	8	28096	28103	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
583	NC_010120	T	7	7	28117	28123	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
584	NC_010120	TCG	2	6	28313	28318	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
585	NC_010120	TCG	2	6	28542	28547	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	161869051
586	NC_010120	AAT	2	6	28561	28566	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	161869051
587	NC_010120	GC	3	6	28669	28674	0 %	0 %	50 %	50 %	161869051
588	NC_010120	GCG	2	6	28723	28728	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	161869051
589	NC_010120	TGC	2	6	28756	28761	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	161869051
590	NC_010120	A	8	8	29006	29013	100 %	0 %	0 %	0 %	161869051
591	NC_010120	GC	3	6	29062	29067	0 %	0 %	50 %	50 %	161869051
592	NC_010120	GGA	2	6	29098	29103	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	161869051
593	NC_010120	CTTC	2	8	29109	29116	0 %	50 %	0 %	50 %	161869051
594	NC_010120	GC	3	6	29141	29146	0 %	0 %	50 %	50 %	161869051
595	NC_010120	CGG	2	6	29170	29175	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	161869051
596	NC_010120	TG	3	6	29178	29183	0 %	50 %	50 %	0 %	161869051
597	NC_010120	CCG	2	6	29184	29189	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	161869051
598	NC_010120	T	6	6	29211	29216	0 %	100 %	0 %	0 %	161869051
599	NC_010120	TCCGC	2	10	29246	29255	0 %	20 %	20 %	60 %	161869051
600	NC_010120	GGCA	2	8	29261	29268	25 %	0 %	50 %	25 %	161869051
601	NC_010120	TCG	2	6	29286	29291	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	161869051
602	NC_010120	GTC	2	6	29333	29338	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	161869051
603	NC_010120	A	6	6	29426	29431	100 %	0 %	0 %	0 %	161869051
604	NC_010120	CA	3	6	29478	29483	50 %	0 %	0 %	50 %	161869051
605	NC_010120	GCC	2	6	29559	29564	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	161869051
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608	NC_010120	CGG	2	6	29629	29634	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	161869051
609	NC_010120	CCGG	2	8	29650	29657	0 %	0 %	50 %	50 %	161869051
610	NC_010120	TGA	2	6	29668	29673	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	161869051
611	NC_010120	GGC	2	6	29720	29725	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	161869051
612	NC_010120	GGC	3	9	29732	29740	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	161869051
613	NC_010120	GCG	2	6	29754	29759	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	161869051
614	NC_010120	T	6	6	29771	29776	0 %	100 %	0 %	0 %	161869051
615	NC_010120	TAA	2	6	29801	29806	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
616	NC_010120	A	10	10	29805	29814	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
617	NC_010120	GCG	2	6	29826	29831	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
618	NC_010120	CCG	2	6	29892	29897	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
619	NC_010120	CG	3	6	29896	29901	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
620	NC_010120	ATA	2	6	29957	29962	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
621	NC_010120	TAT	2	6	29963	29968	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
622	NC_010120	TCA	2	6	29969	29974	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
623	NC_010120	GTTC	2	8	29980	29987	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
624	NC_010120	T	6	6	30005	30010	0 %	100 %	0 %	0 %	161869052
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628	NC_010120	AGC	2	6	30190	30195	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	161869052
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631	NC_010120	GGC	2	6	30311	30316	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	161869052
632	NC_010120	GC	3	6	30375	30380	0 %	0 %	50 %	50 %	161869052
633	NC_010120	T	7	7	30397	30403	0 %	100 %	0 %	0 %	161869052
634	NC_010120	GCCG	2	8	30443	30450	0 %	0 %	50 %	50 %	161869052
635	NC_010120	GCC	2	6	30474	30479	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	161869052
636	NC_010120	GCC	2	6	30567	30572	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	161869052
637	NC_010120	GC	4	8	30593	30600	0 %	0 %	50 %	50 %	161869052
638	NC_010120	TCA	2	6	30648	30653	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	161869052
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641	NC_010120	GCT	2	6	30746	30751	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	161869052
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644	NC_010120	GCCG	2	8	30916	30923	0 %	0 %	50 %	50 %	161869053
645	NC_010120	ACA	2	6	31044	31049	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	161869053
646	NC_010120	TGG	3	9	31089	31097	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	161869053
647	NC_010120	CG	3	6	31194	31199	0 %	0 %	50 %	50 %	161869053
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649	NC_010120	TGG	2	6	31317	31322	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	161869053
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655	NC_010120	CGG	2	6	31651	31656	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	161869053
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657	NC_010120	GCG	2	6	31698	31703	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	161869053
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662	NC_010120	TTG	2	6	31814	31819	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	161869053
663	NC_010120	A	6	6	31821	31826	100 %	0 %	0 %	0 %	161869053
664	NC_010120	GGC	2	6	32021	32026	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
665	NC_010120	GCCTT	2	10	32082	32091	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
666	NC_010120	TCG	2	6	32119	32124	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
667	NC_010120	AT	3	6	32161	32166	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
668	NC_010120	CTG	2	6	32232	32237	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
669	NC_010120	AACC	2	8	32269	32276	50 %	0 %	0 %	50 %	161869054
670	NC_010120	CGG	2	6	32352	32357	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	161869054
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672	NC_010120	CCG	2	6	32375	32380	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	161869054
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700	NC_010120	CCT	2	6	33408	33413	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	161869054
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713	NC_010120	TTGT	2	8	34007	34014	0 %	75 %	25 %	0 %	161869056
714	NC_010120	GGCG	2	8	34051	34058	0 %	0 %	75 %	25 %	161869056
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717	NC_010120	TTG	2	6	34125	34130	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	161869056
718	NC_010120	CGT	2	6	34213	34218	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	161869056
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721	NC_010120	AGGTG	2	10	34282	34291	20 %	20 %	60 %	0 %	161869056
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730	NC_010120	CGG	2	6	34705	34710	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	161869056
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735	NC_010120	TTC	2	6	34913	34918	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	161869056
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739	NC_010120	CGG	2	6	35092	35097	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	161869056
740	NC_010120	CGA	3	9	35209	35217	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	161869056
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742	NC_010120	GCC	2	6	35279	35284	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	161869056
743	NC_010120	GCA	2	6	35293	35298	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	161869056
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745	NC_010120	AGC	2	6	35402	35407	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
746	NC_010120	GGGT	2	8	35421	35428	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
747	NC_010120	TCG	2	6	35487	35492	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	161869057
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750	NC_010120	CGG	2	6	35587	35592	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	161869057
751	NC_010120	GACG	2	8	35602	35609	25 %	0 %	50 %	25 %	161869057
752	NC_010120	TTGCCG	2	12	35616	35627	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	161869057
753	NC_010120	GCG	2	6	35664	35669	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	161869057
754	NC_010120	TCA	2	6	35674	35679	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	161869057
755	NC_010120	AAGG	2	8	35684	35691	50 %	0 %	50 %	0 %	161869057
756	NC_010120	GTC	2	6	35898	35903	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	161869058
757	NC_010120	GCA	2	6	35913	35918	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	161869058
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759	NC_010120	CAG	2	6	35979	35984	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	161869058
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