MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Nitrosopumilus maritimus SCM1 chromosome

Total Repeats: 38425

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_010085	T	6	6	1	6	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_010085	T	10	10	10	19	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_010085	A	6	6	23	28	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_010085	ACTA	2	8	34	41	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
5	NC_010085	TAAT	2	8	46	53	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_010085	AAACT	2	10	57	66	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
7	NC_010085	CTATT	2	10	74	83	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
8	NC_010085	CT	3	6	89	94	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
9	NC_010085	GT	3	6	136	141	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
10	NC_010085	ATT	2	6	166	171	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	161527513
11	NC_010085	GAACAA	2	12	263	274	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	161527513
12	NC_010085	GTC	2	6	362	367	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	161527513
13	NC_010085	A	6	6	368	373	100 %	0 %	0 %	0 %	161527513
14	NC_010085	AG	3	6	391	396	50 %	0 %	50 %	0 %	161527513
15	NC_010085	A	7	7	442	448	100 %	0 %	0 %	0 %	161527513
16	NC_010085	AAT	2	6	560	565	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	161527513
17	NC_010085	A	6	6	576	581	100 %	0 %	0 %	0 %	161527513
18	NC_010085	TGT	2	6	586	591	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	161527513
19	NC_010085	TGA	2	6	601	606	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	161527513
20	NC_010085	CAG	2	6	760	765	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	161527513
21	NC_010085	GAG	3	9	773	781	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	161527513
22	NC_010085	ATG	2	6	798	803	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	161527513
23	NC_010085	A	8	8	814	821	100 %	0 %	0 %	0 %	161527513
24	NC_010085	AGAGG	2	10	826	835	40 %	0 %	60 %	0 %	161527513
25	NC_010085	GCT	2	6	890	895	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	161527513
26	NC_010085	AGG	2	6	901	906	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	161527513
27	NC_010085	ACA	2	6	970	975	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	161527513
28	NC_010085	A	6	6	1017	1022	100 %	0 %	0 %	0 %	161527513
29	NC_010085	GAA	2	6	1025	1030	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	161527513
30	NC_010085	AGA	2	6	1036	1041	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	161527513
31	NC_010085	AGA	2	6	1181	1186	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	161527513
32	NC_010085	CA	3	6	1189	1194	50 %	0 %	0 %	50 %	161527513
33	NC_010085	AAT	2	6	1222	1227	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	161527513
34	NC_010085	A	7	7	1267	1273	100 %	0 %	0 %	0 %	161527513
35	NC_010085	ATC	2	6	1288	1293	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	161527513
36	NC_010085	A	6	6	1303	1308	100 %	0 %	0 %	0 %	161527513
37	NC_010085	GAT	2	6	1319	1324	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	161527513
38	NC_010085	TGG	2	6	1365	1370	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	161527514
39	NC_010085	CTTG	2	8	1434	1441	0 %	50 %	25 %	25 %	161527514
40	NC_010085	CAA	2	6	1478	1483	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	161527514
41	NC_010085	TCA	2	6	1639	1644	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	161527514
42	NC_010085	TTG	2	6	1648	1653	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	161527514
43	NC_010085	ATC	2	6	1691	1696	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	161527514
44	NC_010085	CAT	2	6	1715	1720	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	161527514
45	NC_010085	CAG	2	6	1747	1752	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	161527514
46	NC_010085	CTT	2	6	1802	1807	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	161527514
47	NC_010085	T	6	6	1878	1883	0 %	100 %	0 %	0 %	161527514
48	NC_010085	ATCA	2	8	1892	1899	50 %	25 %	0 %	25 %	161527514
49	NC_010085	T	6	6	1910	1915	0 %	100 %	0 %	0 %	161527514
50	NC_010085	TCC	2	6	1991	1996	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	161527514
51	NC_010085	AAAT	2	8	2002	2009	75 %	25 %	0 %	0 %	161527514
52	NC_010085	T	8	8	2014	2021	0 %	100 %	0 %	0 %	161527514
53	NC_010085	CTT	2	6	2068	2073	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	161527514
54	NC_010085	TTGT	2	8	2139	2146	0 %	75 %	25 %	0 %	161527514
55	NC_010085	ATG	2	6	2184	2189	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	161527514
56	NC_010085	CTA	2	6	2236	2241	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	161527514
57	NC_010085	AAT	2	6	2279	2284	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	161527514
58	NC_010085	TC	3	6	2333	2338	0 %	50 %	0 %	50 %	161527514
59	NC_010085	ACAT	2	8	2367	2374	50 %	25 %	0 %	25 %	161527514
60	NC_010085	GTCT	2	8	2434	2441	0 %	50 %	25 %	25 %	161527514
61	NC_010085	ATT	2	6	2445	2450	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	161527514
62	NC_010085	CTA	2	6	2469	2474	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	161527514
63	NC_010085	GGAT	2	8	2561	2568	25 %	25 %	50 %	0 %	161527514
64	NC_010085	ATC	2	6	2597	2602	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	161527514
65	NC_010085	TTGA	2	8	2603	2610	25 %	50 %	25 %	0 %	161527514
66	NC_010085	AAT	2	6	2616	2621	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	161527514
67	NC_010085	T	6	6	2632	2637	0 %	100 %	0 %	0 %	161527514
68	NC_010085	TAT	2	6	2654	2659	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	161527514
69	NC_010085	T	6	6	2669	2674	0 %	100 %	0 %	0 %	161527514
70	NC_010085	A	6	6	2774	2779	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_010085	TTAA	2	8	2791	2798	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_010085	TTGTG	2	10	2838	2847	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
73	NC_010085	GAA	2	6	2935	2940	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	161527515
74	NC_010085	CAT	2	6	3014	3019	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	161527515
75	NC_010085	GTTT	2	8	3062	3069	0 %	75 %	25 %	0 %	161527515
76	NC_010085	ATTTGC	2	12	3087	3098	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	161527515
77	NC_010085	C	7	7	3135	3141	0 %	0 %	0 %	100 %	161527515
78	NC_010085	ATTTT	2	10	3148	3157	20 %	80 %	0 %	0 %	161527515
79	NC_010085	A	7	7	3238	3244	100 %	0 %	0 %	0 %	161527515
80	NC_010085	TCA	2	6	3260	3265	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	161527515
81	NC_010085	AGG	2	6	3312	3317	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	161527515
82	NC_010085	TAG	2	6	3423	3428	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
83	NC_010085	AGA	2	6	3447	3452	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
84	NC_010085	ATT	2	6	3489	3494	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	161527516
85	NC_010085	AT	3	6	3510	3515	50 %	50 %	0 %	0 %	161527516
86	NC_010085	GAA	2	6	3589	3594	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	161527516
87	NC_010085	CAAAT	2	10	3595	3604	60 %	20 %	0 %	20 %	161527516
88	NC_010085	ATC	2	6	3627	3632	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	161527516
89	NC_010085	GTA	2	6	3647	3652	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	161527516
90	NC_010085	TGA	2	6	3690	3695	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	161527516
91	NC_010085	AGA	2	6	3696	3701	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	161527516
92	NC_010085	TAC	2	6	3792	3797	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	161527516
93	NC_010085	CTT	2	6	3804	3809	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	161527516
94	NC_010085	TGC	2	6	3837	3842	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	161527516
95	NC_010085	ACA	2	6	3868	3873	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	161527516
96	NC_010085	TGA	2	6	3876	3881	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	161527516
97	NC_010085	AAT	2	6	3891	3896	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	161527516
98	NC_010085	CAA	2	6	3941	3946	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	161527516
99	NC_010085	GAA	2	6	3949	3954	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	161527516
100	NC_010085	AAC	2	6	4026	4031	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	161527516
101	NC_010085	TTAGG	2	10	4043	4052	20 %	40 %	40 %	0 %	161527516
102	NC_010085	TGA	2	6	4062	4067	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	161527516
103	NC_010085	ACT	2	6	4090	4095	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	161527516
104	NC_010085	ATG	2	6	4109	4114	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	161527516
105	NC_010085	GAAAA	2	10	4142	4151	80 %	0 %	20 %	0 %	161527516
106	NC_010085	ACATT	2	10	4229	4238	40 %	40 %	0 %	20 %	161527516
107	NC_010085	TGA	2	6	4239	4244	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	161527516
108	NC_010085	TTCC	2	8	4442	4449	0 %	50 %	0 %	50 %	161527517
109	NC_010085	GTA	2	6	4525	4530	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	161527517
110	NC_010085	GTT	2	6	4589	4594	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	161527517
111	NC_010085	ATCA	2	8	4632	4639	50 %	25 %	0 %	25 %	161527517
112	NC_010085	GTT	2	6	4678	4683	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	161527517
113	NC_010085	TGC	2	6	4734	4739	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	161527517
114	NC_010085	ATCT	2	8	4796	4803	25 %	50 %	0 %	25 %	161527517
115	NC_010085	CTT	2	6	4880	4885	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	161527517
116	NC_010085	TTC	2	6	4893	4898	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	161527517
117	NC_010085	ATT	2	6	4902	4907	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	161527517
118	NC_010085	AAG	2	6	4938	4943	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	161527517
119	NC_010085	ACCTAC	2	12	5043	5054	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	161527517
120	NC_010085	TCTG	2	8	5089	5096	0 %	50 %	25 %	25 %	161527518
121	NC_010085	AT	3	6	5103	5108	50 %	50 %	0 %	0 %	161527518
122	NC_010085	T	6	6	5204	5209	0 %	100 %	0 %	0 %	161527518
123	NC_010085	ATTCTA	2	12	5224	5235	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	161527518
124	NC_010085	TTC	2	6	5255	5260	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	161527518
125	NC_010085	ATC	2	6	5279	5284	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	161527518
126	NC_010085	CAT	2	6	5317	5322	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	161527518
127	NC_010085	TCA	2	6	5323	5328	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	161527518
128	NC_010085	TCT	2	6	5331	5336	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	161527518
129	NC_010085	TCA	2	6	5337	5342	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	161527518
130	NC_010085	CAT	2	6	5347	5352	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	161527518
131	NC_010085	T	6	6	5367	5372	0 %	100 %	0 %	0 %	161527518
132	NC_010085	ATTA	2	8	5384	5391	50 %	50 %	0 %	0 %	161527518
133	NC_010085	CCA	2	6	5414	5419	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	161527518
134	NC_010085	CTT	2	6	5482	5487	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	161527518
135	NC_010085	T	7	7	5507	5513	0 %	100 %	0 %	0 %	161527518
136	NC_010085	TC	3	6	5517	5522	0 %	50 %	0 %	50 %	161527518
137	NC_010085	ACA	2	6	5532	5537	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	161527518
138	NC_010085	TCT	2	6	5548	5553	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	161527518
139	NC_010085	GAA	2	6	5641	5646	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	161527519
140	NC_010085	AAT	2	6	5647	5652	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	161527519
141	NC_010085	ATT	2	6	5671	5676	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	161527519
142	NC_010085	AAC	2	6	5698	5703	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	161527519
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146	NC_010085	TGG	2	6	5947	5952	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	161527519
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151	NC_010085	GAA	2	6	6323	6328	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	161527519
152	NC_010085	GGCT	2	8	6356	6363	0 %	25 %	50 %	25 %	161527519
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156	NC_010085	A	7	7	6501	6507	100 %	0 %	0 %	0 %	161527519
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159	NC_010085	T	6	6	6612	6617	0 %	100 %	0 %	0 %	161527519
160	NC_010085	ATG	2	6	6636	6641	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	161527519
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164	NC_010085	TGG	2	6	6799	6804	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	161527519
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173	NC_010085	TAT	2	6	7135	7140	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	161527519
174	NC_010085	AAACT	2	10	7157	7166	60 %	20 %	0 %	20 %	161527519
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257	NC_010085	AGA	2	6	10879	10884	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	161527523
258	NC_010085	GAAATT	2	12	10903	10914	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	161527523
259	NC_010085	TGA	3	9	10923	10931	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	161527523
260	NC_010085	CA	3	6	10957	10962	50 %	0 %	0 %	50 %	161527523
261	NC_010085	CAAA	2	8	10995	11002	75 %	0 %	0 %	25 %	161527523
262	NC_010085	ACA	2	6	11011	11016	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	161527523
263	NC_010085	TTG	2	6	11024	11029	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	161527523
264	NC_010085	AAG	2	6	11054	11059	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	161527523
265	NC_010085	TTC	2	6	11084	11089	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	161527523
266	NC_010085	TGA	2	6	11103	11108	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	161527523
267	NC_010085	AGATA	2	10	11109	11118	60 %	20 %	20 %	0 %	161527523
268	NC_010085	A	6	6	11135	11140	100 %	0 %	0 %	0 %	161527523
269	NC_010085	AAG	2	6	11177	11182	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	161527523
270	NC_010085	GAT	2	6	11236	11241	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	161527523
271	NC_010085	TGG	2	6	11244	11249	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	161527523
272	NC_010085	TGA	2	6	11253	11258	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	161527523
273	NC_010085	AGA	2	6	11265	11270	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	161527523
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275	NC_010085	ATGTTG	2	12	11321	11332	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	161527523
276	NC_010085	ATTG	2	8	11382	11389	25 %	50 %	25 %	0 %	161527523
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290	NC_010085	A	6	6	11902	11907	100 %	0 %	0 %	0 %	161527523
291	NC_010085	CAA	2	6	11953	11958	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	161527523
292	NC_010085	A	6	6	11995	12000	100 %	0 %	0 %	0 %	161527523
293	NC_010085	ATG	2	6	12105	12110	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
294	NC_010085	TAG	2	6	12119	12124	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
295	NC_010085	TGA	2	6	12143	12148	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
296	NC_010085	AGT	2	6	12209	12214	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
297	NC_010085	GAT	2	6	12228	12233	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
298	NC_010085	CAAAA	2	10	12238	12247	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
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302	NC_010085	TCATAT	2	12	12308	12319	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
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398	NC_010085	AAT	2	6	16067	16072	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	161527531
399	NC_010085	CTT	2	6	16102	16107	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	161527531
400	NC_010085	GTGAT	2	10	16126	16135	20 %	40 %	40 %	0 %	161527531
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402	NC_010085	AATG	2	8	16167	16174	50 %	25 %	25 %	0 %	161527531
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