MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Nitrosopumilus maritimus SCM1 chromosome

Total Repeats: 38425

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_010085	ACT	2	6	41342	41347	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	161527564
1002	NC_010085	TGT	2	6	41350	41355	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	161527564
1003	NC_010085	CGT	2	6	41421	41426	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	161527564
1004	NC_010085	GTG	2	6	41451	41456	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	161527564
1005	NC_010085	CAT	2	6	41479	41484	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	161527564
1006	NC_010085	T	6	6	41496	41501	0 %	100 %	0 %	0 %	161527564
1007	NC_010085	TAT	2	6	41531	41536	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1008	NC_010085	AATC	2	8	41550	41557	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
1009	NC_010085	AGA	3	9	41575	41583	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	161527565
1010	NC_010085	TTG	2	6	41637	41642	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	161527565
1011	NC_010085	ATCT	2	8	41694	41701	25 %	50 %	0 %	25 %	161527565
1012	NC_010085	GAA	2	6	41735	41740	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	161527565
1013	NC_010085	TTTC	2	8	41741	41748	0 %	75 %	0 %	25 %	161527565
1014	NC_010085	CT	3	6	41861	41866	0 %	50 %	0 %	50 %	161527565
1015	NC_010085	AAT	2	6	41884	41889	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	161527565
1016	NC_010085	TGC	2	6	41977	41982	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	161527565
1017	NC_010085	ACAA	2	8	42014	42021	75 %	0 %	0 %	25 %	161527565
1018	NC_010085	CTAG	2	8	42041	42048	25 %	25 %	25 %	25 %	161527565
1019	NC_010085	AGA	2	6	42088	42093	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	161527565
1020	NC_010085	CTT	2	6	42160	42165	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	161527565
1021	NC_010085	TG	3	6	42240	42245	0 %	50 %	50 %	0 %	161527565
1022	NC_010085	TGA	2	6	42322	42327	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	161527565
1023	NC_010085	ATG	2	6	42348	42353	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	161527565
1024	NC_010085	AGA	2	6	42412	42417	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	161527565
1025	NC_010085	CAAA	2	8	42504	42511	75 %	0 %	0 %	25 %	161527565
1026	NC_010085	TTCT	2	8	42552	42559	0 %	75 %	0 %	25 %	161527565
1027	NC_010085	TGT	2	6	42563	42568	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	161527565
1028	NC_010085	TTAA	2	8	42584	42591	50 %	50 %	0 %	0 %	161527565
1029	NC_010085	A	6	6	42646	42651	100 %	0 %	0 %	0 %	161527565
1030	NC_010085	TGGTGT	2	12	42658	42669	0 %	50 %	50 %	0 %	161527565
1031	NC_010085	AGA	2	6	42697	42702	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	161527565
1032	NC_010085	AATT	2	8	42768	42775	50 %	50 %	0 %	0 %	161527566
1033	NC_010085	A	7	7	42793	42799	100 %	0 %	0 %	0 %	161527566
1034	NC_010085	ATT	2	6	42805	42810	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	161527566
1035	NC_010085	ATCA	2	8	42840	42847	50 %	25 %	0 %	25 %	161527566
1036	NC_010085	AGT	2	6	42883	42888	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	161527566
1037	NC_010085	ATCAA	2	10	42913	42922	60 %	20 %	0 %	20 %	161527566
1038	NC_010085	CAC	2	6	42932	42937	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	161527566
1039	NC_010085	TGA	2	6	43017	43022	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	161527566
1040	NC_010085	AATA	2	8	43035	43042	75 %	25 %	0 %	0 %	161527566
1041	NC_010085	CAG	2	6	43150	43155	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	161527567
1042	NC_010085	TCA	2	6	43173	43178	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	161527567
1043	NC_010085	T	7	7	43186	43192	0 %	100 %	0 %	0 %	161527567
1044	NC_010085	TTC	2	6	43199	43204	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	161527567
1045	NC_010085	GCA	2	6	43239	43244	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	161527567
1046	NC_010085	ATT	2	6	43272	43277	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	161527567
1047	NC_010085	TCT	2	6	43338	43343	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	161527567
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1052	NC_010085	TTCA	2	8	43544	43551	25 %	50 %	0 %	25 %	161527567
1053	NC_010085	ATA	2	6	43584	43589	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	161527567
1054	NC_010085	A	6	6	43589	43594	100 %	0 %	0 %	0 %	161527567
1055	NC_010085	GCA	2	6	43671	43676	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	161527567
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1057	NC_010085	T	6	6	43743	43748	0 %	100 %	0 %	0 %	161527567
1058	NC_010085	TGTTT	2	10	43787	43796	0 %	80 %	20 %	0 %	161527567
1059	NC_010085	T	7	7	43811	43817	0 %	100 %	0 %	0 %	161527567
1060	NC_010085	TTC	2	6	43835	43840	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	161527567
1061	NC_010085	T	7	7	43865	43871	0 %	100 %	0 %	0 %	161527567
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1064	NC_010085	ATCAT	2	10	44046	44055	40 %	40 %	0 %	20 %	161527567
1065	NC_010085	T	6	6	44082	44087	0 %	100 %	0 %	0 %	161527567
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1069	NC_010085	GAA	2	6	44284	44289	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	161527567
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1074	NC_010085	T	7	7	44456	44462	0 %	100 %	0 %	0 %	161527567
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1081	NC_010085	T	6	6	44766	44771	0 %	100 %	0 %	0 %	161527567
1082	NC_010085	CTT	2	6	44793	44798	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	161527567
1083	NC_010085	ATC	2	6	44871	44876	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	161527567
1084	NC_010085	T	6	6	44890	44895	0 %	100 %	0 %	0 %	161527567
1085	NC_010085	ATG	2	6	44900	44905	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	161527567
1086	NC_010085	AATTC	2	10	45000	45009	40 %	40 %	0 %	20 %	161527567
1087	NC_010085	ATGCC	2	10	45016	45025	20 %	20 %	20 %	40 %	161527567
1088	NC_010085	T	6	6	45033	45038	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1091	NC_010085	AAG	2	6	45180	45185	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	161527568
1092	NC_010085	CTC	2	6	45190	45195	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	161527568
1093	NC_010085	AAG	2	6	45196	45201	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	161527568
1094	NC_010085	TGAG	2	8	45268	45275	25 %	25 %	50 %	0 %	161527568
1095	NC_010085	A	6	6	45280	45285	100 %	0 %	0 %	0 %	161527568
1096	NC_010085	ATT	2	6	45311	45316	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	161527568
1097	NC_010085	CAA	2	6	45436	45441	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	161527568
1098	NC_010085	CAT	2	6	45475	45480	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	161527568
1099	NC_010085	CAGA	2	8	45481	45488	50 %	0 %	25 %	25 %	161527568
1100	NC_010085	TAC	2	6	45605	45610	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1101	NC_010085	TGA	2	6	45656	45661	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	161527569
1102	NC_010085	GA	3	6	45669	45674	50 %	0 %	50 %	0 %	161527569
1103	NC_010085	AGA	2	6	45698	45703	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	161527569
1104	NC_010085	TCT	2	6	45813	45818	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	161527569
1105	NC_010085	A	9	9	45866	45874	100 %	0 %	0 %	0 %	161527569
1106	NC_010085	A	6	6	45928	45933	100 %	0 %	0 %	0 %	161527569
1107	NC_010085	GAA	2	6	45945	45950	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	161527569
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1109	NC_010085	TGG	2	6	45977	45982	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	161527569
1110	NC_010085	ATT	2	6	46050	46055	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	161527569
1111	NC_010085	ACT	2	6	46155	46160	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	161527569
1112	NC_010085	ATG	2	6	46167	46172	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	161527569
1113	NC_010085	CTT	2	6	46298	46303	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	161527570
1114	NC_010085	AGA	2	6	46363	46368	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	161527570
1115	NC_010085	A	6	6	46528	46533	100 %	0 %	0 %	0 %	161527570
1116	NC_010085	TGT	2	6	46534	46539	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	161527570
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1119	NC_010085	AGT	2	6	46736	46741	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	161527570
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1121	NC_010085	ATT	2	6	46889	46894	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	161527570
1122	NC_010085	ATG	2	6	46920	46925	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	161527570
1123	NC_010085	TGG	2	6	46956	46961	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	161527570
1124	NC_010085	GTTG	2	8	46986	46993	0 %	50 %	50 %	0 %	161527571
1125	NC_010085	A	7	7	47030	47036	100 %	0 %	0 %	0 %	161527571
1126	NC_010085	TGT	3	9	47054	47062	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	161527571
1127	NC_010085	A	6	6	47106	47111	100 %	0 %	0 %	0 %	161527571
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