MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Nitrosopumilus maritimus SCM1 chromosome

Total Repeats: 38425

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_010085	T	6	6	198797	198802	0 %	100 %	0 %	0 %	161527732
5002	NC_010085	GTG	2	6	198819	198824	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	161527732
5003	NC_010085	A	6	6	198890	198895	100 %	0 %	0 %	0 %	161527732
5004	NC_010085	ATG	2	6	198915	198920	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	161527732
5005	NC_010085	ATTG	2	8	198980	198987	25 %	50 %	25 %	0 %	161527732
5006	NC_010085	CAT	2	6	199057	199062	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	161527732
5007	NC_010085	C	6	6	199081	199086	0 %	0 %	0 %	100 %	161527732
5008	NC_010085	ACAAT	2	10	199087	199096	60 %	20 %	0 %	20 %	161527732
5009	NC_010085	CTG	2	6	199107	199112	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	161527732
5010	NC_010085	ATG	2	6	199116	199121	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	161527732
5011	NC_010085	TC	3	6	199131	199136	0 %	50 %	0 %	50 %	161527732
5012	NC_010085	A	7	7	199173	199179	100 %	0 %	0 %	0 %	161527732
5013	NC_010085	AGA	2	6	199219	199224	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	161527732
5014	NC_010085	GTT	2	6	199301	199306	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	161527732
5015	NC_010085	TGACGG	2	12	199498	199509	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	161527732
5016	NC_010085	ACA	2	6	199530	199535	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	161527732
5017	NC_010085	AAT	2	6	199595	199600	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	161527732
5018	NC_010085	GTT	2	6	199613	199618	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	161527732
5019	NC_010085	AGA	2	6	199657	199662	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	161527732
5020	NC_010085	GAA	2	6	199748	199753	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	161527732
5021	NC_010085	TGG	2	6	199756	199761	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	161527732
5022	NC_010085	CTA	2	6	199826	199831	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	161527732
5023	NC_010085	TGA	2	6	199855	199860	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	161527732
5024	NC_010085	CCA	2	6	199874	199879	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	161527732
5025	NC_010085	TAC	2	6	199885	199890	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	161527732
5026	NC_010085	TAC	2	6	199969	199974	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	161527732
5027	NC_010085	ATC	2	6	200123	200128	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	161527732
5028	NC_010085	ACCAA	2	10	200148	200157	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
5029	NC_010085	CTA	2	6	200278	200283	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	161527733
5030	NC_010085	AAG	2	6	200295	200300	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	161527733
5031	NC_010085	AATT	2	8	200344	200351	50 %	50 %	0 %	0 %	161527733
5032	NC_010085	CCT	2	6	200373	200378	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	161527733
5033	NC_010085	TG	3	6	200404	200409	0 %	50 %	50 %	0 %	161527733
5034	NC_010085	AGC	2	6	200420	200425	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	161527733
5035	NC_010085	GCA	2	6	200493	200498	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	161527733
5036	NC_010085	TCA	2	6	200544	200549	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	161527733
5037	NC_010085	TGA	2	6	200596	200601	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	161527734
5038	NC_010085	AGT	2	6	200602	200607	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	161527734
5039	NC_010085	ATT	2	6	200618	200623	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	161527734
5040	NC_010085	TTG	2	6	200628	200633	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	161527734
5041	NC_010085	AG	4	8	200767	200774	50 %	0 %	50 %	0 %	161527734
5042	NC_010085	AGA	2	6	200781	200786	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	161527734
5043	NC_010085	TGAAT	2	10	200796	200805	40 %	40 %	20 %	0 %	161527735
5044	NC_010085	A	6	6	200875	200880	100 %	0 %	0 %	0 %	161527735
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5048	NC_010085	TTTACA	2	12	201121	201132	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	161527736
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5050	NC_010085	CAT	2	6	201194	201199	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	161527736
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5053	NC_010085	AAT	2	6	201241	201246	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	161527736
5054	NC_010085	ACT	2	6	201256	201261	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	161527736
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5056	NC_010085	CAA	2	6	201278	201283	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	161527736
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5059	NC_010085	TAGA	2	8	201479	201486	50 %	25 %	25 %	0 %	161527737
5060	NC_010085	GGA	2	6	201520	201525	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	161527737
5061	NC_010085	CA	3	6	201528	201533	50 %	0 %	0 %	50 %	161527737
5062	NC_010085	CTAC	2	8	201553	201560	25 %	25 %	0 %	50 %	161527737
5063	NC_010085	AC	3	6	201644	201649	50 %	0 %	0 %	50 %	161527737
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5065	NC_010085	TAG	2	6	201713	201718	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	161527737
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5070	NC_010085	ATG	2	6	201914	201919	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	161527737
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5073	NC_010085	AAG	2	6	202094	202099	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	161527737
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5075	NC_010085	A	6	6	202189	202194	100 %	0 %	0 %	0 %	161527737
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5082	NC_010085	ATG	3	9	202400	202408	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	161527737
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5093	NC_010085	TGA	2	6	202995	203000	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	161527737
5094	NC_010085	GTTCA	2	10	203009	203018	20 %	40 %	20 %	20 %	161527737
5095	NC_010085	GAA	3	9	203047	203055	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	161527737
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5101	NC_010085	AGC	2	6	203178	203183	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	161527737
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5104	NC_010085	T	7	7	203379	203385	0 %	100 %	0 %	0 %	161527738
5105	NC_010085	CAT	2	6	203409	203414	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	161527738
5106	NC_010085	CAC	2	6	203428	203433	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	161527738
5107	NC_010085	CTA	2	6	203447	203452	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	161527738
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5109	NC_010085	TCT	2	6	203551	203556	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	161527738
5110	NC_010085	TTTG	2	8	203564	203571	0 %	75 %	25 %	0 %	161527738
5111	NC_010085	T	6	6	203573	203578	0 %	100 %	0 %	0 %	161527738
5112	NC_010085	A	6	6	203625	203630	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5113	NC_010085	ATT	2	6	203644	203649	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5114	NC_010085	CTG	2	6	203653	203658	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5115	NC_010085	TCT	2	6	203681	203686	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5116	NC_010085	AT	3	6	203712	203717	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5117	NC_010085	AACT	2	8	203725	203732	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
5118	NC_010085	TAT	2	6	203808	203813	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5119	NC_010085	T	7	7	203837	203843	0 %	100 %	0 %	0 %	161527739
5120	NC_010085	A	6	6	203849	203854	100 %	0 %	0 %	0 %	161527739
5121	NC_010085	AAAT	2	8	203874	203881	75 %	25 %	0 %	0 %	161527739
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5123	NC_010085	ACTCCA	2	12	203901	203912	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	161527739
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5494	NC_010085	GTC	2	6	219613	219618	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	161527756
5495	NC_010085	TTC	2	6	219646	219651	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	161527756
5496	NC_010085	CAT	2	6	219652	219657	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	161527756
5497	NC_010085	CTT	2	6	219658	219663	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	161527756
5498	NC_010085	CTTT	2	8	219693	219700	0 %	75 %	0 %	25 %	161527756
5499	NC_010085	TCA	2	6	219755	219760	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	161527756
5500	NC_010085	TAA	2	6	219828	219833	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	161527756

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