MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444 plasmid pNL2

Total Repeats: 11576

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
11001	NC_009427	ATGCC	2	10	462571	462580	20 %	20 %	20 %	40 %	146276031
11002	NC_009427	GTCG	2	8	462594	462601	0 %	25 %	50 %	25 %	146276031
11003	NC_009427	TGA	2	6	462602	462607	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146276031
11004	NC_009427	CCG	2	6	462614	462619	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146276031
11005	NC_009427	CATCG	2	10	462633	462642	20 %	20 %	20 %	40 %	146276031
11006	NC_009427	CCG	2	6	462686	462691	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146276031
11007	NC_009427	CGG	2	6	462747	462752	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146276032
11008	NC_009427	CACG	2	8	462837	462844	25 %	0 %	25 %	50 %	146276032
11009	NC_009427	CG	4	8	462906	462913	0 %	0 %	50 %	50 %	146276032
11010	NC_009427	TGA	2	6	462930	462935	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146276032
11011	NC_009427	CGC	2	6	462949	462954	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146276032
11012	NC_009427	CGA	2	6	463062	463067	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146276032
11013	NC_009427	GC	3	6	463134	463139	0 %	0 %	50 %	50 %	146276032
11014	NC_009427	ACC	2	6	463145	463150	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	146276032
11015	NC_009427	TTG	2	6	463154	463159	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	146276032
11016	NC_009427	CG	4	8	463200	463207	0 %	0 %	50 %	50 %	146276032
11017	NC_009427	CGAG	2	8	463272	463279	25 %	0 %	50 %	25 %	146276032
11018	NC_009427	GCG	2	6	463295	463300	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146276032
11019	NC_009427	GCCC	2	8	463333	463340	0 %	0 %	25 %	75 %	146276032
11020	NC_009427	CG	3	6	463348	463353	0 %	0 %	50 %	50 %	146276032
11021	NC_009427	CG	3	6	463374	463379	0 %	0 %	50 %	50 %	146276032
11022	NC_009427	CCG	2	6	463382	463387	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146276032
11023	NC_009427	CAT	2	6	463405	463410	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146276032
11024	NC_009427	GCA	2	6	463496	463501	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146276033
11025	NC_009427	CTA	2	6	463514	463519	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146276033
11026	NC_009427	TGGTC	2	10	463592	463601	0 %	40 %	40 %	20 %	146276033
11027	NC_009427	GTC	3	9	463599	463607	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146276033
11028	NC_009427	GAT	2	6	463617	463622	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146276033
11029	NC_009427	GAA	2	6	463707	463712	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	146276033
11030	NC_009427	GCA	2	6	463718	463723	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146276033
11031	NC_009427	CGC	2	6	463727	463732	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146276033
11032	NC_009427	AGA	2	6	463733	463738	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	146276033
11033	NC_009427	CGG	2	6	463802	463807	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146276034
11034	NC_009427	TGC	2	6	463870	463875	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146276034
11035	NC_009427	ATC	2	6	463882	463887	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146276034
11036	NC_009427	CATG	2	8	463892	463899	25 %	25 %	25 %	25 %	146276034
11037	NC_009427	CCG	2	6	463955	463960	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146276034
11038	NC_009427	CG	4	8	463977	463984	0 %	0 %	50 %	50 %	146276034
11039	NC_009427	TGC	2	6	463995	464000	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146276034
11040	NC_009427	AGC	2	6	464008	464013	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146276034
11041	NC_009427	TCG	2	6	464035	464040	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146276034
11042	NC_009427	GCA	2	6	464045	464050	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146276034
11043	NC_009427	AGA	2	6	464081	464086	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	146276034
11044	NC_009427	GCA	2	6	464102	464107	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146276034
11045	NC_009427	CGTC	2	8	464178	464185	0 %	25 %	25 %	50 %	146276034
11046	NC_009427	CGG	2	6	464186	464191	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146276034
11047	NC_009427	ACC	2	6	464239	464244	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	146276034
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11049	NC_009427	GC	3	6	464306	464311	0 %	0 %	50 %	50 %	146276034
11050	NC_009427	CG	3	6	464333	464338	0 %	0 %	50 %	50 %	146276034
11051	NC_009427	CCA	2	6	464441	464446	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	146276034
11052	NC_009427	TGC	2	6	464513	464518	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146276034
11053	NC_009427	TCG	2	6	464554	464559	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146276034
11054	NC_009427	CGGGC	2	10	464564	464573	0 %	0 %	60 %	40 %	146276034
11055	NC_009427	G	6	6	464581	464586	0 %	0 %	100 %	0 %	146276034
11056	NC_009427	CGC	2	6	464667	464672	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146276034
11057	NC_009427	CGG	2	6	464699	464704	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146276034
11058	NC_009427	CACG	2	8	464784	464791	25 %	0 %	25 %	50 %	146276034
11059	NC_009427	CG	3	6	464790	464795	0 %	0 %	50 %	50 %	146276034
11060	NC_009427	TCA	2	6	464813	464818	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146276034
11061	NC_009427	CTG	2	6	464841	464846	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146276034
11062	NC_009427	CTC	2	6	464859	464864	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	146276034
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11064	NC_009427	GC	4	8	465030	465037	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11065	NC_009427	GCA	2	6	465056	465061	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11066	NC_009427	GCG	2	6	465149	465154	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11067	NC_009427	TGGA	2	8	465201	465208	25 %	25 %	50 %	0 %	146276035
11068	NC_009427	GCGCG	2	10	465268	465277	0 %	0 %	60 %	40 %	146276035
11069	NC_009427	CTG	2	6	465282	465287	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146276035
11070	NC_009427	GC	3	6	465342	465347	0 %	0 %	50 %	50 %	146276035
11071	NC_009427	GC	3	6	465364	465369	0 %	0 %	50 %	50 %	146276035
11072	NC_009427	GGC	2	6	465402	465407	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146276035
11073	NC_009427	CGG	2	6	465535	465540	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146276035
11074	NC_009427	GAC	2	6	465543	465548	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146276035
11075	NC_009427	GCG	2	6	465553	465558	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146276035
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11077	NC_009427	CG	3	6	465671	465676	0 %	0 %	50 %	50 %	146276035
11078	NC_009427	CGGA	2	8	465681	465688	25 %	0 %	50 %	25 %	146276035
11079	NC_009427	GAT	2	6	465731	465736	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146276035
11080	NC_009427	TGC	2	6	465748	465753	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146276035
11081	NC_009427	CAG	2	6	465771	465776	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11082	NC_009427	CCAC	2	8	465872	465879	25 %	0 %	0 %	75 %	146276036
11083	NC_009427	CCG	2	6	465889	465894	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146276036
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11085	NC_009427	AGCGC	2	10	465934	465943	20 %	0 %	40 %	40 %	146276036
11086	NC_009427	GCC	2	6	465960	465965	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146276036
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11088	NC_009427	TCC	2	6	466080	466085	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	146276036
11089	NC_009427	AGA	2	6	466135	466140	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	146276036
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11091	NC_009427	CAG	2	6	466172	466177	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146276036
11092	NC_009427	CG	3	6	466179	466184	0 %	0 %	50 %	50 %	146276036
11093	NC_009427	GGCG	2	8	466231	466238	0 %	0 %	75 %	25 %	146276036
11094	NC_009427	GGCC	2	8	466258	466265	0 %	0 %	50 %	50 %	146276036
11095	NC_009427	CGC	2	6	466298	466303	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146276036
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11101	NC_009427	CGCC	2	8	466399	466406	0 %	0 %	25 %	75 %	146276036
11102	NC_009427	GGC	3	9	466496	466504	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146276036
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11104	NC_009427	CGA	2	6	466573	466578	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146276036
11105	NC_009427	CGCC	2	8	466596	466603	0 %	0 %	25 %	75 %	146276036
11106	NC_009427	CCG	2	6	466624	466629	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146276036
11107	NC_009427	GGC	2	6	466651	466656	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146276036
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11109	NC_009427	ACG	2	6	466701	466706	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146276036
11110	NC_009427	GAT	2	6	466772	466777	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146276036
11111	NC_009427	GATC	2	8	466852	466859	25 %	25 %	25 %	25 %	146276036
11112	NC_009427	GTC	2	6	466860	466865	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146276036
11113	NC_009427	TGG	2	6	466876	466881	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	146276036
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11115	NC_009427	CG	3	6	467081	467086	0 %	0 %	50 %	50 %	146276036
11116	NC_009427	CCG	2	6	467098	467103	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146276036
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11118	NC_009427	CGCGC	2	10	467173	467182	0 %	0 %	40 %	60 %	146276036
11119	NC_009427	GGC	2	6	467189	467194	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146276036
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11242	NC_009427	CGA	3	9	473155	473163	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146276041
11243	NC_009427	GAA	2	6	473179	473184	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	146276041
11244	NC_009427	CGG	2	6	473242	473247	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146276041
11245	NC_009427	GCA	2	6	473384	473389	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146276041
11246	NC_009427	CCT	2	6	473425	473430	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	146276041
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11250	NC_009427	TTCG	2	8	473527	473534	0 %	50 %	25 %	25 %	146276041
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11269	NC_009427	CG	3	6	474726	474731	0 %	0 %	50 %	50 %	146276043
11270	NC_009427	CGT	2	6	474747	474752	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146276043
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11282	NC_009427	CGAC	2	8	475364	475371	25 %	0 %	25 %	50 %	146276043
11283	NC_009427	GCTG	2	8	475397	475404	0 %	25 %	50 %	25 %	146276043
11284	NC_009427	TCA	2	6	475406	475411	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146276043
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11289	NC_009427	CGCCAT	2	12	475677	475688	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	146276043
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11324	NC_009427	CAA	2	6	477009	477014	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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11347	NC_009427	CCGC	2	8	478061	478068	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
11348	NC_009427	GCA	2	6	478114	478119	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11349	NC_009427	G	6	6	478140	478145	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
11350	NC_009427	AGC	2	6	478230	478235	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146276048
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11352	NC_009427	CAT	2	6	478266	478271	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146276048
11353	NC_009427	CGGG	2	8	478274	478281	0 %	0 %	75 %	25 %	146276048
11354	NC_009427	CAA	2	6	478359	478364	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	146276048
11355	NC_009427	TGC	3	9	478394	478402	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146276048
11356	NC_009427	ACA	2	6	478445	478450	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	146276048
11357	NC_009427	GAG	2	6	478459	478464	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	146276048
11358	NC_009427	CG	3	6	478528	478533	0 %	0 %	50 %	50 %	146276048
11359	NC_009427	GGC	2	6	478534	478539	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146276048
11360	NC_009427	ATC	2	6	478663	478668	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146276048
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11362	NC_009427	GC	3	6	478717	478722	0 %	0 %	50 %	50 %	146276048
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11391	NC_009427	GCG	2	6	479904	479909	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146276050
11392	NC_009427	AGA	2	6	479973	479978	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	146276050
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11395	NC_009427	CGG	2	6	480057	480062	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146276050
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11398	NC_009427	GCCA	2	8	480119	480126	25 %	0 %	25 %	50 %	146276050
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11405	NC_009427	CGGC	2	8	480417	480424	0 %	0 %	50 %	50 %	146276050
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11407	NC_009427	CGGTC	2	10	480448	480457	0 %	20 %	40 %	40 %	146276050
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11417	NC_009427	ACG	2	6	480874	480879	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146276051
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11420	NC_009427	ATCG	2	8	481036	481043	25 %	25 %	25 %	25 %	146276051
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11427	NC_009427	CTCG	2	8	481224	481231	0 %	25 %	25 %	50 %	146276051
11428	NC_009427	GCT	2	6	481328	481333	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146276051
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11431	NC_009427	GCC	3	9	481456	481464	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146276051
11432	NC_009427	GCCG	2	8	481485	481492	0 %	0 %	50 %	50 %	146276051
11433	NC_009427	CGC	2	6	481551	481556	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146276051
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11443	NC_009427	CAG	2	6	481842	481847	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146276052
11444	NC_009427	CGGG	2	8	481872	481879	0 %	0 %	75 %	25 %	146276052
11445	NC_009427	CCA	2	6	481973	481978	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	146276052
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11447	NC_009427	GCG	2	6	482071	482076	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146276052
11448	NC_009427	ACTTCG	2	12	482110	482121	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	146276052
11449	NC_009427	CAT	2	6	482124	482129	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146276052
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11451	NC_009427	ATC	2	6	482146	482151	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146276052
11452	NC_009427	ACC	2	6	482182	482187	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	146276052
11453	NC_009427	TGATC	2	10	482240	482249	20 %	40 %	20 %	20 %	146276052
11454	NC_009427	GGC	2	6	482372	482377	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146276052
11455	NC_009427	GCG	2	6	482381	482386	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146276052
11456	NC_009427	CG	3	6	482412	482417	0 %	0 %	50 %	50 %	146276052
11457	NC_009427	CCA	2	6	482435	482440	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	146276052
11458	NC_009427	CG	3	6	482530	482535	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11459	NC_009427	GCG	3	9	482533	482541	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11460	NC_009427	TTC	2	6	482606	482611	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	146276053
11461	NC_009427	TCCG	2	8	482627	482634	0 %	25 %	25 %	50 %	146276053
11462	NC_009427	TGGCCA	2	12	482642	482653	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	146276053
11463	NC_009427	TCG	2	6	482705	482710	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146276053
11464	NC_009427	GGCGA	2	10	482716	482725	20 %	0 %	60 %	20 %	146276053
11465	NC_009427	CGG	2	6	482733	482738	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146276053
11466	NC_009427	CTT	2	6	482803	482808	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	146276053
11467	NC_009427	CGC	2	6	482832	482837	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146276053
11468	NC_009427	TCG	2	6	482849	482854	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146276053
11469	NC_009427	CGT	2	6	482862	482867	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146276053
11470	NC_009427	GCT	2	6	482904	482909	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146276053
11471	NC_009427	GGC	2	6	482956	482961	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146276053
11472	NC_009427	CGC	2	6	482962	482967	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146276053
11473	NC_009427	GCG	2	6	483002	483007	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146276053
11474	NC_009427	CG	4	8	483012	483019	0 %	0 %	50 %	50 %	146276053
11475	NC_009427	ACG	2	6	483059	483064	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146276053
11476	NC_009427	CGGCG	2	10	483191	483200	0 %	0 %	60 %	40 %	146276053
11477	NC_009427	TCG	2	6	483236	483241	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146276053
11478	NC_009427	AAC	2	6	483242	483247	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	146276053
11479	NC_009427	ATC	2	6	483250	483255	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146276053
11480	NC_009427	ATGGC	2	10	483269	483278	20 %	20 %	40 %	20 %	146276053
11481	NC_009427	TCG	2	6	483284	483289	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146276053
11482	NC_009427	CGC	4	12	483360	483371	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146276053
11483	NC_009427	CGG	2	6	483402	483407	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146276053
11484	NC_009427	GCG	2	6	483415	483420	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146276053
11485	NC_009427	CG	4	8	483419	483426	0 %	0 %	50 %	50 %	146276053
11486	NC_009427	GGC	2	6	483466	483471	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146276053
11487	NC_009427	CATCG	2	10	483498	483507	20 %	20 %	20 %	40 %	146276053
11488	NC_009427	CTC	3	9	483565	483573	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	146276053
11489	NC_009427	GGA	2	6	483576	483581	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	146276053
11490	NC_009427	CGG	2	6	483629	483634	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146276053
11491	NC_009427	CGA	2	6	483657	483662	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146276053
11492	NC_009427	CAGCG	2	10	483832	483841	20 %	0 %	40 %	40 %	146276054
11493	NC_009427	GCAA	2	8	483904	483911	50 %	0 %	25 %	25 %	146276054
11494	NC_009427	CGC	2	6	483974	483979	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146276054
11495	NC_009427	CGA	3	9	484005	484013	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146276054
11496	NC_009427	CAC	2	6	484024	484029	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11497	NC_009427	AGT	2	6	484038	484043	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11498	NC_009427	TGCC	2	8	484048	484055	0 %	25 %	25 %	50 %	146276055
11499	NC_009427	GGC	2	6	484119	484124	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146276055
11500	NC_009427	CAT	2	6	484175	484180	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146276055

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